CmaCh01G006390 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh01G006390
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr01: 3327571 .. 3332803 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G006390
SyntenyCmaCh01G006390
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATCGTTCCTCTGAAGATGGCAAAACAAAGAATGTTGGTCTTGAGAACCGTGGGAAAAAGCATTAAATTTGCAGCTCTTCTCATCAGACTCATGGATTCCGTTTTACTGGAGCCAATTTTGTTTCCTTGGTATTATTGCATCTAGTGATATAGGTGATTCCCTTATGCCTCTTTTCTTCATTTGGGTGGTTTATTCTAGTTTTGTTATTTCAGGTTGCTGCCATATACAAAGATGGTTTTTGGGGATGAAGTTCTGTGGCAGTTAAGTTTCTTGGTTTTGTCTCTTGATTATAATATTTGGCTCTGACATGGTTCATGTAGACATCAACAGTATGTAGTAGAAGTTTGGTATATGGCTATCACTTCATTGTGTTCATTGTTATGTTTACATGTTCTTTTCATCTTCCGACATTTAAATGCCATTTCATCTGAAACCGCAATGTTCCTTTAATCAACATCATCGCAAACATATTTTTTTTTTCTCACTTTAATTTTGCTTTCGGTGTTGAAACTGAATAAAGTCGTCTCCTAACCAAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAATAAATAAAAAAAATAAAAGAAACTAGATTACGTTCTGTCCTTGTGGGTCCTTGGCATTAGGGTAAGTGATTCTTGTTGTCTGGAAAAGAGTCCTAAATAAGACTGTTCTGATACAACTCTTCATGTCCTGCATACCAGGAATGCCTTGTTCAAACCAAATTTTCATTAGTAAAGTGTTTTTGATAATCTTCTTTTGTTCAGTTTTCCCCTTTTTCCTACCTTTTGTTCAATATTTGGGATGTCTTTTCATTGTTAGTTTAAAATGGTGGAAAGAAGAACTGGGGAGTCTAACAGCTGAGGTGTCTTTCTTCATAAGCTGAGGTGTCTTTTATGTCTTTCTTCATACAAGAAGAGGCATCTTTGAGGTTGGTTAACCTGAGGAGTGTATAGGGCTATTTACAAATTGCCAAGTCCATGAATAAAGATTGAGCTTATTGTAAAGCATGCTTCTAAACTGTGTAACGTGTATCATTTTAACCATTTTTCTTTTGTTTACTTATTTAATTATAGGGTGTATGGGTTTCTTATCCAAAATAATTGAATTATAGGGGGTATGACCAGTTTTAAGTTTAGAGGAGAGACATGTTCTCAATGAGGATAAATATAACACACTAATTTGTTTTGGAAGTACGAGCATTCGCCCTTGGCCCTGTAGACATTTGCACTACTGTGTTTTGGTGGATTAGAGCTGACATCGGAGTGTGGTATGAATGGATTAAATTACATCAAAAGGAATTTCTGTGAGAGTTACATATTTAGAAAATTTAGAAGCTGATGTTGTTCATACTGAAGGGATAAATGTAGGCAGATATCCAAGAAGAAGACATAGGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTAAAAATAGAAATGATGTATTAGTCACAAAAAAGGATCAATCACTTTGGGGCCGAGTAGAGAAAACCACTAACCCAAGACTACAAAAGATTACAAAAGAAGAGCCTTCTAGTTATTAATGATCACATGAAAACTATTAGTACAAAATAATTTCTCAAGGCTAGAGCACCACCAAGGAGTCGTATGCTGTACACTAACTAGAAAAAGAATTCTACGAAGTTGACTTTTCTTAAAAAAAAAAACCTCTTGTTTCTTTTCTTCCAAATATGCCAAAGGAGGGCTATAACCATGCAATTCCAAGATCTTTGCTACGCTTTTGAAAAACGTACCTCCAAGAACACATATTATTGCCCTCTTTTCATTATCAAGGATAACATTTTTTAGGGAAAGAAAGATTCACATATATAATAAATTTAATCGAGTTATTCAAGATTGCACATGGAGAAAAGCTTGCTATAGGAAGTCTGTTAGTATTACAATACTTGTTGAAATTACTTGTTAGATACAATATTGTCTTCTTATGTATGTGAACTATAGCCGACAGTATTATGTCATAATTGGTGGTCGTAAAAGAAGAAAGGATATTATGACTTTTATGAGAATTGACCTACTTTAGTTTGTACTTGACCTACATGCCTCCGATTCACTTGTCCAATAGAAAGTAAAAACTGTTTTTTGTTTTTCCCTTAAGTACGGGATGGCTTTGTTTAAGATTTTATTGTTGAAATTCATTACCATTTCCAATTTTATGTTCCTAGTGAAGATCTGATCATTATTCCGTCACACTTATTTAAGCTTCCAAGGTCAATATTTAGAGTTGATTTTCTATTTTTTATTTTTTTGGTGATTTTTTTTTTTAATAATAGATCTTTCAATTTGACCTGTTTTCTGGGCGAAGCAGACTACCAAAATTCTGAAAGTTCAGTGGCAAGGTTTATCAAGTCATCTTTGTTCGAGGTGGTAAGAATGTGTTTGATGAAAAGGTGCATTAGTTGCAAATCTCTTTGCTGCATTTTTATTTATTAATCTTAAACTGATATTAAAATTCTGCTTCTTGCACCATTGACGGTTTCTTCACATTGATGTCATTAACTTTAGGTTTCAGCCACAAGTTTTATCAAGTAGAGGAACCCGTGGAGCTTAGAAACTTATTTTGTTCTTCGTTGAGCATCATGTAATGCTGCCCCGTCTATAACTCTCAGCATACTGTTGTCAAAAGCTTGTGTTTTAACGCAATCAGTTTCTTTTAAATGCTTGATTTTGTGGCCAAGGAAACTGAAGTAAAGGAGCGAGGGAAGATAATCCTCCCAACTTAAAGCTGAAGGAGTTAACGGATAGTACATCAATAAAAGGGATGTTAGTTTACACAGGAGTCCTGGAAATGTACACCAGGAATAACATAAAAATATACACAGACTCCCCACATTTCTTCTGAATCCATAGCCTTATCCTAAAAAATTGTTTTGTTTCTGACTAAACAAGCCAAAAGACTGCATAGGTGTGACTTTACCATTAGATTGGAAAGACGATCATACACCAATTGCTCTTAGAGATATCCTAAGAACCAGCTGATTCATTCATTTCTGTATTTAATCTCAAGGAACAGAGAATCTATTGAATAATTTGTTTAGTGAAAAGCTACAACCAAAATCTATGTATTCCCTATAGGAGTTCACCAGAATTCTAGGATCTCTTCCCAGCTGCCATTCATTTTCCATAAAATAGCCTTCAATATTTTGTAGGCGTAGTCTTCGTTCTCCATGTTCGATATATTTTCTCTTCTTTTACCTCTTTGTTCTTCTGTTTCTGCTCCTCTGCTTCTGCTTTTCTCTGCTTTCATACAAAGTCTCACCCCTACTCCACTTCCCTCGCTCCTACTCCACTTGATTAGAGCACCAATGATTTGTTTCTGTAAAAATCACTTCTAAGTGTGCTTTGGCTTTTCTTAGAGGTGCTTTCAAATTGTAGTCAAACACAAACACTCAGGGTAGGATACGTTTTTAATGCTTACAAGTACCTTTTCCATGGTTAAAAGCAAAATGGACCCGATCCCCTATTCTCCAGCATTACTGTGTCTCTAAGCTCTTCATATTCCAAATTGGTTGGTTCCCTTTTGCCAAAAATTTACAAACACAAACACTTTCTGCCGCAAATTATTGTCAAATGCAAACACTTGAGGTAGGACGCTTTTATATACTTTTTTTTTAAAAAACTTTTTTGGTCAATGCTTTTAACCACTTAAAAGTACTTTTTACATGGTTGAAAGCACTTCAAATGAACCCTTCCTCATTCAAACGATCTTAACATTCTTTATTCAATTTATGATGCTTTGGACCAAACAAAGAAGTTTGTTACTAGAAGAAATCTCAGGAGGAAATTCAGGAATATAGTTCCTTGCTTTGCTGGAAGGTTTAATGTTTTCCTAGTAGTACAAGAAGTTAAAGAGTATTTCAGGTGTATTCTCGGTGCTTTCTTAGTCACTAAGTGCCTTCTCTTATGTTATCCAAGTCTTTCAGTAAGGTCTTGCTGGAAGTCTAGAATTCTGAAGAAGTTCGATGTGTTTATTTGGATCTTACTAAAGGGTGGCGTAGATAGAACTGAAAATTTATAAATGAAAGTGACTTTGCTTGCTTTACAAGCAGCTGTTGGTGCGCTGTTTATGAAAGTTGATAGATAGTATAGATCAGAATCGTATCATATTTTCATTGCTCGTAATTCCGGAAATGTGGCAGCACTTATGTAATTGTTTTCAAGTTTCTGGGGTGTTTGACAAATGTTCACTAAACAAAATCTTGCGACCTCTCATAGAGAAGTTAAGCTCACGAGTTGATTTGGGTGAACTCTTTTGAAGAAATTATTTTATAACTTTGGTTTGAAAGTAATCAAAGGATCCTCACAGAGAAATCTCTTGAATGGTTTGAATGATTTGTTGTAGCTAAACATAAATCCTCATTTTGGTCTAGTTGAGGGTTTGTTAGGTATCTGAATAAAACTCAGTTTCTTGTTTTTTGATTTACTGAACAGATGAATTCATTGAAATTCTGTTTGGTGGATTCATTTACGAAAACAATTTTTGGATTGTATTTGGATTATGAAACGCTGGAAGTGATAATTTGAAAACTATGTTGTGTGGAATGGAGGAGTCTACAGCCCTGGAAGTCATCTTGTGAAATGGGATTGGGCTTCTCTTCCAACTACCCTTTGAGGCCTTGGAGTGGGATCTCTTAATCAAAGAAACTCATCCCTGCTTATGAAATGACTGAACAAGTTGGGGTGGCTCTCGTGGAGAAGCTGAATTCTGCAGTTTGGTAAGGAGTAGGGCATATTTTGGTTGGTCTCTTGATAACTCAGGCAGGCATACTGCCAAATCGACCTTCTTAAACCTCTCTATTAGACCTTGAGAAGCTTGTATTCCATTGATCAGGTTGGTCGGGAAATTCAAAACTCCCAAGATGGTATGGGCCTTTCTTCGCTCTTTGGCTTATAGAAGCCTTAATAACAGATGACAAGATCCAAAGAAAATTTTCTTCTTGAGCCATCTCTCTGTCCATTTGTAGCCTTTGTTTTGAAGAGGAAGAGTCCATGGACCATCTGTTTTTACACTGCCCCTTTATGGCCAAAGCCTGGCATTTTATCTTCAGTAAAGTGGGGCTGCCCCTTTGCCTCCTTTTGAGAGTGGAAACTTGGCTCCTAGATGGTTTAAATGCACGGAGTCTGAGGGGTAAAGCTAAGATTTTATAGAACTGTACGATCAGGGCTCTTTTTTGTCGTATTTGGAAGGAAAGGAATGTTAGAACTTTCAGAGATAAGTTTTCAG

mRNA sequence

ATGATCGTTCCTCTGAAGATGGCAAAACAAAGAATGTTGGTCTTGAGAACCGTGGGAAAAAGCATTAAATTTGCAGCTCTTCTCATCAGACTCATGGATTCCGTTTTACTGGAGCCAATTTTGTTTCCTTGGTTGCTGCCATATACAAAGATGGTTTTTGGGGATGAAGTTCTGTGGCAGTTAAGTTTCTTGGTTTTGTCTCTTGATTATAATATTTGGCTCTGACATGGTTCATGTAGACATCAACAGTATGTAGTAGAAGTTTGGTATATGGCTATCACTTCATTGTGTTCATTGTTATGTTTACATGTTCTTTTCATCTTCCGACATTTAAATGCCATTTCATCTGAAACCGCAATGTTCCTTTAATCAACATCATCGCAAACATATTTTTTTTTTCTCACTTTAATTTTGCTTTCGGTGTTGAAACTGAATAAAGTCGTCTCCTAACCAAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAATAAATAAAAAAAATAAAAGAAACTAGATTACGTTCTGTCCTTGTGGGTCCTTGGCATTAGGGTAAGTGATTCTTGTTGTCTGGAAAAGAGTCCTAAATAAGACTGTTCTGATACAACTCTTCATGTCCTGCATACCAGGAATGCCTTGTTCAAACCAAATTTTCATTAGTAAAGTGTTTTTGATAATCTTCTTTTGTTCAGTTTTCCCCTTTTTCCTACCTTTTGTTCAATATTTGGGATGTCTTTTCATTGTTAGTTTAAAATGGTGGAAAGAAGAACTGGGGAGTCTAACAGCTGAGGTGTCTTTCTTCATAAGCTGAGGTGTCTTTTATGTCTTTCTTCATACAAGAAGAGGCATCTTTGAGGTTGGTTAACCTGAGGAGTGTATAGGGCTATTTACAAATTGCCAAGTCCATGAATAAAGATTGAGCTTATTGTAAAGCATGCTTCTAAACTGTGTAACGTGTATCATTTTAACCATTTTTCTTTTGTTTACTTATTTAATTATAGGGTGTATGGGTTTCTTATCCAAAATAATTGAATTATAGGGGGTATGACCAGTTTTAAGTTTAGAGGAGAGACATGTTCTCAATGAGGATAAATATAACACACTAATTTGTTTTGGAAGTACGAGCATTCGCCCTTGGCCCTGTAGACATTTGCACTACTGTGTTTTGGTGGATTAGAGCTGACATCGGAGTGTGGTATGAATGGATTAAATTACATCAAAAGGAATTTCTGTGAGAGTTACATATTTAGAAAATTTAGAAGCTGATGTTGTTCATACTGAAGGGATAAATGTAGGCAGATATCCAAGAAGAAGACATAGGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTAAAAATAGAAATGATGTATTAGTCACAAAAAAGGATCAATCACTTTGGGGCCGAGTAGAGAAAACCACTAACCCAAGACTACAAAAGATTACAAAAGAAGAGCCTTCTAGTTATTAATGATCACATGAAAACTATTAGTACAAAATAATTTCTCAAGGCTAGAGCACCACCAAGGAGTCGTATGCTGTACACTAACTAGAAAAAGAATTCTACGAAGTTGACTTTTCTTAAAAAAAAAAACCTCTTGTTTCTTTTCTTCCAAATATGCCAAAGGAGGGCTATAACCATGCAATTCCAAGATCTTTGCTACGCTTTTGAAAAACGTACCTCCAAGAACACATATTATTGCCCTCTTTTCATTATCAAGGATAACATTTTTTAGGGAAAGAAAGATTCACATATATAATAAATTTAATCGAGTTATTCAAGATTGCACATGGAGAAAAGCTTGCTATAGGAAGTCTGTTAGTATTACAATACTTGTTGAAATTACTTGTTAGATACAATATTGTCTTCTTATGTATGTGAACTATAGCCGACAGTATTATGTCATAATTGGTGGTCGTAAAAGAAGAAAGGATATTATGACTTTTATGAGAATTGACCTACTTTAGTTTGTACTTGACCTACATGCCTCCGATTCACTTGTCCAATAGAAAGTAAAAACTGTTTTTTGTTTTTCCCTTAAGTACGGGATGGCTTTGTTTAAGATTTTATTGTTGAAATTCATTACCATTTCCAATTTTATGTTCCTAGTGAAGATCTGATCATTATTCCGTCACACTTATTTAAGCTTCCAAGGTCAATATTTAGAGTTGATTTTCTATTTTTTATTTTTTTGGTGATTTTTTTTTTTAATAATAGATCTTTCAATTTGACCTGTTTTCTGGGCGAAGCAGACTACCAAAATTCTGAAAGTTCAGTGGCAAGGTTTATCAAGTCATCTTTGTTCGAGGTGGTAAGAATGTGTTTGATGAAAAGGTGCATTAGTTGCAAATCTCTTTGCTGCATTTTTATTTATTAATCTTAAACTGATATTAAAATTCTGCTTCTTGCACCATTGACGGTTTCTTCACATTGATGTCATTAACTTTAGGTTTCAGCCACAAGTTTTATCAAGTAGAGGAACCCGTGGAGCTTAGAAACTTATTTTGTTCTTCGTTGAGCATCATGTAATGCTGCCCCGTCTATAACTCTCAGCATACTGTTGTCAAAAGCTTGTGTTTTAACGCAATCAGTTTCTTTTAAATGCTTGATTTTGTGGCCAAGGAAACTGAAGTAAAGGAGCGAGGGAAGATAATCCTCCCAACTTAAAGCTGAAGGAGTTAACGGATAGTACATCAATAAAAGGGATGTTAGTTTACACAGGAGTCCTGGAAATGTACACCAGGAATAACATAAAAATATACACAGACTCCCCACATTTCTTCTGAATCCATAGCCTTATCCTAAAAAATTGTTTTGTTTCTGACTAAACAAGCCAAAAGACTGCATAGGTGTGACTTTACCATTAGATTGGAAAGACGATCATACACCAATTGCTCTTAGAGATATCCTAAGAACCAGCTGATTCATTCATTTCTGTATTTAATCTCAAGGAACAGAGAATCTATTGAATAATTTGTTTAGTGAAAAGCTACAACCAAAATCTATGTATTCCCTATAGGAGTTCACCAGAATTCTAGGATCTCTTCCCAGCTGCCATTCATTTTCCATAAAATAGCCTTCAATATTTTGTAGGCGTAGTCTTCGTTCTCCATGTTCGATATATTTTCTCTTCTTTTACCTCTTTGTTCTTCTGTTTCTGCTCCTCTGCTTCTGCTTTTCTCTGCTTTCATACAAAGTCTCACCCCTACTCCACTTCCCTCGCTCCTACTCCACTTGATTAGAGCACCAATGATTTGTTTCTGTAAAAATCACTTCTAAGTGTGCTTTGGCTTTTCTTAGAGGTGCTTTCAAATTGTAGTCAAACACAAACACTCAGGGTAGGATACGTTTTTAATGCTTACAAGTACCTTTTCCATGGTTAAAAGCAAAATGGACCCGATCCCCTATTCTCCAGCATTACTGTGTCTCTAAGCTCTTCATATTCCAAATTGGTTGGTTCCCTTTTGCCAAAAATTTACAAACACAAACACTTTCTGCCGCAAATTATTGTCAAATGCAAACACTTGAGGTAGGACGCTTTTATATACTTTTTTTTTAAAAAACTTTTTTGGTCAATGCTTTTAACCACTTAAAAGTACTTTTTACATGGTTGAAAGCACTTCAAATGAACCCTTCCTCATTCAAACGATCTTAACATTCTTTATTCAATTTATGATGCTTTGGACCAAACAAAGAAGTTTGTTACTAGAAGAAATCTCAGGAGGAAATTCAGGAATATAGTTCCTTGCTTTGCTGGAAGGTTTAATGTTTTCCTAGTAGTACAAGAAGTTAAAGAGTATTTCAGGTGTATTCTCGGTGCTTTCTTAGTCACTAAGTGCCTTCTCTTATGTTATCCAAGTCTTTCAGTAAGGTCTTGCTGGAAGTCTAGAATTCTGAAGAAGTTCGATGTGTTTATTTGGATCTTACTAAAGGGTGGCGTAGATAGAACTGAAAATTTATAAATGAAAGTGACTTTGCTTGCTTTACAAGCAGCTGTTGGTGCGCTGTTTATGAAAGTTGATAGATAGTATAGATCAGAATCGTATCATATTTTCATTGCTCGTAATTCCGGAAATGTGGCAGCACTTATGTAATTGTTTTCAAGTTTCTGGGGTGTTTGACAAATGTTCACTAAACAAAATCTTGCGACCTCTCATAGAGAAGTTAAGCTCACGAGTTGATTTGGGTGAACTCTTTTGAAGAAATTATTTTATAACTTTGGTTTGAAAGTAATCAAAGGATCCTCACAGAGAAATCTCTTGAATGGTTTGAATGATTTGTTGTAGCTAAACATAAATCCTCATTTTGGTCTAGTTGAGGGTTTGTTAGGTATCTGAATAAAACTCAGTTTCTTGTTTTTTGATTTACTGAACAGATGAATTCATTGAAATTCTGTTTGGTGGATTCATTTACGAAAACAATTTTTGGATTGTATTTGGATTATGAAACGCTGGAAGTGATAATTTGAAAACTATGTTGTGTGGAATGGAGGAGTCTACAGCCCTGGAAGTCATCTTGTGAAATGGGATTGGGCTTCTCTTCCAACTACCCTTTGAGGCCTTGGAGTGGGATCTCTTAATCAAAGAAACTCATCCCTGCTTATGAAATGACTGAACAAGTTGGGGTGGCTCTCGTGGAGAAGCTGAATTCTGCAGTTTGGTAAGGAGTAGGGCATATTTTGGTTGGTCTCTTGATAACTCAGGCAGGCATACTGCCAAATCGACCTTCTTAAACCTCTCTATTAGACCTTGAGAAGCTTGTATTCCATTGATCAGGTTGGTCGGGAAATTCAAAACTCCCAAGATGGTATGGGCCTTTCTTCGCTCTTTGGCTTATAGAAGCCTTAATAACAGATGACAAGATCCAAAGAAAATTTTCTTCTTGAGCCATCTCTCTGTCCATTTGTAGCCTTTGTTTTGAAGAGGAAGAGTCCATGGACCATCTGTTTTTACACTGCCCCTTTATGGCCAAAGCCTGGCATTTTATCTTCAGTAAAGTGGGGCTGCCCCTTTGCCTCCTTTTGAGAGTGGAAACTTGGCTCCTAGATGGTTTAAATGCACGGAGTCTGAGGGGTAAAGCTAAGATTTTATAGAACTGTACGATCAGGGCTCTTTTTTGTCGTATTTGGAAGGAAAGGAATGTTAGAACTTTCAGAGATAAGTTTTCAG

Coding sequence (CDS)

ATGATCGTTCCTCTGAAGATGGCAAAACAAAGAATGTTGGTCTTGAGAACCGTGGGAAAAAGCATTAAATTTGCAGCTCTTCTCATCAGACTCATGGATTCCGTTTTACTGGAGCCAATTTTGTTTCCTTGGTTGCTGCCATATACAAAGATGGTTTTTGGGGATGAAGTTCTGTGGCAGTTAAGTTTCTTGGTTTTGTCTCTTGATTATAATATTTGGCTCTGA

Protein sequence

MIVPLKMAKQRMLVLRTVGKSIKFAALLIRLMDSVLLEPILFPWLLPYTKMVFGDEVLWQLSFLVLSLDYNIWL
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh01G006390 vs. NCBI nr
Match: KAG6607287.1 (hypothetical protein SDJN03_00629, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 3.8e-07
Identity = 29/29 (100.00%), Postives = 29/29 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 32 MDSVLLEPILFPWLLPYTKMVFGDEVLWQ 61
          MDSVLLEPILFPWLLPYTKMVFGDEVLWQ
Sbjct: 1  MDSVLLEPILFPWLLPYTKMVFGDEVLWQ 29

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh01G006390 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G006390 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G006390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6607287.13.8e-07100.00hypothetical protein SDJN03_00629, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of CmaCh01G006390 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh01G006390.1CmaCh01G006390.1mRNA