CmaCh04G019310 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh04G019310
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr04: 10484571 .. 10500813 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G019310
SyntenyCmaCh04G019310
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

ATGAAACTTGAGGTATTTCTCATCTTCCCCTCTGGCTATTGTAGAAGCACTATGACAGATAAATGCACAACTCTCATTGCATATGCATCTTCTGCAGCTCCATTACCATGTTCAAAAGGGTGTCGAGAACGGCGAGAGCCAACAAAGTCGAGTCCAAGCCACTGCCATGGCCAACAAACGTATCTACTCCCATTTAATCCTCTTCTCGAATCTTCTCGTTTATCGAGCTCTTCAAGCTGTCGGGTAAGCTCTTCCACCCTCTCCCTCAACCTGGACACCCTCACGTCCGCCAGTCTCAATGATTTCTCCGCCGCATCTCTGGCTGCCATAGCGGCATTTACTATTATAAACAATGCTCCCAACCCTGTGCCAGACAAGTTAGAAGCAAGCATACCTGTGCCAGAAACTCTTGCTCTACAGCTTTGCCAGCAGCCGCTTCTTGCTCTGCAGCTACCTTCCATCTCATGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAACTTGAGGTATTTCTCATCTTCCCCTCTGGCTATTGTAGAAGCACTATGACAGATAAATGCACAACTCTCATTGCATATGCATCTTCTGCAGCTCCATTACCATGTTCAAAAGGGTGTCGAGAACGGCGAGAGCCAACAAAGTCGAGTCCAAGCCACTGCCATGGCCAACAAACGTATCTACTCCCATTTAATCCTCTTCTCGAATCTTCTCGTTTATCGAGCTCTTCAAGCTGTCGGGTAAGCTCTTCCACCCTCTCCCTCAACCTGGACACCCTCACGTCCGCCAGTCTCAATGATTTCTCCGCCGCATCTCTGGCTGCCATAGCGGCATTTACTATTATAAACAATGCTCCCAACCCTGTGCCAGACAAGTTAGAAGCAAGCATACCTGTGCCAGAAACTCTTGCTCTACAGCTTTGCCAGCAGCCGCTTCTTGCTCTGCAGCTACCTTCCATCTCATGA

Protein sequence

MKLEVFLIFPSGYCRSTMTDKCTTLIAYASSAAPLPCSKGCRERREPTKSSPSHCHGQQTYLLPFNPLLESSRLSSSSSCRVSSSTLSLNLDTLTSASLNDFSAASLAAIAAFTIINNAPNPVPDKLEASIPVPETLALQLCQQPLLALQLPSIS
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh04G019310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P2ILC0 (Uncharacterized protein OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 3.6e-13
Identity = 52/71 (73.24%), Postives = 57/71 (80.28%), Query Frame = 0 

Query: 45  REPTKSSPSHCHGQQTYLLPFNPLLESSRLSSSSSCRVSSSTLSLNLDTLTSASLNDFSA 104
           R PTKSSPSHCHGQ TYL PF P  ES R+SSSSS  +SSSTLSL+L  L SA+LNDFSA
Sbjct: 24  RMPTKSSPSHCHGQHTYLGPFRP-CESPRVSSSSSWWLSSSTLSLSLVALKSANLNDFSA 83

Query: 105 ASLAAIAAFTI 116
           ASLAAIAA  +
Sbjct: 84  ASLAAIAAVAV 93

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh04G019310 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh04G019310 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A2P2ILC03.6e-1373.24Uncharacterized protein OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CmaCh04G019310 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh04G019310 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh04G019310.1CmaCh04G019310.1mRNA