CmaCh11G011500 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh11G011500
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Unknown protein
Location	Cma_Chr11: 6614904 .. 6627829 (-)
RNA-Seq Expression	CmaCh11G011500
Synteny	CmaCh11G011500

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

CATCCTCTTCTCTCACCCCACCTGTGATCTCACCTCACCTGTGATCTCACCTCTCACTTTGTTTGCTCCTCTGTCGTTGCTCTCATTCTTGCCGTCACCGTCTCCGTCGCCGTCGCCGTCGCTGAGATTTGAGAAGCAAACCTGTTGAGAGGCGACAGTACTGAGTTTATTTTTATTCTTAACACTTTGTGCTTCCGCCTTCTCATTCTCTTTCACTTAACCATTAACCAATTGATAGAGGAGATAATTGAGTGTAGCCTATCTCGCTCTTTCATGTTCAAGATCCTTATTTATTCCAATTTCCGTCAGTTAATTGATTGATTATGTGAATGAAATAACGACTTCTTAATTGTAATTAGAAGCAATTGTTAATACTCTATTCCTTGTTCTCATCAATCTGAATGTAGGACAGCAATTTTGGTTTTGAAAGTAATTTCGAGTACTTGTGTTTTCCTTTATTTCTAGGGTTCTTTTATGTCAAGTAAAATTATTGTTGAAAATTTATATATTTTGAAGAATTCAGTTTTTAATTGGGGATGTCTCGAACGGGAATCTGTTAGCTCAAATTGCTTGATGTTTTCTTGCTGGATCATATTTCTTGAAATTTATCCAATCCAACCAATCTAAATATATAAGCCCCATTAAGTTTTCTCCAAACATTTATAATATCACTGATTTAGGGTGCTTTTTTGAAAAAATGGAAATCTTAGTTTTGGAACGTGGTGAAGTCTAAAGCTCTAGGAATGGATCCCAAACACACGGGAGAGATTTTGAAGTAAGTTCTTTTCAACGAATTCAGTAGGTGAAATTCCTTTAGTATCTTTGGATGGGATACTGGTCATTAACTTCTAAATTTGTTGTGCAGGCATTTGGACAAGCAGGATGAGATTCTTATGGATGCTTATAGATTAATGTCCCATGAATTACATAAACTTCAGGTTTCCTTTCTTTTGCTCTTGATTTGCTGATTTGTTTGATGAACTTGCATTATCGATTTCATCTTATTTTGAGCTGTATTGTCCACCTTTCTAAGTTTTTACCTTTTAGAAGGATTTAGAAAAAAATCTGACATATTAGTACATATATGATTCTATACGCCTGTCTTTATGTATTAACCTGATTGGCATCCGTGGATATCTGATTCAGTTAGAGATTTTTTATTTTATTTTATTTGGCTCTCATTTTAAGTTCTTAAGCCTCTACGGCTCTGGCTTATGTTCTGATTGCAGAATATAGTCCTTTGAAGTAACTACGAGTACAATGCTATTTTAGACTTTTTAGTACTACAGGATTTCATCGATTTGGATTTTTTTTTTTTTTATGATAACTTACTGTCAATAGAGAAAGACTGGGAGGGAGGTTGCCAAACAATATTTCAGTCTACTTTCAAAAGATATTAATGCAGTTGAAAATTCAAAATCAACTTAATGTTGTTTTATTGTATTAGTCTGTTATATTTGCTCTTGAGATGAAACTTTGCTTTTTGAGAGAAATCCTGGAAATTTTGGGTTACAACTGGAAGGTTGTTGGTTCTATTTCTAGTGCTTGTAATTGCAATTCTAATATTTGCAGGTAGAAGAAGAAATGCTCATGCGCAAGTTTTTTGAAATAATGTCAGCTCATGGTCTAACAAAGAAGGTTGTGATATCCAAATTGCACATAATTATACTTTGGATGTTCTTTTAATGTGCTCAAAGATGTCAAATTCTTAATAAATCTGACCTAATTCTGATCTATCTTGGGAACTTGATTGGATGGAATAAATAGCTTAAAGCTTGTAACAGCGGGTTCCTTCGAGAGTTCGGCTGTTCAGAAGTAGTGCAAGGTTGTCAGTTTCCATTAACTCTATCTTTGACTAGACTAGGTCTCTAATAGCTTCCAGGTCAGGCTAACCAGTTAACTACTAAGGACCACAATGTACACTGAATCAGTATAAAATATTAAAGCACAATGCTAGCATCCTATGCATCCCACTCACTCTTAACTATGATTAAATTCATCTCCCGTTTGAACAAACCACAAAAAGGTTTATAGTGGGTAGAATACATATAGATCATCTGCAATAAATGTCAAGTTAACCAGAGGTATGTTAAGTTGTACTTTCATTAAGGGAACTACCAATTAATATGTTTTTTTTGTGTGGAATATATGGCTGTAAAGGAATATGGTGTTTGATGATTGGCTAGGGATTTAGGAAGGAGCTTGGTGTCACAATCGCACTCTTTGCGACTCACAAAGCGACTGTGCGACACTGATTCTTGTTCTCAAGTCAGCCAACCAACTGAAACTTAGGTTGCTGGTGGCACAATAGGCATATGATTTAACCTCCGCACATTCTTGAAAAATGGTGTTAGAGAAAGTTTTGGAAAACGTTTTGAACGCAACTTTTATAAGCTAGCAAGCAATAAGCCACAACATCAATAACATTGATAGTATGTAACCCTGGTAGGAAGATTTGACAACCAGTTGTATCCATTACATTTGGAGGTAAATTGCATTTGGCAAGTGGAGACATCAAAAGTGGTGAGGAGTAATACACTCACAAAATTACAAGAAAAGTAAATTACTACATTAGAATGAAAAACATATAATAAAAGCAAGGTAAAAGGATTTGGAATGGGCATGCAACTACGGGTAATAGGCCTTAGACATGCATGACCATGACATCCTCCCCACTTAATTGGATGATGTCCTTGTAACTGAATCTACTCAAACTCATCAATGTGAATAGCGACTGTCTGTAGGTCTTCAATGAATTCTCTATTGATCTCTGTGTCAAGGAGTCCCTCCACTATATAAGGAACTCGTGCACATCTCTTTTTGGCTTACCTATTTGTCTTGTTCTCTTAGCTAGAATCTCTTCTTCTTCTTTTTTTGACATTATTATTCATTGTGAGGGGAGGTCGTGTTACCTCATTGTGGCCGTTGTTCTCTAAATCAGAATGGTAGAGGTTTAAGTTACTTACATGGATAACTTGGTGAATCTTCATCCATGAAGGAAATTGGGTCCTGTATGATGCCTTCCTGACCTTCTAAATGACTTCGTCTAGTTCTTCATATTTTCGCACTAGTCACTAATCCTGGTTGCTTCTGAATCAAAACTGTTTTGGTCTTGCAAAACTGTTTTGGTCTTAACATGATCAAAACTTTGTCTCTGACTTGGAATTCCAGTGGCTTTTCAGATCCACCCATTTCTTCATCCGCCTAGATGTTTTCTCTAAGTAATCATGAGCTACTTTAGAGGTTCGTCTTTACGCTTTGGTGAAATTGTAGTCTTGGAGACTCTTTCCAGCATATGGATGGTCAATGACATGAGCCTTTGCGGGCCAAATAAACTCGACATTCAACAAGTTGTCTAGCTATTTTCAAAGTTTGCTAATTCGGGTGGAGCCATACGGTACATATTTTTGGCATGCAGTCTCGCTTCCGATAGTAACTCAGTTTCATGATCTAACCCTCTGTGTGGGGATAAAACTTTAGTTAGCCTTTTTAGAATTACATCATGGTGTTTTTCTAGCAGCCATTGGATCTTTATAAGAACTAGTCTACTCGAGCCTTCATCTTCAACCTCAGGAATGACCATAAAAGTGGGTTCATTGTGGATGGGGCCACATTTCAATTGTTGCGACGATATCATCTTCACCCCCTTTTGAATGTTTGACATTAGTTTAAACATGGTGGGGTTGGATCCCATCACCGAGCATTTTTCTCGGGGTATGAGAATGTCTTTGTGTTTGAATAGGAACTCCTTCCTTAACAATGCTGAAATCGAACATCTTAACAATCACAAAATCATCATGTCCATTCCAAGTTGCCATCTTGATTGTAATTCTCTTTGCAATTCCCAAATTGGGTAGGGTTACCAAATTGACGGCCTTCGTCTTCATATCTCTGTGCCAGAGTATGTTTAAGAACTTTGCTTCGGTCTCTGTCACAAAGTTGTGAATGATTTTAGAGTCGACCATAGTGCTCTTGGTCGATCTATGGTTAACCCAGGTCTCAACATACATAAGTCCCCGTCCACTAACTCTTTCATCTCCCCCCAATTCTCTCTAAAGAACCGATAAGAACTTCTGGCCCCATGCGGGGGTTGTCAATGATTTCAATTGATGGTACTTCAAATTTTGCCATTTTAGATTTAACTTTTGAAGTCGTTATAAATGTTGCTTGGAAGACTTTGAGGGCCGCTCTATTTGAGCACTTAAATACTCGATGGGCCCCTTTATGTATGAAACAGGACAAGGGCCCCGATTATAATTATTTTGGTTGTGCAGTCTCAGCTTAATTTCAACCTCTTAGTTGAAAGGGTTTATAGTCTCCTCTAGTTCCAGGTCTATCGCTAGCCCTTTGGCAAAATTTTGTTTTTTCAGAAAAATCCTAAGTTATCTTCCATCAACTCAGGAAAGTACTTGACGTAGTACGTCTTGGATATTTCTGATGTGTTTCAATTCCCTAGATTTTTCTCTTGTTAATGTCTTGACATTCTCAAGGAAGAATTTGTTGACTCTGGCAATTCAGAGGAAAATGTCGACGAAAAACCAGCCGAAGGTTTCTTTTAAAGAAAAAATAGTAGAAGTAAAAGGAGAGAGGGAGAGAGATTTGCTGAAAACTCGATTTATTTCTCTTCCGTTGAATTTTTTAAATAACAAATCTAATTACAAAAAATAGAAAAGTGGGCTAAGACTTCGCCCAAGTTGGCAGCTAGAATTACGCTCTTCCATTGGCGTGAATTCAGAAGTTTTGAGACGTCAAAACAACCTAACTGAATAAGGAACATAGCTTTTATTTAACAATCTCCTCGTAAAAGCTGTGCTATATCTACCTTATTATTTGAACTCCGATCTTTGAGCGTAGTTCTTCAAATTTTACCCGCGCCAGGAACTTGGTGAAAATGTCTCCAAGTTGTTCCTCTGTTCGGATGAAATCAATCTTGATGAGCCCTCGATCTGCACATTCTCGAATGTAGTGGAATCTGATTTCAATGTGCTTGCTCCAGTCGT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CTACCTCAAGAGAAACTTTTACATCTTCAGAAAGGTCTGAGATCATCTGAACTATAGCCTTTCGAGAGTTTTCTAAACCTTTGACACGCTTCTCCATGTGGACAACCGAGCTTGTCGACCTATCCCCACGCCTGAACCAATCAACCGTGTGATTTTGTCTTTTAAGATCTCAACCTTGAACATCAATTCTTGGATAGGAATCTCGTCTAGGCGGCTAGCTACTATGTTAATTTTGTCGGTTTTGGTGGAAATCTCATCCAGATGAGAATCCAAAAACCAAATATTGTCAGGGACTTCATGTAGATAGAACATCTACTCTTTGATCTGGACCAATTAGTCAACACGAGAGACTTGCCCAACTGCTTAGTTGTCGACATGTTTACTAATTTCACTCTACGAATTGACTTAGTTTTGTTCCATTTGTCACAATCGCACTCTTTTGAGACTCACAAAGCGATTTTGTACCACTTACTTTCACCTTCGAGTAAGTCAACCAACTAAAATCGTTGGTGGCACAAATAGTCTATCCGCCTCCGTCCTGTTTTTTAAAGTGATTTTAGAAATGAGGTTAGAGAAGGTTTTGAAAAATATTTTGAAGCAATTTTAGAAAAGAAAATGTTATAAGCTAGCCAGCAATAAGGGACAACAACATTAATAGCATATAAATAGGGTAGGAAGATTCGACAGCTAGTCATATCCTCCTATAGTGCATTTTAAGGCAATTTCCTTTGGTAGACGTAGACATCAAAAGTGGCGGAGAGTCATACACTCACAAAATTACAAGAAAAATAAATGACTACACTTGAATGAAAAACATACAATAAAAGTGAGGTAAAAGGGTTAAATGGGCATGCGATCATTGGCAACATGCATTGGACAATCATAACCGTGACACTTAACAATCTAAAGTTAGTTATTCTCGCTCATTTAGGAAATGAGCCTTTTCTTCCGTAAGGGTGGTAGGGTAAGTGTGACTTGTGTTTTGGTTTTAGGTATGGTCCTCCTTGTGATAGAGTTGTTTTGGCTTTATTTTGTTTGGTTCAAGCTTTGTAAATTTCAGTTTCTTCATGAAAAGTGTCATTAATGTTTTCCCCCCCTAAAATAACTTGGAATGAACTTTATCTCAAATTGAAGCTACAACAAGAGAGTATCTAGAGGGAAGTAATCTTATAGATCTTCCGTGATAAATGTCAAGTTGATGTCAGCCCATCTGGAACATCAAGAATATAAGCATTTTACTTTTTGTTTTTGATAATTTAGCAAGGGCCCTTCTGTCTTTTGTTCCAGTAATTGTATCTAGTCCTAGTTCTCCAAGATTTACTATAACAAGGTACCAACTTAAAGTTCTTTTTGTTCTTTAGCATTATCCTTGAAAGTTGTTCGATAGTCACTTCCCTTGTGCAAACAAGAGATGCTCTACAATTTCGGTTGCCTCTAGGCTAACATCTATGGATTGAGGCAAGGTGATTAAATCGTCTTGCATGAAAGTTCGACATGTAGAATCTGAAAAGAAGATATACGCAGTTTTTCTACATTTGATTAAAAGAATATCAACTTCAATGGCATGAATCTCATTTCTAAGCCTTAGATCCACATAAGCTTCTTATCATACTCTCTAGACTGTAATAAGTTGGAGATTTTACTGAAGCAGCGCGCGGCACAATGGAGGCAAACGTAGTTCTTGAACCTTCACCTTCTTTGGGATCACTTTAGTTGACTTTGTTTATTTTGTCTCTTAGTGGGACCTGCTGCATTCCTTTTCTTTCTAATGGTTTGCCTTTGTAGTATTCTTCCTGTTACAGGCTTTCTTAACTTGGCTTATTGCTTAACAATTTCATATTTTAGCCGCCTAGTGAACAATATCTAAAAGTTCTACTATTTCTCTTACCCCACAAATCCTACGGGCAAAACTTCCACTTTTCATGTGAGATCCCACATCGGTTGGAGAGGAGAACGAAGTATTCTTTGTAAAGGTGTGGAAACCTTTCCCTAGTAGACGTGTTTTTAAAATCTTGAGGGGAAGTTCGAATGGGAAAACCCAAAAAGGACAATATTTGCTAGCAGTGGGCTTAGGCTGTTACATTTAATCTTTCCTTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTGGATGGAGAAGGAACTCCGGAACTCCTTGATTATCTTCCTGCAACTTCTTTGAATGTCAAACTAAAAGCCAAACACATCACAAAAGAGTTTCTAAAATCCCACAAAAACTGAGCCTAGTCAACAAACCTGCTTAAGTCATGTTGAAGTGTTTCTAAGAGGAGCTGGATGGATTAAAATCCCACCCCCCATATCGTTGAGAAAATGCATTAACTTCTATTTATATGTTCTCTATTTGAGTTGACTTATTTAGATTCCTACTAGGATTGCGCAATGCACATGTTCTAGCTGTTGCTCCTTGGGATCTAATTAAACTAGTATGTTGTCAAAATCAACCACTATAAACTCACAAGAAATTATTTTGATACTTGTTCTATCAACTTCATGTCGTGTATGTGCTTGTAGTATTGTTTAATGAGAAATGCATAAGAGTCCTTAATTATTGTTTATAGAGTTTTTATATTCCAATACTCTACTTCTACTTCTAGGATGTATGAAAATAGACCATAAGTTGGTCTAGTGGTAGCTTCAAGAAAAAGTCTGCGACAATTTATCATCGTTATCTTGTTCCACTCGTTGAGTTTATTAAAAATTTATTTTGTGCATTGCAGAGTGAAGATGGTCTTGTTAGTTCTATTAGCAGAGGGGATGCGTTAGCTATATCTAATACTGACGCTAAAAGGTAAAATTACCACGACCTCTAACTCACTGTGAAAGGAAAGTCTCAATGTGACTCACATTTATGTAATTTTTTTTCTCCATAGTATAAACTAAAATTTTGATCATATGTAATTACAATTACATAAG

mRNA sequence

CATCCTCTTCTCTCACCCCACCTGTGATCTCACCTCACCTGTGATCTCACCTCTCACTTTGTTTGCTCCTCTGTCGTTGCTCTCATTCTTGCCGTCACCGTCTCCGTCGCCGTCGCCGTCGCTGAGATTTGAGAAGCAAACCTGTTGAGAGGCGACATTTTGGAACGTGGTGAAGTCTAAAGCTCTAGGAATGGATCCCAAACACACGGGAGAGATTTTGAAGCATTTGGACAAGCAGGATGAGATTCTTATGGATGCTTATAGATTAATGTCCCATGAATTACATAAACTTCAGGTAGAAGAAGAAATGCTCATGCGCAAATTCCTACTAGGATTGCGCAATGCACATGTTCTAGCTGTTGCTCCTTGGGATCTAATTAAACTAAGTGAAGATGGTCTTGTTAGTTCTATTAGCAGAGGGGATGCGTTAGCTATATCTAATACTGACGCTAAAAGGTAAAATTACCACGACCTCTAACTCACTGTGAAAGGAAAGTCTCAATGTGACTCACATTTATGTAATTTTTTTTCTCCATAGTATAAACTAAAATTTTGATCATATGTAATTACAATTACATAAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATCCCAAACACACGGGAGAGATTTTGAAGCATTTGGACAAGCAGGATGAGATTCTTATGGATGCTTATAGATTAATGTCCCATGAATTACATAAACTTCAGGTAGAAGAAGAAATGCTCATGCGCAAATTCCTACTAGGATTGCGCAATGCACATGTTCTAGCTGTTGCTCCTTGGGATCTAATTAAACTAAGTGAAGATGGTCTTGTTAGTTCTATTAGCAGAGGGGATGCGTTAGCTATATCTAATACTGACGCTAAAAGGTAA

Protein sequence

MDPKHTGEILKHLDKQDEILMDAYRLMSHELHKLQVEEEMLMRKFLLGLRNAHVLAVAPWDLIKLSEDGLVSSISRGDALAISNTDAKR

Homology

[Close]

BLAST of CmaCh11G011500 vs. TAIR 10
Match: AT4G37608.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; Has 22 Blast hits to 22 proteins in 10 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 22; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 2.0e-08
Identity = 29/55 (52.73%), Postives = 39/55 (70.91%), Query Frame = 0


Query: 1  MDPKHTGEILKHLDKQDEILMDAYRLMSHELHKLQVEEEMLMRKFLLGLRNAHVL 56
          M+P+HT ++LKHL+KQ E+L +A + M  EL KL+VE E +MRK L  L N H L
Sbjct: 1  MEPQHTDDVLKHLEKQTELLKEAQKNMLQELQKLEVEHETMMRK-LYELMNTHSL 54

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh11G011500 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh11G011500 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G37608.1	2.0e-08	52.73	unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biologic...	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR37718:SF2	BNAC03G61340D PROTEIN	coord: 1..46
None	No IPR available	PANTHER	PTHR37718	BNAC03G61340D PROTEIN	coord: 1..46

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh11G011500.1	CmaCh11G011500.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane