CmUC11G219460 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC11G219460
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionExtensin-like protein
LocationCmU531Chr11: 27899663 .. 27930138 (+)
RNA-Seq ExpressionCmUC11G219460
SyntenyCmUC11G219460
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCAGTCTGAGGAAGAGACTGTGCATAATCGAAAGAAGTTAAGCTTCTGGTCTCGTCTCGTTTCATTGATGAAAAATCGAGGTAAATGCAGTTCCTTTTCACACCTTTTTAGTTCTATGACGCAATGAAGCAATTAGGTCTTGACTGTGTTCTAGTCTGGGTTTGGAATTTTAAGGGTACGGTCGGGCCGGCTATTTCGATTTAGGGGTTCATCGGAGAACTTCCGATGTTAATCACACATTGTTGTTTTATTTTATTTTATTTTTTTGCCTGATTTCTATACCGTTCGTATTTTTTTATGGTTTCGATTACAGAGGATTAGGGCTTTTTCCGTAGGTTGCTCTGATGGTTACAGGACTCTTCGTTTCATTCACCGTCTCTGTTAATATTCTAAATCTAATATTCAAGTAAATGTGTTGGCAGAAGAAGACGACGATGAATTCTTATGTTCTTGAGATTGCTTCCGATGACAATGAAGGGGACAAACGAAGTAGTTGCTCTTGATGAAGTTAATGATTGGGCAAAAGAAGACTGGTATGGTTCCAACCCTAACGGGGGGAGTTCAATTTAAGTTTTAAGATTGATAATAATGCTGAAAATATGGGACTTTGATTTTTATGTTTGAAATCGTTCATGAAGCTATATCACTTCATTTTTTTTCTTTTGGGAGTACTATTCAAATAGTTCAGGATGTACCATTTTCCTTTTTCTAATTTTTTCATAATAAACTATGTAGGATTATTTTATGCATATCTGCAATAAAAGGATCTTATTCTCTTGATGCAAAATTTTTGAAGTTGATATTTGGTGCTTATTTAACTTCGTGCATAGATCAGCCTATCAAACTTGAACATGAAATCATTATTTCAGATTAGTGTATTCACACCTATTGCTTTGGGTATGAAAGGGTTTGAGGTCTTAGCATTCTTAAGAAAAACAAGCCACCATAATTTGTTATTTTTTATTTTTATTTTTTTAATTTTTTTTTTATTATTATTATTATTTTTGGAGAGGAAGCCATGGTAACTGTTGATGTTCACTTTTTACGGTTTCAAAGTATCCATATCTCATTGGTTTGACATCATTGCTCAAGTTTCCTGAGTTACTATATTGTGAAAATTCAGATGGACATAAAGTTGGGGTCGTCCATCAACATCCAATTGCTTCTTTCAACACTCCATCACGTAAGAAATTTTCAATGGACATTATGAGCCACCATATGTGCGGTCTAAGTTCTAATTGGAATTATAATTTTGGTGCTGTTGTGGTCCTAATAAGGTTAGGTTCTCATGTTTTATTCTCATTATATCTTTGTTTTTCCTTTTTGATGTTTTTTTTTTTGCTATCGATATCATGTTTTTGTCTTAAGAGTAAGTGATTAAATTACAATAATTGATTGTAATGAATGTAACTTGATAGAGGTTCACGAGTTAGGAATGAAATTATATGTTTTGATTTAGGACTGTTTTAGGTAGTTAGGATTATTTCTTTTTAAATGAAAAGCCAACATTTTATTGAGATCAAATGAAAGAATACAAGGGGAACGCACAGAAAAAAAGAAAAAAAAAACCCACCCTAAGAGAGGAGCTGAAATAACCTAAAAGGACACTCCAACTCCAACCAAGCAAAATAAGACCCAAACGGTAATTACAAAAAACTTTAACTAACAAGGTTACACCTCACCTCAAGGTCTTCCAATCCCTCTAAAAATCCTATTGTTTCTTTCACCCTAAAAATCTCATAAAATGGCATAAAATAGGTTTTTTTGGAAAAGGAAATGAATCTCTTCATTGAGTAAATGAAACGAGACGATAAGGATCAGGAGGTGCACCTGGGGATCTCAACTAGGTTGACACCTCTTAGCACCCTCATCATATCCAAATAACGAGAACAAGTAAACTAAACTAAGGAGAACAAACCAACAAACCAAATCCACGCCCAAAGTCCAAATACAAGAGCAAAGATCCAATACAAAATTAAACCATAAAACTAAGATACAACCAGAAACTAGGTAGCTGGAAAAATAAATGTCCACCAATTTAAATTTAGAACATGAATAGAGAAGTCTTCGAATGATTTGGAAAGTGTGCACTAAGAGGAGGCATTCAGCTCTGCAATCTCGAAACGAACTAACCAAGGAGAAGCTTTGTTATGGAAGACTCATTGGTTTTGTTCAAACCATGGAACTACAACCTCTTCCACACAAGTAAACTCACAAGACCATAGGAGATGATCTAGATCCTTGTCATTTCCTGAAAAAGATACAATACCAGACCCAATCAAAAGAGGGGAAATCCTCTTTAACACAATCCAAAATATTAGCCTTGCCATGGATGAATGGGCAAACAATGGAACTTGCATCAGATTGACTCCAACATTGTGTCTTAAGATTTCTTGTCATTTCCTTGAGTTTGAGATTCAGCAACTAAGTAATGAGGATTATTTTAGAGAATTTCTTTGAAGGAAGCAGGATCATAGATAATTAGGTATTTAGTTATATAGGAAGGCCAGAGTGTACTTGGTTGTATATATAATGGAAAAGCTTTTGGACTTCTTCAGTTTTGTGGTTACGTATGCAAGTAAGGAAGAAGGAAGAGAAGCTAGGACAAGTAAATTCTAAGTGAAGTATGAGATTGGATTTGAGTTCTTAATCGAAGTGATGTTGTCATTGTTTGGAATGAAAGATTAGCATAAAGTAGTAGGTGTTGTGGTCATCTTGGGGACAATTTGGTTGGCGATTTGCCATGGAGATTGACACGACAATGCAACGTTCGAGCATATGTACTCGAAAAGGAGAAAGGCACTTAGAGTGTGTTGGATTGAGGAAAATTCATTGGAATGAATTGGAACAAAGGAGTTTGGAAATTTTGTTGGATGTTGTTGAAGGGTTGATTATACGCCGTTGCAAATTTGTCCAGGAAAGAAGTTTCTTGAAATTGGAAAATCATTGGTTTATGGTCTTAAGTTCTCTAAGTTTTTGAATAATTGGCTGAGGAATACCCAAGTCTTAAAGGAGTAATTTAAAGGAGTAAATGGTGCGATGGATGAGGAAAAGAAGTTTTGGAGAATTTTTATGAAGGAAGCACCATCATAGATAATTGGGTATTTGGTAATTGAGGAAAGTGGGACTCTATTGGTTGTATATATAAGGGACAATATTTTGGACTTCTTGACTTTTGTTGTTATGTTTGGTAAAGAAGAAAGACGATAAGTTTGGACAAGAAAATTTAACGTGAAGTATGAGGTTGGATTTCAGTTCTAAACGAAGAGGTGTTGCCATTCTTAGGATGGCGTAAAGGAGTAGGGGTTATGATCATATTGGTTGATGATTTTTCTTGGAGATTGACACGATCATGCATCGTTAGAGCACATGTACTCCCAATGGAAAAAGGACACCTAAAGTGTGGTGGATTGAGGAAAATTCCTTGGAATGAAGGTGTTTGGAAATTTTCTAGGATTTCGTTGAAATGTTGATTTTCCGTTGTAGCAATTTTGTCTTGGAAACAAAGTTTGTTCGAATTGGAGAACCATTGGATCGTGGTTTTGAGTTCTCTACATTTTAGGATGATTGGTTGAGGAATTCATAAGTCTTAAAGGAGTAATCGATGGGAGGGAATAGGAAAAGAAGCTTGGGAGAATTTCTATGAAAGAAGCAGGATCATCGATAATTGTGTATTTGGTTATAGAGAAAGGCCAGAGTGTACTTGGTTGTATATAGAATGGAACAGCTTTTGGATTTCTTTAGTTTTGTGGTTACGTATGCAAGTAAGGAAGAACGAAGAGAAGCTAGGACAAATAAATTCTAAATGAAGTATGAGATTGGATTTGAGTTCTTAATCGAAGGGCTGTTGTCATTGTTTGGAATGAAAGATTAGCATAAAGTAGTAGGTGTTGTGGTCATCTTTGGGACAATTTTGTTGGCGATTTGCCGTGGAGATTGACACGACAATGCAATGTTCAAGCACATCTACTCGGAAAGGAGAAAGGCACTTAGAGTGTTGGATTGAGGAAAATTCATTGGAATGAATTGGAACAAAGGAGTTTGGAAATTTTGTAGGATGTTGAGGAATTCCCAAGTCTTAAAGGAGTAATTTAAAGGAGTAATTGGTGCGATGGATGAGGAAAAGAAGTTTTGGAAAATTTTTATGAAGGAAGCACCATCATAGAATATTGGGTATTTGGAAATGGAGGAAAGTCGGGCTCTATTAGTTGTATATATAAGGGACAATATTTTGGACTTCTTGACTTTTATTGTTATGTTTGGTGAAGAAGAAAGAAGATAAGTTTGGACAAGAAAATTTAAAGTAAAGTAAGAGGTGGGATTTAAGTTCTAAACGAAGAGGTGTTGCCATTCTTAGGATGGCGTGAAGGAGTAGGGGTTATGATCATATTGGTTGATGATTTTTCTTGGAGATTCACACGGTCATGCACCGTTAGAGCACATGTACTGCAAATGGAAAAAGGACACCTAAAGTGTGGTGGATTGAGGAAAATTCCTTGGAATGAATTGGAATAAAGGTGTTTGGAAATTTTCTAGGATTTCGTTGAAATGTTGCTTTTCCGTTGTTGCAATTTTGTCTTGGAAACAAAGTTTGTTCGAATTGGAGAACCATTGGATCATGGTTTTGAGTTCTCTACACTTTAGGATGATTGGTTGAGGAATTCATAAGTCTTAAAGGAGTAATTGGTGGGAGGGAATAGGAAGAGAAGCTTGGGAGAATTTATTTGAAGGAAGCAGGATCATAGATAATAGGGTATATGGTTATAGAGAAAGGCCAGAGTGTACTTGGTTGTATATAGAATGGAACAGCTTTTGGATTTCTTTAGTTTTGTGGTTACGTATGCAAGTAAGGAAGAACGAAGAGAAGCTAGGACAAATAAATTCTAAATGAAGTATGAGATTGGATTTGAGTTCTTAATCGAAGGACTGTTGTCATTGTTTGGAATGAAAGATTAGCATAAAGTAGTATCTTTGGGACAATTTGATTGGCGATTTGCC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TCATGGTGTGATCTGTGATTGAACTTTATTGTATAGGTGTCCTTTGTTTTCAAGGAGGATTATTGAAAATGTGACCTAAGTCCCACATTAAGGGAATGGTCATGGGTATATTAGTGAGAATAACTTTATCTTCATTCTTATGACCCCTTTTGGGGTGAAACCAAATGTAAAGTCATGAGGGTTAATGCTCATAGTATGTTCATCTTGATAAGATTCGTTGTAAAGATATTTAGAGGGTCGTTGTCCCTAACAATGTGTTCATCTTAATAAAGTTCATCAGGGAGGTGCCAACTTTCAACACTGCACATAAATTTTTTCACATTCTCAATGTACTTTTTCCACTCTCAATTTGGCTTTACAATTGAATTCATTAAGCCTTTTTTTCAATTATTTCGGCTTTGTTTGATAATAATTATTATTTTTATTATTTTTAAAATTGTAGTTGTTCTCCCACAATCTATTTACACCTGTCTTAA

mRNA sequence

ATGCACTTTCTGTCAATGGACGTCGATGAATTTTACCGGCAACCGGCTGCCGTTCCTTTCAAATGGGAGATCAAACCGGGCGTCCCCAGAAACCACCACCGCCTCCGACAGTCTCCAACTCACTCTCCTCAGCACCATCAAAAGCTGAAGCCTCCTCCTGCTGTATCCAACTTCCTCCATCCTTCAAATTCCCTCCACTCCTCCTCTCGAACCCGGTCCGACCGGTGGCGGTTTGCCCGCTCCAACCTCCTCGAGCCCGAGCAAGTCTCTTCCGGTTGCTTCCCCTCGCCTTTGCCCAACCGGAAATCGCCCAAGACCGTGAGCCGGAAACCCGAACCGGATTACTCCTCTGAATTGGAGACTTTGTCGCGGTGGTCTGTTTCCAGCCGGAAGTCGATTTCGCCGTTCCGATATTCAGTTTCGTCGTCGCCGTCGTCGTTCTCGTCGAACCAGTCATCTCCCCGTCCGACTAGTGATACTGATTGGGCCGGTTGTTCTCCCACAATCTATTTACACCTGTCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCACTTTCTGTCAATGGACGTCGATGAATTTTACCGGCAACCGGCTGCCGTTCCTTTCAAATGGGAGATCAAACCGGGCGTCCCCAGAAACCACCACCGCCTCCGACAGTCTCCAACTCACTCTCCTCAGCACCATCAAAAGCTGAAGCCTCCTCCTGCTGTATCCAACTTCCTCCATCCTTCAAATTCCCTCCACTCCTCCTCTCGAACCCGGTCCGACCGGTGGCGGTTTGCCCGCTCCAACCTCCTCGAGCCCGAGCAAGTCTCTTCCGGTTGCTTCCCCTCGCCTTTGCCCAACCGGAAATCGCCCAAGACCGTGAGCCGGAAACCCGAACCGGATTACTCCTCTGAATTGGAGACTTTGTCGCGGTGGTCTGTTTCCAGCCGGAAGTCGATTTCGCCGTTCCGATATTCAGTTTCGTCGTCGCCGTCGTCGTTCTCGTCGAACCAGTCATCTCCCCGTCCGACTAGTGATACTGATTGGGCCGGTTGTTCTCCCACAATCTATTTACACCTGTCTTAA

Protein sequence

MHFLSMDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHSPQHHQKLKPPPAVSNFLHPSNSLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVSSGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSELETLSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAGCSPTIYLHLS
Homology
[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match: XP_038899347.1 (uncharacterized protein LOC120086669 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 5.7e-70
Identity = 139/160 (86.88%), Postives = 148/160 (92.50%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHHQKLKPPPAVSNFLHPSNS 65
           MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVP+NHHRLR SPTHS PQHHQKLKPPP+VSNFLHPSNS
Sbjct: 1   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPKNHHRLRHSPTHSPPQHHQKLKPPPSVSNFLHPSNS 60

Query: 66  LHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVSSGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSELETLSR 125
           LHSSSRTRSDRWRF+     +PEQVSSGCFPSPLPNRKS K++SR PEPDYSS LE+LSR
Sbjct: 61  LHSSSRTRSDRWRFS-----QPEQVSSGCFPSPLPNRKSAKSLSRNPEPDYSSGLESLSR 120

Query: 126 WSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           WSVSSRKSISPFRYSVSSSPSS+SS  SSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 WSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSYSSYHSSPRPTSDTEWAG 155

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match: XP_004142634.1 (uncharacterized protein LOC101220757 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 8.6e-66
Identity = 140/163 (85.89%), Postives = 147/163 (90.18%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHH-QKLKPPPAVSNFLHPSN 65
           MD DEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLR SPTHS PQHH QKLKPPPAVS+F HP N
Sbjct: 1   MDTDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRHSPTHSPPQHHRQKLKPPPAVSHFPHPPN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQV-SSGCFPSPLPNRKSPKTVSRK-PEPDYSSELET 125
           SLHSS RT+S+RWRF RS     EQV SSGCFPSPLPNRKSPK+VSRK PEPDYSS+L+T
Sbjct: 61  SLHSSPRTQSERWRFVRS-----EQVSSSGCFPSPLPNRKSPKSVSRKLPEPDYSSDLDT 120

Query: 126 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWAG 158

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match: KAE8649619.1 (hypothetical protein Csa_012837 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 258.5 bits (659), Expect = 4.3e-65
Identity = 139/162 (85.80%), Postives = 146/162 (90.12%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHH-QKLKPPPAVSNFLHPSN 65
           MD DEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLR SPTHS PQHH QKLKPPPAVS+F HP N
Sbjct: 1   MDTDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRHSPTHSPPQHHRQKLKPPPAVSHFPHPPN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQV-SSGCFPSPLPNRKSPKTVSRK-PEPDYSSELET 125
           SLHSS RT+S+RWRF RS     EQV SSGCFPSPLPNRKSPK+VSRK PEPDYSS+L+T
Sbjct: 61  SLHSSPRTQSERWRFVRS-----EQVSSSGCFPSPLPNRKSPKSVSRKLPEPDYSSDLDT 120

Query: 126 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWA 164
           LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WA
Sbjct: 121 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWA 157

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match: XP_008444194.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487607 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 9.5e-65
Identity = 141/164 (85.98%), Postives = 147/164 (89.63%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHH-QKLKPPPAVSNFLHPSN 65
           MD DEFYR+PAAVPFKWEIKPGVPRNHHR RQSPTHS PQHH QKLKPPPAVS+F HPSN
Sbjct: 1   MDTDEFYRKPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRPRQSPTHSPPQHHRQKLKPPPAVSHFPHPSN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQV-SSGCFPSPLPNRKSPKTVSRK-PEPDYSSELET 125
           SLHSS RTRSDRWRF RS     EQV SSGCFPSPLPNRKSPK +SRK PEPDYSS+L+T
Sbjct: 61  SLHSSPRTRSDRWRFVRS-----EQVSSSGCFPSPLPNRKSPKALSRKFPEPDYSSDLDT 120

Query: 126 LSRWSVSSRKSISPFRYSV-SSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           LSRWSVSSRKSISPFRYSV SSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWAG 159

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match: XP_022131529.1 (uncharacterized protein DKFZp434B061-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 237.7 bits (605), Expect = 7.8e-59
Identity = 128/165 (77.58%), Postives = 140/165 (84.85%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHSPQHHQKLKPPPAVSNFLHPSN-- 65
           MD DEFYR+PAAVPFKWEIKPGVPR HHRL  SP+  P   QKLKPPP VS+F  PS   
Sbjct: 1   MDADEFYRRPAAVPFKWEIKPGVPRAHHRLCPSPSPPP---QKLKPPPVVSHFRRPSESS 60

Query: 66  --SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVS--SGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSEL 125
             SLHSSSRTRSDRWRFARS+L EP QVS  +GCFPSP PNRKS K+++RKPEP+Y++EL
Sbjct: 61  SCSLHSSSRTRSDRWRFARSSLAEPPQVSPATGCFPSPSPNRKSGKSMNRKPEPNYTTEL 120

Query: 126 ETLSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           ETLSRWSVSSRKSISPFR SVSSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 ETLSRWSVSSRKSISPFRDSVSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWAG 162

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BAM4 (uncharacterized protein LOC103487607 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487607 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 4.6e-65
Identity = 141/164 (85.98%), Postives = 147/164 (89.63%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHH-QKLKPPPAVSNFLHPSN 65
           MD DEFYR+PAAVPFKWEIKPGVPRNHHR RQSPTHS PQHH QKLKPPPAVS+F HPSN
Sbjct: 1   MDTDEFYRKPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRPRQSPTHSPPQHHRQKLKPPPAVSHFPHPSN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQV-SSGCFPSPLPNRKSPKTVSRK-PEPDYSSELET 125
           SLHSS RTRSDRWRF RS     EQV SSGCFPSPLPNRKSPK +SRK PEPDYSS+L+T
Sbjct: 61  SLHSSPRTRSDRWRFVRS-----EQVSSSGCFPSPLPNRKSPKALSRKFPEPDYSSDLDT 120

Query: 126 LSRWSVSSRKSISPFRYSV-SSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           LSRWSVSSRKSISPFRYSV SSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 LSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWAG 159

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BQH3 (uncharacterized protein DKFZp434B061-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004696 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 237.7 bits (605), Expect = 3.8e-59
Identity = 128/165 (77.58%), Postives = 140/165 (84.85%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHSPQHHQKLKPPPAVSNFLHPSN-- 65
           MD DEFYR+PAAVPFKWEIKPGVPR HHRL  SP+  P   QKLKPPP VS+F  PS   
Sbjct: 1   MDADEFYRRPAAVPFKWEIKPGVPRAHHRLCPSPSPPP---QKLKPPPVVSHFRRPSESS 60

Query: 66  --SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVS--SGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSEL 125
             SLHSSSRTRSDRWRFARS+L EP QVS  +GCFPSP PNRKS K+++RKPEP+Y++EL
Sbjct: 61  SCSLHSSSRTRSDRWRFARSSLAEPPQVSPATGCFPSPSPNRKSGKSMNRKPEPNYTTEL 120

Query: 126 ETLSRWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           ETLSRWSVSSRKSISPFR SVSSSPSSFSS QSSPRPTSDT+WAG
Sbjct: 121 ETLSRWSVSSRKSISPFRDSVSSSPSSFSSYQSSPRPTSDTEWAG 162

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHC7 (uncharacterized protein LOC111445775 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445775 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 4.6e-57
Identity = 124/161 (77.02%), Postives = 133/161 (82.61%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHSPQHHQKLKPPPAV--SNFLHPSN 65
           MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRL Q PTHSPQ H+KLKPPPAV  + F   SN
Sbjct: 1   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLHQFPTHSPQQHKKLKPPPAVTATQFHRSSN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVSSGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSELETLS 125
           SL    RTRSDRW   +S L EPEQVS GCF SPLPNRK+ K V+RKPEPDY+SELETL 
Sbjct: 61  SL----RTRSDRWSSTQSKLAEPEQVSVGCFSSPLPNRKASKIVNRKPEPDYASELETLP 120

Query: 126 RWSVSSRKSISPFRYSVSSSPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           RWSVSS+KSISPFR SVSS  SS SS QSSPRPTSD++WAG
Sbjct: 121 RWSVSSKKSISPFRNSVSS--SSLSSYQSSPRPTSDSEWAG 155

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ISY3 (uncharacterized protein LOC111480325 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480325 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 223.4 bits (568), Expect = 7.4e-55
Identity = 121/163 (74.23%), Postives = 133/163 (81.60%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHSPQHHQKLKPPPAV--SNFLHPSN 65
           MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHH L   PTHSPQ H+KLKPPPAV  + F   SN
Sbjct: 1   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHCLHPFPTHSPQQHKKLKPPPAVTATQFHRSSN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQVSSGCFPSPLPNRKSPKTVSRKPEPDYSSELETLS 125
           SL    RTRSDRW  ++S L EPEQVS GCF SPLPNRK+ K ++RKPEPD +SELETL 
Sbjct: 61  SL----RTRSDRWSSSQSKLAEPEQVSVGCFSSPLPNRKATKILNRKPEPDCASELETLP 120

Query: 126 RWSVSSRKSISPFRYSVSS--SPSSFSSNQSSPRPTSDTDWAG 165
           RWS+SS+KSISPFR SVSS  SPSS SS QSSPRPTSD++WAG
Sbjct: 121 RWSLSSKKSISPFRNSVSSSPSPSSLSSYQSSPRPTSDSEWAG 159

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KY52 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G361790 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 1.8e-45
Identity = 102/123 (82.93%), Postives = 108/123 (87.80%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRQSPTHS-PQHH-QKLKPPPAVSNFLHPSN 65
           MD DEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLR SPTHS PQHH QKLKPPPAVS+F HP N
Sbjct: 1   MDTDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPRNHHRLRHSPTHSPPQHHRQKLKPPPAVSHFPHPPN 60

Query: 66  SLHSSSRTRSDRWRFARSNLLEPEQV-SSGCFPSPLPNRKSPKTVSRK-PEPDYSSELET 125
           SLHSS RT+S+RWRF RS     EQV SSGCFPSPLPNRKSPK+VSRK PEPDYSS+L+T
Sbjct: 61  SLHSSPRTQSERWRFVRS-----EQVSSSGCFPSPLPNRKSPKSVSRKLPEPDYSSDLDT 118

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. TAIR 10
Match: AT1G77400.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF688 (InterPro:IPR007789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hydroxyproline-rich glycoprotein family protein (TAIR:AT1G21695.1); Has 328 Blast hits to 314 proteins in 61 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 130; Fungi - 28; Plants - 92; Viruses - 10; Other Eukaryotes - 56 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.9e-15
Identity = 72/228 (31.58%), Postives = 98/228 (42.98%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPR--------------------------NHHRLRQSP 65
           +DVD+ +++P  +PF WEI+PGVP+                          +H +    P
Sbjct: 4   IDVDDSFKRPGTIPFSWEIRPGVPKTRMSQPGNTTPLQPPKKLSPLRFKPLSHSQPLLPP 63

Query: 66  THSPQHH-----------------------QKLKP---PPAVSNFLHPSNSLHSSSRTRS 125
             SP                           KLKP   P ++S F  P  S  SS R  S
Sbjct: 64  ALSPPSSSFISNSKSRPLSPLTPHSFSTTPSKLKPPRTPSSLSGFYSPGPSFRSSPRAFS 123

Query: 126 DRWRFARSNLLEPEQ----------VSSGCFPSP---LPNRKS----PKTVSRKPEPDYS 165
           +RW+  R N + PE              GCFPSP   L   KS     K+ SR     Y 
Sbjct: 124 ERWQLHRPNRIRPESEPEPSSDFSVAGFGCFPSPKFRLRKVKSGGSRRKSGSRSENDYYC 183

[Close]
BLAST of CmUC11G219460 vs. TAIR 10
Match: AT1G21695.1 (hydroxyproline-rich glycoprotein family protein )

HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 2.0e-04
Identity = 54/172 (31.40%), Postives = 74/172 (43.02%), Query Frame = 0 

Query: 6   MDVDEFYRQPAAVPFKWEIKPGVPR-----NHHRLRQSPTHSPQHHQKLK-PPPAVSNFL 65
           +D D+ +++P AVPFKWEI+PGVP+     +   L Q P  +     KLK  PP+ S   
Sbjct: 2   VDGDDSFKRPGAVPFKWEIRPGVPKTRPGDDDPALLQPPPPNKLPPLKLKSTPPSNSPSP 61

Query: 66  HPSNSLHSSSRTR--SDRWRFARSNLLEPEQVSSGCFPSPLP--NRKSPKTVSRKP---- 125
             S+S  S SR+R  S         L  P    S C  SP P     SP+     P    
Sbjct: 62  SSSSSFFSESRSRPVSPFAPPPSFKLKSPSDSDSNCSASPTPYFRSSSPRAGGSLPRCFF 121

Query: 126 -------EPDYSSELETLSRWSVSSRKSISP--FRYSVSSSPSSFSSNQSSP 155
                  +   S +L+   +   SS  S S   +    + SPS   S+Q SP
Sbjct: 122 PKSLFGLKKSKSGDLKKTGQQEPSSTTSESDNFYESGTTLSPSEEDSSQGSP 173

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038899347.15.7e-7086.88uncharacterized protein LOC120086669 [Benincasa hispida][more]
XP_004142634.18.6e-6685.89uncharacterized protein LOC101220757 [Cucumis sativus][more]
KAE8649619.14.3e-6585.80hypothetical protein Csa_012837 [Cucumis sativus][more]
XP_008444194.19.5e-6585.98PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487607 [Cucumis melo][more]
XP_022131529.17.8e-5977.58uncharacterized protein DKFZp434B061-like [Momordica charantia][more]
BLAST of CmUC11G219460 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmUC11G219460 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3BAM44.6e-6585.98uncharacterized protein LOC103487607 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487607 PE=... [more]
A0A6J1BQH33.8e-5977.58uncharacterized protein DKFZp434B061-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC1... [more]
A0A6J1FHC74.6e-5777.02uncharacterized protein LOC111445775 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114457... [more]
A0A6J1ISY37.4e-5574.23uncharacterized protein LOC111480325 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480325... [more]
A0A0A0KY521.8e-4582.93Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G361790 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CmUC11G219460 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G77400.11.9e-1531.58CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF688 (InterPro:IPR0077... [more]
AT1G21695.12.0e-0431.40hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 136..164
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 88..121
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 136..165
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 88..103
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..73
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR35466SERINE/ARGININE REPETITIVE MATRIX PROTEIN 1coord: 5..165
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR35466:SF4SERINE/ARGININE REPETITIVE MATRIX PROTEIN 1coord: 5..165

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC11G219460.1CmUC11G219460.1mRNA