CmUC09G166270 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATCAGCCCAAAGGCCATTGTATGAGCAACGTCCGGCGGCCCAGTAAAGAAAACAGAACAACAAGAGGAGGTTTACCAAAGCGCAACCCTCGCCGTCGACGGTCACCCTCTCATTCTCAGGTGAACCCTTCGCTCTTTCTTCATTTTCTATGTGAAAAGCATTTCAATGGTAGCTTATGAATGCGTGTTCAATATCGGTTATTCCTGTTATTAGAACTTCAATGCAAGTTCTAGTATCATATCCCTCAAAATTTCTTGTATGGGTTATGAATTGTTGTTCTTTTTCTCTAATCGGTTGTGTGTGATTCTCTCAAGTTCAGAATGCAGAGATCGTTCAGTTTTGCCGGTCAGCTCGTGAAGAGGCGAGGATTTTCGACGAATTCCGAGAAAATTGTAGCGTCTGTACTGTTCGAGAGGCTGCCAGTCGTGATTCCGAAGATTGACCCCGTGGTCTATGCATTTCAGGAGTTCAAGTAGGTCTTTCTTTCTTTTATTTCTTATTTTTGGCGGAAATAGTTGTTGTATCTTGACTTGATTTCCATGAGGATAGGGAATAATCTGGAATTGGAATTCGAACGACGTGATTATATGTATTATAGCTATTATAACTATAAGCTTGCAGTTAAATCAAGTAATATTGTTATCGTAGAGTCTCTGTGAAAAACAGTTTGTCTGATATTTCTGCTCGATTGTCTTCAGATTTAGGTGGCAACAGCAATATCGGCGCAGATATCCTGAAGAATTTTTAGATAAAGCTAATGCCAGGTATATGTTCTATCATTTTGTGTGGTCGTGTCAAGTATAGGGTTTTGGTTTATGAATTGTTCTAACTTGACTTTCTTTTTGAACTCTTCTAATTCTTGTGCTATTTTAAAGTTCCAAGTTCTTGAGAGTGCTTTTTTAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTGTCAAACATCATTATCCACAACAATTTGATAATAGTTATCATATTTTAGCTTATTTATTCTTAATGGTGCAAGACAATTGTTTCTGTGGGCTACTAGGAGGGCACCAGTTGAGTCCAAACTTTGAGCAAGAAAATTTTGTGGAAGTAAAGAAAATCTATGTTAGAAAACTTACGTGCCAATGTAATTTAATTATCAAAAGGATGGCACTGCCATACTGATCGAGAAAAGTAGGTTCCAGTTTCTAATCACATTGCAGATTTCTAATTCTAACGTGATTTGTGGAACTGAAGTAATAACTCTGAGTTCTTTTGGTACCAAAAGCCATTCAAGAAAGTTACCAATTATTGGTAAAGTTAAACTTTATGCCTTCCTTGTAGCCTCTTCTAAGAAAGCTCTTTGCTGATAAACCTAAGGGCTTCCTGTAGCAGTGAGCTTTGTATAATGTAGCTTTTAGGTGATCAGTTTTCTAAATTTTCGAATCATTTGCTTGGATTATCTGGGTGGAGGATGACCAACTTTGTAGCCGTTTTTCCTGAATTATCTTAGTACATTGTTTATTGTTACTACTTGAATTACTGAAATATTATTATCACTAGCACAATCTCATATGTCCATAGGCCATCACATAATTTAGTGCCATCAATTTTCAGTTAGCCAATTTGTGGAGCTTATTGATAAAACACTGGATAAATGAAAATGCATGATTTTTCTTTCTTTTGGTAATTATATGACTCGAGCTGCTGATAACAGGGGAAAAGGTGACTACCAAATTGATTATGCTCCAGCTCCAAGGATTACTGAAGCTGACAAAACAAATGATAGGAAGTATGCAGTCTCTTCTTTCTTCCTTTTATTTTTTCGTTTTCTTTCTCTCTCTCTTAAATATAATTTAGAATTGATAGATTGAAGGTTTCTTAATCCATACGACATTACCATTGATAATGCTCATACATCTTTAAAACCATAGTTCTACTTCATTTTCATGATGACTTATGAAACTTGTTTTAGCCCTGGGGAAGAAATCCCTTTCATTTGATTCATGAGAAAATTTCCAGATCTCATTGTATATCTAATAAATGTTGAACTTATATTTCTTTGTTTCTATGCCAAGCTATCAATGTCTTTCCTACTCTACAACTGAAGTTTTTAGATGTTGTCTCTAAAATACAGAGTCTCCCTTTTTCTCATTGTTTATTTAGAGTTCAGGCTATCTGATCCAAGTAATTAGTTTGCCAGATTCTAAGGTCAAAAGTGAGGTTTACATTCTGGTTAATTGAGTCGTTCTCTCTCTTTTTAGGTCACTGCAGAGAGCACTTGACAGAAGACTATATCTTCTTCTCCATGGTACCTCTATTGGGGCACCTGATGAGAAACCTATCTGGCATTTTCCGGAAAAAGTTTACGAGAGCGAGGAGACATTACGTAAAGTAAGAGATTGCTACCAGTACTCTTCAGTTTTCTTTTTCCTCAACTTTACCTTTCTGACTTTCAAGTTCTACAGTGTGCAGAATCTGCCTTAGAGTCCGTCCTTGGAGATCTTTCTCATACATATTTTGTTGGAAATGCTCCAATGGGTCATATGGTTGTACCACCTACAGAAACTGCACAAGTTCCACCTTTGAAGGTATATGTCTTCTACTAAAAATTCTATATCATATAATACCTTCAAGCCTTCAAGCATTGGCAATTGGAATTGGTTAAAATACCACTTTGGTTCTAGTACTTTGAATTCCATCCCAATTTAGTTCATGTACTTTCAGTCAATCTTAAATTTAGTCTCCAAAATTATTATGAATATATAAAAACTAAATTTAGACATTTGAAAGTACAATAACATGAAATGGAACAAAATTCAAAGTTCTGGACTAATATGAATGATTTTTTAACCTCTAGAGTTTATGCTTGAACTAAACGATGAGGTCACTTACTCATTTGCTTAAACAAAATCTCTCCTGTTTGCCAGCGATTCTTTTTTAAGTCTCAAGTGATTGCAACCAATAAATTCAATATTGGGAAATGTGAAGATTTTGTATGGGTTACGAAGGATGAACTGATGGAGTATTTTCCCGATCAAGCTGAATTTTTCAAGAAGATGATCATCAGTTGATGCTAGTAGATTTACCCTATAAGCCTTACATAGAGTTCCTCAATCAACATATTTATGGTCAGGGTGTAAGTGGCGTAGAGGATTGAGTTCTAAAATGCTAAATTATTAGGGGTTGAGGCCGAGGCTTTGTTTGTTTCTGATGTAAAATGGATGAATGAGGATACCAATTTGGGATCAGGACTTAGGCAATTTCCTCTTAGCTGTTTCTTTGATTATTACAGTCAGGATAAATGGTTCGATCCTCTTATTTTGATTTCTCGAACCAACGAGTACATCGTTGGTATCATCTCAAAATTTTGAATATATAATCTTTCCTTCACATTTTTCTTTTTGGTGTGATGAGAAGCAGTGAATCCTTCATTTCATTGTTGAGATGAAATTATCACAGAAGTGAACCTATGTATGTCCAGAAGGAATTAATAATAATAAAAAAAACTTTAAGGTTGGTTTTTTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTAGTAGAGGACGAGAGATTTGAACTATAGATTGCTTAGTCACTAATACATATTATATGTCAGTTGAGCTATATTTATTTTGTCACGGTATTTTCATTTTAAGACAATGTACATCATTGTCCCCGCCTTAGGTGTGCCAACATTTTTGTCGTCTATCCTGACTTGAATTTTCCCCTCGAGTTTTCATGTCTCTCCTCCAAATAACCTCTTGGTCCACCATGGCTACTGATTGTATTTATCCTAACTCTAATTTTTCTTAGAACTTGTAAGTTATTTTGTCACTTTGCTTCTATGAAGTCCTAATTAACTTTTTATCATGTTCTAATTTTTTTTTTTCCGAAGCCATATGCAGTTGGAGTCTTAATAAACTGAAATCTTTTAGCAAAGAAACAACTCTCTATGTTGAGATTTTTTCTTATGCCACAAATTTCTGTTTACATGGTGTTCAAATTAATGAAGAAAGCAGTCATACTAATTTATAAAGTTTTAATATGGTTGGTTCATCAAAGTGTCACTTAAAAGTATATGGACAATCAAGTTAAACAATTGTACACGTAAAAACTCATCATTCAATATAATATTTGGCATAAGCTTTTCAATGGTAAACATTTCTTTAATTTCTTAGCTACATTTTCTAGACTTAAACACTCTTTTTTATATGATCATGACCACCAGTTATTTTGTCACTTGCTCATAATTTGGCTTCAAAATTTTAGTCTTAGTGTGTCTATTGATATGATGTTTTTTCCTAAAAGAAACCTTGTAAGATTGAAAAAAAATCACTCAAACAACCTTCTAAACTTTTGAAAAAAATGTATTTTTAGAGAAAATTTAAGTTAAAACAAAGAAACCACATTTAAATGGTAAAATAGATTTCTTAATTTTCATTTCAGTAGTTTATTTGATGTTCCTACTTTCATTTTCTTACCCAATATACATTGAACATATTTGAAATGTATGGATTATTTGTTGAAATTTGCTTAGACAATTAGGCAACAAGACAACAAATGTAGAGAAATCTTTCATAGTAACTATTTTGCAAATTAGTCCTCAAAGTTCAAAAGGCTACAACTCTAGTCCTAAAAAAATAAAAATTTGTCTTTTACTCTAAACATATCTAATGAAAAGTTTAAATTACTACTTTCGTTTGATTTGGATTTAATTTGATTTGATTCTTATGATTTTTCAAGCTTAAATTTAATTCTTATATTTATTTCTTTTAAACTAAAAAGTCTCAAACAATAAGATTACCAATCTTCTCTAGCGTCAATGATATCTCTAGAGATTTAAACAAAAATTTAAGGACAGCACCTTTTATAAGACCTTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAAAATCGTAATATTTAAACATTCAAGAGACGTTTGAAGCACTGAGTTGGTTATTATAGTCAATAAGTTATAATAGTTTGTGTTTGAGGTACAAACTATTTT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CTGTATGGTGCCGCCGATACAGACGCCGTGCCCGGAGAAGGCCGGCGACCAGAAGACGAGGCCGACGGAGCAGTGCGGCGAGTGGAGAGGGTGA MSNVRRPSKENRTTRGGLPKRNPRRRRSPSHSQFRMQRSFSFAGQLVKRRGFSTNSEKIVASVLFERLPVVIPKIDPVVYAFQEFKFRWQQQYRRRYPEEFLDKANARGKGDYQIDYAPAPRITEADKTNDRKSLQRALDRRLYLLLHGTSIGAPDEKPIWHFPEKVYESEETLRKCAESALESVLGDLSHTYFVGNAPMGHMVVPPTETAQVPPLKFSNEIPDRRRRSEMFFGGGTEDGFASRGDWCLEVVMKKGKGRNLGLLPNSLKMISSCLKTVSTNASTVASTVRSAGASVAASISAASSEDEKDQEFGGECSSKQRADKPENVKGVTWAGFDVLEIEPYVIRHVLLLGYLNGFQVLDVEDASNFKELVSKRGGPVSFLQIHPSPAKLDTPAKPDSHDVLRRSHPLLLIVAGEERKDVAVGQNHSPTGVHPGSCANSHNAVQFYSLKSHSYVHVLRFRSAVCMVRCSSQIVAVGLATQVRTKLTDNYGYRIDLMIYCFDAITLEVVFSVLTSPVPEISGQGTTGINVGFGPMAVGPRWLAYPAVGPLPSTTVPLSSQSLCPSPGVNPSSLPGSDRTKAHYAVKSGWKAGRHAGMEADYPGMVAVKDFVTRAIITQFRAHTSPLSALCFDPSGTLLVTASIYGNNINIFRIIPNSRIGSSGLSFDCSSSHVHLYKLHRGITSAMIQDICFSNYSQWVAIVSSKGTCHVFLLSPFGGEAGFRILNSQGEEPCLLPVLTLPWWSTSSLMINQQSFPPPPPVTLSVVSRIKYSSFGWLNTVNNSAGSGKGFVPSGAVAAIFHNTLSHNIQHVNSKPNSLEHLLVYTPSGHVVQHELLPSFGVEPSLRSSTTESSSFLHMQEDDLKLKVEPIQWWDACRRSDYSERGECIYDSTFDGQDVKTKTKTKTIQNERTDTEEIYDLDFQEMNDGSTAEKVLRVRDQSGISHEQSHRFLSNAEVQMSSGRLPIWQNSKIYVMSSPRINSIAGGEFEIEKVPVQEIEVREKELLPCFDHCLSLKSGCNDRRVQVLGSNILHNKSCTEVWVFGRKGLLLGRSISPTSFETYQSEVKVTEEIVVICHSKPASLSSTESSDGGASRRMENFIDFDQASCEKSGTPLCQHLNEMYWEKRASESCMTPKSSNILFTKVEGLRIDGSPCDLHFSSSNFDFPSIEQVSSKRPPFNKVTFERICQEEPCKALESNDGCQDINDISTDHVDPNGNSDVEYENICSDENDKVSAINFEVSHEISCFFFNLLFCFSRERVLKVFRWLHYIIVLCLCCSYLSELAAPALMAEEKKQSELRMRMRSFFVIVLCLVQCCWFSDAILDPIDFLALQSIRKGLEDLPGSNFFASWDFTADPCNFAGVFCDSDKVVALNLGDPRAGSPGLVGRIDSAIGKLSALTEFTIVPGRVFGALPQSLFQLKNLRFLAISRNFIAGTLPANLGELRSLRTLDLSYNQLTGEIPRSIGTITELSNVILCHNRLTGSVPMFPFRSLNRLDLKHNNLTGPLSPDSLPPSLQYLSLSWNRLNGPVFRLLSRLDQLNYLDLSLNQFTGTIPTRIFSFPIVNLQLQRNFFTGPILPVDQVTIPTVDLSYNRLSGPVSPMFSTVQNLYLNNNRFTGEVPNSLVDRLLAANIQTLYLQHNFLTGIAINPTAEIPLSSSLCLQYNCMVPPIQTPCPEKAGDQKTRPTEQCGEWRG Homology
BLAST of CmUC09G166270 vs. NCBI nr
Match: XP_038900257.1 (autophagy-related protein 18g-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1644.0 bits (4256), Expect = 0.0e+00 Identity = 848/963 (88.06%), Postives = 865/963 (89.82%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. NCBI nr
Match: TYK18276.1 (autophagy-related protein 18g isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1627.8 bits (4214), Expect = 0.0e+00 Identity = 836/983 (85.05%), Postives = 870/983 (88.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. NCBI nr
Match: XP_004148874.1 (autophagy-related protein 18g isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1607.4 bits (4161), Expect = 0.0e+00 Identity = 840/1034 (81.24%), Postives = 874/1034 (84.53%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. NCBI nr
Match: XP_023548500.1 (autophagy-related protein 18g isoform X4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1591.2 bits (4119), Expect = 0.0e+00 Identity = 824/987 (83.49%), Postives = 864/987 (87.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. NCBI nr
Match: KAA0057555.1 (autophagy-related protein 18g isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1579.7 bits (4089), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/1010 (81.49%), Postives = 857/1010 (84.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUL1 (Autophagy-related protein 18g OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG18G PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 795.0 bits (2052), Expect = 1.6e-228 Identity = 483/1015 (47.59%), Postives = 615/1015 (60.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H1Q5 (Autophagy-related protein 18h OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG18H PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 589.7 bits (1519), Expect = 1.0e-166 Identity = 374/822 (45.50%), Postives = 488/822 (59.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FH32 (Autophagy-related protein 18f OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG18F PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 2.6e-69 Identity = 249/801 (31.09%), Postives = 364/801 (45.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6XAT2 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ERL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 1.3e-36 Identity = 108/327 (33.03%), Postives = 159/327 (48.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q658G7 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase SIK1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SIK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 6.5e-36 Identity = 107/325 (32.92%), Postives = 156/325 (48.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D409 (Autophagy-related protein 18g isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold411G002190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1627.8 bits (4214), Expect = 0.0e+00 Identity = 836/983 (85.05%), Postives = 870/983 (88.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K530 (BCAS3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G391270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1626.7 bits (4211), Expect = 0.0e+00 Identity = 840/995 (84.42%), Postives = 874/995 (87.84%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UVG7 (Autophagy-related protein 18g isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold497G00270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1579.7 bits (4089), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/1010 (81.49%), Postives = 857/1010 (84.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQE2 (autophagy-related protein 18g isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456528 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1575.8 bits (4079), Expect = 0.0e+00 Identity = 817/987 (82.78%), Postives = 860/987 (87.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JXP6 (LOW QUALITY PROTEIN: autophagy-related protein 18g-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488813 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1568.9 bits (4061), Expect = 0.0e+00 Identity = 824/1026 (80.31%), Postives = 863/1026 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. TAIR 10
Match: AT1G03380.1 (homolog of yeast autophagy 18 (ATG18) G ) HSP 1 Score: 795.0 bits (2052), Expect = 1.1e-229 Identity = 483/1015 (47.59%), Postives = 615/1015 (60.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. TAIR 10
Match: AT4G03010.1 (RNI-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 594.3 bits (1531), Expect = 3.0e-169 Identity = 289/395 (73.16%), Postives = 335/395 (84.81%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. TAIR 10
Match: AT1G03440.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein ) HSP 1 Score: 593.2 bits (1528), Expect = 6.6e-169 Identity = 286/397 (72.04%), Postives = 339/397 (85.39%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. TAIR 10
Match: AT1G54710.1 (homolog of yeast autophagy 18 (ATG18) H ) HSP 1 Score: 589.7 bits (1519), Expect = 7.3e-168 Identity = 374/822 (45.50%), Postives = 488/822 (59.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC09G166270 vs. TAIR 10
Match: AT5G54730.1 (homolog of yeast autophagy 18 (ATG18) F ) HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 1.9e-70 Identity = 249/801 (31.09%), Postives = 364/801 (45.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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