CmUC08G157980 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC08G157980
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr08: 26838706 .. 26843546 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC08G157980
SyntenyCmUC08G157980
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATGTTAGTTCAATTGGAGTTCATACACTAAACACCAATTCTCCATTAAAATCCAAATTCATCGATTTTACCTAACCATTGTTATTGCTTATGCCAAATCAGTCAAGGGTTATTGCAATTTGCAATCGCATAGCTGTTCCTCGATCTTTGATCCTACTTCCCAACTTCACAATCTGTTCATCAACTATCTCAATTCTCAAAATGGTTAGTTCTTATAATCTCATCTTATGCTGTTTCGTTCTGTTTCCATGTAATAGAGCCACAAGGGGCATTGACTGAATCCTTCTGTACTTCACAAAGTGACAAGCCTATTACATTTGTTCTTATCTTCTACATCTTCCCCCTTGTATTGACTAATATAATTCTTTTTCATTCTTGTTTATCTCATGTTCTCGAATGTATTAAAATAGGAATCCCGAAGAGTCATTTATGTTGGTGTCTCTTCCGCAGGACTGTGTCGTTGCCGAATTATTGGGCATGAGAAATTTTGTTGGCTGCTTGTGATATCTTATTTGAATCAAATTTATACATTAAGCATCTGATTTGACTCGAAAAACTCTCCTACACGAGCCGTTCAATGGTCATCCTTTATAATATTCATCCGGGTCCCACGTACATTGACAGAACATTTTGAAATATGATACGTTGGGTTTTGTTTGTTTATTTATTTTTATTTTTATAATGGGTATCCAGCTTCCTTACTAGATTGTCTTATAATTGTGTTTCTGGATGCTTTTCCAGACGTGGTCTTATGTACTTCATCGAGTTTCCCCAGATAAACTTTTGTTTGGTCAAAGCAATTGATCAGGAAACGTTGTACCATACACTTTTTAGTCTTTTGGCATTGCTCTATTCTATCTTGTAAGATTGTTATAGATGCTTCTGGCGTGTTAACGGTTGTGATTTTGTTAAAAACATAAGTTGAGAACAAAAAATCTGCACAAAATGCAGTAGATAAGTTAATGGAATGCTGATCAATAACTAACAAATCTGGACGTGGATACTTCCTTGTAGAGGCAGGACAGGTCGGTAGATGTTTCTCTGTTGCACATTTTTCCGGGATGTGCAAAAATCACAGTGCTGTAGAAGGTTATGTAAGGTCGAAGTGTTTCGGTTTTGTTAACCTAGAAGATGCATATGATTTTGTGAAAGCAACAAATGGACTTGAATGATAAAGAGTTTGATTAAAACGAGTGATAGGTTGAAAAGCTATGAAATTTTTTGAGAGTTAAGAGTTCTGGAGCTGATCGAGCATAGTGCGGATGATTTACTTGGTTGATAGCATCTACAATGATAAATTTACCATAGTGTTTTAGGAATTGCCACAATTTCCTCGTGCTATGTTTATTATTTTCTTTTAATGATAAAACCGTGCAGTTCCAATTTCATCCTTCTCAGAGTAGTAATTGTCATGTTTTCCCTCTAAACTCTTAAATTTACAGCATATGTCGAAATGTGCCTTTATATATATGCTCTCTACTCTATTTCAATGTCTTGGAGTTGTGAGCCCCATGGTTCTAATCATGGACTTTTGTATGCAAAAGTTCGTTTCATAGTCAAGGATTAGGAATGTAACTCTTATTCATTGATTGGATCTGCTAGCTCTCATTGTTCTCTCTTTTTGAGTGCCAAGTATATTTCGGGGAGATTATTCACTTGGCAAGCCAAAAACTTGTAAAGGAAACTGGCCATCTCCTTGAATTACTTTATTAATGATAAATATAGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTGTGTACGTTCTTGATGTTCTCTATATATATTCGAAAATTTCTGGTAAAAGTTCTCTTCCATTCATCATGCGAGTGTTACGAATAAACTCTTGAATATGTATCAATTTTTTAGTAGAACTATGTGTACGATGACTGAGTTCTTTTACAATGTCTTCTCACAAGTCTGAAAATCAATATTTATATTGTCATTCTGTGTGCTTTCATAGTCTGTGAAACTGAAGACTGGAGTCTTCTGGTTAAATATTTGCAATACAACCTGCTGGTTTATATGGAATGAGAGAAATATAGACCTTTCTTAGATGCTTGTGACCAGGGAATGATTATTGTTGTAGCTTAAAAATGCAGCTCTCTTGATAACGATTTCAGTAATGATTCTTCCTACCATTTTTGCCCATTAGTAACCTTTTTCTTAACTCATGGCTTAGATTTGGATGGTGGCTTATCTCCCACTTTAGATTTGGACGATCTCTTTTTGTACTTTACTGTAAGAAACAAAAGATAAAATCCTCTCTTAACTTGCTCGTAAATTTTTCTCATTACTGTGTGGATATGATGACTGATATTTATAAAATTTTGGCAATGGTGGTAAAAGGGTCAACCTCAAATGCTTTGAGGGTTAGGGAGACTCAAATCATGGTGCCCGAGATGATCAAATATCATAGTGCGTTTTGTAAATTTCCCTGTTGGAATCTAGATCGTCTCCACCATATTCTTTTCCTTTATGATAGATTGTGGCGTGATTTCTCCGGCATGTATTTGATGATCTTCTGGTGCTCCCTCCCTGGGTTAAAGATTGATCTTTTTTACTTTTTTATTTGTTGGGTTGATAATGGTTTCTGCTGTAATTCTGAGCATTAACATGGAGTGTATTTAAAAAAAATGACCAGTTCTAAATGGTCGAAAAATTGGTAGTAGAAGATGCGATGCAGAGATAACAAGTCAGAAAAGAAAGTTGTAAGTTCTTTGCGTCCATTCTTCTTTCTATTAAAGAGAAGATCTAACATGGCTCTGCTTTATGTAGATTGAATTTGGTTATGAGCAGCTAACTTCCTGACGATGGGGTCTGATAAGGCTTTTGCCTTGGACTTCTGCGCTCTTGGTTAAAACTTTTCCCTATGCAGTGGCTTCTTTGCTAAATAGTTGCTTCCAGGATGGGCCAAATTGAAGTTTCGCACATACTGTGTCACCTGAGATTTTGCAGACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGGTCTTGTATTTTGGAGACAGCTAGATTTGTCATCTTGGCGTAGAAGCGCAAGACACTTTGGAATATAAATCCTACAGTGTTCTTTTTCATATTGACCCAATGCATTTCATTAGTTTGCCTTTAACATTAAACCTCAAATTCTAGTACATATTTCTTTGTCCTGTAATTTCCAATGTCCAGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTGTTTGATGTTTATCTTATCAGACCCACGTCTTGAAATTGCATCTGTTTTCCTTGGCTTTTCCACAATTTCCATCCTAATTATTTGATTACCTTCTTCTCTACAATGAGTTGGGTGCTGGTGGCTTCCCACGTGTGAGGCTTAAGCAGCGAGCAAATACTTTTCTTATGGACGAGGACTTGAATAGGTATCAAAACCAACTTATGGATCAAGTTTCCTGGTAATTTTTTTTAAGACAACTCAAAAAAGTTAATTAATGGCCTCAAAATCTTGAGCTCTGTTATAAGATTCACCCGTTTTTACCATTCTTTGGCTTTGATGTGAAGAGTTACTGACTGAATTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTTTCCTTTATGAGGGTAGAAGTGTGGATAGTATAGGATAGGAACTCTAAATGTAGACTGAATCAATTGGATTTTGTTAGTTGGCAGTAAATTAATATCAAACCTACCTGTTTTATATTTTCAATCTGCAGGTTAAGACCAGGATGAGCCTATTTATTTTATTAATGAGCTAATGGAAGAGTGACATTTTAAATTGCATCGGATGCCTGGCATGCTTGCTTGCTGTGCCATCCTTCCCTTGATGGTGAAGTTAGTTAATATTTTTGGCTTCTCCCCATTATCTATTTTGCAGATCACGGGAACTTCTTAGGCAGTTTACTTTCAAAATTTCCAACTTTATATGCAAAGTTCAATGAAACTTAATGATGAAAAAGGCCTTTTTTTTCATTTTTTTCCCTGTTTATTGCTGTGAGTCTGATTTTTAAACTGGTAGTTGAAACAACCCAATGTGATATTATTGTTTTGCAGTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGTACTGACCTTTGCATCATTTTCACCCTTCTTGCTTAATCTATTTAATTAAACTCCCTACATTTTTTTACTAGAGGGTTTGGTAAGTATATTTACTGCAGTGTTTGCAGGTGAAAGGGATTGGCAATATCATCATCAGTGATTATTGCAGCAGGCTTCTTTTCATTTGCTGTACCAATTTCATTCCTTTTATTTTTTTCCTTTATAATAATATATTATCTAAAAGTCTTAGCTGATAGGTGGGATTGATTAGCACATTTTTTCTGCTGTTTGATTATTGACAAAAGTTGCATCCAGTTTTCTTCTTTCTTTGACACATTCATTTTGATTCAATTTCAATCTTCTTTCTACTCATTTTGAGAAGAAAAATGGCAACTGACAAAGATGCCCACTTATAATGGTGGGTTAGGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

mRNA sequence

ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATATGCTTCTGGCGTGTTAACGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATATGCTTCTGGCGTGTTAACGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

Protein sequence

MPRRLHQTVATKTGLTKKGVDQLYASGVLTFSISRSFPLYAEPLIIGFLPKNLEQEYNFQSAGSTVAFVTFLQVSEWSHEGYVAAWKVQRSLPTPRKHHLPSNTWTVMKVDAIHIKKTLWVNDGSTKRKAILVPSWFSLIIISTAVGEKKVTHLNCLVNFNLLNALCLSTVD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC08G157980.1CmUC08G157980.1mRNA