CmaCh01G016050 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh01G016050
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr01: 11063640 .. 11066982 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G016050
SyntenyCmaCh01G016050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGTATAGTGAAATTTGTAATTTGTGTAGCTGTAACAGAAGTGTAGAGAACTGGAATAGTGATTCTCGTTGTCTTCGAATAAACTCAAGTATGCGATTAGCCCGGATTCCTGTAAGCTCGTGCTTAAGCTATCGAAATATTTCTCTATCTTGCTTGCCTTTAGATGCCTAACTCTGCGTGCATTCATGCGTGGAGTTCAGCTACCGTTAATTTGATTGCTTTTTATGGGCTTAACGACACGTGGAGTTTGAAAATTTGAACTTTTAGCTTATTGATCGAAAGTATATGTTTAATTCATTGAACGAAAGAAAAACATCTTGGGCACGTAAAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGCATCAGATTCCATTTTCAGACCACTAAAGAAAGTCAACACTTAAATTATCTTTTTTTTTTTATTTCTATTTTCTTGCTTTATTATCTCTGTTTATATGCTACAAACTTTAAGCATAATGGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGCATCAGATTCCATTTTCAGACCACTAAAGAAAGTCAACACTTAAATTATCTTTTTTTTTTTATTTCTATTTTCTTGCTTTATTATCTCTGTTTATATGCTACAAACTTTAAGCATAATGGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGCATCAGATTCCATTTTCAGACCACTAAAGAAAGTCAACACTTAAATTATCTTTTTTTTTTTATTTCTATTTTCTTGCTTTATTATCTCTGTTTATATGCTACAAACTTTAAGCATAATGGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGCATCAGATTCCATTTTCAGACCACTAAAGAAAGTCAACACTTAAATTATCTTTTTTTTTTTATTTCTATTTTCTTGCTTTATTATCTCTGTTTATATGCTACAAACTTTAAGCATAATGGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAAATCAATCAATTTGACTTTTTAAATTCTTAAATATTCTTTCTCATCTCCACCCGCTACTTAATCAATGTAACCCGAGAATAAGATCGTTAGAAATGAAATATTTTAAAATTTAAAATTTAAAATTTAATATAGATGCTTATGATGAGATTATTGTCGAATTAGATTCAGGATTTTGATATATTAGAATAAATGTAAGTATAATACAATCGAGAATTGAGAATAAAATTTCAACGAGAATATAGATACAAGTTTATACCACTTCTCGAGAGTGAAATTCAAATATTTATTTATTTATTTATTATTATTATTATTATTTAATTTTTGGAAAGTTCGAAAAAAGAAAATTCATAATTAATTGGACCAAAAAGTTAGAGACATAAAATAAAATAAAAAGTGGTAAAATTATAACCTAAAAGAATATAAAAGGACTTAAGGTTTCAGATTTATGAATCAACCACAAAATTGTAGCTCAAGCTTTGACTCGGTCAACTTGACCGTCTAGTCAATTCTCCCCTTTCACGCGCTTTTGATTATTTGCCCAATTGTTTCTAAATTTATTAGTTATTAATTTTAAAAAATATATTTAATTATTAATTATTCTATTTTGTAAAAAAGTAATTTATAAAATTTATTCACACAAAATTAAAAATATTATAATTTTATTAAATAAAAAAAATAAATACTACAATTTATTAAATAAAAAATTTTAAGTTTAAATATGGATCATTAAAGTTTAAAATTAAATAAATATAAACCGGGTTTGCTTCAATTTATTTATTTATTCTTTTTACGAATACGTGGATGTCGGGATTTAAACTAGCAACTTTTGTTCGATGATAAATATCACAACGAGTTGAGTTATACTTATATTGACACTTGTTTATTATTTAGTCCCTCAAATTTAATTAAATTTCATATATTCTAAGTTTTCGTCGCTCAATAAAGCTATTATTCATTACGTAAACATAATGTTTTTTTCTTTATAGTTGTTTAGGTAGTTCCCCATTTTAATATTAGTTTGACGGTATGAATTAAACAATTACACCTTATATTATATAATTAATCAATTACTTATTAATTTATTTATTTTAAATAAATTTTATAGAATTTTCATTTTTCAATATAATTTATATTAAAACATATAAAATAACGGAATAAATCAAATAATATTTTATAAGTAAAACTCAAATTTTAATATTACAACGTAGTTTTCCATATGTATGTATACTTATATTTAAAAACTACGGTTGGACAAGGATTGAGAATATAATCTTTATCTCCGACCCCATTTAGCTAACAAAGAGAAACCTCTCTTAATTTTTCGAGAATTTTGCATCCCATTAGGGGTGTATCCCTAGCCCTACAAGTTTAATGGACCGCTCATGTTTATGGACTAAACATATCATTTAACTCGCATAAATATAAAAAATGAACAAAATATTTTTACAAAGAGTGTGAAAATCTCTCCTTAATAGACGAGTTTTAAAAACGATGAGGGAAAACTCAAAAGATACAATATCGGCTAGCGGTGAGCTTAAACCATTACAAATGGTAAAAGAGTGAGATATCATGCGGTGCCAGCGAGAATGCTGGACTCCACCTCGGACCTGGGCAAATCTCGGAAAATCCGAAATGATTTTATAAATTTAATGGTGAAAAAAATGGTGGAATAAATATTGAAATAAAATAAATAAAGTCAACAGAGCCTTTTCTTTATACCATTTTTTCTTTTTTCTTTTTTAGATAAAAATATTTAAAACAAATAATTTTTAATAATTTTAATAACTTTAGTCATGCATTTGCTGAGTCAGCTTAGACTTCCAAAACGGTTGCAAATCATGGCAATGGAACGATGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGCTTTGTTATTTATTAAATTTTAATTTTTTTAATTATTTAATTTTTAATTTTGATTTTCAGAGAAAAGCTTACAAAATATGTTCCTACTCCTTTTCTCTCTCCTTCTCGCATCATTCAACCAATTAAGAACCAACTGAAGCAATACACAGCAACAAGAAGAACCTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGACGAAGAAGGTGCGAAACCTTAAACCATTTTTTTCCTCTTTGTTCTTGAGCTTTAATCTGATCGTTCATGGGAGATTTCAGCCACTCAGGTACCGTTTTTCATCATCCTTTTGACTATTTTCTTGGTTTTCTAGAGGCTTTTAGGGCATCGTTCCTTATGGATTATTATGAATCGTTATTGAGTTCGTAAATTGATGGCGCAGTTGGTGAATTCTGGAGGTGGATTTGATTGGAATTGGGGTTTTTGGGTTGATTTGGTGGAGATGACTCTGTACGAGGGATAG

mRNA sequence

ATGCTGTATAGTGAAATTTGTAATTTGTGTAGCTGTAACAGAAGTGTAGAGAACTGGAATAGTGATTCTCGTTGTCTTCGAATAAACTCAAGTATGCGATTAGCCCGGATTCCTCAACAAGAAGAACCTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGACGAAGAAGCCACTCAGTTGGTGAATTCTGGAGGTGGATTTGATTGGAATTGGGGTTTTTGGGTTGATTTGGTGGAGATGACTCTGTACGAGGGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTGTATAGTGAAATTTGTAATTTGTGTAGCTGTAACAGAAGTGTAGAGAACTGGAATAGTGATTCTCGTTGTCTTCGAATAAACTCAAGTATGCGATTAGCCCGGATTCCTCAACAAGAAGAACCTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGACGAAGAAGCCACTCAGTTGGTGAATTCTGGAGGTGGATTTGATTGGAATTGGGGTTTTTGGGTTGATTTGGTGGAGATGACTCTGTACGAGGGATAG

Protein sequence

MLYSEICNLCSCNRSVENWNSDSRCLRINSSMRLARIPQQEEPEEEEEEEEDEEATQLVNSGGGFDWNWGFWVDLVEMTLYEG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 36..62
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 41..56

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh01G016050.1CmaCh01G016050.1mRNA