CmUC10G188520 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC10G188520
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr10: 8570488 .. 8578644 (+)
RNA-Seq ExpressionCmUC10G188520
SyntenyCmUC10G188520
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGTTCGCTACAACGAAAAGACAAAGCGAAAGTTGCATGTGATAGAAGAGATTCCTCCAGAGATCTCTCCAATGACAACAAACAAATATGGTGTTCGGGTGCGGGGTATGCTTGTCTGCAAAGATAGAATGGAAATGCTGACTGTGGTTGCTAAAAGAAGGCGTTCAGGTTTTGGTCCCCCACTAAAGACAAAGCGAAGATCCCTGTAAGTTTTCTTGTCCTTACCTTAACTTATTTGGTAGGTCCAAGGAAAGAGATCTTTCCAACGAAGGGTAAGTCACTGTCGAGTGAGTCTTCAAATCATTCCAAAAATTTTATTGTCTCTCAGCAAAACCCTAGTATGCATTTTAGGTCTCGCACTTTTGGGTTAAAACAAAATAGGATTAATGAAACTAGGAGTTGTACTGATAAAAACTCATTGCTTGAAAGTTTTGCCCTGAATCCATCCACTCTGAAACTGTTGTTACTGAGAATGTGTCATCGAAAAATCCATCTAAATCCGCCAAAGGTACGTCCGATGTTTGTACTCTTGAAATTATTTTTGAAACCCTTGCCTCTATGCCTGATGTTGTCACCGAAAGTAATGTTGAGAATCTCAATTTTCCTACTGAAAATGTGAAGAATTCATTCTCTGTTCCCTCCAAGTCTAATGCTGATAGATGTGCAAAGCGAAGTAGTTTTGCTGATATTGATCTGCAAGTTAGTGCTATGAATAATCTGTCTCTTGTCAGTGGTACTCATGAGCAAGAAACAACTCCAAAGGCTGCCTCTATGTCCCCAGGGTCTTCAAGTACTAAGTTAGAGAAAATGGCTTCTGATGGAGACGGTGAGTGGGGTCTGTTAAGTTGTTCGGAGGAAGAAACTCCTGTCACAACCAAAGTAACAAGGAGTTCTACCAAATGGAAAACCAAGACTACCTCTATGAGTAATGTGGCTACTGTTCCTTTGGATGAGGTATCCTTTCACTCTGAAGAGGGTGCCAGTCTTTGGAAATATGTTGTGAAATGCAAAATTGTTGATGAGAAGGAACTGTCTTTAAGCACCCAAAAGTGTTTAGACCTTATGGGTCTTTTGTTCGAAGCACAACTTGATAAAACTGTATTGTGTTTGGGCTCTTTCTATCCACAATTGGTTGGTGAATTTATTGTGAACTTGTCCTCTGACTTTGACAATCCTTACAGTCCTGATTTTCACAAAGTTCATGTGAGAAGACATCAGTTTACTTTCTATGTAGCCATCATAAGTCAATATTTACAGCATGTTATTCCTTAAGATGTGATGGAGCAACGACCCTTTATGAGAGAGTTGGTTTTGAGTTAACTGGAGGAGATAGGATAACATGGCACGCGAAAGGTCAATTGCCTACTGCAGCTCTCAGTATGAAATACGCTATTCTTCATCGTATTAGAATCACAAACTAGTGTCCATCCTCTCATAGATCTGGTCTTTCCATTTCGCTTGCTACTCTGATTATTCAAATTGGTAATAAATTCCCTTTTGACGGACAAATGAGCATGCAGCAGAAGTTAATTTGATCAATTTTCACTCTAAGATGCTCAATTTAGATGATTAAACATGCAATTAAGAAGAAAAACCAAAGTTTCAAGAACACTTACCCTTGAAGCTCCAAATTCTCCTTCAATTCTTGATGAATTTCAGCACCACTTGGTTGTAGACCACCACAAGAGTCTTCTCTACTATTCTCTAGGCTTAGATTGGATGGTGGGATCCAAATTTGTGGTGAATTTGATAAAGAATGAAGGTTGGGAAGAAGATGAACAATGGATAGAATTTTGCAAAATTAACCCTTAGTTTCACAAAATTCTTAACCCTTTTTTATGTCAAAATCATCTCTATTTATTAAAGAATAACATGCAATCCAATTGCATCAAAATTTGACAACACAAAATGGTTAATTTGTTGGTTAATTTTGAAAAAGACAACTAAGCTCCTAGCTTAGTTAGTGGGAAAATCCAATCTTCAAAAATCAATTTTAAAATCAATTTTCAATGAATTTCCAAAATTGAATTAAAATTGATTTTTAATTTCAAAAAGATAATTAAATAATTAAATAAAAAATAATTTAATATTTAATTAATTAAATATTATTATTTTAATATTAAATAATAAAATAATATTATTTTTCCCACTTGTCCCGATTTTTCTAAAAAAAAACCGATATGAATCCCTATTCATATTATTAATATTTAAATTATATTTAAATATTATAATTAACTCTATTTGTACGTTTAATTCGTAATTAAACGCCGATATATCGTATATATCTAACTTTCATTCCTTAAGCCAAGATTTGAACGATTCAAACTTATTCACCACATTATCTAAGATTTTAGTCCATTTATGAGCTAGTAGAGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGAGCTCCAACGATCTGAGATTAACCTGCCAAACTCTTTAACCTAGTTAACTAACATTCGTTAACTAACGGGACACTCCACTAAAGCCCATAGTTGCACTCTCCTCACTGTAGATATATTTGTGTCCATTTGATATAACCGTCATCGATAAGTCAATCCTTCACAGGTTGTTCATAACTTCAGCTAGGTCAAATACCAATTTACCTCTGAGTTACATCTTTTCTCCTTAAGTACCATTGTCCCTCTAATGAACAATTAATTTAGGATCTAATCACTAAATCCATTCCCTCTCGGGCCAGTGAGAGGATGGGGCCCCTTGTTCAAGTCCTGGGAACAACACTTAAGAAAAAAACCTCTCTTCTATCCCTAAGTTGGGTAGGAGTGAATTCCGTTTTGCATATTCTATGTTCCTAACTATCTACCTAGTCTTATCCCTGAAATAGGAGGAATGTTGAGCAGCACTATTGAGCTTACTCTTACCTATGTAGATCAAGGGATAATTCTAAATAAATAGGAGTTCATAGATAACTCAAGATTCAGATCAAGTTATCTAGGTCATCGATAAGTGAAATTAATCAGTGTTAATCGTAAACGGTGTTAATACGTAACAGTAATTATTTCAGGGTCAGTCTTACACAATCTCATTATGTGGAATACCCCGCTCACATGTCTCTACATGATCAAATCAGAATCACTTCATTTATGACACTTTACAATTTTTGTAACAATCATGAAACGGGTCGTATTCAATAGTGTCTCCAGGAAGAGGTACCCAACCTGATCCATGTACTATAGACTATTGAGGCTACTTACTCGAACTTGATCCTGTTTATGTCTCCCCATAAAGTCCAAGTACTCATGATAGTAGCCAAGGGTTCGTAGTTTAATTGGATTTAGAGTTGATAAATAATTAATTCACTTGAATAACTTCATATGTACTAAAAATCACCTATTTACAAAAACTACGAGTTTTAGGACATACAACCCAACAAACTCCCACTTGGACTAAAACTCCTAGTGGGTTACAACAAAGTTGAGTACAGTAAGAGAATCTAAATACAATAAACTAGGGCATCCCATACCCACAATTTCTCCCACTTGCCCTATTTATTCTACTCGTAATCCTAAACTCTTCAGGTTGCCCTAAAAAACAGTAGCCGGGAGGGCCTTTGTAAATGGATCAGCAATGTTGTGCTCAGATGCTATTTGTCTCACAATAACGTCTCCTCTCTGCACAATTTCTCTGATGAGATGGTATTTGCGCTCAATATGCTTTCCGCGCTTATGGCTTCTTGGTTCTTTGGAGTTCGCTACTGCCCCACTATTATCACAATGTAAAGTGATTGGTAGATGCATGTCTGGAACAATTTCCAGATCGTTGAGGAACTTCCTAAGCCATACTGCTTCTTTGGCTGCCTCGCCTGCAGCAACATATTCCGCTTCCATTGTGGAGTCGGCAATGCAACTTTGCTTAATACTTCTCCACACTACTGCTTCTCCGTTAAGAGTGAATACCAATCCCGAAGTAGATCTCCTTGAGTCTATATCGGTTTGAAAATCGGAATCAGTGTATCCGGTAAGGATCAAATCCTTATTTCCATACACAAGCACGTAGTTCCTCGTTCTCCTTAGATACTTGAGGATATTCTTAACGGCAATCCAATGTGCAAACCCAGGATTGGACTGATACCTACTGACAATTCCTACTGCAAAACATATGTCTGGTCATGTACATAGCATTGCATACATCAGACTCCCGACAGCTGATGCGTAGGGAAGTCGTCTCATATCCTCAACCTCTTGAGGTGTTTTAGGACATTGTTCCTTTGACAAATGTATTCCATACCTGAAAGGTAGAAGACCTCTCTTGGAATCTTGCATCTTAAACCTAGACAACACTTTGTCTATATAAGATGTTTGAGACATAGCTAACGTTCTATTCTTACGGTTTCGAACTATTTGGATCCCGAGAACATACTGAGCTTCTCCCATATCTTTCATTTGAAATTGAGTTGCTAGCCAATTCTTAATGTCAGTAAGATATCCTACATTATTCCCAATAAGTAAGATATCATTTACATATAGAACAAGAAATGCTACAGTGGAATTGATGATCCTTTTATATACACAAGGTTCATCAACGTTTTGTTTAAAGCCATAAGATTTGACTGCAGTATCAAATCTCATATTCCAAGATCTGGATGCTTGTTTTAATCCATAAATGGATCTATTCAGCTTGCAAACTTTTTGCTCCTGGCCTTGTTCTATGAACCCTTCTGGTTGGACCATGTAGATGTTCTCTTCAAGATTGCCATTTAGGAAGGCAGTCTTGACATCCATTTGCCAAATTTCATAATTATAAAAAGTGGCAATGGATAAGAGTATCCTTATTGATTTTATCATAGCAACAGGTGAAAAGGTTTCTTCATAATCTACCCCCTCTACCTGGGTATAACCCTTTGCTACTAACCGGGCTTTATAGGTCTGTACCTTCCCCATATGGTCTCGTTTACGTTTGTAAATCCATTTACAACCGATAGGTCTTACCTCATCAGGTTGATCTATAAGTTCCCAGACTGAATTGAAGTACATAGACTCCAT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mRNA sequence

ATGGTTCGCTACAACGAAAAGACAAAGCGAAAGTTGCATGTGATAGAAGAGATTCCTCCAGAGATCTCTCCAATGACAACAAACAAATATGGTGTTCGGGTGCGGGGTATGCTTGTCTGCAAAGATAGAATGGAAATGCTGACTGTGGTTGCTAAAAGAAGGCGTTCAGGTCCAAGGAAAGAGATCTTTCCAACGAAGGGTAAGTCACTGTCGAGTGAGTCTTCAAATCATTCCAAAAATTTTATTTTTTGCCCTGAATCCATCCACTCTGAAACTGTTGTTACTGAGAATGTGTCATCGAAAAATCCATCTAAATCCGCCAAAGGTACGTCCGATGTTTGTACTCTTGAAATTATTTTTGAAACCCTTGCCTCTATGCCTGATGTTGTCACCGAAAGTAATGTTGAGAATCTCAATTTTCCTACTGAAAATGTGAAGAATTCATTCTCTGTTCCCTCCAAGTCTAATGCTGATAGATGTGCAAAGCGAAGTAGTTTTGCTGATATTGATCTGCAAGTTAGTGCTATGAATAATCTGTCTCTTGTCAGTGGTACTCATGAGCAAGAAACAACTCCAAAGGCTGCCTCTATGTCCCCAGGGTCTTCAAGTACTAAGTTAGAGAAAATGGCTTCTGATGGAGACGCTTGTGTTTTTTCTGGCCGTTTTGGCGAATTGACAAGAGTTCTTGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTCGCTACAACGAAAAGACAAAGCGAAAGTTGCATGTGATAGAAGAGATTCCTCCAGAGATCTCTCCAATGACAACAAACAAATATGGTGTTCGGGTGCGGGGTATGCTTGTCTGCAAAGATAGAATGGAAATGCTGACTGTGGTTGCTAAAAGAAGGCGTTCAGGTCCAAGGAAAGAGATCTTTCCAACGAAGGGTAAGTCACTGTCGAGTGAGTCTTCAAATCATTCCAAAAATTTTATTTTTTGCCCTGAATCCATCCACTCTGAAACTGTTGTTACTGAGAATGTGTCATCGAAAAATCCATCTAAATCCGCCAAAGGTACGTCCGATGTTTGTACTCTTGAAATTATTTTTGAAACCCTTGCCTCTATGCCTGATGTTGTCACCGAAAGTAATGTTGAGAATCTCAATTTTCCTACTGAAAATGTGAAGAATTCATTCTCTGTTCCCTCCAAGTCTAATGCTGATAGATGTGCAAAGCGAAGTAGTTTTGCTGATATTGATCTGCAAGTTAGTGCTATGAATAATCTGTCTCTTGTCAGTGGTACTCATGAGCAAGAAACAACTCCAAAGGCTGCCTCTATGTCCCCAGGGTCTTCAAGTACTAAGTTAGAGAAAATGGCTTCTGATGGAGACGCTTGTGTTTTTTCTGGCCGTTTTGGCGAATTGACAAGAGTTCTTGCTTGA

Protein sequence

MVRYNEKTKRKLHVIEEIPPEISPMTTNKYGVRVRGMLVCKDRMEMLTVVAKRRRSGPRKEIFPTKGKSLSSESSNHSKNFIFCPESIHSETVVTENVSSKNPSKSAKGTSDVCTLEIIFETLASMPDVVTESNVENLNFPTENVKNSFSVPSKSNADRCAKRSSFADIDLQVSAMNNLSLVSGTHEQETTPKAASMSPGSSSTKLEKMASDGDACVFSGRFGELTRVLA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 55..74
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 185..207

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC10G188520.1CmUC10G188520.1mRNA