CmUC06G120630 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC06G120630
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr06: 24169550 .. 24175174 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC06G120630
SyntenyCmUC06G120630
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGTTAGCTTTTCTAGTAATGGAACTGAAAATCCCATATTTGTATTTTTCTTCCTGCAAACGATTCTAATCAACCGGTACTCATTCAAATGATCTTTTGATTTCTTCATCAACAAAACCTCCTCTCCTTTCCAATTTATAGGCATGAAATATTACTTTTGATAGTTGCACAAATTCACAAATTCAGGGTACGAGTTTAATTCTTAGCATCATTTTGTTCTATCTCTTTTTCCAGATTGATAGATATTAAATTGTGAACATCGTTTTTTAGTTTGGTAGATATCACTTTGTATTCTTCCAATCCTTTTGTCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTTTCTTAAAAACCTAATTACGTATTAGTATTGTTTTATGAAAATCCTCTATTCACAGTATCAGTGTGCAGTGTGGTTAAGATTCTTTATTATTCCTCTTAAATCTATATTATCAATGTTTACATTTTCCAATCATTCAATTGTATAAACGTGTATCTTGAGACATTGAAGAGAATTATAATACTCGTCTTGTCTCCTTGTTAATTTCAGGGAAAAATGTTGGAAGAAAGCATAGAGTTGATGAGAAAAGACGTTTCATTCCCATTAAGTTTGAACTTACTTGGAAAGAATTAGATATCTATGACTTTTCTCATAAAATTCCGATTAGCACCTTACGGGAAAAGTGATTTAACAAATTTCCTCGTAAGTTCTCTTCGCATCTACCTACAAAGTTAAAACCCACCATTCTTTTCATTGTGAAAGTCTAAGTGTCCAGTTTTTTACGATTTCTGCTAAATAATAGAATTTGTTGTTTTTTTTTTTAAAAAAACAACAAATTTGTTCATTTGATATCTATTACTTAGCAGAAATCGTGGTTTTTTTTTTTCAGAATTGATTCGACAGAAACTCAGGTTCAATATAGTTAAAGTCTTTCGTGCTTTTTTACACTCCTCAGAGAAATCACACAAAAACCCTCATCCAACATAATATTTCAGGGCAAATGGAATCTAAATAAATGAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTCTTCTTCAGAGAGGAAGGGACGGAGGGGATGATTTGGTTAGAGGAAGTTTTAGAGGAAGGAGAGTGATGATTTTGGGAAGAACTAAAATTTGAAAATAATGAGGACAAAAACGTCATTTCACATTGTGGGGTCCTCCACTAAAAAGCTCAAAAAGTTAGATTTTTACTCTAAAAACTTTTTTAGGTTAGAAATAGCAATTTCTTGAGCCTTTTTATAGATCCCAAGAGGTGGTGGTGGCTGCTGAAGATGAGGAGGCCATGGGCTGCCCTAATTTACAAGATTTGAGGAGAAAATCCCGAAATCAAGCCCACAATCAGATTTGAAAATTGAATTAGGCTGTGGTAGATTGCTATAGAAATCTGTTTTAATGCTGCAACAATTTGGAATCAACGAAGTTTTTGCAAAAATACACGAAAATTAACAAGAATCTTGTGAAATTCACTCTTTTTTCTCATTTTAGACTAACCATGCCATTTATGAATCTTTTGTTATTTTTAATCTTGATTTTTCTATGAAAAGGACTAAATGTATGAAATTTCCATAAAAAATCTTACCTTTAGAAGCTAAATAATTCTAAAAAATGAGAATTATCACGGGGACTCAATCCTCAAATGGGGATTCCCCGACCCCGACCCTAACTCCCCAAAATAGGGAATGGGGCGGGGACGAGGATCACAATTCCCCACAGGGACAAGGATGGGGAGTGCATCCTTGGCCCAGCCCCGTTGCCAACCTAATATGTAGATAAGGAGATATAGATCTTCAAAGTAAGATTCATGGCAAAAGGGTAAAACCTATTGAGAGAACTTAGACTATGGGTCAATTTTCTCACTCGTTGCCATAATAAAGTCTTTGAGCATTGTTTGATTCATTATTTCATATGACATATGTAAAATGAATGCTTAGATTCTTTTATGAAAAGAATTTAAAGAATGCATCTACACAAACAAACTGAGGAGTTCAACTTTCAAAGATCAAAAGTAAGGAATTTGTTGTATAGGTTTATTTGAGAAATGAATTAGATAATTAGAGATCTTTGAATACGAGGTTTGATAAAAGTTATTATAACCTATGACTTTGAACAAATATTAATGATCTTGTATAGACAAGAGAGTCGTTAACTGACAAGTGGATATTTCTCACGTTTTATGTTAATGATGTATTACTAATTATGAATGATGTAGGATAACATTAAAAAATTTAACTGTCTAACTAATTAAGGACATAACATTAAGTTTGTCTCAAACTTCTTGCATTTACAAAATGTTTGTCAAATATTCGATGCACAACTTCAAAGAATGACAATGTATCATTCAAATGTGATGTTAAGTCTAAGAAAGAGTATCCTAAGATACCTCAAGTGTTGAGGACAAGTAATTAATTATCTTCTCTTAGTAGGAGACAATTGATGCATAAATGAGGCCTAACATGCAATTGGTTAGTTATATCGGTTATATAAATGGTGTGACCATTGAGTAGAAAATTAAAAGTTGCTTCCGCTGCAATTCAAATCCCTTTAGTTATAGTAAATTAAAATGGCATAAAATGCCGAGTATCATCCTCGAAGATCAAATATCATAGTTATTATTTAACTAATTTAGAATCATGTCAATTTTAGCGCAGGATTGGAAACCAAACTTTCCTTTTGATTTTTTTTCTTCTTTTAAAACAATAATTAAAACTAAAGACAAGTGTGAAAATTCCAGAGCTAAAACATTTTAGGGTGTGATTTCATTAAATACACCATTAAGCCATACTGAGATTATTCATGGAGTCTTGTATAAATGCTTAAGTTTAGAAACTCAATTATGGATTATTTTCTATTAGAAACATTTTTTTCTCATGCAACTTAAATAATAACTAATTTTTTGAAACCAAATTAAGAATTATGGTATTAAGCAACATCATTAACAACTAACCTAACTATTTTTACAAGAGATAAATAATGATTTAATGCTATAGTTTTGGTTAAACATGCAATTCATCAAATTGAACATCTAACCTAACATTCATTGAAGACCAATAAGGATTAATGCATAATAACGTTTAAAATATAGTATTCAACAATATCCATGAAAGCACTCAATGCAAACTTAAATTCATAAGTAAAAAAATATATTATTCAACAATATCCATGAAAGCACTCAATACTAACTTAAATTCATAAGTAAATTCTTTAACAACCTAAAATTAAAGAGTTTAGTCACTCATAGCTCTCAAACATATATTTCCACACAAATTTGCAAGCCCAAATAGTAAAAAAAAATATGGGAAATGAGAAAAAACTACTGTTGAAGCGTTCCGTCATCACTTGAATTCTTTAAGAACTCCTTGATCTTCACCTCATGAACTCAAACGGCCTCCAAAATAGATCCCGCAAAAACTCACTTTAGGGCTCTGGAATTTCATGATGGAGGCTGCTGAAAAACCTTAGGATTTATAGAGGAAACTTCCCAAAAATGTTGAAATTGTCAAATAAGGAAAGCCAGTGTTGTGACGCTCTAAGGTAACGTTGTGGCGCTGCCTTGCTGAAAAGCTCGTAGATGCCAGGTTGTCGCACTATGCAATGCCTGATTTTGATGGTCTCGGGTTTTGGCGCCAAGGTCAGCGTCGTGGCACTACCCTATTTTCTTGACAACTTTGGCTTTTTCTCCACTTTGCCTTCGATGTTTGGCGTAGTTTGGTTCTTTTTACGTCCAACACTTGTTTTCTTAATAAATCTTTAAAAAACATTGGTAAACACATTAAATTTAATAAAAATACTCTAAATAAAAAGCAAAGAAAATACTTTTTAAATGTTTTTCAATGGTCTTATACAAACTCTTTGGATAAAAAGAAAAAATCGGAAATAGTTTATTTATATATAAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAACTACTAGAAGACTTATCATAGACATGCTTAACGGAAATCTTCTATTAAGCTTTAAGGTTATTAATTTTATTTATTATTTATATAAATTTAAACTAAAAAAATCAACTAACTAACTGGTTTAAATAGGAGAAAAAAATTTGGAATTAATTTAAGTAAAAAAAAAAGGAAAAAAATACCTATTTGGATTATGGGAAATCTTCTTCTTTTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTACACCAATTCCATTTTTCTAATGCAATTAAGTTTAAATTGGAACCAAATCTAACGAAAAATGGTTCCAAATCTGAGCATAAACATATAAGTTACGAGTTTTTTTCTTTTTGAAAATGGTTCCGGGAAAATTACCATTTCGTTTTTAAAATTACTATTTTTATTTTTTAGATTAAAAAATAAATCTTACAAGTTACGGGAAAATCATTTTACATGAGATTAGGAACCAAATCTTACGATTCCAAATCTTAATGAAAAATGTTTTCAAACTTATAAATTTTTTAAAATTACATTTATTATTTTTTAGATTTTTATTTTATTTTATTTAAAAAAGAAAACCTTCAAAATTAAGGGAAAACAATATCTTATGAATTTGGTTCCAAACCTTAAATATTTTTTTTTCCCGAATGTTTTAAGTTTTGTTTATTAAAAAAAAATAAAACATTTAGATCTAGTTGTCAATCATTTCAATCATTTCATTTTTTTGTTTTGTTTTTGAAAATTAAACATATTTTCTCCACATTTCTCAAAATGATTTGCATTTTTTTCAAATACAATATTAAATTCTTAGCCAAATTAAAAAATAAATTTTTAAAAGTTACTTTTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTGGCTTGTTGTTTTAAACCATCGACAATAAATGAAGAGATTTGAAGGTATAAATAATATTTATAAACTTAATTTTTAAAACTAAAAACAAAAACAAAATAATTACCAAATAGAACCTTATTAAAACAATTTGTTTCCAAAAGATTTGGTTCCAAGTCTTATAAAAAAATGATAAAAGTGTGTCAAATTTATGATTGTTAGAAAAATTCTTTTATATTTACGAGTAGTTTAGCTGATTTGGCTGAATTTGAAAACAGCCTAAATAACAGAGAAAATGAAAAAAATTCGGGTAGTTCATGTTTTATTTTTTAAAAAAATGTTTAATAGTAGTTGATGAATTCTTTACCTTCACTCATAATTATGAATGTGGCCATTGGGGAAGCAGAACAAACACAATGCATCGAAAGGGAAATTTGTTAATACGACAGTGAAAAAATAATAATAATAATAACAAATAATGGGAATTATACACGTCGGCTAACGGTGGTGTCCACGTCATCCATCTTGGAGGTATGAGCTATGGCAGAAGTACGGAAAACTGAAACTACTAACAAACACAGGAAAAACGAAGCCATCTGCCGGGAAAAGGAAAACCCCTACCTACGTATTGACCCTCAACACGAAGCGAAGACGGATATACCAGCTGAAACCTTTGAGCTTCAACAAAGGAACTGA

mRNA sequence

ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGAAAAACGAAGCCATCTGCCGGGAAAAGGAAAACCCCTACCTACGTATTGACCCTCAACACGAAGCGAAGACGGATATACCAGCTGAAACCTTTGAGCTTCAACAAAGGAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGAAAAACGAAGCCATCTGCCGGGAAAAGGAAAACCCCTACCTACGTATTGACCCTCAACACGAAGCGAAGACGGATATACCAGCTGAAACCTTTGAGCTTCAACAAAGGAACTGA

Protein sequence

MRPIEKPSNNGQAQISVCACGSPSAFAKLLKELDSNLRFLRKSTLSSMIKSSTCKRRKNEAICREKENPYLRIDPQHEAKTDIPAETFELQQRN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..20
score: 6.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G120630.1CmUC06G120630.1mRNA