CmaCh12G005950 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh12G005950
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr12: 3102773 .. 3107051 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh12G005950
SyntenyCmaCh12G005950
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

ATGGTAATAATTTTGAATATCTGCAGAAACTTCTTTATTTTGAAGTTAAGTATAAGCAAGACTCATGAGAATGAAAGTAATAATATAAACTTAAGTGAGTCAAGAACTTCAAATAACTCAAGGCGTGGGTTTGGTTTGAAAGGTCGTGCAATGGGCGGCGCAATTCCCGAAGATAAAAGAAAACGAGTGGTCCGGCGAATGCGCCGGAATCTGCGGCGGCGAAGAATGACGACACTTTTGAATAACGGACCCCTTCCCTCCTTCCATCATGGGGTCCTTTTACAATATTGTGATATTTCGAGGGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTAATAATTTTGAATATCTGCAGAAACTTCTTTATTTTGAAGTTAAGTATAAGCAAGACTCATGAGAATGAAAGTAATAATATAAACTTAAGTGAGTCAAGAACTTCAAATAACTCAAGGCGTGGGTTTGGTTTGAAAGGTCGTGCAATGGGCGGCGCAATTCCCGAAGATAAAAGAAAACGAGTGGTCCGGCGAATGCGCCGGAATCTGCGGCGGCGAAGAATGACGACACTTTTGAATAACGGACCCCTTCCCTCCTTCCATCATGGGGTCCTTTTACAATATTGTGATATTTCGAGGGCCTAA

Protein sequence

MVIILNICRNFFILKLSISKTHENESNNINLSESRTSNNSRRGFGLKGRAMGGAIPEDKRKRVVRRMRRNLRRRRMTTLLNNGPLPSFHHGVLLQYCDISRA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 25..43
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 25..57

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh12G005950.1CmaCh12G005950.1mRNA