CmUC06G117570 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC06G117570
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr06: 14811403 .. 14817118 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC06G117570
SyntenyCmUC06G117570
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCCCGTCAGCGCCTTTGGGGCACGCCTCATCCTGTCCGGCTAAAGCCTCTGGCTGAGGGGTTGGCGTGCCCGACTCCATACCTGCAGCCAATTCAGGTGAGTCATTGCCGAGCCTCGCTACCACACGTGTTCGCCAATGACTGGGTCAGCAAACTTTTCCCGTGATCGATTGTCAGCCTACCCCCGTTTGCTCTCTTGGCCCCACTCGAACCTTCATGGGTGTTCCCTTCGAGAATCAGGGGTCTGACAGTGAGCTTCATTGAAGGCTTAATGTGTTGCTTGTTGGGCAAGTGGGTTAGGCGTTCATGAGCTTAGCTATGTTGGTTGAGGAAGAGGGGGTGATGCGTTGAGACTATGTGTCCAAGAAGGCCTGTGAGGCTGACGCATGGTGGCTATACATCCAAGCTAGGTATCCAAGTTGGCCAAGGGGGGTTGCGTGCATGGGTAGCCGAGTAAGGAAGCTACTAACCTCAAAAAGAGTGCTTGACCATGCGTGGAGAGTTCTTGGTCAAAGGATGCGTCCACCATTCCTTCTTGATTAAGCAAAGCCTAGACTTAAGTGTTACGCAAGGCAGATTAGGTGTCAAATTGAGGTTAAGTGTGGCATGGGCTTGCATGCAAGCATGAGGTGGCGAGCTAGGACTTAGCATGTAGATTTCTGTGAAGTTTATGAATAGAAGGGTCCGGCAAATGAGGTTGGTGTGTGCAAACCACTCATGCTATTTGCAATTTTCTTCAACCAAATTGTCCTAAATTGAGTCTAGTTTCACTAAAAAGGCTGTCAGAAAGAAACTCTTTGAGGAAGAACTTGGATTTCATCAAAAACTCAAGTTTGCTCCGGCTATCGGGTAAACTAGAGTAAAGCGGGAAGATTTTGTGATATCTAGCAGAGGAAGAGAAGTTAGAGGTTGAAATTTTGAGATAAGCTAACCAACACAAATATCTACAAGTTTGTAAGAGGAAAAAAAGTCTAAATTTGGTTAGAAACATTACTTTTGGCAATTGAAAGTGAAGACGATGTTTTTTAGGCTACCGGGTGCATTTTGAAGGAGCTGTGCATGTAGGCAAGCTAAGGCAGTGGCCAGAGGTAAGAATCCTTTGAGGTTATTTTGACGTGTTTTAGACGTCTAGGAGGCGAGTCGACATGCCACTGGTCGTGCAAGCGTGAGCGAGAGGTGTTGCTGTCGGTGTGCAGGCTGTGGGGGAGAGATAGGTCTCGCTAGTGAGTAGGAGGTGGCGCTGCGTGCGTGTAGGGGTTGAGCGAGACAAGTCTCGTTGGTCTCGTTGAGGTACATAACGCAGGCAGGCGACGCAGACGCGCACACGTGCTTTGCCTCTTTTGAGGTTATTTTGGCAGTGTATGTGCGAGGACTACTGCCCACTACTGAGATGATGATTGACTCCAAATGAACCTCTAATGAAATGAATTTGCGAAAAATTTAAAACTTCTTTTACAATTGAGATGTGACTTTCTCATATTAGAAGGTGAGAAGGATTAGATTTTTGTGTACAAGATCTTATTCAAATGGAGTTCCACTTTCCACACCCTATAAAAGTTCATCTAGGATCATTTAGGTTTTCGTTGGGCAATTATTCCTCATCAATTAATGTTCATGTGTCTTTTCCATAAAGATTTTAGTTGGAGGAATTTCTCCAACAATTATTGTGACAAATAAGTTCTACACTATGGATAAGTCCAATAAGAATTTCTATCATGGAAAGTCCAAAATTTGAAACTACTTTAGTTGAAGTTTTAATTAAAATTAAAGTCGTGTCTTGAGATTACACCTTAAATAAAACTTAAATAAAAAAGAGAATCGTGGTTTATTTTCTATAAAGTGGCCCTAATGGGTCAACTTCTCAACTCATCCACCAATTAGGACAATCACAAGTCTTACGCTAAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAAAATCATGAGGGTCAATTGTTGATTAGATCTTGTGCCAATTCTTGTTCTTTTAATGCAATTGTGTCCCTCGACAAAGACTTGAATGTGGGCAAAGATGCTCAACTAAGCTTTGCCCCATATTATTGAGATCCAACATTTTAAATTAAAATAATATATATAGAAATAAATATCGTGTATATATTAAGTTGAAACCAAAGCACAAAGAGGACAAACAAAAAAGCATCCAAGGAATAATATTTTATATATATAAGATGAATGTTTGATAGGATGACCCAAAATGAATGGCATAAGCCTCTAATATTGAGTTTCTTATGGCCCCTCTTTTTACAAAGCAATAGAATTTCCATTAAAAATTACACTAAAGTCAGAAAATTGAAGAAATATGAGTTTGATAATTAATTATCTTTTTGAGAACGATTTTCTGTCATAATTTCAAAATTATTTCATATAAAATTAATTACTAATACTAAAATTTTTTTTCAAAAAAATTATTAATCCTAAAATTTTAGGCATTGATTACAATTTTCATTTTTATCAACATAATCTTACATATAATTAATTAAGTCACATTTAATATAATATTATATTCTTTTCCTTTTGAAGGTGGCTAAAGAAAATTTAAACGTTGTATGGACAAGATTTAAAATGCTGATGTTGAAGAAAATATCAATAAAATTGTCTATGTTGATGGATTTTTTAAAAAATTATACAAAATTTTAAAAATATTTTAATTAGGAAATAAATATTGTACGCTTTTTTTTAACCAATTAAAATATTTATTATTGATGTTATATTACATTAGTGACAATTTTTTTTTCTCATGGATTTCTTTTACGAGATAATGAAAACGTTGATTATCCCTCTTGTCAATGTCGAATCTATAAAAGTACTGATATATGGATGAAATTGTAATATATAGTTGAAGGTATTAAAAATTATGGTTTTATCCTTAATAGTAAGGAAGGTTCACAGAAATGATGTTTATTTTAATCTTTTTTCTTTTTATTTAGATTCCGATCTATTAAAGGAAGTTTGACTCTATATTATATTATATTTAGGTAGTAAATGAAATGAAATTGATTTTTTTCCACATATTTTGTACCTCATGTTTTGATATTATTTTAATCCATATTATTTTGCATCCTTCATGTGACTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTCCATTTTTTTAAATACAACCTGACTCCCTCTTACAATTTTAGATTCTAATTGCTATGTACGTAATATAATTTCCATATTTTTATATGATACTAGTTTTAAAATGGTAGTGTCTAGTGTAGTTTGTAATTGTTACATAATATATACATCATATTTTTATACAATCCTAGTTTGATAGTGTTTTATTTAAATGAAAAAAAATTAATAGTGCAAAATTAAGACCTGCCAACCTCCCGTAGAAGAAGAGAGTTCCTATTATCCAACTTACAACTAGAGACCAACTTGAAATTAGAAAATCACACAAATCACTGCAATAAAAATAGGCTTGTATGACTCTAAAAAACTATCATTAGCACATTTCTTGACTTTTTTTTTTAGTTTTTGAATCCACCATCATCTAAAGTGTATAGATGACACATGAGAAAGCAGTCATCATTGATAGTTTCATGACTTTTAAATATAGTCAACAAAGAATATGTATTGACATTTATTATATGTCATGAAAACTATTTTTAATGACAATTTTCTACGGTCAATTACTGATCAAAACGTTGACTTTTTTTTTGTCAATTAAAGCGTTATATTGACATTAAAATTCTGTCATTGAAGAACAAATAATGTCACATTTACAGTGTCAATAATACCTTAATTTTGACACTTTTTAAATGTCATTGAATTACGTACGTTGTCACTTATTTATAGTCATTGAAATTTGATTGATGACACTATTCCACTATCATAAAACTACATCTCATGACTTTTGTCAAATGTAAAACAAACCATTTCAATGATACATATTATTACACTTGTGTTTCCTCCAATTTCAACACAAAATATGTACACAAACATATTTATAAACTTTCATATATAACAATAGAGTTTGTAACTTTAATACAAGGAAACTATACACAACAATACTAGTAACCAAACTTTGGGTAAGTCATTTACAAATTTAGTAATTACAACTAAGTGTTGGCACAATACTAAAAAAAATTTACACCACCTATATAAACATCTTCCTAGATGGGTTTCCTTGCTTCAATGGGCTTGTCCAAGAACCTAGTGAACAAAAAATTCATTTCAGAATTTAACTCAATATAACAAGGTGAACAATAATAACAATATGTAGGTTATATATTGTTATTATTCTGTTAAGTAATAATATCATTCTGTTAAGTACATTTACACTCAAAACCCCACTTTAATCATACAAGTAAGCTTCAAATTACACTTTAAAACAAAATGATACATGCATAGAGTCACAATATAACCACATAAATAAGCTCAAAATCACATTATAATCTCCAAATCAACTTTAATAACATAGATAACCTCCAAATTTAATTCATTGCTTACTTACTACAAAGCTAACAAACTTTTGACATTAAATATTAGCATAAAAATCATGTAAGAAGTATTGTAACTTGTCCAACTTTTTAAGTGTATAACTACTAAAAGTAGAAATACTCATACATTAGTCTACTAGAAAGAATAAGGGTCAAATGAAAAACTTCTTCGTTGAGGGGGAGGGGGGCAAGTGAAACATAATACAAAAAATACTTATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCATAGAACTCAAGCATATTAATACTTCATAGAACTCAAGCCCTTCCATGTCCTTGCCCCAACAATTTTTGAACATCGGTCCATCTATCTTCCCGTAGTTCTTAAGTGTCTTTTTGATATTCAAAACCAACTAAAAAGTAACTAAAAAGTGTCTAAATGACACTTTAACTCCCAAAACAACTTCAAAATACCTAAGTATGACTTTCAAACTCAAAACCAACCTAAAAAGTGTCTAAGTGACACTTTCACCCTCAAAACAACTTAAAAAGTTCATAAAAAGTGTCCAAGAGACTTGTTGACTCCCAAAACACCCTAAATATACTTAAGTGTCTTTTTTTTATTCAAAACCAACTAAAAAGTACCTAAAAAGTGTCGAAATAACACTTTAACTCCCAAGACAACTTCAAAATGCCTTAAGTTCCTAAAAAGTGTCAAAGAGAATTTTGTGCCATGTTGATTAATAAAAAGGTTACACTTGAAAGTCTTATTTGTCCAACTACTGCCATGTTGATAAATAAAAAAGTTACACTTGAAAGTTTTATTGTCCAACTACAAGAGTGTCTCGTAATCGATAATTCTCTAAACAACTTAATCACGAAAATTCATATATTTTGTATTTTAGTTTAAAGTTTTTACTAGAATAATAAACGAAATAAAAAAGTAAAAATCCCAAAAACAAGTTGGAGAAAAACAAAGCAAAAACAACTAAAATAGAATGGATAAAAATGGTTACTTATCTAGTTGTACATAAAGACTAAAGAAATAAATAATAAACCAAATAAAAATCATTGAAACAAAAAATAACAAGGGCTTAATTGATAATGTATTTACAATCTTCTCGACAGTTAGAGATAGAGAACTTACCCAACTTAAAACGGCGAGCAGAGCGACGCTTGATGGGGGCACGAGCAGCAATCGACGACGAGCAGGAGCGGCGCTTGATGGCAATAAGAGCGGCAGTTCACGAGCAGGAGTGTGATTCTCGTGCGGTGAGAGGAGGGAAATGA

mRNA sequence

ATGCCCCGTCAGCGCCTTTGGGGCACGCCTCATCCTGTCCGGCTAAAGCCTCTGGCTGAGGGGTTGGCGTGCCCGACTCCATACCTGCAGCCAATTCAGTTAGAGATAGAGAACTTACCCAACTTAAAACGGCGAGCAGAGCGACGCTTGATGGGGGCACGAGCAGCAATCGACGACGAGCAGGAGCGGCGCTTGATGGCAATAAGAGCGGCAGTTCACGAGCAGGAGTGTGATTCTCGTGCGGTGAGAGGAGGGAAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCCCGTCAGCGCCTTTGGGGCACGCCTCATCCTGTCCGGCTAAAGCCTCTGGCTGAGGGGTTGGCGTGCCCGACTCCATACCTGCAGCCAATTCAGTTAGAGATAGAGAACTTACCCAACTTAAAACGGCGAGCAGAGCGACGCTTGATGGGGGCACGAGCAGCAATCGACGACGAGCAGGAGCGGCGCTTGATGGCAATAAGAGCGGCAGTTCACGAGCAGGAGTGTGATTCTCGTGCGGTGAGAGGAGGGAAATGA

Protein sequence

MPRQRLWGTPHPVRLKPLAEGLACPTPYLQPIQLEIENLPNLKRRAERRLMGARAAIDDEQERRLMAIRAAVHEQECDSRAVRGGK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 43..63

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G117570.1CmUC06G117570.1mRNA