CmaCh12G006560 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGATGGAGCTAAAATTCGACATGGGTTCTGCTCATTCTTCATGCTCTCTCGTTACAACTTCCTCCACCAAACATTTCTGCTTTTCCCAATCTTCAATTTGCGTATCAAAGTTACACCCAACAAGTCAGAATCAAATCAGATCTATCAAATTCACTTCTCACCCTTTTCATTGTTGTTGTTCCTCTTCACAACATTTGCCTTTAAGGTGTAATCAAGTAGGTGAATTTGAAAGCCAAGTGAAGTCTTTGAAAACCATGGCGGATATTCATGGCATTGATCAAGAGTTGCTGAAGAAGATGGTCTATGATGCTCTTGTTTGGAGTTCTCTACATGGACTTGTTGTTGGTGACAAGTCAGTGAAGGTAAGCATTTCTGCAGTTTATAGGATGGATGTTCTCTGCCTTTTATTTGGTTTTTGTATGCTGAAAATGTCTTATGATTGTTGCTTCTGCTGTTAGTTTGGAAAGATGAAGGACCGAATGATTCATAATAGTGGATTATTACTCGTTGCTTATGATACTCTCTCCAATTAGTGTTTATGAAAGAGAAACGCAAATGTTCTTACTAAAGGAGCATTGGAAGAAGATATGGTGCATTCCTTTAGATTCTGAACCAAAAAGATTGAAAATTCCATATCCTCTCATCATTTCAAGTAACTGTTATTTCTCCATTAAAAAAATGGTAGAAATTTCTCAAAGTAGTAATTGGAATAAGGACGTCTGTAAAGTGGTTGCTGATGCTGAAACAGCAAACGTCTTTTGGGGGTAAAATTTTAATATCATTTCAAATGTTTTGGGCTGCAGAGATCAGGTAAAGTACCTGGTGTAGGTTTGGTTCATGCCCCAATTGCCTTGTTACCTGGGTTATTTCCTGAAACTCATTGGAAGCAAGCATGTGAGTTAGTCTCCATTTTTAATGAATTAGTCGATCGGGTGAGCTTGGATGGGAAATTTTTACAGGAATCATTATCCAGGTATGCTCGCTCGAGAGCCCTTTCATGTCTGGCACACACACTAGTTATTGACTCTTGGAATTCTCATGTCTTTATACTTGACACAATCATCTTGTCTTAGCTCTGCTCTTGCCTGGATCTTCACATTTTAGACAGTACTTTCTTTTGTTTTTGGTAACTTGTCTTTTGTATTTCATTTCGTTTGATGGAAGTGCCTTCTTTATTAGCATGTATCGATTATGATCCCAACGTATTCTATTCATCTGCTGATCTGGTTCATCCTCATTCGTTTGTTCTTTCCTTTTTAATTCTTCTAACTAGTTACCTTCCCTACTTTCTACCATTATGGTTATTAGTGGAGATTTTCGCTGCCTAAAAAAGACTTCATATGTCATTCATATAGCAGAACCAAAAAAGTGGATGCTTTTACGTCTAGACTTTTAGTTATTCATTCCAAGATGCTTTTACGTCTAGCCTTTTAGATATTTATTCCAAGATGCTTTTACGTCTCTGCCTAAAAGACTTTTGATATGTCATTCATGTTGCAGAACCAAAAAAGTGGATGCTTTTACGTCTAGACTTTTAGATATTCATTCCAAGATGCTTCAGATTGACAAAAAAGAGGTTAGTGTATGCAAATTTTTATTGATATTGTGTAGGTCAACTATCAAACTTTTATATTGTAGCTTTTTGGATACAGTTAATGTGTTTCATGACCAATTTTTTAAAAGGCTTAAGGCGGCTTGAGGTTTTTCCTTGTAGAGATGCGAAGGGTAGACACTCACTGTGAACAAATAAAAACAAAAAGAACACGAGTAAAGAAGGGACAAAGAATAAAACAAAACTCACCTTGTTGTGTTGGTTGTCAAAGAGTTGCGACTTTTTTCTTTTGTTAATGCAGTCACTCAGAGTCAGCTCTATTTTAAATAACACAGCAAGGTGAACATTCGATATATATATATATATATATTTTAAGTAAACCAATAGAACTTCTTCTAATTTTTCAGTGCATTTTTAAGTTTTCTTTGATATCTGTCTTTCCCCATGGTTGACGAAAATGAACTGCTTGAATTAAATGCACTGCTTGCACAGCAGGGGCCTATGGCGCACCAGAAATAAACACAAGGCTTACGCCTTATAGCCACAGAGGTGTTCGGATGGAGGCTTATGCCTCTATTGAGAGAGGCATAGGCCCCTCTTTGTGTGTAAAAGACATAAGCCTTGAGAAAAAATGTTGCTGCCTCGCTTCAAGGCTTCTGCCTTAAACACCTTTTAAAACGTTGTTTATGGCAAGTTTTTAGTTTAAAAAAATTAATTCCATTCACTTGTTATGTTTTTACTGTGTGACATGAAATATTTACATAACCTTGCAGTTTAGAATAAGTTAACTTCAGCCTTGTAAATGAATATGAAACTTCCATTATGTTTGTGGCTCCTAAAGACATTACCTACTTAATTTTGATGTTTATGGCTCTTAAAGACATTACCTACTTAATTTTGATGTTTGTGGTTCCGAAAGGCCTTACCTACATAATTTCTCCATGCTATGCAATTTTATCCAAAAGGGTTGTATTATTTAATTGAAGGATTATAACGAACTTCTCCAATTATTCAAGTAGGAAATTCGCTTGGGTTTACATCGCTCAGATTATATGCTTGATGAGAAAACAAAATTACTTCTTCAAGTAGAGCTCAACACCATATCATGTTCATTTGCTGAATTTAGTCATCTAGTCAGCCAACTTCATAGGTAAATATAACTTTTATAGACATCTACCATTGAGATTTCTTGTGCCTTAGATTTTGTGTATATTTGGCCATTTTAATCCTCCCATTAAAATATAACTTTTATCAGAAAAAACTTGTACATACAGCAGATTATATTTGATCCTTCAATTATTTATTTATTTTTATGAGAAACCAAGTTTTCATATACAAGGGCATATAAAAAAAATATCCCAACAAGGGAAGTCCAATCAAAGAACGAGACTCCAACAGAAAAGAATGATGCCTAGTTGTTAATGTGAGACCCACATCGGTTGGAGAGGGGAATGAAGTATTCCTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAAACACGTTTTAAAACCGTGAGGCTGATGATGATTCGTAACGAGCCAAAAGGGACAATATTTGCTAGCGGTGGGCTTGAGCTATTAAAAATGGTATCAGAGCCAGTGTGACAATGTGCCAACGAGGACGTTAGGCTTCCAAGGGGGGATTGTGAGATCCCACATCAGTTAGAGAGGGAACAAAGCATTCCTTACTAGGTGTAGAAACCTCTCCCTAGTATACGCGTTTTAAAAACCTTGAGAGGAAGGCCAGAAGGGAAAGTTCAAAGAGGACAATATCTTCTAGTGGTGGACTTGGGCTGTTACAACTTTTCCTCCAGAAGTTCTCTGAATTGTTTGAGATGTCCGAGAGCTTTGTCTTAACTCTTCAGTAAAAGAACATTATTTATCCATGCCTGATCATTCATTTTGTTATTTTATCTTGCAGTGATTTACTTGGTCAATATGGGGAAGTCCTCGGATTAGACTCGAGAATGATTCCTGAAAATCATGCGGGTAATCAATATGCTGAGGTATTGGTCAAAGCTTGGACTGAATATAACAACCCAAGGTTAGATTTGAAAATTTGATCTTCTTATTCATCACCATTCCTCAAACCTAATTTTCAGTGGGTTATTAATTTTTGTAGTGCTGTTATCATGATTGTGGTTCAAGCTGAGGAACGCAACATGTACGATCAACACTGCCTTTCTGTTAACTTGAGAAAAAGATATCCACTTTTTCCTGATTGTCAGGCTCCATTAGAGTACATAATTATCTTTATTGTGCACCCAATCTTTTTACTATTTGAACAATTTGATCTATCGAGTTTTCCATGTAAACGTTCCTTAGCTTTATAATACACATTATATCAAAACTCTTCGGAAAACACTGGCAGAAATCGATAGGGAGGGAGAACTGCAATCTGATGGAACACTCCTTGTGTAAGTAGTTTTGAATGTCAAAATTAGTTATTCCTAGGAAAATTGGGTTACCATTTTATGTTACTTGGAATTCCTGAGAGCTTCCTCCTGCAGAGATGGCCAAGCAGTTGCAGTTGTGTACTACAGGGCTGGATATACACCCACTGACTATCCTTCTGAATTGGTAAGTAACTTCCTTCCTGTTGTAACTTGTCATGAAGAATAGGTTCATGCATCTCCTATGCATGTATTGACATTTATTTGATTCATAACTCTCATTTATTTGGTTCATCTTCCATTTTGTTGATTCATGTATGACATTAATGCTTCTATACCTATATAAAGGGTTGTCTAGGATGGTTGAGATGTATTGAGTTTGATTGAGTTTGAGTGTCATTTTGCATTTGTTGAGTGACATTTGGGAGGAACTTTGTTGAGAGATTTTGTGGGGTGAGATATACACTTAGTAAACACTTTGATTATTGAGATTGGTTGTTACCTGTGGATGTAGGAGAATTTCTTATCTCCGAACCACATAAATCTTTGTGTTTCTTTGCTAAACTTCTGTTTGTGGGTGAGTGAGTGCGATTGATCTTGTTTCCGCTTCCGTTACATCACTTCTTTGGTTGGGATTACGTTCATATATTCTTTTGGAATGAGCTTCCTCGGCATTAGTGTTACCCTTCATTTTAGGAAGAAACTCGCATTTTCGGATGAATCTCAATAGTTTTATGAAATCTTAAGACACAAGCAAAAGTTGGTTTTTTCATATAGAAATTGATGACTTTTATCTATTTCAATTCCAAGCAATTTCATTATATCTTGAGTAAAGCTTTGGGGTTATTTTCTCATTTGAATGGTAAAAAATTTCAGGAATGGAAAGCAAGGTTACTTATGGAGCAGTCATCTGCAGTCAAATGCCCATCCATATCTTACCATTTAGTGGGCACCAAAAAAATTCAACAGGAACTTGCACAACCAAATGTACTTGAAAGGTATTAATTATTGATCTTAGTCTTGCTTAAAGAATATTACCCGATGATCCTAT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BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P46416 (Glutathione synthetase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GSH2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 1.8e-178 Identity = 321/520 (61.73%), Postives = 380/520 (73.08%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22494 (Glutathione synthetase, chloroplastic OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=GSH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 2.6e-177 Identity = 322/521 (61.80%), Postives = 381/521 (73.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35668 (Glutathione synthetase OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=gss PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 286.6 bits (732), Expect = 5.9e-76 Identity = 182/502 (36.25%), Postives = 265/502 (52.79%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5EAC2 (Glutathione synthetase OS=Bos taurus OX=9913 GN=GSS PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 282.7 bits (722), Expect = 8.5e-75 Identity = 182/501 (36.33%), Postives = 263/501 (52.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KS33 (Glutathione synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495982 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 867.8 bits (2241), Expect = 2.3e-248 Identity = 452/523 (86.42%), Postives = 453/523 (86.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GH89 (Glutathione synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 851.3 bits (2198), Expect = 2.2e-243 Identity = 443/525 (84.38%), Postives = 447/525 (85.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GH64 (Glutathione synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 850.9 bits (2197), Expect = 2.9e-243 Identity = 442/523 (84.51%), Postives = 446/523 (85.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KP26 (Glutathione synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495981 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 807.7 bits (2085), Expect = 2.8e-230 Identity = 419/523 (80.11%), Postives = 433/523 (82.79%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GI97 (Glutathione synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454173 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 790.0 bits (2039), Expect = 6.0e-225 Identity = 409/523 (78.20%), Postives = 427/523 (81.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. NCBI nr
Match: XP_023001958.1 (glutathione synthetase, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 867.8 bits (2241), Expect = 4.7e-248 Identity = 452/523 (86.42%), Postives = 453/523 (86.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. NCBI nr
Match: XP_022951297.1 (glutathione synthetase, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 851.3 bits (2198), Expect = 4.6e-243 Identity = 443/525 (84.38%), Postives = 447/525 (85.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. NCBI nr
Match: XP_022951296.1 (glutathione synthetase, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 850.9 bits (2197), Expect = 5.9e-243 Identity = 442/523 (84.51%), Postives = 446/523 (85.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. NCBI nr
Match: XP_023537149.1 (glutathione synthetase, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 846.7 bits (2186), Expect = 1.1e-241 Identity = 444/531 (83.62%), Postives = 446/531 (83.99%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. NCBI nr
Match: XP_023537148.1 (glutathione synthetase, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 845.1 bits (2182), Expect = 3.3e-241 Identity = 442/523 (84.51%), Postives = 443/523 (84.70%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G006560 vs. TAIR 10
Match: AT5G27380.1 (glutathione synthetase 2 ) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 1.3e-179 Identity = 321/520 (61.73%), Postives = 380/520 (73.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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