CmaCh11G001340 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACATTGGATGTGTATGATATTTGGTTCCACCTTAGCTGTACAGGTTTAAAAATCTTTGGAAGGTTATAAATATTTTTGGTAATTCGAGTGGAAGGACAGCTGCGAAAATTTCCAAAAGTTATTGGGCCGGCTCAGCCCAGTTCATCATCGGGATTTCCGGACTGAAATCTCATTGCAAGTTGCAATTTCGCGCAGGAACGGATCATCGTTTTCCCTGCTCCCGCGTTGGACATACAAAACTGAGCTTCCGATCGTTGTGACCGCTTCGCTTGCACTGTTTTCCGGCCACGGAATCCTTCTGCCTGTAATTTTATTAACTTCTTCGTTGTGTCGAGGTTGCTGGTCAAGTTTCGTAAACGAATAACAAGCATACATCAAAACCGGCGGTGCCGGCGTTCTCAATGGCCTCGACAATCAAAGCCTACTCCGTGCCGTTGATTCTCTTTTCCGTAGCCGTGTTTTATCAGCTTGTTGTTATTCCTACCTCCTTTCCTACCTCACATTACGACGGTGAGACATCAGAAAGAAATTCACTGTAAAAACTTCTTTAACGATTAATATACGAAGTAAATTTCGTTTTTTTTCCTGGAATTATTTGGTCATTATTGTATGTTCTTATGTTTTAGTTTTGGGAATTAAGAGGTTTAGTCCCGTTGATGAAGTGAAAGAAGCATACGAAAAGCTCTCAGTCAAGTGGTAATTTTTCAACAGTTTTTCTTTATTGGTATTGTCGTGCCATTATACATTATGTTCGATTTTGAAATTAGTAAGCTAAATTGTGTTTCACTAATCGTTACGAATCTCAAACCTGATTGAGGATCATCTGGTGAGAAATTATATTGATGCCACATTTTTTTAGTATCTCTGGATTTTTTTCCTATTTCAGGGATCCAGGACTTGAAGTTCCCAAGGCTGTCGATTTTATAAAGGTCAGTCGTTTTTAATTTGTTCTCCAGAAGTCGCATCCTTCTTGTCAAATCATCCAAAATTTAAACTTAGTGAAATCCTGATAGTGATCCCATTTTGGTCATCTTTTGTGGTACATATATTAGAGTCTTATTATTAGGAATACTTGAGTTGGATCTTCTGTCATTACTTTTCTCCTTAGTGCTGGTCGTATACTTTGAACATTTTGTCTTTTAGTCCCTGCGCGTCTAGAATTTTGAATGGTGCGTGAGGAGAAAGAATAATAACATTTAGTCGGACAAATTGCTATGGAATGATTTAATAAAATTAGGGCTAAATTAGATTTTGGATGGGATTGGTGGTAGGATTTTGCAGTTGAGTACAACAGGTTAGAACTAAGACTAAAGGCCAATTGTTTGTTTGTGTTCATTTATCAAAATTTGTTATCCAGTCAATCAGGCAACTCATTCAAATTTTATCTACTGGAGTTGTCATGTTAACCTTCCATCAAAACTGCAAGAACTGGAAACTAGCTTATTTGAAGTTGAGGAACATAAATGAAATTTTACTTAACAGATACCATTATAAAAGTACATGAATTTATAGTTTAAACCTTTTCAATAATATTGTCTAAGCTTTCTTTTGTTGCATAGTACGATGAGAGGGATTTCTTGTTTTAAGTATTTTTGTCTGATTTAAATGTAAATGATACAAACTTTTAAAATATTCCAGTTGGTAAGCATGCCCGTTGCCTACATTTGATTTTTGCTGTTAATGTTGCATTGTACTTTTTCCCTCCTGCATGATATAGATTTCCATCCAATGTTGGGGAAATGAGGTGCATTTTATCTAACTATTTATGCTGAACTGTATAGGATCCTCATTAGGCAGTGGGTCTCAATCCGTTTGATCCTCTATATATTGTTATTGATTATTGACTTTGTTTTTCTTCTTTCTCTGAACTTCAATATTGATGGTTTGACATAAATTATGCATGTTAATGAAAAGATCGTTTTTAAACTGTCATAAGTAACATTGTTCAATCTTAGTCATGATTATCCATTTCATGTATTGATTTGTTCGAGTTTGTTTCGGGAATCACCCTAGCTTCCTTAGATGGATGTCTTTATCTTTACTTCCATTTTCTTTCTTTCTTTCATTCAAGTTGCTTCTTATAACAAAAATGTCTAAATAAAATAAATTGATTAACTCTGCTCGTGATTCTAACCATTAAGCATGAAATTGAATTTTAAATTAAAATTTTGTATGTTATTTGAAATACTGTACCTTCAAAATTTTGTATGTCATTTGAAACACTGTACCTCTCCAAGTACATTTAGCTAATGTATGTAGTTGGAAGGTGGACTCAGACACCAAAGCTAGATTATTAGGTTGCACCGTATGTATATACTTCGTATTATAATTTTATGGCGAAAAATTCACTATTTTAGTCTTCTTATCATGGGTTGTCCGCAGTAAGTTTTTAACCTTGCCTTGATTTGCAGGTTCAATATGCTTATGAATTGCTAAAAAATAATTTATGGAAACGTAATTATGATCTTTTTGGCATCGATGAACAACAGGTGAGTAGTTGATAAATAATTTGTGTTATTATTATTTTTATATTAGTTTACTTAACAATTAACATAATGGATGCAGGGTGTTCTTGAAAAGGTCAAAGTGCAATATGCAGGAAAAAAGTTTTCAGAAATAAGTCTTCCATTGTTAGATGAAGTTGATTTAAGTGAGTTCCATTTACAATCATTACAGCTTCTATTAAGTTTTTTTTATTATTTTTTTTTATGTGAAACGCTGATGTATTTATCCCCTATCTGGTGCAGATACTGAAGACCACAACCTTAATTTCATTACATCCAATGATGTTCGATCTTTATTTAATCATGATAAGGCATCAGTAATTATGGTAATTCTTAATTAAGAATTTTGCAGTGCATATGTGTTGCCAACCCTTTTTTCAAGGAAGCCCTTATAGTTTGAGATTCTAAGATAAACGAATTGCACAATATTTTCCATACAAGATCAAGTGATTCATTCTATGTGCTTTTTGTTTGGTTATTAAAGGATGTAGATTATTACGCTTTATGTTAGTATTAAAAGAAAAGAAAGTTACGTAATGTATGCTTATCTTTCGAAGTTTCTTTTAGCCAGGATTATGTATATGAAGGAAGACATTTAAATTTACTGTTATTTTATTGTACGTTACTGATTTATAAATATCCAGTTATCGTTATTTATTACTCATCTAGAACTGACACGAGTATTATTCTGAAGCAAGCATTCAAGTTAGGTTGCTTGCATTCTTTCCACTCTTGAATTTTATCCGGTTCTCCAGTGTTGTTCTCCCTCTCCTCAACCTGTCGTATAGTTATTTTAGGTGAATAGGATGATTGCTTATATATATATATATTTTAAGGTCTGGCTTACTAATATTAGAGTTAACATGGTGCACTCAGCCAACGTATTGTAATATTATTTTTTCAAATTGGGAGCTTTTAAAAACTTGGATAACTCCTTTAGGCTTTTGTTTTCCCTCGCTCCCAGCAAGTATATATTATAGTGGTGGTGACAGAATAGCTTGGGATCTAAATTTCTTGTTGTTGATTTTTTTTTTTCAGTTGTATTCATTTGGAAGCAAACTCTGCGCCCAATTTTCTGATGTTTGGAAAAGAATTGGTACGTACTTCATCTGAATTCCATATTTAATGGATGAGAAATTTTTACATTGGGGAGGGGGGAGAAAAGTTTTCTTATTTTGATGTACACCATTAAATAAATGTCAAGAAAAGTGAATTTACACAAAAAACCAACATAAGCCGAAGAAGTCACAAAACCATCTCACAATAACAAGATCATAATTTGAAACTCTTTTTGGAGAGAAGTCCATCCTGAGGTACTAGAGAGGCTATTTGGGATGAGTTTCGTAATCTTGTTGGTATTTGTGTTGAATGTTGGAGTCCGGTTGGTGACTTTATTAAGGTATTAGAGGCTTTTTGGGATGAGTTTTGTAATCTCGTTGGTATTTGTGTTGAATGTTGGAGTCTTGGTGGCTTCATTGATACTAGGTTTCCTTTAAAATTTGAGTGGAGGCAGAGGCACCAAGTCCATGAAAGTTTCAATAGATTCTTTGAGGACTATAATCTCATTGATCTGCCTTTAGTAATGGAACTTTCACTTGGTCCAACCTGAGGCATAAGATGGTGTGTTGCAGACTCGATGAGTTCCTTTTTTCCAACGGGTGGTTGGATTTACTCCTTAGCTCTAAACAGTCTCTAGGCCCTAGAAGTCTGTCAGACCATTGGCTCATTTCCTTTGAGTCTGGTCATCACAAATGGGGCCCAAGTGCATTTTGATTAAAAAATATGTGGCTTTCCAATCCATCTTTTAAATTTGTGGTGGAATTCTGGGTGATGGGTAAGTGGAAAGGTATTTTATTATTATTTTTTCTTTATAAGGAAGTTAAGGTCCCTTAAAGAGCATTTGAGAGTTTGGAATCACACTAATTTTGGGGGTATCAAGCTCAAGAAAGTCACCTATGAAGGGTTTCCTTTGATGAGGTGATTGACAAAGAGACTGAAATTGTTGAAAAAACATATTTTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGTACTCTCTCTCCAGATTTGTAAGCTCCCCCATCCGCATTAACCTTTGAAGGAGTTAGATTGGTGTCATATCATTGTTAGTAATAATAATATGTTTGAAGCACCTTTTACCTTAGAGGAGATCAGGATAGTAGATTTTTTGTTTGATCGAGATAATTCCCTTGGCCCAAATGGCTTTTCTATGACTTCTCTATTAAGTTTATTGAGAGATATTGATGACAATGCTGCTTCCCAATGAATTCATTGATGACAATTGTTAAAATTTGAAATTTCAGCTTTACAAAAATCTCCCAAGCTCTAGTTACAAACAGCCAAGGGAGGTGTTGAAACCTCAGTATCTCCCAATGAAACTCCAACTTTACTAATCATCTTGTTCGTCTAGGGTGGGTTGTGAGGTGAATCTCTTGCCTTGTACCTTGGGCTTCCTTTAGGTGATGATTTGAGGTGTGT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MTLDDSCENFQKLLGRLSPVHHRDFRTEISLQVAISRRNGSSFSLLPRWTYKTELPIVVTASLALFSGHGILLPHTSKPAVPAFSMASTIKAYSVPLILFSVAVFYQLVVIPTSFPTSHYDVLGIKRFSPVDEVKEAYEKLSVKWDPGLEVPKAVDFIKVQYAYELLKNNLWKRNYDLFGIDEQQGVLEKVKVQYAGKKFSEISLPLLDEVDLNTEDHNLNFITSNDVRSLFNHDKASVIMLYSFGSKLCAQFSDVWKRIVTLLDGVANTAVVELGEAQLAAYFAEKKPTGQPFFRNGLPSLVAFPLGCKSVDCINRFDGELSADDITDWVATTVLHLPRILYYSKDTLGQNFLAKSSPHKVKVIIFSETGERAVPFIRQTAKNYWDSVSFAFVLWREEDSSVWLDAFGVEFAPAMIFLKDPGVKPIVHHAIPQLRSRTSMELGCDARGYSRAGSETLTWYCAIIAGRLGTELNKMRETIRRVKETLTTDSEAYEADEGPMVSPAAVALKNKRLSFTWLDGEAQKKYCFFYISSESSYETCGPRRDLSDVPRLFIVRYKRDATKAKEIKPRSLFDTSSEDLDLAAQLVALYNGSSEISEIVQWISKIIDDGDSKDLPFYRVKSPELVLEDPEPMRFGRAGSSFIDNVLKWIAHIKVAIYDRLDDPRIGPVFFLASLLSFGTIWLRKSQPTLPSRPARQPDLPNESTQPSQPSAKEGSKARRRNRSRTASEGDIPPSITDFEPPNAYQMPQLSGSDSE Homology
BLAST of CmaCh11G001340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q498R3 (DnaJ homolog subfamily C member 10 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Dnajc10 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 3.0e-09 Identity = 57/251 (22.71%), Postives = 108/251 (43.03%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9DC23 (DnaJ homolog subfamily C member 10 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Dnajc10 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 1.5e-08 Identity = 51/233 (21.89%), Postives = 101/233 (43.35%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CP18 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) OX=176280 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 6.3e-07 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 43/70 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5HNW7 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 35984 / RP62A) OX=176279 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.1e-06 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 43/70 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7X2Y0 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus aureus (strain Mu3 / ATCC 700698) OX=418127 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.8e-06 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 44/70 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.1 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 702.2 bits (1811), Expect = 4.5e-202 Identity = 359/709 (50.63%), Postives = 487/709 (68.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.2 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 699.1 bits (1803), Expect = 3.8e-201 Identity = 354/700 (50.57%), Postives = 481/700 (68.71%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.4 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 692.2 bits (1785), Expect = 4.7e-199 Identity = 359/724 (49.59%), Postives = 487/724 (67.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.3 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 668.3 bits (1723), Expect = 7.2e-192 Identity = 351/709 (49.51%), Postives = 477/709 (67.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh11G001340 vs. TAIR 10
Match: AT1G24120.1 (ARG1-like 1 ) HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 2.3e-04 Identity = 32/120 (26.67%), Postives = 57/120 (47.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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