CmaCh01G001050 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh01G001050
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr01: 483400 .. 489404 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G001050
SyntenyCmaCh01G001050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGGGAATATCGGTAAGCGTATACTTTTATTTCATTCAGGTGTCGCAGTAGGAGTGGGCAATAAGATGGTTTACATGTGAGCGGAAGTACAGGCCAAGAATCGCAGCTCCGACAAACATGCACAGGTGTTAGCCCGAGAGACGAGTTCTCACGAGCTTTCAGAACATCACCACATGATTCAGGAACCACTTCCTATGTCCTCCTCCTCACCGCTTTCAATCTTTTTGCACACCAACCGATCCATGCTCAATTTCCGGTTTGCTTCTTTTGTTTTCAACCTCCGGTGCACGCTACCACTCGCTCGCCTTCCCCGATTTCCAATGCCGAAATTAGTTCGTCTTCAATCGGAGCCCTCATCGCCGTTGCTCGAACCACTCTAGCCCTGTTCCGGCGCATTTTAGTCACTCTCTCGGCCCTCTCGCTTTCCTCTTCCGCGATTTTAGAGGTACGCGTGGTTAATTCTTGCCTCTCTCTGATTTAAACTCTAGATTGTTTGCATTTTGCTCATGTCCTTCGATGTGTGTTAAATTGTGCGTATGGTTTTATTTTTTGTACAGAAATTTATGTTTTAGGTAATTTGTATACAATTTATAATGGAGAAGTATGTTAATCTTTGTATATTGAATTCATTGATCATTTGTACTGAGAGCTCTTTCTCTTAAATGTTAATCTCTGTATATTGAATTCATTGATAATCTGTACTGCTGTAATAGACTAACGATTATAACAATTAAAGCTTTCAATACGATAACTCTAATAATTTATAGTTGAAACGATAAATTGTTTTGTGTCGATCGGACAGATTATTACGGAATGTCAACGTGAATGTCTTCTTGTTCGTGTTTTTTAATCAATCTTGGGTCCGTATAGAAATATATTAAGCTGCTGCGGCAAAGAAATTAAGAAATATTTAGAAAAAATAAATGATCGATAGTTATAAGGATACTCTGCATTCACGAGGTGTTTATTTTCTCTGCTAATTGTAACTGTTTTTTTCTATGGACATATTTTTTTTTTTTTGTCCTTTGGGATATTAAGGTCGACATGATGCCATCCTGTTGATACTCAGGATTTTTCATCGTTTCTGTTTTTGTTGCTTTGGTCTTCCTAAGAATTCCATTCCCAGGTGCTACTAGTCACCGAGTTCCTAAGAGGCAGTTGTTCTACAGCTGGCCTTGAGGATAGCTTGTTTATAATAATTAGAATTACGTCATGAGGGGGCGCCATGTTGTGGAAATGTCCACGACACACAAACGTACAGCACCGAGGGACCATTTACATGCTTCCAGTAAACAAGAGAGTCCAGGTGTGGTAGCAACGGTTCTATCAAGATTCTCATGATTTTTTTGTTGTCTGGAATTAGAATACTAACTTCTTAACATCTCAACATCTCTTAGAGCGTTATACTGTTTACCCTTCATGGAAACGCTCCTTGCGGCATGTAGGTGTAGCGACTCTTGCTTCATTTTTACTTGGATACCATCTTGGGTATGTTCTCAATCATCACTATTCCTTATATCATTTTTAATGTTTCCTTATCGCTTGAATTTTTCAAATTGATTTACTCAATAGTTATTTATCTTTGATGTTGCAGTGTAATTAATGAAACATTAGAGAGTATTTCCTTAGACCTTGCCTTTAGTGGGAGCACATTGGCCGAAGGTGATTACATAAACATTTATTTTAGTACTTTTATTTGTGTTTTTGGTTTTTTTAAAAAAGTAATCTAGTTTTTTCCTTAAATAAAGGTCTCGTAGTAAGTACATCCTTAGGTGGCGCCTTTCTTGGATCTCTATTCAGCGGCGTGATTGGAGATGGAATAGGGCGTCGTAGAGCATTGCAGCTATGTGCATTACCAATGATAATTGGTGCATCCATGAGGTAAGCATTACGTGAAGCATCTTCCTGAGTAATTCACTCCTGGTACTAGATAGACCCTCATGGGTAATTGATATTTGGCACCGATTCAAGTGCTGTTCGTCATATTGATTCTTGTACACTGTTTTCTAATTTTGCAATTAATACATTTTTAACCTCCCTCAGGTCATTTCAATAATATCTCCCAATATCAGGTTTTAAACATGCTTATCATATTACTGTCAATCTGTTAATTCAGTTTCGGCAGTAATTTTCTTCTTTTGCACAAATATGATTGCAGTGCAACCACAACAAATCTCTGGGGAATGCTTCTTGGGAGGTTATTTGTTGGGATGGGGATGGGTCTTGGCCCAACTATTGCATCACTTTATGTTTCTGAGGTACATAATATCTTGATAAGTTTGAACAGCTAGCCACACTCTGGAATTAAAATTAGTATCCCACCTTCAGTTTGCCTTGTTTGTAGTTATTCCATATTTATTTTGAGTAGGTATCACCAGCTTATGTAAGAGGAACTTTTGGGAGTCTTACTCAGATTTCCTTATGTCTCGGTCTTCTGGGATCCCTATTTATGGGACTGAAAGCCAAGGGAATAGTGGATTGGTAAGTAATGTCCGAGGGAATGCATGGTTGAAGACTACATCAAAATTTTCGTTTCATGGGCAGTTCATCAATTTGTCTATGAACAGCAGTAGATAACACAGCTTTTTTGACTAGAAGGTTTTCTCAGGTGGCGGACTTGTTTTTGGGTATCTGTCATTCCTGCTGCTTTACTTGCCCTTTTGATGGAATTTTCTGCAGAAAGTCCTCATTGGCTTTTCAAGGTCATAATCTCATATATAATTTCAACTGCCTCTTGGGACGTTATCAACTCGTGTTTGAGAATTTACTTTCTTCATGTGCTAGATTGTAAATTGGTTGAGTTTAATCAAGTTTAGGGAATTACAGGTTCTTTCTCTTTCCTTCAAGCATGCACTTATCTCACTAATTCCACATAGGTATACCATGTCATGTCTAAGTGACATATCTTTTGTTTTAGTCATATACATATTGGTGCCAGGAATTCCGACTTAGGGAACCTTTTTTTATTTCTCAGTTTTCTTCCTTCTTGTTTATATTGGTAAATACCCCAAGGCTTTGATATCTTCCTATTCTACTTCATTTCATTGTTCATTCCACTGGCATGCTTCAATCGGTCGATCAGTTCCATGTGACACCACATGATACAATAATTACACCATTTACTGTCTCCGTCTCATGGTGCTCAAAAGAATATAATTTCAGAATATAAGCAGTAATTTTAAGGGTAAATTCAAGTTATATAATCAAATTCAAATAATAATCTGTTTCTACAATCCTGCGTTGGTCCCTCATGAGTTCTATTGAATGAGTAACAAAATTGATGGTCAAGCATCTCAGACTCACATCTATATATTTGTTTCATGCTCTCCTGTTTGTGGACCATTTCTTGATTATGTTCTGAAGCGATCTCTAACCATCTTTTTTGGATTTGCTTCAGAGTGGAAGAACTGCTGAAGCTGAGGCTGAATTTGAGAAGCTTTTGGGAGGAGTACATGTTAAATGTGCATATGCAGAATTGTCGAAGTCTGATAGAGTAGATGACGCTGATGCAGTGACGTTATTGGATTTACTCCAGGGCCGCTATTTCAAAGGTAAATGTACAAACAATGTAATCACTGATCAGTTAATAGTTTCTCACATACTTCTAACTCCTAATGAAACCTTTTTCTTTCTCTAAATTATTACATTTGCATGTCAATTTTGCAGTGGTTTTCATCGGTTCAATCCTTTTTGCTTTACAGCAGCTCTCTGGCATTAATGCTGTTTACTATTTCTCTTCTACTGTCTTCAAAAGTTTTGGCATACCTTCAGATCGTGCAAATATTTGCATAGGAGTCGCAAACCTTTTTGGTATGTCGGCTCTGACTGGATCATCTCCAGTTCAGCTATGAGATTATTCTGGTATATGCCTTTATTTATTTTCATCCTTCAGGGACAATTGTTGCAATGCTACTGATGGATAAACTTGGAAGAAGGGTGCTGCTTCTTGGCAGTTTTTCAGGCATGGTAATTGTTCTAGTGCTTTTCGGGGGGAAAAAAAATACTCTTTGGTTTAGATAGATGTCTTGGCAGAAACTGAGTCTAAATTTCAAAACGCACGATATCTTTCCCGCATTATTTCTTTTGTATCGTTATGAAATGTTTCTATAGTACTCTTTTTGGGTGTTAAGGATTCAAAACAGATGTATGGTTATGCTCTTTATAGCATCATTTGGTCCCGACTAAAGTTGTAAATTACTTCTGTAACATGTATGAGACTGGTATAACTAAATTAGGTCAACCTAAAAATCCTATACAAATTTCTTGTACGTGAGCCCTTGATTAGGTTTTACTTTCTACTAGCGTTTTGTATTTTTCTGACCTTACTGTGTTTGGTTCTAGGCAGTGTCCATGGGCCTCCAAGTGGTAGGAGCAAGCTCATTTCCATCCAGCCCTGGAGCATTCTATCTTTCTGCCGGTGGCATGTTACTGTGAGTAATTATCATCTTAATAGTCAAATAAACTTGGAATGCTTACCTAGACGAATGAATGTCGGATGTTTCAAAGAGAAGATTATTACCAGATGTTTTGACAAACACAAGGTGGATAATGTAGGTTTGTCCTGACATATTCTCTTGGTGCGGGTCCTGTTCCTAGTCTCCTCCTATCAGAAATATTTCCTGGTCAGATTCGAGCAAAAGCAATGGCATTTTGCATGTCGGTTCATTGGGTACTACGTTTCTCAGTTCAACCGATATGACTTTGTTTGGAAGTTTCATTTCTTTATTTATCTGCTGTGCTTCTTTTGATCTTTGCTTCCATGTCTGATTTTCGCTTTACAATCCCTAGTTGGAACAATAATTGAAAGTGGAAAAAACTGGACCTCGATTAAAAAAAAAAAGCTGTCAGATGTTCACTATTTATTAGATTGACATCCTCTTATGAGATATCAAAATTTATGGTAACTGCTAAACATCTTTACTAGTTTACTTTTTGCCCACAGAAACAGAATTGTTGTATTTGTTCTTGTAATAAAACTTCATTGGATGTTTTGTTCTGGTTTGGCCTGTGCTTCCTTCACTGCTTATGAGCATCTCTTCTGTCTTCCCCTCGCATGCGAACACAAAAGAGTTGTGCCAATTAAGGGAAAAGAAAACTTGTAGATGTCTCACATTCTTGCTGGTTGGACATGAACAGGTGATAAATTTTTTTGTTGGTTTACTCTTCCTGCCGTTACTGGAGCAATTAGGAGTCCAGATCCTATATACAGTTTTCGGTACATTTTGCTTCATAGCAGTGATTTTTGTGAAGAGGAATGTATTGGAAACAAAAGGAAAATCACTTCAGGAAATAGAAATGGCACTTCTACCAGTAGTGTAGAGGTATTTGATACATGGATCAAATCATCCTCTTCTTTGTTTCTCTCTGAAAATGGTAAGAGACAATAGTTTCACAATTATTTACACTCCTAATATTCTACCCTCGTGGTTTTCTGATTTTTCTCCTTCCGAAACATTGTACAACTATATCAATTTCTGTTGATCGTCCTCACCTTCTTTTCAGGGAGGAAACAGATTCATTCAATATTCCTATCATCATCTTGCATATGTCCTTGTTCAAATGGAGTGATTACAAGATCATACAACGGCATCAAAACTTACAGCTTCTTAACTTTCGCCCAATCGCTTTCTAGAATGGTATCGATTTTCTTGAGGGCTGTCTTGTCTTTTTTCCCTCAATTCAGGTCATTCATTATTTGTCTATTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTGCCTTGATATAATGAAAAGAAAGTGCACAAATGCCATGGATCACAGTTCAAAGTTCTCTATTCATTGATTATTTATGTAACTTGACCTCTCTGAGCTTCAAAGCTGATGATGCTTATGAGTACTCACAATGCTGCAGGTTTATATAACATACGTCTCTTCTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTGTTCAACAATTAAGAAGGATTCCAAATCTGTCCTCTTATGATTTGAATTGAGCGAAATGGTGTTGCACATATTTTAC

mRNA sequence

ATGGCGGGAATATCGCTCCGACAAACATGCACAGGTGTTAGCCCGAGAGACGAGTTCTCACGAGCTTTCAGAACATCACCACATGATTCAGGAACCACTTCCTATGTCCTCCTCCTCACCGCTTTCAATCTTTTTGCACACCAACCGATCCATGCTCAATTTCCGGTTTGCTTCTTTTGTTTTCAACCTCCGGTGCACGCTACCACTCGCTCGCCTTCCCCGATTTCCAATGCCGAAATTAGTTCGTCTTCAATCGGAGCCCTCATCGCCGTTGCTCGAACCACTCTAGCCCTGTTCCGGCGCATTTTAGTCACTCTCTCGGCCCTCTCGCTTTCCTCTTCCGCGATTTTAGAGGTGCTACTAGTCACCGAGTTCCTAAGAGGCAGTTGTTCTACAGCTGGCCTTGAGGATAGCTTGTTTATAATAATTAGAATTACGTCATGAGGGGGCGCCATGTTGTGGAAATGTCCACGACACACAAACGTACAGCACCGAGGGACCATTTACATGCTTCCAGTAAACAAGAGAGTCCAGAGCGTTATACTGTTTACCCTTCATGGAAACGCTCCTTGCGGCATGTAGGTGTAGCGACTCTTGCTTCATTTTTACTTGGATACCATCTTGGTGTAATTAATGAAACATTAGAGAGTATTTCCTTAGACCTTGCCTTTAGTGGGAGCACATTGGCCGAAGGTCTCGTAGTAAGTACATCCTTAGGTGGCGCCTTTCTTGGATCTCTATTCAGCGGCGTGATTGGAGATGGAATAGGGCGTCGTAGAGCATTGCAGCTATGTGCATTACCAATGATAATTGGTGCATCCATGAGGTCATTTCAATAATATCTCCCAATATCAGTGCAACCACAACAAATCTCTGGGGAATGCTTCTTGGGAGGTTATTTGTTGGGATGGGGATGGGTCTTGGCCCAACTATTGCATCACTTTATGTTTCTGAGGTATCACCAGCTTATGTAAGAGGAACTTTTGGGAGTCTTACTCAGATTTCCTTATGTCTCGGTCTTCTGGGATCCCTATTTATGGGACTGAAAGCCAAGGGAATAGTGGATTGGTGGCGGACTTGTTTTTGGGTATCTGTCATTCCTGCTGCTTTACTTGCCCTTTTGATGGAATTTTCTGCAGAAAGTCCTCATTGGCTTTTCAAGAGTGGAAGAACTGCTGAAGCTGAGGCTGAATTTGAGAAGCTTTTGGGAGGAGTACATGTTAAATGTGCATATGCAGAATTGTCGAAGTCTGATAGAGTAGATGACGCTGATGCAGTGACGTTATTGGATTTACTCCAGGGCCGCTATTTCAAAGTGGTTTTCATCGGTTCAATCCTTTTTGCTTTACAGCAGCTCTCTGGCATTAATGCTGTTTACTATTTCTCTTCTACTGTCTTCAAAAGTTTTGGCATACCTTCAGATCGTGCAAATATTTGCATAGGAGTCGCAAACCTTTTTGGGACAATTGTTGCAATGCTACTGATGGATAAACTTGGAAGAAGGGTGCTGCTTCTTGGCAGTTTTTCAGGCATGGCAGTGTCCATGGGCCTCCAAGTGGTAGGAGCAAGCTCATTTCCATCCAGCCCTGGAGCATTCTATCTTTCTGCCGGTGGCATGTTACTGTTTGTCCTGACATATTCTCTTGGTGCGGGTCCTGTTCCTAGTCTCCTCCTATCAGAAATATTTCCTGGTCAGATTCGAGCAAAAGCAATGGCATTTTGCATGTCGGTTCATTGGGTGATAAATTTTTTTGTTGGTTTACTCTTCCTGCCGTTACTGGAGCAATTAGGAGTCCAGATCCTATATACAGTTTTCGGTACATTTTGCTTCATAGCAGTGATTTTTGTGAAGAGGAATGTATTGGAAACAAAAGGAAAATCACTTCAGGAAATAGAAATGGCACTTCTACCAGTAGTGTAGAGGTATTTGATACATGGATCAAATCATCCTCTTCTTTGTTTCTCTCTGAAAATGGGAGGAAACAGATTCATTCAATATTCCTATCATCATCTTGCATATGTCCTTGTTCAAATGGAGTGATTACAAGATCATACAACGGCATCAAAACTTACAGCTTCTTAACTTTCGCCCAATCGCTTTCTAGAATGGTATCGATTTTCTTGAGGGCTGTCTTGTCTTTTTTCCCTCAATTCAGGTCATTCATTATTTGTCTATTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTGCCTTGATATAATGAAAAGAAAGTGCACAAATGCCATGGATCACAGTTCAAAGTTCTCTATTCATTGATTATTTATGTAACTTGACCTCTCTGAGCTTCAAAGCTGATGATGCTTATGAGTACTCACAATGCTGCAGGTTTATATAACATACGTCTCTTCTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTGTTCAACAATTAAGAAGGATTCCAAATCTGTCCTCTTATGATTTGAATTGAGCGAAATGGTGTTGCACATATTTTAC

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGGAATATCGCTCCGACAAACATGCACAGGTGTTAGCCCGAGAGACGAGTTCTCACGAGCTTTCAGAACATCACCACATGATTCAGGAACCACTTCCTATGTCCTCCTCCTCACCGCTTTCAATCTTTTTGCACACCAACCGATCCATGCTCAATTTCCGGTTTGCTTCTTTTGTTTTCAACCTCCGGTGCACGCTACCACTCGCTCGCCTTCCCCGATTTCCAATGCCGAAATTAGTTCGTCTTCAATCGGAGCCCTCATCGCCGTTGCTCGAACCACTCTAGCCCTGTTCCGGCGCATTTTAGTCACTCTCTCGGCCCTCTCGCTTTCCTCTTCCGCGATTTTAGAGGTGCTACTAGTCACCGAGTTCCTAAGAGGCAGTTGTTCTACAGCTGGCCTTGAGGATAGCTTGTTTATAATAATTAGAATTACGTCATGA

Protein sequence

MAGISLRQTCTGVSPRDEFSRAFRTSPHDSGTTSYVLLLTAFNLFAHQPIHAQFPVCFFCFQPPVHATTRSPSPISNAEISSSSIGALIAVARTTLALFRRILVTLSALSLSSSAILEVLLVTEFLRGSCSTAGLEDSLFIIIRITS
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh01G001050 vs. NCBI nr
Match: KAG6606760.1 (putative plastidic glucose transporter 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 5.2e-40
Identity = 93/93 (100.00%), Postives = 93/93 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 26  SPHDSGTTSYVLLLTAFNLFAHQPIHAQFPVCFFCFQPPVHATTRSPSPISNAEISSSSI 85
           SPHDSGTTSYVLLLTAFNLFAHQPIHAQFPVCFFCFQPPVHATTRSPSPISNAEISSSSI
Sbjct: 6   SPHDSGTTSYVLLLTAFNLFAHQPIHAQFPVCFFCFQPPVHATTRSPSPISNAEISSSSI 65

Query: 86  GALIAVARTTLALFRRILVTLSALSLSSSAILE 119
           GALIAVARTTLALFRRILVTLSALSLSSSAILE
Sbjct: 66  GALIAVARTTLALFRRILVTLSALSLSSSAILE 98

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh01G001050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G001050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G001050 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6606760.15.2e-40100.00putative plastidic glucose transporter 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp.... [more]
BLAST of CmaCh01G001050 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh01G001050.1CmaCh01G001050.1mRNA