CmaCh05G003260 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh05G003260
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Cell wall-associated hydrolase
Location	Cma_Chr05: 1412686 .. 1415615 (-)
RNA-Seq Expression	CmaCh05G003260
Synteny	CmaCh05G003260

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGCGAACAACCCAACCCTTGGAACATACTACAGCCCCAAGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCAATGTGAGCTCTTGGGGAAGATCAACCTGTTATTCCTATATTAACTTTTATCCATTGAGTGACGACCCTTCCACTTGGCACCGTCGGATCACTAAGGCTGACTTTCGTCCCTGCTCGATGGGTGAGTCTTGCAGTCAAGCTCCCTTCTGCCTTTGCACTCGAGGGCCAATCTCCGTCTGGCCCGAAGAAACCTTTGCACGCCTCACGTTTATATTTAAATCCAAGAGTGAAAATAATTTTTTTTTTTAAAAAAAATCGTTTATATTTCTCAACTTTCAAAATTATAATAATTAAAATTCAAATTAATTATTGAAACAATATACACTATAAACTATTATAAACCGAATTCAATTCGCGCAATTTATTAGTAATTTATAATTATTTTTTATTTCATTAAATCTATTTAAAAATTTATTTTTTTCGTAAAATTATAATAGTATATAAAAAATAAAAAAAACAAAATGTGACATGATTTTACAGTAGCAGAAAAAGAGGGAGGAAAAGACGAGAAAAAACCATTCATAATAATTAATACACTTATCTAACCATTTCATGTCATTTATTTGTAAGCTAACATTTAAAAAAAATATCTAAAAAATGTGTATTAATGATATAATTTTTGTATGTTAAACAAGAATATAATATAGTGATTTACTGGTTTGTTATCAAATATGTGATTTCATGGTTTGTTACTAAATTTATGATTTACAATATAATATTTATTATACACATCTCTAAATACACGAGGTCCATAAGTTACAGTGCCATTCGACCTAACAAATACGACTTTTTTTTAATAAAAAACTATGTTTAATAAAATGATTTTAAAAGGTCAAAAGTGATTTTTAATTGCTAATCGAGTATAAATCAATCAATATAAACGTGATCAACTGAGTTTAGGTTTCAACGTCATCCTTCCTCACTAATAATAAAAAAAATAGAGAAAAAACAATGATTTTTATTTAAAACATTATGTGTATATATATATATATATGTGTGATAAAATCAAAGACAAAACTAAATGTGAGGGTAAATGACGGAAAATAAATGCATATATTCTTTTATATAAGTAATTATGATTAGTTATATCTATATAATAGAGGCAATTTTAGCTCTATACTCCAAATTTTATTTTGAAAAATATATTAATAAACAAGTTTATAATAAAAATGAGTTTTTTTTTCACCGTTATTAATTTAAAAATAAAAATGGTTTTTTTAAAATATTCAATTATAAATTTAATTTTTAAAATTTTAAATATATGTCTATTTGTAAATTTAATCGTTAAATTATGATATTTTTGAATTCATTAAATTAATACAAGAAAAGGTGAAAGTTTAAGGTTCTTTAAAAAATTTGAATTAATTAAAAATTTTACGAACAAAAAAATCCAAAATAAAATTTTGGAATAAATTTTATAATTTAAAAAATTGTTGTAAAATACCATTTTTACCCTTCCATTTCTCCCTTTTCCTGTTCTCGCGAACTCCCCCCTTTCTTCATTCTCTTCTGAGTCAGCAGAATCGTCAAGTTTACGCGCCTTCGAAACCGCTTCATTCTGTTCCTTCCAGCTTATCTCGATCAATCGTCCCTTCCTTCCAACATTCTTCGCTTGGCTGCTTCAAGGTTTGTTCATGAATTTTCTTTTTCCTTTGAGATTCTGTCGTGTTAGGGTTGCTGAAATCACGATTAGATTGTTTTTGTGTTATTGTTCCCTATATCTCTCTCACTGTTCCAAAATGTTGTTCCAGAGTCATCTATCACAGATTAATTAGCGTTCAATGTACACGTTCTTCCAGCATGAGAATGGATTGAGGATTTGATGATTGTAATTGCTGTTTTGTTTATTACTTATGCACATTTGTGAAAAACTGGCGTTTATCACTTTATTCTAGGCTGAGTACGGTGGATTTGACCTATGGAAGCTGCAATTCCTTCTCGAAACTCTTTGCAATTCTTCACTTGGTAGTAGTTATTGATTAACCGCCGTGTATTGTATTTTAGCACTATCACATACTGCCAGAGGTTTGATTAATGCCATACAATGAATTTTAATATTCTTTCCGTGATCTTGAAAAAGGAAAAGACTTATCGCTATAACATTCATGGTTGTTGGCCGAATTTCTAAAAGTTGTAATAGTATGAGTAACATTTGTGACATTTTGAGAATTAAGAGAGAGCATTAACATGTCAGATCGCATGATTTTGTTTGTAAATGTTAATCACAGTCCTTTTTCTTTAGCAAACCTGAATCCATTTTTGCATTTCTTCTAAAGCCAGTTGCATTGATTCCATGGTATCCTTTATTTTGCACGATAATCTCAGTAACTTTAGCACCAGCTCTAGATCAAAATTGATGCTCTAATACCAATTGATAGGACTCTGATCTTGCAATAGAAATTGACAGTGAATAACACTGAAATCGTATTGCGCTTGTAATGGCTTGGTCTCTCCCATTGGCCTTATAGACTATGGTATGGATTTCTTTTTGGTTTATAAAAAATCTTCTACTGACGTGAAGTGTCAATTTATTTGACTAAAATGGTTTGGTTTGTGCTATGCAACAAAATGGAATTTCATATGTATTATGATATCCATGGGGCTTTTGTTTTGACTTCATGTGCCATTTATCGTTCATAGAGTTTATATAAACTATTTTTAATACACTTTTTCAATTCAGTTTTCTTTGATGGTAGTAATTTATCATACCTGCCCTCTCACTCTTCTTCTTAATTTCCCATGATGTTTTCATTGGTACTTAGTAGGAATTGGTAAGGCTATAAGCAAAGTTGTCCACAATCATGACAGGGAGTTGATTGAGATTGCTGCACATAGACCCGATCCTTAG

mRNA sequence

ATGGGCGAACAACCCAACCCTTGGAACATACTACAGCCCCAAGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCAATCAGAATCGTCAAGTTTACGCGCCTTCGAAACCGCTTCATTCTGTTCCTTCCAGCTTATCTCGATCAATCGTCCCTTCCTTCCAACATTCTTCGCTTGGCTGCTTCAAGGAATTGGTAAGGCTATAAGCAAAGTTGTCCACAATCATGACAGGGAGTTGATTGAGATTGCTGCACATAGACCCGATCCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGCGAACAACCCAACCCTTGGAACATACTACAGCCCCAAGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCAATCAGAATCGTCAAGTTTACGCGCCTTCGAAACCGCTTCATTCTGTTCCTTCCAGCTTATCTCGATCAATCGTCCCTTCCTTCCAACATTCTTCGCTTGGCTGCTTCAAGGAATTGGTAAGGCTATAAGCAAAGTTGTCCACAATCATGACAGGGAGTTGATTGAGATTGCTGCACATAGACCCGATCCTTAG

Protein sequence

MGEQPNPWNILQPQVAKSRHRGAKPSRQSESSSLRAFETASFCSFQLISINRPFLPTFFAWLLQGIGKAISKVVHNHDRELIEIAAHRPDP

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh05G003260 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh05G003260 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..33

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh05G003260.1	CmaCh05G003260.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0016787	hydrolase activity