CmUC05G084430 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAACCACCTCTAGGTTTACTGGGTAGCAGCGGCATTGCCAGCGCCGGCGGCTCTTCCGGAGCCTCCAACGATGAGAATTCTGTTTCCAAGGCTAAGGAGTTAAACAACAACCAGACGGATTTGTCATCCGAGGAATTTTCTTCCCCTGTTGAGGCTGAGCTCGAATTAGGGCTAGGGCTCAGTCTTGGAAATGGGGTTTCTTCTGGAAAGGGTAAACATGGTGGCTGGGGTGAGCGCGGCCGGATATTGACGGCGAAAGATTTTCCCTCGGCGATCTCTCCTGGTGGGTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTAGATTCTCTGGCAGACCTGCTGCTGTTTCTGGTGTCAAGAGGGCGGCGGAACCTGTTAACCGCGACGGCGGTTCTCCTCCTCCGGCTGTCAGGTTAGATGGATGCTCTGTTTATTATTGATTGTTGATCAAACAGGATGGAAATGGAATGAGTTAGGTGAATAAGCACTATGAAGAGTAATGAAGTTTTCTCTTTATAGTGATGAGGAATATTTAGAATCTCCGATTCTTAATTCCTCGAGCTGAAATCCTGAACTGTTTGTTAGTTTTGTATTTTTAATCCTAATAGTTAACAGTTGAAAAGAGATTGTCTCCTCGTTGCACTGTTAAAGTAGAAATAGTAATCGATGAACTGTTGGCTTTTGTTAGGATCTTCCATAACATGCATATGTTAGAAGTGTGTGTGATCCTGTTAAAGTAGAAATGTTAATCAATGAACTGTTGGCCTTTAATAGGATCTTCCATTACATGCATATAAAAAAGTTAAATTTTGGTCTCTATATTTGTTTAAATCTCACAGAATGTCCATCTGGGTAGTTTCACTGAGATCCATCTTAGTCTTACTATAGATTGGCAATACCAACCAAGTCTTGATTGAATGATGTGAGGAGGTGGGATGTTGATCTAACCATTCCCTGAAGCTTACTCAATAGTCATGAAACTGGATACCCCCTTTTTGTGTTCATCGAAGCTTGTCTTTCTAATTGGTTTATTTTTCTTTTAAGTCATATTCTGATGCTTTGCATGTTTTTCGATTTGTTTTCTTTTTTTACTTTTGGATGAACCGGAAGCAGTCAGGTGGTGGGATGGCCGCCCTTGAGAGCTTACAGAATTAACAGCCTGGTTAACCAAGCTAAAAATCAAAGGGCTGGAGATGAAAAGGAGCTGCTTTCTCTCAAGAATAGTTCCAATGGTGTTTCAGAGAAGATCCATGATGGCAAAAATACGAGTGCCAGTGATACTGAAAAGGGGCCTCTAGGTTTTGTGAAAGTGTATATGGACGGAGTTCTAATTGGCAGGAAAGTGGATTTGAATGCCCATTCTAGCTATGAGACTTTGGCTCTGATGCTCGAGGATATGTTTTTTAAGTCCGCGGGAAGCGTCCCATCCACCGGTTAGTTGCTTCTAAAGATCATCATGCCCATCTATCTATTCACACGCACACAACCATCTATTTATGGGCAGTTGATAACCGAGATTATTTGTGCTGACAAAGAGCTGTCTTTCTTTTATGGTTAGGCTTAAGTGGAGGTCAGGATGAACAAGCACCAAAACTCTCGAAACTTCTGACTGGCTCCTCTGAGTTTGTGCTCACCTATGAAGATAAAGAGGGAGACTGGTTGTTGGTTGGGGATGTTCCTTGGAGGTATGCACTTATGAAAAACCAAGTGTTGAGTTCATGGTTCACTTATTTACCTTATATGTCTGTTTTCATTTTCATTGATTAGGATGTTCCTTGTCTCGGTTAAGAAACTTCGAATTATGAGGACATCTGAGGCAAAGGGACTCGGTATGTTTTCTCGTAATCCAAACTTGTAGTTGATTTTGATATCGTCGTTTTAGTTTCTAGTTACTCCATGTCGTAGCTAATCAATAAAACCATCCACAGCTCCAAGGTGTCAAGGAAGAAGTGAGAGAAATGGCATCAAGCCCATTTAGAACCATTGTTATAACCCTGGCCATGTGAAGATAATGTGAAGTGAAGTTGGTCCACATGAGTAGAGAAATAGAAAAAGTGAGAGTGGTTTTGATGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTCTTTCTGTTTGATTCTCATTTATGGTTCTTGATTTTTTTGAATGGTTCTCTAAACCATTAACAAACCCCCCCATCCCAAAGAAAGAAAGAAACGTCTTATACAATGCTATCCTACAGGCTTATAAACTCGGCTATGATTTACGACTCTCTTCGCTTAAATCGACTAAAGTTGTTTCCTTCTCAAGGGAAAGCTGGTATCGGTTTCGAACCTGTGATTCTTTGCTGCATTGGTCGACTATCTTTTACTAGTGCATCTCTTATGTTTGTGAATTGAGGCCTAATGGATCTTTCTGTTTCGATGATTAACATGTTATGAAGGTGAAGATGGTTTCATCTTTTGCTTTATGTTTGTCCTTTTCAATTTGAAACTTCATTTTGCAATAATGCTAATATGTTCTCTTATACTTTTGAAGACCTTTGCCCATCACCTGACTCGCTTAGTTCGTTCTTCTCATTGATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGATGTGATTTGATTCCATTTTGATGACTAAATTAAGATTGAACGGTTCGGATCCTATGATCGACCTCACTTGTCATGGTTCTTTTGTTTAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACAAAAATCAAAATGAAATGGTTTTGATCTTATGAACTAACACCAACTCGTCTGACGTATGTTTTGAATAATTTTTCACGTGTTTAAAAAAATGTTTGAAAAATCATTCCAAACTGACTATGTGAGTTGTCAAAATAAACTCTTTTTTTAAATACAGAAAATATGATAGGAGTCGAGCTGTTGACGTGGATATTAATAAAATATCAACTTTGATAGATATTTTTACAAATAAAAGCTATTTTTTTAAATTAATAATTAAGTCGTGTTTATATAAATCTATGGAAATACTTATATATATTGTTATTAGTATGTGTTTTCGAGATTAATATGTGATTTCACTTTATTCTAACACTTATACTTGATTCCCAACTTAAACAATAAATATTTTATGAAATTCTAACGCTCATACTTGATTTCCAATGTGAACAACGTTTGAAAACAAAAATTATATATTTTTTTTCATAAGATTGGAGTTTAAATTTGTGCATCACATTGTTTTACTAAGAAGAATATCTGTTTAATCATACTTGATCCGACCATATGCGTTTACTTAATATTTCAAAAACAATGATCACCTAAACTGTGTGACTTGAATTTAATTAGGGAATTATTCAAGTGGGCTAGACATATATACTTGACTAAGATATCCAACTCCACATGTTGTTATGTGAAGAATTTAAAAAAAATAATAATAATAAAAAAAAAACCGACTATGGAAATATTTGCGATATATTTGTAGATCAGATAGTTTGATATTAATATTAAGAATTATTTATATATTTTATAAATGCAGAAAATTACTATAAAAGAAAAAGGAAATTATTTTGAATGACAAAAATGTTAAAAATATTTATAACCAATAGCAAAATATTACAGTCTATCTGCGAGAAACTGCGATAGACTGTGAAATTTTGATATATTTTGTAAATATTCTAGTTCATTTTTTATATTAAAAAAATCCTAAAAATATCAAACAATTTACAAATGCGTAAAAATTTCAATGTCTATCACTAATAGATAATTAAAATTTTCTATAGATAACGAAAATTTTCTATATTTATAAATAGCTTGGCTCATTTTGCTATATTTGAAAACAACCTTATAATTATACCCAAAGCACAACAAATTATACATGAATATCAATATAAGCAATAAGACGAAGAACTATTTTAGAAGTAAAACATAACCAAATTATCAATTAAATGATTGGTCAAAATACTATTTTGTCTTTATACTTTGAAGTTTGTTCATTATTAGTCCTATACTCTCAATTGTCTAATTTTAGTTTATCATGTATGAAAATAAAGTATGTAAATTGGTTTTTAAAATTTATAGTAAAAAGTCTATAGATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGTGCATTGAAGACTAAATTAGAATTTATTAAAAGCACTCAAACTAAAAGTATACAATTAAAAGTAGAGAGATTAAAATTTAACAAACTTCTATTAAAATGTATTTTAATTAATTTATTTGTATAAATTTATTTATTTATCAAAATAAAAATTGAAATCTCCATCCACATTGATTACTGTTTGCTTGTACGGTGTACCATTGTGGCGGGAACTCGGTAATCATCGGAAGCCAGGGTTTTCAGTTCCGGCAACGAGGAGTTACAACTTCCTCATTAACCAAAGCGCTATAAAACTTCCAAATAACAACAAGATTGAAGCTCACAAAGCATTATTTTCGATTTCATCCACCGCCATGTACTGGGTGGCAACACGAAACGTCGTTTTTTCCCCCCGGTGGCGTTTTTTGGCTCTTTTGATTGGCTTCCCTCCGCGCAACTTCACCTCATTTACTCACTCACCGGCGTTTTTGTAATGCCTCCTTTTCTCTTCATCTGCTCATCTCTTCCATGCATTATGGACTCTCATCACTCGTTTTCTGTGTCATTTCTGCTTTGGGTCTCTGTTTCTTTATTTGGTTATGCTGGGTTTTGTTTGCTGTTTGTAATTTCTACTCCTGATTTATGTCCACGGAGAGTGAGAAAGTTTATTGTAGCTTGTTATTTTTAAGAGATTGAGAAATGTGTTATGGCGGTTGTGCATATTCGACGTGCTTAGAAATACCCTTTGTCATAGTTTGGGGAATTCACAATGATCGATTGAAAAAAATTTCCTTGGGGAGAGGCTCCCTGTTTGCATTTTGTTGAATTTGTTGAATTTGTTGAATTGAGAGTCAGGGGGGTTAAACTACTTTTCTGACTGTAAACATCTTCGTTATTGCTTCATTTTCTATGCGGTG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MEPPLGLLGSSGIASAGGSSGASNDENSVSKAKELNNNQTDLSSEEFSSPVEAELELGLGLSLGNGVSSGKGKHGGWGERGRILTAKDFPSAISPGGSSSSSSSARFSGRPAAVSGVKRAAEPVNRDGGSPPPAVSQVVGWPPLRAYRINSLVNQAKNQRAGDEKELLSLKNSSNGVSEKIHDGKNTSASDTEKGPLGFVKVYMDGVLIGRKVDLNAHSSYETLALMLEDMFFKSAGSVPSTGLSGGQDEQAPKLSKLLTGSSEFVLTYEDKEGDWLLVGDVPWRMFLVSVKKLRIMRTSEAKGLVPATRSYNFLINQSAIKLPNNNKIEAHKALFSISSTAMYWVATRNVVFSPRWRFLALLIGFPPRNFTSFTHSPAFFERQRLEKLHFGKGRKYSRGSIKAAKKFKDINNVQDDKFLSHILWWKEMVESCKKPSSVQLVKRLDFSNLLGLDINLKNGSLKEGTLNWEILQFKAKFPREVLLCRVGDFYEAIGIDACVLVEYAGLNPFGGQRMDSIPKAGCPVVNLRQTLDDLTCNGFSVCIVEEVQGPMQARSRKGRFISGHAHPGSPYVFGLVGVDHDLDFPEPMPVVGISRSARGYCISLVIETMKTYSSEDGLTEEALVTKLRTCQYHHLFLHTSLRNNSSGTCRWGEFGEGGRLWGECNSRHYEWFDGNPLDNFLYKVKELYGLDDKVTFRNVTISSENRPHPLTLGTATQIGAIPTEGIPCLLKVLLPSNCAGLPALYIRDLLLNPPAYETATTIQATCRLMSNVTCAIPDFTCFPPAKLVKLLEMREANHIEFCRMKNVLDEILHMHKNCELNNILKLLMDPASVATGLKIDCDTFVNECEWASSRVDEMIFLGSESESDQKISSYPIIPNDFFEDMESSWKGRVKRIHIEVSCTEVERAAEALSLAVTEDFVPIISRIKATTAPLGGPKGEILYAREHQSVWFKGRRFAPAVWAGSPGEDEIKQLKPALDSKGKKVGEEWFTTKKVEDALARYQETNAKAKAKVVDLLRQLSSELLAKINVLVFASMLLIIARALFAHVSEGRRRKWVFPTLVAPSHRSKGIQSLEGKVGMKLIGLSPYWFDAVEGNAVQNSIEMESLFLLTGPNGGGKSSLLRSICAAALLGICGFMVPAESALIPHFDSIMLHMKSFDSPADGKSSFQVEMSEMRSIISRVTERSLVLIDEICRGTETAKGTCIAGSIIEALDKVGCLGIVSTHLHGIFNLPLDTKNTVYKAMGTICADGRTVPTWKLISGICRESLAFETAKNEGISEAIIQRAEDLYLSNYAKEGISGKEKTDLNFSVSSHASLNGNGKSHHKSNGVIVEADKPKTETASKTGVLWKKIEGAITAICQKKLIEFHKDNNTLEPAEIQCVVIDAKKKPPPSTIGASSVYVILRPDGKFYVGQTDDLEGRVRSHRLKEGMRDAAFLYFLVPGKSLACQLETLLINRLPDHGFQLTNVADGKHRNFGTYNLLPDNVTVCS Homology
BLAST of CmUC05G084430 vs. NCBI nr
Match: KAA0049205.1 (DNA mismatch repair protein MSH1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2619.0 bits (6787), Expect = 0.0e+00 Identity = 1337/1515 (88.25%), Postives = 1388/1515 (91.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. NCBI nr
Match: XP_038881777.1 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2187.1 bits (5666), Expect = 0.0e+00 Identity = 1083/1149 (94.26%), Postives = 1109/1149 (96.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. NCBI nr
Match: XP_038881769.1 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2182.5 bits (5654), Expect = 0.0e+00 Identity = 1083/1150 (94.17%), Postives = 1109/1150 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. NCBI nr
Match: XP_008438449.1 (PREDICTED: DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2142.1 bits (5549), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1151 (92.09%), Postives = 1097/1151 (95.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. NCBI nr
Match: XP_008438450.1 (PREDICTED: DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2137.5 bits (5537), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1152 (92.01%), Postives = 1097/1152 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84LK0 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MSH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1531.9 bits (3965), Expect = 0.0e+00 Identity = 765/1143 (66.93%), Postives = 910/1143 (79.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38831 (Auxin-responsive protein IAA13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IAA13 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 230.3 bits (586), Expect = 1.4e-58 Identity = 137/266 (51.50%), Postives = 166/266 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38830 (Auxin-responsive protein IAA12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IAA12 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 1.7e-51 Identity = 133/276 (48.19%), Postives = 162/276 (58.70%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38829 (Auxin-responsive protein IAA11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IAA11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 1.3e-40 Identity = 131/294 (44.56%), Postives = 165/294 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DWF2 (Auxin-responsive protein IAA10 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=IAA10 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 3.2e-39 Identity = 122/273 (44.69%), Postives = 153/273 (56.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U6B6 (Auxin-responsive protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold171G004430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2619.0 bits (6787), Expect = 0.0e+00 Identity = 1337/1515 (88.25%), Postives = 1388/1515 (91.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L490 (DNA_MISMATCH_REPAIR_2 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G134540 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2142.1 bits (5549), Expect = 0.0e+00 Identity = 1072/1197 (89.56%), Postives = 1120/1197 (93.57%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AX18 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483539 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2142.1 bits (5549), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1151 (92.09%), Postives = 1097/1151 (95.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AX16 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483539 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2137.5 bits (5537), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1152 (92.01%), Postives = 1097/1152 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E994 (DNA mismatch repair protein MSH1, mitochondrial isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2132.5 bits (5524), Expect = 0.0e+00 Identity = 1051/1149 (91.47%), Postives = 1094/1149 (95.21%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. TAIR 10
Match: AT3G24320.1 (MUTL protein homolog 1 ) HSP 1 Score: 1531.9 bits (3965), Expect = 0.0e+00 Identity = 765/1143 (66.93%), Postives = 910/1143 (79.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. TAIR 10
Match: AT2G33310.2 (auxin-induced protein 13 ) HSP 1 Score: 230.3 bits (586), Expect = 9.9e-60 Identity = 137/266 (51.50%), Postives = 166/266 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. TAIR 10
Match: AT2G33310.1 (auxin-induced protein 13 ) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 1.4e-58 Identity = 137/266 (51.50%), Postives = 166/266 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. TAIR 10
Match: AT2G33310.3 (auxin-induced protein 13 ) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 1.4e-58 Identity = 137/266 (51.50%), Postives = 166/266 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC05G084430 vs. TAIR 10
Match: AT1G04550.2 (AUX/IAA transcriptional regulator family protein ) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 1.2e-52 Identity = 133/276 (48.19%), Postives = 162/276 (58.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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