CmUC08G143020 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTAAGAGGAAGAGAGAGCTTGGTCCGATTAGTTGGCAAACGTAGACGCTTCCTTCCTAATCGTCTTGCCATTCTTTCCTCTTCCCTCGAGGTGCCCATTTTTCTCCCCCTTTCTCTTCTGTTGCCTTTTGAAGATTCAATTCAATTCTTTCTTCACTCTTCTCTCATTCGTCTCTGTGTTTGAAATTTTATAGAGTACTTTAAATCTCTGCTCTAATGACCATTTCAACGCCCTTCCCGTTGAGACAAATCTGGACGCTCATGACGATGAGGACATTGGAACTAGTAGCTCCCGGAAATATGTTACTTGCCCAGTTTGCAGCAGCAGAGTAAATGGGGAAGACTCCATTATCAACTCCCATCTGGGTATTCTTCTTATCTTAAGATTTTATATGTATAGATACTTTGCTGGTAAAATTTGCCTCCCTATGAAAATTTGTCTCTGACCTGTGGCTCAGTTGTGGTCTCTAGAAAGAAACTAGAAGCATAAGATGACTTTGCTTCCCTGAGGAATTTTAATGTGCATCTATGCATCTAAGGAAGTGTAGCTTTCTATTAGGTTATATTCTTTGGCGGGGTACGTGTATGATGCAGCAATTCGTCAAACCTTTCAAATTTTGAGAATTAGCTAGCTGAAAGAAACTAATATTAGCCATAACGATGGGATTAGAATTTCAAATATCTATTTCTTATACAGGAGGTAGTTTGATTTGCTGACCTCCTTCTGTTGGAATCATATAAAAGTCAATCTTAAGCAGCTTGTAGGTGCTGCAAATGAAGTTTGTACTTTTTTTTTTTTTGATGATTTATGAGCATCTGATAATTTACTTTTAACCTTATCCTTAAATGGGATGGATATATGAAGTGAAAGGAGTGTTAATGCATGTTACCAATTGTGAACCATAGGCATTTGTGACTTGAAACCTTGTACCAACTTTTCTGGAACCTTCATTACATTCTCAAAGTGCCGTGCAAGCTGAAGACAACTCAAAAATAATAAACTGTTATTACTGCTATGTTTATTTAATATTTCTCCTTTGATTTTTATAATGTCTGGAGTATTGTGGTTTCCAGATGCATGCTTATCTAGGGGAACGAAGCGGAAGTTGACTCAAAGCACTCTTCTTCAACTAAACTTCTACTCCCGATCAAAAGTTCAACATCAATCTCATGTTCTGAAATCAGAGAAAAATGAGTGTTCTGTGGGTCCCGGTGCTGGCCTTATGCACAATACTGTCCGTAAATTTCCTGAAGATGCATCTTGTATTGAAAATGACGAAATTATATGTGAATCGTTAGTAGAATGTGCAATGCAGCCACAAAAGGACTGTTTATTGGATACCCTAAATAACTGTGAAAGAGCTAATGATGCTTCAGAAATTTGTTCTCAGAAAAAAAGAATTACATCTGGGAAGGCACCAGCCAAGGATGATTTATCTGGGATGATTCTTCAAACTTTTATTGTCGGTCGTAAGTATAGTGATAAAAAGGAGTTAAGTCTTGGGGAAAGCATCTCTCTTGAAAGAGATCCTACCAACGGAAAGGATCCCAATGCCATCAAGGTATGATTCTTCTGCCATTTCCCTCTTAAATTAGTGCGGGAAATGTATAACCTCTAATTTACTTGCGTAATAGAAACTTTATGGAGATTGGCTACTTAAATGCGGAAGTGTTTGTGTTTTCTAATCGTAAACCTATAATGGTATTAACTGCTGTAATAATGCAATCCTAAAATAACCCAAAGTATTGGCATACCATAACACACTTGAGCAGGGAAACAATGAACTACCGAACCTTGAGAACTCCTATCAGGAAATTTGGGAAATCAAACTCCTGACTGCTGGAAACTTACCGAGTATCTATGTTTCCCCACATATATATGCAGACATCGTCCATTCTAACTCCGAGCGCATTAAAAATGTTGTTATAGTGAACTTTTGATCATTATATTAGCTAATCTTTGACTGTTTGAACATAAGGTATTGCAACTGTAGCCTCAAATATAGATTATGACATTATCGTGAACAAGCCATGGGTATGGGAACATGCAAGATGACACATGACGGGCCAACAGCTACCTAAGGTTAGAGTTCCAAGAAAGTGTTTATCCCATAAGGCAAATGACTCTTCCTTACTTTCGATGCATTAAAATGTTTGAAAATGTAATATAGGGTGGATCATTTTAACTCTCCATTGTCATGGGGTCGGCGCCTGAGTTTCTTGTCGTATGTAACGTGCCATGATGTGAACAATAGACAAGTTGTTTTTTGATAGCAGCTAGAACTATTTGGTAGTGTTTGCAAGTTTAACACTATTGCAGTTTCTTCTACCTACTTGATGGTTTGTATAGGGTGTAGCCTCTGTGCGAGTACAAACTGTCTAGTCCATGTAAAAAGTAGTATTGCTGTCAAAACATCTCAAAGAACCTTTGTTTCTAATTTGAGTTGTTTCATTAGTAGGTTTCTTTTTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTAAATTCTTTTATTATTATTTTTATGGGATAAGAAACATTCAATTGATGAATGAAATAAAGGGGAAAGCCCAATGCCAATAATAGCACCAAGACTAGGTTCCCACATAAACTTTTTTTTTTATTTTCTTTGGATAAGGATCCTTCGGATCTTTCAAGAGAGAGTTCACAATACCCACCAACCCCAAGTGGCCATAAGGGATTTAACAATGAATGCCATAGAAGGATCAAGAGGCCATGACCAGGTATTGGGAGTGAGGCGAAGTCTAATAGAAGATAAAAGATGAGATAATGAAGCCCATTCATTGATCTCCAAATCAATAGATGAAAACATAAATCCCAATTGACCGAGCGCAAACTCCGCATATTAGCCACTGATTCATGAGAATGAATAGCAAGATGAAATAGTTGAGGAAGAGCATAGGAGAGAATACCACAACTAAGCCAAGAGTCCTAAAAAGATATAGAAGAGCCATTGCCAAGGCAACATTGAGCCCCATTAGCAACCAAATCAATAGTTTGACAAATAGACCTCCATGGGGATTTCAAAGACCCATGTCGACTAATAGTAGGCCACATACAATCAATCGTATAACACTTAGCAACAATAAATTTTCTCCATAATGCATCATGTTCACAAAGGAAACGAAAAATCCATTTAGCCAAGAGAGCAAGATTATGATGGCAGGAATTACCAATACTGATGCCACCCATTAATTGAGGACGCAGTGTAATCTCCCAATTCACATTATACATACTGACATCTCCCTAAGAATCTTCCTAGAAGAAGTCTCTAACCAACTTGTCCAAATGCTTGATAACTGAGGTAGGCGCACAATAAAAGTATGTCTACCACTCTTAGAAATAAAAGCATATTTCCAATTATGGAGTTTGTGTTGAATTCTCTAAATAATTGGTTGAACTGTCATATTTAGAACTCCCATCCAAAGGCAAACCCAAATAGGTTGAGGGCCAACATTCACATTTACAACCAGAAGTAGGTGTGCAAGAAATGAAAAAACCAAGGAGCCGAACCAAACCGGTCCAAGATGACTGGTTTGGTTTGGACCATTCGGTTATTTAGAAAAATTGGATTTCTTGGTTTAAAATCTTAAAAGTTCACAATTTTTGGTTCAGTTTCCGACTTGTGTTTATCCAAAACCAATAAAACCGAACTGAACTGAAAATATAAACAATAGCCTAAACCCAACCCACATGGCCCAACACACATTTTAAGACACCCTAGCCACCATTTTCTCTCTCCATCATTCAATGTCACCTTTTCCCAAAAGACTTTTCATTTTTCATCTTACTGTCTCTCCTCAAACCCACTTTTCTCTCATCTTACCCTCTCTTCAAACCCACATTTCAGCTTCTTCTCTATCCTCTCCTCTCCTCTCTAATGGCTTTTCATCTCCATTCTCCCGCTCCCATTTTCTTCCACAGCCCACAACCACACATTGACGGTAGTAGCAGCAGCAATTTTCACTCTTTTTCGCTTTCGCTTTCATCTCCCTCCCTTTCTCTTTTGCTTTCTCTTGCTCAAGGTGACTCAACCCATGATCTTCCCACCATGATCTTCTTCCTCAAGCTCCCCTCAATTTGCAACTTGCTTTATTATTATTATTATTATTTATTTTTTAAATCCAAAACCAAAATCAAAACCAAATCAAGAGTAAATCGAAATATACTAGTTTGGTTTTGAATTGAAACCAAGGTAACTTTGGTTTCCTCAATTAACAACTTGCAAGAATCGAGAGGTTTGGTTCAATATCTGGTTTTATCTAAAACTGAACTGTGTACACCCCTAGCCAGCAGATAGTCTACTTTAGAGTCATCATTATTAAGACCAAGCAGTTCACTCTTGGATAAATTGATTTTTAAACCAAAATCACATTAAAAAATATGGACAATGTCAAAAAGGAATTTCAAAGCAATACGGGTTATAGTTGAGAATGGGAAAGTATCATCAGCAAATTGAAGATGACTCATGTAGAATGAAGAGGCACCAAGCGAATGAGTCGCAATGAGACCCAAAAAAGAACTTATCCAAAAGACGACCCAAACAAGTGACAACCAAGATGAATAAAAAGGGGGAGAGGGGATCTCCTTGTCTAATACCGCGAGTTGGAATGATCTAGCCTAGCCAATACTTTAGAGTTGCATTAATAACACCCAATGAAAAGAATTCATGAATCATATGCATAATGTCGTGTTTAAGAATAGGCTAGGAGAATTTGAAGAATTTCGTAGTAAAATTAAAACCATCAAGGCTATGGGACTTGCTAAGTCCCAAAGAGGAATCAACCCTGAACGCCTCATATTCAGTGATAGGATGCTCCAGATCTACTGCTTGCTCAATATTAATTGGACACCAGTGAACATTGGTAGGAAGGAAATTCTGATTCCCTTCCTTAGTAAATAAGTTCGATTAAAAGTTAAGAAATTCAACTTCGATATAAGTTGCAGTCAATAAACTCACCCCACTTATGGAA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BLAST of CmUC08G143020 vs. NCBI nr
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BLAST of CmUC08G143020 vs. NCBI nr
Match: XP_038889849.1 (fanconi-associated nuclease 1 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1686.4 bits (4366), Expect = 0.0e+00 Identity = 848/971 (87.33%), Postives = 883/971 (90.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. NCBI nr
Match: XP_038889851.1 (fanconi-associated nuclease 1 homolog isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1682.2 bits (4355), Expect = 0.0e+00 Identity = 846/971 (87.13%), Postives = 881/971 (90.73%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. NCBI nr
Match: XP_008459669.1 (PREDICTED: fanconi-associated nuclease 1 homolog isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1668.7 bits (4320), Expect = 0.0e+00 Identity = 830/970 (85.57%), Postives = 874/970 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. NCBI nr
Match: XP_011656116.1 (fanconi-associated nuclease 1 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8649017.1 hypothetical protein Csa_008796 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1630.5 bits (4221), Expect = 0.0e+00 Identity = 815/970 (84.02%), Postives = 865/970 (89.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XVJ4 (Fanconi-associated nuclease 1 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAN1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 905.6 bits (2339), Expect = 4.9e-262 Identity = 501/975 (51.38%), Postives = 646/975 (66.26%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5SNL7 (Fanconi-associated nuclease 1 homolog OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os06g0171800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 884.4 bits (2284), Expect = 1.2e-255 Identity = 482/998 (48.30%), Postives = 650/998 (65.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D2HNY3 (Fanconi-associated nuclease 1 OS=Ailuropoda melanoleuca OX=9646 GN=FAN1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 4.8e-76 Identity = 212/683 (31.04%), Postives = 333/683 (48.76%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y2M0 (Fanconi-associated nuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAN1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 287.3 bits (734), Expect = 6.3e-76 Identity = 212/670 (31.64%), Postives = 331/670 (49.40%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69ZT1 (Fanconi-associated nuclease 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Fan1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 280.8 bits (717), Expect = 5.9e-74 Identity = 213/669 (31.84%), Postives = 322/669 (48.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAT9 (Fanconi-associated nuclease OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498718 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1668.7 bits (4320), Expect = 0.0e+00 Identity = 830/970 (85.57%), Postives = 874/970 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFS7 (Fanconi-associated nuclease OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492828 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1593.6 bits (4125), Expect = 0.0e+00 Identity = 810/971 (83.42%), Postives = 861/971 (88.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GAX8 (Fanconi-associated nuclease OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1585.1 bits (4103), Expect = 0.0e+00 Identity = 807/971 (83.11%), Postives = 856/971 (88.16%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DNS1 (Fanconi-associated nuclease OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022365 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1583.2 bits (4098), Expect = 0.0e+00 Identity = 793/971 (81.67%), Postives = 857/971 (88.26%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAQ8 (Fanconi-associated nuclease OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498718 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1582.4 bits (4096), Expect = 0.0e+00 Identity = 797/970 (82.16%), Postives = 840/970 (86.60%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. TAIR 10
Match: AT1G48360.2 (zinc ion binding;nucleic acid binding;hydrolases, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides ) HSP 1 Score: 905.6 bits (2339), Expect = 3.5e-263 Identity = 501/975 (51.38%), Postives = 646/975 (66.26%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. TAIR 10
Match: AT1G48360.1 (zinc ion binding;nucleic acid binding;hydrolases, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides ) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 1.3e-198 Identity = 399/831 (48.01%), Postives = 529/831 (63.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC08G143020 vs. TAIR 10
Match: AT1G48360.3 (zinc ion binding;nucleic acid binding;hydrolases, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides ) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 1.6e-98 Identity = 243/592 (41.05%), Postives = 333/592 (56.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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