CmaCh03G002790 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh03G002790
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr03: 3746148 .. 3750047 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh03G002790
SyntenyCmaCh03G002790
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTTGTTAGTTGTAACTGTGTTATTACAAATCCCAACATGTTTAGCGAATGTTTCTGATACAATGTTTAGAAAAGTGGTCTATGAAGAGAGTTCAACTCAGTATATATATATATGAATCGAAAATCGTGTTAGTAGAGATATCTATGTGATAGGAAATTGGGTAGGATCAAAGTCGGCTAACATAATCTCCGTCCTCAATCCCATTTAGCTAAGGAGGAGAAATGATAAAATTCTCCTTTTAGGGTCAGAGACGGCTAACATATTCCAATTCTCTATGTGGTTGGAAATTGGATAGGGTCGAAGATGGCTAACATAATCCCCGTCCTCAATCCCATTTAACTAATGAGGAGAAAATAAAAAAATTCTCATTTCAAGCTAACATAATCTCCATTAGGAAATTCTCCATGTGGCAGGAAATTGGATAGGGTCAGAGACGGCTAACATAATCCCCGTCTCAATCCTGTTTAGCTAATGAGGAGAAAATGAGAAAATAATTATCCTTTTAGTCTATATATATACTAACAAATTGGCGAGCCGAGTATTAGTAGAGATATCCATGTGGTAGGAAATTGGATAGGGTTGGGGACGGTTAACTAATCCCCGTCCTCAATTCAAATTAGCTAATGAGGAGAAAATGAGAAAATTCGAAAAAATTCTCTTTATCTCTCTCCATTCTCCGTTTAAACAAACATTTCTTGTCCAGTCATGAGCAAGACAAACAACAACATTTTACATTACAGAAGGTTCTCAAGCTCTAGCTATTCGAGAAGAACAACAACATTTACATTACAGAAAGGTCAAAGTTACTAACTTCTAGAAGACAACCAACAACAAGAACTACATTTACAAGCAAGAAGCTCAAGCTAACCTAACGTCTAGAACAACAACATGAATTACATACTGATTATCTGTTCATAAAAATTTAAATTAAAAGTTCCAATAGAAAAATGAAATTTTCCTTCAAAAATATATATTTTTTTTTAATCCCCAAATATTGAAATTGGTATCTAATATATATTTTAACTTTTAATTTATTTTTGTAATAGGTAATTGAACCTTCACTAGGCTACCAATTTAGAAATTTAATAATTCACATATAATTTAATTTTATGTGTAATATATCTTTTAATTATATATATATATATAATTTGAATGACAAAATTAATGCAGTTGATCTTTTTTATACGTAATTAAAATACATAAATTGACTCATTTATAGCCATTAAATTGGTATAGTTGACTTAAAATTAAATGAGAAAATATCTCATCACGAAAAAAAAAAAAAGAATAAAAAGAATAAATAGTCTAATTTTGATGATCAACATTTTTTAATTTAATTCTTAGATTTTAGAATGGTAGCATTGTTTCTATTAGATTCAAAGTTTTCAGATTTACACTTTTATCCTTGTTCTTTTTACTAATTACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTANTTAATTTTAAAATAATATTACTAATTTTTCATCAATATTAAAATTAATTTAAAATGTTATATCATAATTATTTTTAATTAATTAATTAAAAGTTAAAACTTATAAGCTAATAGCTAAATTTCAAAACTAGAATCGCTTAAATTTTTGTTTTTAATAAAAGTAAAATATTGATTTGTTCGAATTTTAATTAAAATAGTTAATTAATGTTATAAATATTAAAAAATAACTATAAAATTAAATAAATATATGCATGAAAAAAATATATTTTAAAATTAAAAATAAATTCATATGAAAAATTTATGAAATTTTTATTACTTAATTTTTTTTAACCCTCCTAAGAAAAAAATAGTTAAAAATAAAAATAAAAAAAGAAGTAAATGGGACAAATTCGGAATATTCTTTTTCTATATTATTCCGTTGACTAAATACAAAACACAAAATGGGACTCAAAAGTTGGATCAAAACAGTGTGCTGTTTTCCTCTCTCTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTAATATTTCCAATTCTAGGTTTTTTCTTTAAATTAATTAATTTAAATTATAATAATTCTTCCTAATCCATATTTAAAGTTTGAATATATTTCTAAATTAAATTTGGTATTTAATATATTTAATTTTTAAATTAATTTATTTGCTCCTTACTAAAATTTGAATTCTATATTTGATATATTCATAAATTCTATAAAAAAAATTATAATAAAACAGGAGGCTATTCGTTGGATAATTATTATTTTTTAAATTAAATTTATGAAGAACACTTTTAAAAATGTTTTCAAATTTGTTTTTATTTTTAGAATTTAGATTCCAATTCAAATGCTCCCATTAAAAAAAATAAAAATATGATAAATAATAGTTACAAAATAAACCTTTTTTTTTTTAATATAATATGTTTTAATTTGAAGTCCAATATATTTGAAATATATCGATTAAATTATAAATTTATTTTAATATAATATGTTTTAATTTAAATTAAAAAAATTCGATAATATTATTAAGCTAAAGTATACTCATATTCAATTTAATATAACACGATAGATGATTAGTATATATAGTAATTTAATTTAAATTTATATCATGAGTAAAAATTGAGGGACATAATTGAAATATTTGAAAGTATAGGGACTAAATCATAAATATTATATAAATTTTTTAAGGGGGTTATTTTTGTCCCAAATTAAGATCGGCGGTGAGGTGAAGTTTCCTATTATTCCACCAACCACCTTACGAAGAAAACCGCTCTTTTTCTCATTCGCCCAAAGTTTGAAGTCTGGGGAGCGCCATTTTTTGTTCTTCATTTCTCCAATTCTTCAATGTAAGTTCGATTTCCCCTTCCTTTCTTTTCAATTTTTCGTCTTTGATTCATCTGTAATTTCCATGTCTGTTTTTGTTTCAATTTCAACTTGTTAGGGTTCTGTTTGCATTTGTATACATTGCCTTCAATTTCATTCAAGAATGCGTTTCTTCCCTTCTTTATTTTTCTGGTCATTCTTTAAAGGAATTGTTGCAATTTCGTCTTAAATTTCTTGAAATGCCTATATTGGTGTTGGGAAATTCTGTTTGGTGGGTTTGATCATGGAATTGGTTGATTCTAGCGTTGTTTCATGATGGGATTGTTGTTGACTTTGTGGTTAGCGTCCATTGCTTATCCTCTGTAAATCATTTCTTTTTGTATTTTGTGGAAGGGATTTTCGATGGATGGTTATTGTCCTTCGCGTTGTCCCCCGCATTTTCGTTGTGTTATTTAATTTTTATTTTGGAGAAGGTTTTTGCGAATTTGTATAAGTCTGTTGATGTAAAGTTCAGTAATATTGCATGGACGATTGGATTGGCTACCTTTTAGGTGAATCTATCTCAACACCTCTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGATTGCCCTGCTTTCTTTATCTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAATTGGATCTGCTAATAGTATCTCTTATGATTTAGAAATACGAATACCATTCATGGTGCGTCTGTTTTGATGTATGTACTCAACCTGCATCTCGGTTGACACTCTGTGAAAGTGAAGAGCATAAACACCATGGTTCTATTGTTGAGAAATTTTGTATTTTTTTCTCATTTTTGGTAGATAATGTTGTAACAAACTTTTTATTCTTATGATCATTCTTTGATTCACAGCATAGCTGAAAGGCGTCTCCCTAGCGTTAATCTAACAAGAGAAGGTGGTTTTTAAAATTTTGAAGTGAAGGATGCATGCAGCTCCTGGAAGTTTTATGCTATAAGCTCCTTGACTAGGAAACAGTGTCTAATGCTCTTTTAGGATTGTGGTGAAGTAGTAAAGACCGTTCTATCTGGTGCTTGGGAGATTGGGCAAATTTGTGTTCCTAATTTTCTCCGTGAGAAGATTACTGTTCATCCGTCTAATTCATGA

mRNA sequence

ATGCTTGTTAGTTGTAACTGTGTTATTACAAATCCCAACATGTTTAGCGAATTCTGGGGAGCGCCATTTTTTGTTCTTCATTTCTCCAATTCTTCAATCATAGCTGAAAGGCGTCTCCCTAGCGTTAATCTAACAAGAGAAGTAGTAAAGACCGTTCTATCTGGTGCTTGGGAGATTGGGCAAATTTGTGTTCCTAATTTTCTCCGTGAGAAGATTACTGTTCATCCGTCTAATTCATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTGTTAGTTGTAACTGTGTTATTACAAATCCCAACATGTTTAGCGAATTCTGGGGAGCGCCATTTTTTGTTCTTCATTTCTCCAATTCTTCAATCATAGCTGAAAGGCGTCTCCCTAGCGTTAATCTAACAAGAGAAGTAGTAAAGACCGTTCTATCTGGTGCTTGGGAGATTGGGCAAATTTGTGTTCCTAATTTTCTCCGTGAGAAGATTACTGTTCATCCGTCTAATTCATGA

Protein sequence

MLVSCNCVITNPNMFSEFWGAPFFVLHFSNSSIIAERRLPSVNLTREVVKTVLSGAWEIGQICVPNFLREKITVHPSNS
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh03G002790 vs. NCBI nr
Match: KAG7033702.1 (hypothetical protein SDJN02_03427, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.6e-09
Identity = 32/33 (96.97%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 47 EVVKTVLSGAWEIGQICVPNFLREKITVHPSNS 80
          EVVKTVLSGAWEIGQICVPN+LREKITVHPSNS
Sbjct: 27 EVVKTVLSGAWEIGQICVPNYLREKITVHPSNS 59

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh03G002790 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh03G002790 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh03G002790 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7033702.12.6e-0996.97hypothetical protein SDJN02_03427, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of CmaCh03G002790 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh03G002790.1CmaCh03G002790.1mRNA