CmUC05G085890 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGTTCTCATATCTAGTGAGAAGCATTTGAAATTTCATTTTCCTTTCTTTTTTCCTCTACTTTTTTGGTGGAAACTAAATTGCTTTGTTTCCTTGACTATGTCGTAGGATCAAAGATGTTAGTCGATGCTTTATGTAAATGTAACTTCATAGAATCAGATTTCTGTCTATTTGGTGCTTTCTTTTTCTGGCAAGAGAACTGGTGAAGACCAATGTTGAAGAACTCTACTTAGACAACATGCTGATTCACATATATTATATATCAGGAAAAGAAAATCTCATTTCAATAAGATTGTATACTTAAGAGAATTGGTCACCAGTAGTCCTTACAAGAACACAAACCGTCTCTGTAATGGTGAAATCTACTTCTGTCCCTAATGATGATCTCTCTGGCATATACTTTTGAGGCTAATTTCATAAAAGCATGACAATCCTCACAAATTCGAAGGTTCTTTATAATGCAAATGCGTGGCCCTTCATTCATGAGGGCATAGCAAAGTGCCAATTTCTCGCTGTGCCAGAGGACTAATTCCTTCTTTTCCTCTTCGTCTAAATCAACGAGCACATAATTTGTCTGTGGCGTATAACCAGCCAGATTCAACTTTTGAACTACCTCATCTAATTTCTGATGTATTTGATCTGCTTGCTTGTGATTTCTATCTGCCATTTGAAATTCATGGACCTCATTGTTCAATTCAATTCTACTGCATCCTCTCTCTTTGGAAACGCCCATCTTGGTCATTAGTTTTCTAACTTCCCCAACGTCTTCCCATCTTCTTTCTTTAGCGTATATGTTTGATAAGACGACAAGGGCCCCATCATGATCAGGCTCGAGCTTGAGAACTTGTTTAGCAGCAAATTCTCCTAACTCAGTCTCACCGTGGATCTGACAAGCAGCCATAAGGGATCCCCAAATAATAGCATTAGGAGCAAATGGCATTGCCTCAATCACCTCAAGAGCTTCTCTCAGAAGATTTGCACGGCCAAAGAGGTCAACCATGCAACCAAAGTGTTCATGCTTGGGACTTATGCCATACTCATCGGTCATTGAATGAAATATTCTTCGGCCCTCCTCAACTAGACCTCCGTGGCTACAAGCATAAAGCACCCCTACAAATGTGATCCAATTAGGCTCAACATTTTCAACTTTCATTTGATGAAATAAGCTTAAAGCATTAGGAGCATCTCCATGCATTGCAAGAGCATGGATCATACTTGTCCAAGATATTACATTTTTCTTTGGCATCTTTCCAAAGACTTTTCTTGCTCCTTCTAGACTCCCACATTTGGCATACATATCAATGAGTGCATTATTGATAGATAATGCCTTGCCAAACCCATTTTTATCAACATAAGTTTGTATCCATTTGCCTTGATCTAATGCGCCAAGATGAGCACAAGCTGAAATAACACTCAATATGGTGACTACATCAGGTTTCATTCCCTGCTGTTGCATTTTCTTGAATAATACAAGAGCCTCTTGAGGGCAGTCACTCTCTGTATAGCCAGAAATCATTGCGCTCCAACATATCAAGTCCTTCTCTACCATCTGATCAAACACGTAGCGAGCTTCTCCAATCTGTCCACCTTTTGCAAGCCCAGAAACCATGGCAGTCGAAACAACCATGTTCTTGGGGGAAATCTTTTCATAGAAATCCCAAGCCAAGTCCATGGAGCCACAGCTCGCATACATTGTGATGAGAGCACTTTGTAAATGAGGATCCATGACAATATTCTTCTTAGTAATGAACTCGTGTATTTTTGTTCCAAAATCCAAATTTCCAGCACGAGCGCATGCAGAAAGAACTGTAGAAAGAATCATCTCATCTGGTTCCAACTCTGTTCTCTTCATTTCTTCAAAGAGTTGAAAGGCAAGATCATAAAAGCCACTTAAGCAATACCTGTATATTTGAGGATAAGGGGCAAATATAAGTTCCGCAGTAATTTGTCTCCTAAACAGCCATGCATTTAAACTGGAAAATGATAAGATAGAAAGATACTACCATAACAATACAACGTCCAAAGTAAATTTATAACTCTTTCTCATTTGGAAGACTACTAGAATTGGCCACAATATCCATGGTTATAACATAGTAAATTGAAAGTCTGAAACAAAATTTCCATGAAAATCTAAAATCAACTAAATTTTACCACATTAACCTTCACTAGTAAATGCAGAGCAACAACATTAGCTTCATACCCATCAATCATGATGCTCCAAGCAACGACATCCCTGTGAGACATTTTATCAAACACCAACCGAGCTTCCATTATCCGTCCACAGGCTGCGTACATTCTAACCAAACCCGTCTCCACAAATGGGTCCGACCCAAATCCCAACTTCGACGCGAGCCCATGAATCTCCATCCCCGTTCTCAAGGAAAGATTCCTCGAAGCAGCTTTCAACAGCGGAGGGAAGCAGTACCTATCCAAACTCAGACCCTCCGCCCTCATCTTCTCGTATACAAAAAGCGTAAACTCCGGCTCAGAACCTCGTGATAATTGGCGCAGAAGCTTGTTGCAGAGACGGGTCTTGGGCTGGGGAATTTGATCAAACACAGAGAGGGCATAGTCGAGGCTAGGCGAGAGAGCACAAGAGGAAAGAATAAGTTCAAAAAGAAGGGAATTGGAATCACAGCGTTCGAGTTTGGAGCGAAGGATTTGAGCGTGGACTTGTTTGAGGTGGAAGAGGCTGGAGGCGGAGGAGAGAGCGGCGGAGAGAGCGGTGGGTCTGGTGGGGTATGTGTGAAGTTGAAGAGGGAGGACGGAGGTTGAGTGGCTGAGCATTTCCATAGTGTTTGGGTTAAATTATATGTAGAAGATGGAGCAATGTTGAGTTTGGAGTAGTCTGACCGACATTGAAGGAAATCGGAATGCAGAGCAATGGTGGTGGTGAGGTGGATGGGGAAAATGGAGGGAAATATCAGGACGAAGACGTTGAATTCTTATACGGTATAAGTTTTACCTATTTCTTTTGTGGCATACCCTTTTTCAAACATATAAGATTTTGGAAATAGTTTTTAACTTTCTGCATGGTCTTAGAAATACTCCACTTTTAAATATTTCAAAAATAACCTTAAACTAAAAATATAAAAGTTTTAAAATACTCTTATTATTATTTTTAGATGGAAATGGTTAGTATTTTATTTCAAAAGTATATTTGATTTTTTTAAAGTTTCAAAAATATCCTTGAACTTTAGAAAAAAAAAACTTCAAAAGTATCTTATACTTAGTATGTGAACACAAACCGTTAATACTTGTTTAAGAAATATTCTTGAACTTTCAAAAGTTGTATTAATACTTTTAACCTTATAAAAAGAAATTTTTTAATTTCTCAAATCGTTAGTATAGTGATCTTTGTTTGGAGTTTTCTTGAATTTGAAAATAACCAATTTTAAAACAAATTATATTAGATATCATTGTTTTTATATAGATACTCTTATTTTTCTCATATTTGTCCAATTCTAACACCAACTTTCTTATAACAAAATATAAACAAAAAGTTTCGAGTTAAAAGCATAAAATCTCACAAATATCTAAAATCTAAAATCTTTTCTTAAACTTATTAAAACCATATATAGTCAAATACAAAAGAACATATTTGGTTATTAACACATATGCAACTACAAACATATTAAAACAATTAAGCCTTAAGGTCTCTTTAGCGTTTTCATTATTATCTTTCTTTTTGTTGTAATCTATATATGACACTTTTTTTTTCTTTAATGAAATAAACACATATTGAATAGTTAACATAAGGGGGGAAATAGATAAGTCTTAGGTAATATGTTAAAGTAGGGGGAAAGAGAGGAAATGAAAGGGTGAGGTGATAGGGACATAGACAAATGGGCGGTGAGGGAGATTGAGTAGAGTTTTTACCCATTATTTTCTCTCTGTCTTCAAATTGAACTCTCATGTGCTTATTATAGGTGTGCAAAAAGTGATCTCATGACTATTTGACAACTTTTCAATTAATTTCATGTCCCACTGCACAGACTTTATCACGTCATAGATTCATTGACTTTGTCGTGGCCCGATCAAATTAGTCATCCACTTGCATATTGACACAACAGCAACCGCCCATGCGTCCTATGACTCTTTTTCTTCTCGACGTCGGGTTCTTTAACGCATTGATCAGTGGAACTATATAGTCTTGGTGTTTCTGGCCGCATCTTTTCCTTGTCCTTTTTGGTTTCTTGTCAAATATTGCGTTCAAAAGATATAAAGCTCATAATTTCTAGGATAGAAGCTTTTGTAAACATCATGAACGTAAAATTATTCATATTACATTATTTCCTTCTCAACCTCATGCGTTCATCTTCTAAATTACTTTAATTATTCCAAATAAAGAGTACAATAACTTACTTGTATTTCTACAGGTTATCAAAACTATTAGTTTTGTGTTTCAAAAATATCCTTAAACTTTTAAAAAGAAATACTTTAATAAATGAACATAAACTCTTAAGGCCTCATTGCAAAAATATCTATAAACTTTCAAAAGTTGCATGAGTACCCTTACCTTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAAAATGCTATTACAGAGCGAGGATCCATTCATTCCATCTTTGTAAACTATATCAAACAACCTTCATTTCAAGCCTCCAAGAAGCAAGATGTTGTCATTGGTGGCTTGACGTTATTCATTCTCATTTCATTTCCATTTCCAACTTTCTTATTTGTACTGAGATTGTGACATCGAAAGACACATATTTATTTAATATAAATTTGACTGATTCTATATTTCCATCCATTATCATCTTTATCGTTTCACATTATGGGTAACTAAATTTTCTAATGGGTTGAGTGGATGAAACGAACATTTTCAAAGTTTTATCTAAGTTGCATTTATCTTGTTTAAATGTGTTCTCAAAACCTTAGCATGAATCTGTCAAACAAATAGGTTTAAGTAAGTATAATTAACTGCTTAAGAGAGTATGTAATTAACACTTGTTGTTTAAACAAGGAAAGAATTAACTT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MDLTVDLTSSHKGSPNNSIRSKWHCLNHLKSFSQKICTAKESLLRAVTLCIARNHCAPTYQVLLYHLIKHVASFSNLSTFCKPRNHGSRNNHVLGGNLFIEIPSQVHGATARIHCDESTLLLELATISMSNNISFIPINHDAPSNDIPVRHFIKHQPSFHYPSTGCVHSNQTRLHKWVRPKSQLRREPMNLHPRSQGKIPRSSFQQRREAVPIQTQTLRPHLLVYKKQTGLGLGNLIKHREGIVEARRESTRGKNKFKKKGIGITAFEFGAKDLSVDLFEVEEAGGGGESGGESGGSGGEIGMQSNGGGEVDGENGGKYQDEDVEFLYVAEFSNRSSAMAAAFIHLHHVLMSKQNDLTIDEANLLQTCVSKAVRDYTFGGLLGGGVTLAVCSGRNMEAEGLHSATYFCRSLNSSVDDILALDGSRMQKELANIIVTRYPNNPRTMQHIFKHFYYEEVFDDSTLDRPKRMLRYRNFFSDIVHAQRTNDNDHNENVHGNSHHDSSNRDSSAYQSDSYGEPDDKGNALEFKPVLIKRGTDAATADPLNCIFGTLAKEEEIQHSSASNPSPKSHSRSRRYNRRHRRDKKTMPTNFEHV Homology
BLAST of CmUC05G085890 vs. NCBI nr
Match: XP_038878005.1 (uncharacterized protein LOC120070209 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 345.9 bits (886), Expect = 6.9e-91 Identity = 191/267 (71.54%), Postives = 207/267 (77.53%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. NCBI nr
Match: XP_022956077.1 (uncharacterized protein LOC111457878 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 334.7 bits (857), Expect = 1.6e-87 Identity = 184/265 (69.43%), Postives = 206/265 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. NCBI nr
Match: XP_023527180.1 (uncharacterized protein LOC111790494 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 2.7e-87 Identity = 183/265 (69.06%), Postives = 206/265 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. NCBI nr
Match: KAG6582303.1 (hypothetical protein SDJN03_22305, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 332.0 bits (850), Expect = 1.0e-86 Identity = 185/270 (68.52%), Postives = 208/270 (77.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. NCBI nr
Match: XP_022980008.1 (uncharacterized protein LOC111479542 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 330.1 bits (845), Expect = 3.9e-86 Identity = 183/265 (69.06%), Postives = 204/265 (76.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVC2 (uncharacterized protein LOC111457878 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 334.7 bits (857), Expect = 7.7e-88 Identity = 184/265 (69.43%), Postives = 206/265 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IXZ4 (uncharacterized protein LOC111479542 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479542 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.1 bits (845), Expect = 1.9e-86 Identity = 183/265 (69.06%), Postives = 204/265 (76.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L4T1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G146600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 317.4 bits (812), Expect = 1.3e-82 Identity = 181/275 (65.82%), Postives = 203/275 (73.82%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AWL2 (uncharacterized protein LOC103483703 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483703 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 7.0e-81 Identity = 175/258 (67.83%), Postives = 198/258 (76.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C8I6 (uncharacterized protein LOC111009363 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009363 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 6.6e-79 Identity = 171/257 (66.54%), Postives = 193/257 (75.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G085890 vs. TAIR 10
Match: AT1G05430.1 (unknown protein; Has 31 Blast hits to 31 proteins in 9 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 31; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 51.2 bits (121), Expect = 3.3e-06 Identity = 75/271 (27.68%), Postives = 115/271 (42.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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