CmUC04G073620 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC04G073620
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr04: 19620101 .. 19622681 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC04G073620
SyntenyCmUC04G073620
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTATCCACATAAGCAAATTTGTAAAATGGAGAGAAATAGGATAGATTATGACTCAGCTGTCTCCACAAATATTAGTATCGCAGCAACTAACGACGATACTTCCATCATTCACTATAAAATTTTTAGTACTATGATAATATCTATTTCTTCGGTTTATAATTCAACTCGTTATTAAAAGTTATATTATTTTATTTTCTCATTATTTAGTTAGCATAAATAATACACAAATGTGGAGGGGATGAATTATTATTATTATTATTATTTTTAATACCACATTGGTGGGTGTAAAGAGCCAATTATAAAGTTATCTTTCCATTTTGCTATCTGATGCCACCTCCACTCACTTTCCCATTACTATAATTCTCCCATCTATAGCCACCCATTTTTAGGCTCTATAACTTTTATATTATTTTGAACTTTACTTTTTATTATTTATATGCTTTTTTAAATCTACTATTTGGATTTAAATAAATTTTTGTTCATTTAAATTTAAATCTTAATGTGGACTCTTACACTTTGTAACAACTATGTTTTTATGTATGGACCTTGCTTCAAAGTTATTTTAATTATTGCCAATTTTTAATTGGTTGTTTACATTTCATTGATCCCTACATTTTCTATCAATTCATATATACTTTTAAAGAATTTTTTAAAAATTTATTTTTTAAGCTTTGTTAATTATCATTCATCCTAGTTTGTCGAATAATTTTATGTTACGAATATTACTCATTAGTTTAATTTGCTTTATCAAAACCAAAAAGGAAGAGTTATTATTTATTTGTGTATTTATGTTTTCTCTCTTACTTGTTCTTTAAGAGTTTTAGACTTGAAATAATTACAAAAACGAGTCTAAGATATATATATAAAATACTTAAAAAATATTTTTTCTAGATTGTCCCCTTTGTATCTTTTTTAGGTGGAGGAGACTGTAACAAAATTAAAAGTTACAATGTAAAACGGAACCTCTCTATATGAAACTTTTAATTATAATTATAATAAAAACCAAAAATTTATTACTAGTGATGTTTTTAAAAATAGAAAAATAGTTGAAAATAATTATAAATATAGCAAAAATTTTAATTTCTATATGTTATAGACTGCGATAGATCCATATATCTATCACTTTACCAAATAGACACAAATCACTTTACCAGATAGACACAAATAGATGTCTATCTAAGTCTATCGCAGTCTATCATAAATATAAAGTGAAATTTTGTTATATTTGTAAATAATTTGATGTTTTTTCTATTTATAATAATTTTTATTATAGTTGTGTAATTGAAACTTTTTAAAAGTTCAAATATTAAATAGATATAATAATGATATTAAAGACTATATATATATATATTTTTTTTTGTTGATATCCAGAGTGTCTGGGTCAGTGCGCACTTCGACTAATCTTATGAAACAACCTACTTGACACTACAACATTTAGAACTCAAGAAAACTAGTAAGATATTAATTTCTTAGTTGGTGACCACCATAAATTAAATATTAAAGGTTAGATTAGGATTCAATTTTTTCTATAATTATATGTTTTTGTTTTTCTATTTGCTAAAAAATATATTTTTCTAATTTTGTTCTGGTTACATAAAAATTTTATATAAAGTCCCTTATGTTTGAACTTTTTTTAAATTTATCATTTTCGTTGATGAAGGTTAAAGTTGGCTAATAATAAACTTATATGATATGATATTTAGTTTGTTGAAATTTAGTGAAGAAATTAGGCCACCTAAAAAGATTAGAACTTTTTGCCAAACATTTTTAAAATTTGGAGGAATAAAAAATGTCACTCTTTCAAGTGGCCTAAATTTCCTTTTGGCATTTTTTTTAATAATCAAATTGGTTGATGCTAAGTAATTGTATAATGTTGACTTAGCATCAATCAATTTTAGTATTCACCAACATTTAAGATATCATTAAAAGAAAAAATTTGAGTAAGATAAATAAGGATGGAGAATCAAACCTACAACTTTAACTGGAAAAGTACATGTCAATTACTATAACATTGACAATCGAAAAAAAAATTAAAATATATATGATTGAATTCTTTTTTTTCTCCTGAAAACTATAGTTTAGATTGAGAAAATTAATGTTAACATTTGTGATTAAAATATTAAAATTTAAAGGAAAATTATTTTAAATAAAAAAACTGTTGAAAATATTTATAAATAATAGCAAAATATCATAGTCTAAAAAGAAAAAAATCACTTTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCGTGCGTCTGCAACCTAGCCACTATTGTCTTGCCAGTTCTCCTTCCACCGCATAGACGCTGCTGTTCGACTACTGATTCATCGATCGCCGACGTCCATTCGTCCTCGTCGACAGCTAGCCACTGTTCCTGAGTTGTTCGTCGTTGATTTGCCATTCCTTCCGTCGTCGGGTTTCTCTCTCTCAACCAGATCATCTTTTCTCTCTCCCGTCGAGTCGGCCCGACGCCGTTCGCAGCCACCATCGAGACCACGTAAACGCAATGCCACCGTTGAAGCTCAATTCATTGCCACTCGTCCACACCGTTGCTGCCGTTTTCGCCCAGTCGCCGCCGTCGAGCTTTAG

mRNA sequence

ATGTTCTCCTTCCACCGCATAGACGCTGCTGTTCGACTACTGATTCATCGATCGCCGACGTCCATTCGTCCTCGTCGACAGCTAGCCACTGTTCCTGAGTTGTTCGTCGTTGATTTGCCATTCCTTCCGTCGTCGGGTTTCTCTCTCTCAACCAGATCATCTTTTCTCTCTCCCGTCGAGTCGGCCCGACGCCGTTCGCAGCCACCATCGAGACCACGTAAACGCAATGCCACCGTTGAAGCTCAATTCATTGCCACTCGTCCACACCGTTGCTGCCGTTTTCGCCCAGTCGCCGCCGTCGAGCTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTCTCCTTCCACCGCATAGACGCTGCTGTTCGACTACTGATTCATCGATCGCCGACGTCCATTCGTCCTCGTCGACAGCTAGCCACTGTTCCTGAGTTGTTCGTCGTTGATTTGCCATTCCTTCCGTCGTCGGGTTTCTCTCTCTCAACCAGATCATCTTTTCTCTCTCCCGTCGAGTCGGCCCGACGCCGTTCGCAGCCACCATCGAGACCACGTAAACGCAATGCCACCGTTGAAGCTCAATTCATTGCCACTCGTCCACACCGTTGCTGCCGTTTTCGCCCAGTCGCCGCCGTCGAGCTTTAG

Protein sequence

MFSFHRIDAAVRLLIHRSPTSIRPRRQLATVPELFVVDLPFLPSSGFSLSTRSSFLSPVESARRRSQPPSRPRKRNATVEAQFIATRPHRCCRFRPVAAVEL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 45..78
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 45..64

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC04G073620.1CmUC04G073620.1mRNA