CmUC10G187970 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview


Name	CmUC10G187970
Type	gene
Organism	Citrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
Description	Unknown protein
Location	CmU531Chr10: 7083055 .. 7093684 (+)
RNA-Seq Expression	CmUC10G187970
Synteny	CmUC10G187970

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGACAATGAGGATAGTGTGAGTTGGTCCTCCCATGAAAATTCTTCAAATTGCACATCTAATGAAACCAATCCTTACTATGATAGATTTGGGATGGGGCCCGAAGCTTGTCATATGGGTTTGTCATCGTCGGTGACTGAAGTTCAACTTGATTCTTTACGGTACAAATATGACATTCCTACTGATGTGCATTTAAGGGTCCCCTCTCCCTATTAAAGTATGGATCAACCTTCTGCTGATGAAGTTGCTTTTGATTTACTATGTTCCAATTTTGTGTGCGTCCTCCCTTACCTTTTTATTCTCTTAAATTAAGAGAATTTCTAGTAGATTTCACATGTTTGCTAGTGGTTTTTAGGTCATTACAAAGAAAGCTAGAATCGAAAGCCAAAAGAACTAAACCGAGCCAAAATCAAGTGAAAAAGAGAAGAAAATCACCAAATTGCAAAAAACAGAGCAACGCTTTTTTCCGAGAGCATCACCTGATCTCAGTGCAACAACACTGACGCAGCGTTGCGGCACCGCACTTAGGGTAGCCTTCTATGACACACAGCATCGCGATGCCATCCTATAGCATAGCAACGCCATCTTTTGATGTCGGATAGCATATTAGCGCCATGCTACAGGGCCATGACGCCAACTTTCCATATTTGCAAAATCTACATTTTTGGAAAGAATTTTAAGCGGCCAACTCTATAAATTGAAGGGTTTTCAGCAACCCTAGACATCAAGAAATTAGAGAAAAACCCACCAAGAGAGTCCCAAAGAGTGAGTTGGTTGCAAGGAAGAGAGAAGAGAGTTTGAGAGAGAGTTTGGTGCCGTTCGAGTTCCCGACGTGAAGACTAAGGACATCTTGGCGGTTCCTCCTCAATCAAGGGCTTCTTTTCAATAGAGTTTCCATTTCTTTACACTCTTTCTATGCTCTTATTGTTTGTGAACATGTTGCTTAAACTCTTTAGTTTTAGGGTTTTGATGAATTGTTTATGAAGTTATGTTGATATTGTAGACTATTCATGGTTTTGTTGTAATGAATATGCTTTTCATTGTTATTGTGCTTAATTCTTGTTGATTGGTCATCCTTGAAATTTAGGTTAGATGTATGGTTGAGATAATTGTATGTCTAATTGGATCTATAACAATGAATTGTTGTTAATCTATTATGTAAATAGTTAGGTTAACAATGAAAGTTGTTAAAGACTACTTTTAATGCCATATAATTTGTATTGGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATTAAGTTACATGAAAAAAAGGTTGTTTTTGAAAGAAAATAACTTAGATTTATGTTTCTAGACTTAAGCATATGAGTTGCAATAAAATCCATGAACCCTAGAATATTGCATAATGAAGTAAACAAGGATTCATTACCCTAGAATTCTCTTTGACTCTTATGTTTCTTATTTACTTGCTTTTCCATTTTAGTTTTTTTCAAAATCACAACTTAAATTCGAATCCTAAAATAAAATTGATTCAATTTTAGAATAGCTAAGTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATATTCACTATTTGAAATAATTAGAGTAACTTTAGAGCTAAACGTATGATTTTGGTAGCTGAATTGTGTAATATGTGTTACCATGCATTGACATCATTTACAAAAGAATATACCTGAGAAAATATGAGCTTTTTTGTTCTTAACGCAGGATTAAGTAGAAAAGAAGCACAAATAACCCAAGTACTAGAGAAGAAGCTGCTGCGAGAACTAAAGAAGTGAAAACCCATGCGTCAAGACCATGCGTTGAAAAAGTAGATACAGATGCCTGGGCGGTAGCTGTCATATCAATATGCAAACGAATTACACTTTATTAGATCATGGCAGAATCAATGGGCTGACGACGTGAAAAGTGTGCGCAACAGGGCATGAAATTTAATGTAAAGGTGTCAGATTATCATGAGTTCACTTTTTCGACACCTATAAATAACCCAAAGCTTCTCAATTGAAAGGCAGAGAGAAACTAGTTCAAGAGGCGAAAGCTCTGCACAAATTCTCCCTCACTATAACCAGCCTCCATTTCAAGCTCTTCTGTGAGAAGAATTCTAAGAATTTTCAGTCATCTCCTAGTGAGTGAGAACCTTCATCCTATGCCATTTATGTACACTGCCAGTGGCGGCTTGACGTCTTCCATTTCTGTTCTTTCTTCATTCCCATCTTTCTTACTTATGCTTTGTTAATGACATTCGAGAGAATGGTTTATTTACTGAATATAAGTTTGATTGACAATTATCTTCCACTCATTTCCATATTTAATACTCTCCACCATGTTTGCATGTATGTTGAACGAGTTAAATGTTAGAAGTTAGTTTTTTTTAAGCAATAATAAATATGTTTACATCTTGATTAATGCACATCATTAACTTACATAGATTTGTTAAACAAACAAGTTTAAATAAGCATGACTATCTAGCTTGAGAGAGTAGATGGTTAATCTTTAGCATTTATTAAGACTAGATGGGTTTCAGAGATGTAGTTCATCTTTTGCCAAAACAAATTCACCATGCGTCTTAGAGATTAGATTAATGTGGTGTCGAAACATCAAAAGATGGATTCTCAAACCCAAAGTTTGTAACAATGTAAATACACTTAGATATGCTTAAGTAACAACTTGCTGCTATGCTAACTCTCTTATATTTCATGGTTTCATCCTCCTTTTCAATGCATGCTATCTGATTATAAATGATATTTGACTAACATTCTCCACAACCACCCCACCATGTTAATTGTAGGAAATTTCATTTGTTCTTTATGTATAGAATTAGACACAGAAAATTCCTCCTCGAACATAATACGTGTATAGTCACCGCATAGATTATGTAATTAGTCTCAACACTTAATTTATTACAAATCCCTGCGTTCGACCCTAGACTCACCAGGAAACCTATAGAAGCTTACACTTAAGTTTTTTTAGGAGAACTTGCTGATTAATGAACATATTTGTGTAATTCTCGATGCATACTTTGTAATAAAATGATCACACCTAAAAAGGCAACACTAAGTAAGTTAAACCTTCACAATTGGATCCTTAGTGGAATGATATTCGAAACTTAATCGTCTTATATTATAACTTGACCTATACACTTGCAGTAACATGGAAAGTGAGCATCACTTACTCAACTTGCCCCTGCTCAAATTTCACCCAATGGGTGGAGTCATTTGTTTGGCTATTATGTTTTATGGTTAATTTGTCGAAACAATTCTCCTTTATCTGCTTCGTCTTCCTTCTACTGCTCGTTTTGGACCTACCTTGGTTCGATAGGAAAATCTCGTTATGTTCGATTTAATTTCTTCTCGTCAACATAAAGTTTTGTAACCCACCTCCTTCACTCATCTACACGATTTCTCCAATTTTGGCTAGGCTCAGCCTTAGCTAGGCTTTACCTCAATCGCTCCCTTTTTATTCTCTTCCTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATTTTCCTTTCGTTTTTCTATAGATATGGCACCTAGGAAAGCTTCTTTCTTCGAAACCCGCGATGAAAACATCAAAAGTCTACTCAACGGGGTGAGTCGTCGCAGGCTAGTACTCAAGCCAACGTCGCTAACTTAAATGTTGTGGAAATTATTTGTTGAATTTGAAATTACAAACGCAAGGTGTAGCTTAAGATATGATGATGCGTTTTACATATCATGCGTTGAACATGTTATGCGTTTCACTACTATGCGTTGGTGATCTTGTCAAGTTTTCCACTCCTTTAACCAAGTATAAGCAAAGGAGTAGGTTTTCTCGGTGAGTCCGAGGTCGAACACAGGGATTACGTTGATTTAGTATTTAAGTGAATTACATGCGTTGCAGTGGTAACTAAGAAATAATTGGAGGAGTGTTTTGTTTTTAATCTAAAGAAACCGATTGTATGTACACTAGACTAAAATTGTGGAAGATGGAAAGCATGCGACACAGCAAATTCAACTAATGATGTGAATAAATGGATAAAGAAATGGTTCGGGTTGGTTAACATCTAACATCGGAAACGCATGGTAGTATTCTATTCATACTTGCGACTCTTCTCCCGGTTGTCAGCCGCTATGCGTTATATGGAGTGTTAAGAACCAAGGTTATTCCTATAGACAGGTAACACTTCTTGGCCCTTGTCAATTGAGTTCCACAATCACTTACCCTCTCGAGCAGTTTGATTATTACTACTTATATCGATTTGTCAGATGGACATAAGCATCAGATTAAGATCGCAATTGACAAGATGAAATAGTTACACTATGGTTCTTAGTTAGATGCTAACGCAACCCTAGACCCTTGAGTGATTAGTTACTCATGGTTTGAAAGTAAAAAGCGGAAAGTATAGAGAAATGAGTAGACATGGAAGATATATATATTGTTGAAACGGAATACAACTTTAGATAGTCTCAATGTCTTGACACAAATCTAAAATCAAGAGAGAAAACCTAAGAAAGAAAGCAGGAAAGGCGTCAATGTCTTGAGTTGTCCGGATGGAAGCGTGAGTTTCTGTTGTGAAGTGGTCCGGCGGAGGGAAGACTCTTCTCTCTCGAGCTATTCATCTCCGGTTGAAGTCTGAGAGAACTCTGCTGTCATTTATGGAGTTCTTCCGAGAATCAACAACCCTTTCTCATCTCGCAGAGCTGCCCTTTTATAGATGATGCGTTGGCAATTAATGGCAAATCTGCTTGATTGGCGGCGAGATTGATACCATGCGTCCATCTCGCCTGATTGCGTGATTCTGGGGTCAATTAAGATCCACCACTTTAGCCACAAATCATGTTCATCAATCATCCGACAATCTCTCAAGATTTTGATTTGATTCTCGGCGCCTTGCATTGATGGTCGTCTATGCATCCATGAATAGTTTGGCCGATGTTAACGCGTCGTAGGTTGCTAACGCATAGTCATGCGTTGAATAGTTGTTAACGCATCATCAGGTTGTTCGCGTTCCGTTCAGATCATGCGTCCACGAAGAACAGACTGCTAACGCGTCGT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mRNA sequence

ATGGACAATGAGGATAGTGTGAGTTGGTCCTCCCATGAAAATTCTTCAAATTGCACATCTAATGAAACCAATCCTTACTATGATAGATTTGGGATGGGGCCCGAAGCTTGTCATATGGGTTTGTCATCGTCGGTGACTGAAGTTCAACTTGATTCTTTACGACTCCGTGGTATCCCTCCTTCTCATGGTGAAGGTTCCTCAACCCGTCTTCAGCCATTTGCTTTGGCTGAGGACTTTGTCGCTTCTGGTGGCGAGATGGAGCTTGTCACTAGGAGTCTTGAGCTTTGGCGTGGCATTAGTGATAAGCCCACCAAACCTGAGATCGGCTATACTGACCCGGCTACTACGCTGACTCAAGCTTTCTATGATTACCATCACGTTTCCCAAGCTAATCATCTTCTGGCTGAAACCAAGGCAGAGCTGGAATCATCTAAGGCTTACAATGCTCAAATTCAAGCCAAACTTGATAAAGCTGAAGCCTTCCTTTGTGATGCGCCTCACTTGGAAGCAAAATTAAAGAAACTGAATCGTTCACTAGGCTTCAAGATTTCGTTATGGAATATGGAGTTCAATGGTGTGTGA

Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

MDNEDSVSWSSHENSSNCTSNETNPYYDRFGMGPEACHMGLSSSVTEVQLDSLRLRGIPPSHGEGSSTRLQPFALAEDFVASGGEMELVTRSLELWRGISDKPTKPEIGYTDPATTLTQAFYDYHHVSQANHLLAETKAELESSKAYNAQIQAKLDKAEAFLCDAPHLEAKLKKLNRSLGFKISLWNMEFNGV

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmUC10G187970 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC10G187970 vs.


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BLAST of CmUC10G187970 vs.


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BLAST of CmUC10G187970 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..22
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 8..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC10G187970.1	CmUC10G187970.1	mRNA