CmUC09G169510 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC09G169510
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr09: 9125374 .. 9129816 (+)
RNA-Seq ExpressionCmUC09G169510
SyntenyCmUC09G169510
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACACCCCCACTCATAGACCTTAACCCCTTGAACCACAAAGTTCTACGACAACATGAACGCGAGTATGGACATGGATTGTCTTGTCCCACCAACATGAGCGCAATTCAAAGGTTAAGGCACCCAAAACCTTTCCAAGTCCAAAATTCAAACTCCCATCCCTAATATCAATGCTGTGTTCTAATTAAAAAGAAAAATACAATGTCCTATAACCTATTGGCGAAAGCATCCTTTTGTTGTGAGGCCCAACATGCCAATTTGCTCTTATCTCACAAAACCCCAATTCTAAACCAGCTGAAGGAAATTAAGGTATGTGCATGAAAGAATATGAAAAGAGAGATCATCAGAAGAAAACCAAGAGAATCCAAAAATATCTCACCATTTCAACATACAAACAGTGAAGCAGTCAGCAGAGCAACTTTTTCCGCCGCTACAACGCGTCGGTAGAGAGTTGTGGCAAATGCATCACAAAACTGACGAATCAATTGATTCAAATAGGGCTAGAAAGAAGCGAAATGCTTCAGATCGCAACTCTATCCTTGGCTCTCGGAAGAAACAGTACATGTTGCGTTGTGTGGGTTTGGGTAGAGTTCAAACAGTCCTAAGTGTTGAATCCCATGATGATGAAGATGACAGACCTCTTTCGTAATCGTATTTCAGAAAATGGGCAATTAGGCATCGGCAAAGGAACTGAACGGTTATACTTCCACTATGTAAAGGGTTTTAGTTTCCATTTCCTCTACTTTTAAAATTGATTTTGGAAGGGTTAGGTCCTTTTCAAAAAAAAAACCCTTTTAATAATTTAAAATTCATTTAATTTTACAATTTTAAATATAATTTATTTAATATATTTTAGAGCTATTTTGAAAATATCAAAACTCTTTAAACATATCTTAAATTTTTGGGTAAAAAGTTCAATTCAAGAGTTAATTAGTTATAAATAATCCTCCAAGTTTTCTACCTTTCACAAATAACAAGAACAAATGAAAACGTATGTAATCTTTACCTAAACCTTACGTAATCTTTTTCCAAATCTTACGCAATCCTATTTCAACTTTTGTTTTTTATTTCTTCATCTAATTAGAGAATTTGAAAGAAAAAAAAATTAAATACATAATATTTGGAATTAAGTAAGATTGCGTACAACCCTATTATTGATCGGATTCCGCCCAAAAAGCCAAATAAATTTGATGGTTTCGATATGACATTAAAAAAAAACCAAAATTTTGTTTTAATCTTGGTACCAACCCACCCATTCAACTAGTTTCCAATTGCTCTTGTGTGTTACTCCCATTTAGGAAAGACCATAAGAACATGAAATTGACCCCAACCCAACTTGTCATGTTTAGATCATCTCTAGATATGAACATGTATTTTAGTGGCCAATTGATCCATTGTATCTTTATTATATTAAAAAGCAACCATCTTTGTAAAACTGTTTTGGACTATTTTGTCCCTTTGCCAATTTCAAAATTTACACAATCTGCAAGTTACAATTAATTGTACCAATAATTAATAGATAGTTGATTGATTAGCAATAATAATAAATAGAGAGAATACAAAAGGTTTCTCTACAACTTAAAGACTTTATTTTTAAGTCTCTTTTCAAATATAGCAAATATAGCAAAATTTTACTATCTATCTGCGAATCTATCATAGATAGACCGTGTATTTTGCTATTAGTTGTAAATATTTTCAGCAGTTTTGTCATTTAGGATAATTTCCCTTATTTTTATTTAATTATAATTAATTATTGAATTTCAAAAGTTAAAGTCTTTAATTTTTTATCATCTACTATTATAAAAATGACATTTTTTTCATCATTCTTCCAACACTTTCACCAAATATTTCTCTAAGATTCTACTTTCTTTCTCTTTTTTTTTTCCTGTTATTTCAACTAATTGTTATCATACACATATCTAACCACAATGAGATTAGGTGGATGGGAGCTCCAATCGTTTGTGAAGCTTTTGCAGTTATTCACCATTAAACGTCACCAAACTTTTAAGATATTAGAGTAACTACACTTGCATCTTTCATTGAAAGAGCCAATGACTAGCCTTATTGTATTCCATATCAAATATTTTAAAAAGTATTTCCATGTAGAATTTGGACATGAATGATGCTAATGTTTTATAAGCATTAAGCTAAAGTGGGAGTGCTTGTCCTATTTATATGAAATTTGATTTTATGAATGTTATTTTCGAAAAATAAAAAGAAGAAACAATGCTCACAATGTCTCTTCAATCTCAAAAGATCGAGATGTTTTATGTATGTTATTTTAATATTTATATAAAAAAAAATCACAATCCTAAAATAATATTTATGGATTATTTCGTCTCATTTCAAATTTTAAATATACAGAATATCTCACTTATAAAACGTTACAATTGATTGCCAATATGAGCATAGTTGAACTAACATAATTTTTTTTCTCAATGATAAATAGTTAACTCAATAATTATTACATATTTCTTTTTTTAAAAAAATAATCATTACATGTTTAATCATATTTAATGTAAAAAAATATCAAAAGTATTGTATTCTCATAAGTTTTGCTTCTTCAATTATGTGTAATTTAAACCATTTAAAGTATTAGAATATAAAAAGTTTGTTTTTGTTTATATTTTTAGCTACATAAGTTAACTTAATAGTTATTACACCTTTAATCATCTTAATGATAAAAAAAATATCAAAACTCTTCTATTCTCATAAGTTGTTTTTAGTACTAAATCTTACAAGTTGTACTTCTTCGTTTATGTGTAACTTAAATTATTTAAAATTTAAAATGTTAGAATTAGAATATGAAAAGTTTTCATTTTATTTATTTATGTAAAATAATATAATAAATTATTACATTTGTAGTTCTATATAATATAATATCTTTAATTTATAAATCTATAATATATATATGTCATTTATATAAATAAATAAAAAAAACCATAATATTTTATATCTTTTTTACTAATTGTACTCTAAATTTTAATTTGACTACCATAGTGCCAAATCAATCTTATGAAGTGTTTGAATCTTGGGCTAAGGAACTCGTTTTGTGACTCAAGAACTCTAATCTTAAGGCAATCCGTGCCTAACCCAATTCATGTTTCCATGAGCTTGAGTTGCTTTGTATGGTCTTCAAAGCCTAAGGTTTCTTTTGAATTCAGTCTGAGAAAATATGGTTGAATGAAATATCCTTTGATTTGCAGAGATTTGAGAATTTGTCAATTGTATGATTGTGTGTAGTTGTATTGAAAAAGGTTTAGATGTTACCGCATGTTGGTTGTGCCCTCCTTGAATTTAAACTCTTTTGCTCATTGTATTCTTTTTCATATGCACCTGTATGTTCGTTGCATCTCTTATGGAAATGTTGTTGAGACCCTTCGTCAAATAAATATCGAGTCTAGCTAAACCTTGCATTATAAGTAGAACAAGTTGATCCATAAAGAGTTACAAAAATAATAAATTCTTTTGTTGGATTTATGTAGAACGGGAGGGTTTGTGTAGTAATTATGCAAGAAAATTAGATATGCTTAAAAATAAATGCTTGGAGATAAAATTGATTGTCACCACCAATTCATAGTATTTGATCACTAGAATTAAATATCTAAGTAAACACTATGTTAAAAGAGTCAATGACTAGACTGAAAAACCTTACTAGTCTTAAAACTTCCTTAAAGAAAATCAATTTCTTTCAACGTCCAATCAATTCTTGAGTTAACTAAATAATTGGGGGTGAAAATTTTTCATACTATAGTAAATTGCATGAAGTTGTAGAGATTAATCTAAACGTTCCAATTACATCAAAAATCACTAGAAGAAAACTAGGATTCAATGGCATTAATGTAATTTAATTACAATAATTTTTCTATCATGCAAGCTATGAACATTATGGAAAAGCCTAAACAAACAAACACACACATGAAGTAGTTCTAGATGCTATTCAATTTCATTAAACACAACAATTATGAATTGTGATTTGCATTGAGAAGAATTAACCAAACATATAGTGACAAAAATGGAACACTCAAAATTATAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTGTACCCTCAAAGTTGGAAACTTTTAAAAAGTTAACACTTAAACATTTAATTTTGAAAAGTAAACTTGGGGAATTAGTTACATAATTGTGAAAAATTAGTTGACACAATTATGAGAGCTACGAGAATTGGGCTCATGGAAACGGGGGTTTCGAGTCATTGACGTTGTGGGTGAGCTTCATTTCTTCTCATTAATGGAATTTTCCTATGCTTATTGGCTGATTTTGGTGTTTTCCTATTGGTAGTGTTCAAGTATGCAAAAGGGTCGGATTCTGTTCTCTTCCTCCGCCCTCTACGGTGGCCTCTCCACCACCTTCTGGAGCTAAGCCGCCAGACATTTCTCCATCTCCGCCGTCTGGTTCGCCGTATCCCACAGCGAAATCACTTTAA

mRNA sequence

ATGACACCCCCACTCATAGACCTTAACCCCTTGAACCACAAAGTTCTACGACAACATGAACGCGAGTATGGACATGGATTGTCTTGTCCCACCAACATGAGCGCAATTCAAAGGGCTAGAAAGAAGCGAAATGCTTCAGATCGCAACTCTATCCTTGGCTCTCGGAAGAAACAGTACATGTTGCGTTGTGTGGGTTTGGGTAGAGTTCAAACAGTCCTAAGTGTTGAATCCCATGATGATGAAGATGACAGACCTCTTTCTGTTCAAGTATGCAAAAGGGTCGGATTCTGTTCTCTTCCTCCGCCCTCTACGGTGGCCTCTCCACCACCTTCTGGAGCTAAGCCGCCAGACATTTCTCCATCTCCGCCGTCTGGTTCGCCGTATCCCACAGCGAAATCACTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACACCCCCACTCATAGACCTTAACCCCTTGAACCACAAAGTTCTACGACAACATGAACGCGAGTATGGACATGGATTGTCTTGTCCCACCAACATGAGCGCAATTCAAAGGGCTAGAAAGAAGCGAAATGCTTCAGATCGCAACTCTATCCTTGGCTCTCGGAAGAAACAGTACATGTTGCGTTGTGTGGGTTTGGGTAGAGTTCAAACAGTCCTAAGTGTTGAATCCCATGATGATGAAGATGACAGACCTCTTTCTGTTCAAGTATGCAAAAGGGTCGGATTCTGTTCTCTTCCTCCGCCCTCTACGGTGGCCTCTCCACCACCTTCTGGAGCTAAGCCGCCAGACATTTCTCCATCTCCGCCGTCTGGTTCGCCGTATCCCACAGCGAAATCACTTTAA

Protein sequence

MTPPLIDLNPLNHKVLRQHEREYGHGLSCPTNMSAIQRARKKRNASDRNSILGSRKKQYMLRCVGLGRVQTVLSVESHDDEDDRPLSVQVCKRVGFCSLPPPSTVASPPPSGAKPPDISPSPPSGSPYPTAKSL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 99..134
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 102..127

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC09G169510.1CmUC09G169510.1mRNA