CmaCh04G025970 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh04G025970
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr04: 17769086 .. 17777200 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G025970
SyntenyCmaCh04G025970
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CGTTTTGATCATTGCTCCTGCAGCCCATTACCAGAGCCTTGAGAACCTTCCACAACTCATGAACCGTCGTCTTCTTTCTTCCTCTTGCAACTTTCCTCTCCTCCGGCGACCGGAACATTGCCGGCCGACTGCTCCGTCGTTGCCTTGTCCTCATATCACTCAGTTCCATCTCCTTCGGCAACCTCGCGCTACCAAACAGAAACAAGAACCAGCGCGATTTCGTCGGCGACGATTGCAGTATCATCGCTCTCTCCGCCTGTAAGTCGTATTTCTTCAATTTACAGCATCTCTTTCGTTTGATGAACTCCGGATTCTTCGGTAGTGAAATCGAAAACGAATCGAAGTTTTTAACTCCTCTCTTCGTTCTCGCATAAGTGATCTCGCGACCTCTTGCGTCAATCGTAGGCGATTTTCTCGCATCGAACGATTGTGATTTCGTACGAAATTGACGATTCTTTCCGGAAATTTTCTCCGATGCGATTCTTCCTTTGTTTTGTGAATCGCACGGCTGTTTGTAAGGAATCAGTTTCCCGCAGAAGATTATGCTATCAGATCCAGAATATGCTGAATCAGAAACAGAGAAATCGTCGCTGAAAAACTCGAAGAATGTATCTTCGTTGTCGAACGAAGCGCTCTGATCCTGCTTGGAGTAATCATCGCATTTTGATTCATCGCTGTAACCTGGAAGGTCGCATAGCGAGAGAGTTTCTTCCGCTTCTTCATCGTGTGGATACCTATCTTCTGAGAGATCGATGGAGGCATCTTCTTCTCCTCTGTAAGATTCTTTAGCAACTATCATTTCTGAGTTCAGACAAAATGCAAATTCAAGATAAATGATGGAATTCAAATTGAAGAATCATCAATTTCTTATAGGGCATTGCAACAAATTGACAGCGAGAGAGAGAGGGAGTATTTTATTGGTTGTGCTGGCCTTCTAGAAGAACAGACGGAGGCAGATTTTTAAAATACAATGGCGGGTTGAAGACCAAGCCAAGTTCGCCTGATGGGACAAGTTTTCTATAAGGTATTTCCTTTTCTCCTATTTTATTTTATTTTTCTTCCCAACTCGTTGATTTTATTTTGTTAGAATTGTTTTTTGGGGTTAAATTATTGAAAGGAAGAGAATTAATAAATGTTAATTATGGATAAAATATGATTAAATTGATGTTAAATTGCTAATTTCATCTTTAATATTTAAACAATAAGTGAAAAATAAGGATTTAAGCTTCTAATTTCTTAGTTGATGTTGTTTGTCCAAGCTATTTGTGTTACTCTATTGGTAGGGCGGGTTAAAATTTGTGCATTGACTTCTTAAATTTAATTAAATTGTTGCTTTTGTCTTGTATAAATTTATACCCGACCTTAGCTCAATTGGTAGATCGGAGGACTATAGTTTTGATGTAACCAGTTATCCTTAGGTTGCTCGTTTGAATCTGGCAGAATTTTTTAATTATTCTACTTAACATTTGTGCATTGACTTCCTAAATTTAATTAAAATTGTTGTTTTCGTCTAGGACAAGTTCATACTCGACTTTAGCTCAGTTGGTAGAGTTGTAGTTGTATGTAACCAGTTATCTGGCAGGTCGGAAGTTTTAATTATTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTAAATTTAATTAAAATTGTCGATTTTGTCTTGGACAAATTCATACTTGATCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGAGGACTGTAGGTGCGATGTAACCAGTTATCCCTTAAGTCGTTGGTTCGAATTCGACAGGTTGGAAGTTTTAATTGTTCTACTTATAAAATTTCGGCATTGACTTCATAAATTTTTATTAAAATTGTTGCTTTTGTCTTGGACAAATTCATACTCAACCTTAGCTCAGTGGGTAGAGCAGAGGATTGTAGTTATGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTTGCTGGTTCGAATCCGACAGGTCTGATGTTTTAATTGTTCTACATTTGTGCATTGACTTCTTGAATTTAATTTGTGTATTGACTTCCTGAATTTAAATAATCTCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGGTAGTTGTGATGTAACCAATTGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGAAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTTGCTGGTTTGAATCCGGCAGGTCGAAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAATTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGACGTAATCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGATGTAACAAGTTGTTATCCTTAGGTCGTTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAATTAAAATCGATGTTTTTGCCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAACCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGACGTAATCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATCCCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGTGAAGGACTGTAGTTTTGACGTAATCAGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAACTAAAATCGATGTTTTTGTCTTGGACAAATTCATACCCGACCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGATGTAACAAGTTGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCAAATCCGGCAGGTCGGAAGTTTTATAATTGTTCTACTTAAAATTTGTGCATTGACTTCCTGAATTTAATTAAAATCGACGTATTTGTCCACTTAGTTGGTAGAGCAGAGTCCTGCAAGGACCGTAGTTGTGATGATGACACCAGTTATGTTATCCTCTAGTCAAACCTGGCTAAGTTGAAAATTTTAATTACTCTACTTAAAATTTCTGCATTCACTTCCTATATTAAAATTATTCCTTTTGTCTTAGATAGCTTAGCGAATCATTGCTTTAGAAAACTCTACTTTTATCGAATACGCAAATGAATTGTGTTCTAAAACTCAATTGTTTGGAGCAAATTTATGACATCAGTTCAGCCATCTCATTGGCGTTCAACTCAGTGAAAAAAGAAAAGAAAAATCTCTCACGCAATTACAAGTTTTTAAAAGCCGACTCCTGTTGCTGAGGAGTCAGTCTGGCCAACAATGCCTTGTTCTGGCAGTGCTCCTGGTCTACAAAGTAGAAGCTCCCATTAGCCTTGAATGTCACAAAAGGACGATTGGTTTCGGGTGGTCGAATATCTGCAAATCGGATTGTTCGAGGAATGTAAGTTGCCAGCCACGACATAATCTCTACCTCGAAACTGTCTGAACCTGGTTTCCATCTAATTTTATGAACGTAAGGGCTCACGAACCAGTGAAGCACCCCGGTGGTGGTAGCGCTGAAGAATATCACAGATGAAGCAACAGCACCTTTCAGGATGACATTCATGTCAGGGGATGTCATGAAGGTTATGACCGGGCCAAGCGACACGGAGAGGCAGCATGTAGATAGAGATAGAAGCTTAACTTTCTTGATGGTAGATGAGATTGGTCCGACATAAGCAACATCTTTTTCATCTTCCTCAGCTTCTTGTCCTCTGCGTGGTCCAATGCTGATCTTGCTTTCATCCTCTCTTGTTGTAGCTTGAGATGCCCATCTCTTCTGAACTGCACTCAGACGCGAAACAAAGCTGCTCGTGCGTCCACAAGTTTTATCGATCAATGCAGATGAACTTTGGAGATGATAACCTGATGCAAAAGAAAACTTACTAATGAGGGTGATAAAGCTCTGTTATAGATTCTAAATTTTCTTGTTTTTGGTAATATCATGTCAAGAAGAACCTTGAACCAGAACAGGTCAGTGAAGCAAATCCAACATAATTAATAAATAAGAGATGGACTGTTAAAGGATAGATATCAACAAGAATTCCTGTGCAGAAACTGCTGTAGATTGAAACAGACAACAAGCAAAGTTAATAGACTACGAACCCACAGAGAAGATAATATCGACCTCGGAGAATTGTTTTCACCTACCTCGCCTCACCTCCTTCTAGACATCGATAGGCTGCTTATAAGTTGAGTTAAAAAACCATCATTATTTCAACGAACATTTGGTGAAACATCTCAATATTAAATTGAAGATTACGG

mRNA sequence

CGTTTTGATCATTGCTCCTGCAGCCCATTACCAGAGCCTTGAGAACCTTCCACAACTCATGAACCGTCGTCTTCTTTCTTCCTCTTGCAACTTTCCTCTCCTCCGGCGACCGGAACATTGCCGGCCGACTGCTCCGTCGTTGCCTTGTCCTCATATCACTCAGTTCCATCTCCTTCGGCAACCTCGCGCTACCAAACAGAAACAAGAACCAGCGCGATTTCGTCGGCGACGATTGCAGTATCATCGCTCTCTCCGCCTGTAAGTCGTATTTCTTCAATTTACAGCATCTCTTTCGTTTGATGAACTCCGGATTCTTCGGTAGTGAAATCGAAAACGAATCGAAGTTTTTAACTCCTCTCTTCGTTCTCGCATAAGTGATCTCGCGACCTCTTGCGTCAATCGTAGGCGATTTTCTCGCATCGAACGATTGTGATTTCGTACGAAATTGACGATTCTTTCCGGAAATTTTCTCCGATGCGATTCTTCCTTTGTTTTGTGAATCGCACGGCTGTTTGTAAGGAATCAGTTTCCCGCAGAAGATTATGCTATCAGATCCAGAATATGCTGAATCAGAAACAGAGAAATCGTCGCTGAAAAACTCGAAGAATGTATCTTCGTTGTCGAACGAAGCGCTCTGATCCTGCTTGGAGTAATCATCGCATTTTGATTCATCGCTGTAACCTGGAAGGTCGCATAGCGAGAGAGTTTCTTCCGCTTCTTCATCGTGTGGATACCTATCTTCTGAGAGATCGATGGAGGCATCTTCTTCTCCTCTGGCATTGCAACAAATTGACAGCGAGAGAGAGAGGGAGTATTTTATTGGTTGTGCTGGCCTTCTAGAAGAACAGACGGAGGCAGATTTTTAAAATACAATGGCGGGTTGAAGACCAAGCCAAGTTCGCCTGATGGGACAAGTTTTCTATAAGTTCAGCCATCTCATTGGCGTTCAACTCAGTGAAAAAAGAAAAGAAAAATCTCTCACGCAATTACAAGTTTTTAAAAGCCGACTCCTGTTGCTGAGGAGTCAGTCTGGCCAACAATGCCTTGTTCTGGCAGTGCTCCTGGTCTACAAAGTAGAAGCTCCCATTAGCCTTGAATGTCACAAAAGGACGATTGGTTTCGGGTGGTCGAATATCTGCAAATCGGATTGTTCGAGGAATCTTGAGATGCCCATCTCTTCTGAACTGCACTCAGACGCGAAACAAAGCTGCTCGTGCGTCCACAAGTTTTATCGATCAATGCAGATGAACTTTGGAGATGATAACCTGATGCAAAAGAAAACTTACTAATGAGGGTGATAAAGCTCTGTTATAGATTCTAAATTTTCTTGTTTTTGGTAATATCATGTCAAGAAGAACCTTGAACCAGAACAGGTCAGTGAAGCAAATCCAACATAATTAATAAATAAGAGATGGACTGTTAAAGGATAGATATCAACAAGAATTCCTGTGCAGAAACTGCTGTAGATTGAAACAGACAACAAGCAAAGTTAATAGACTACGAACCCACAGAGAAGATAATATCGACCTCGGAGAATTGTTTTCACCTACCTCGCCTCACCTCCTTCTAGACATCGATAGGCTGCTTATAAGTTGAGTTAAAAAACCATCATTATTTCAACGAACATTTGGTGAAACATCTCAATATTAAATTGAAGATTACGG

Coding sequence (CDS)

ATGGGACAAGTTTTCTATAAGTTCAGCCATCTCATTGGCGTTCAACTCAGTGAAAAAAGAAAAGAAAAATCTCTCACGCAATTACAAGTTTTTAAAAGCCGACTCCTGTTGCTGAGGAGTCAGTCTGGCCAACAATGCCTTGTTCTGGCAGTGCTCCTGGTCTACAAAGTAGAAGCTCCCATTAGCCTTGAATGTCACAAAAGGACGATTGGTTTCGGGTGGTCGAATATCTGCAAATCGGATTGTTCGAGGAATCTTGAGATGCCCATCTCTTCTGAACTGCACTCAGACGCGAAACAAAGCTGCTCGTGCGTCCACAAGTTTTATCGATCAATGCAGATGAACTTTGGAGATGATAACCTGATGCAAAAGAAAACTTACTAA

Protein sequence

MGQVFYKFSHLIGVQLSEKRKEKSLTQLQVFKSRLLLLRSQSGQQCLVLAVLLVYKVEAPISLECHKRTIGFGWSNICKSDCSRNLEMPISSELHSDAKQSCSCVHKFYRSMQMNFGDDNLMQKKTY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh04G025970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh04G025970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh04G025970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh04G025970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh04G025970.1CmaCh04G025970.1mRNA