CmUC03G052490 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GATAAAGGTTCGTAGAAGGTCAACCCGGCAAAAATCTGTTTTCTAATTGCAATTCCCTTCCTCTCCTTCTCAATTTTCCTCGACCACCGTCATAGCAGTCCACAAAATGGCATACCCTTGGCTGTATCATGCTTGCCTACCGAACCAAGGACACCGCAGTCACATCTGTTCTCATCGTGCCTGAGTTGACAACCAACCCAAGCTTCATTCCGGTTATTTTCCTTTTTGTTTCACATCATAAATGGCGGAGGGGGATCTACAACTCGTTTCTGCCATTAACGAACTCGACGATCGGTCATTCCTCTCGCTTTGCTTTGGTCCTTCAGTGTCCATCAGGACTTGGCTTCTCAATAACGCCGACAGGTTCCAATTAAGGCCATCTCTGTTATTCACTGTCTTCCTAGGGTTTACGAAGGATCCGTATCCATATGTTAGGAAAGCTGCTCTCGATGGCCTATCAGGTTTGGGGAACACTGTTCTTGAGGACGACACCCTGATTGAAGGTTGCTATTACCGTGCTATTGAACTTCTAAACGACATGGAGGATTGTGTTAGGTCAGCTGCAATACGAGTTGTAAGTCACTCGTTTTGTAGATATCTCTTCATTGTTTCTCTTCTTTTATTACGCAAAAAAATTGGTGAAGTAATTTTGGTTTGGTAGTAAGTCGCAGTTTCTTCAGATTCACACTACATTATTTGATGTATACGTAGGTGTTTGATGAATTGATGACGGTTTCTAGTTAATAGACTTAGTTTTTAAATTATTGTGATCAAGCTGTCGCAATCTCACATTGATATAATATCACGTTCCTTTATTATGTATAACTCTTCTCATCCAAAAATTAGTAATAGCTCTTGACGATTAATCCAGGTCATAACTTGGGGTCTAATGCTTGCGGCGCATAGTCCAGAGAGGAAACAACATTTGTCTGATGAAATATTCGTTAACGTAAGTTTAAATTTAACATAATGTTGATTTCTCTGGATTTTTTAAATTGATTTATTAAGTCTTTTTAATCCTTTTTTTAGGTTGTTGTTCTAAATTTCTCATTCTCATAAACTTTGTTGATATTATGAGTCTGGAAATTTTATTGGTTGCTTGTAGTCTGGAAACCTGTTTTCTTTCTATCTATTGGCCCGTCCTGTTCTTTTAGTCTCATTTGTGACATCATTATTGCAACGCTGGATTTTAGATGTTTGGTTGAGATTATACATTCCATTTAGTTATTCAGGAAGATTGCAGAAAAATATGAAAAATTTAGATTATAGGATGTGGATTTTTCACACATTCACGAGTAGTATCCAGTCCTTTGTTGTGTCTTGATATTCTTTCTTCTGTTTGCTAGTGGTTGATTAATTTTTTTCTTAGGTATTCAACTCCCTTGTTTGTCTGCAACTTCAGATATGCTTTTTCTTTTCCATGTTCATCTCTTTCAGTTCTCATGTTCAGTGCTTAAAACTTTCCAGTTTGAATATTGTTTGCATGTGGACAGATCACATTTCCTTAGGAGATCCTTAAGGAAATGATCACTATTTTCCCATGCCAACTGAACTTTATGAAGTGCTTTCCTTGCGTCGAGTCTTAAAGTGAATGCTTCGAATTTTGAACTTGTAGTTATAAAGTGCCTCTGTTAATATTTATATATTGGTAATATCAGCTCTGTTCCATGACGAGAGATATGAACATGAAGGTCAGGGTTAATGCATTTGATGCAATAAAGAGGCTGGAAATTGTTTCCGAGGATCTTCTTTTACAAAGTGTGTCCAAAAGAGTCTTGAGTAGCTTCAAGGGTAAAAAATCTCTTGTTCAATGCTCTACCGAACAATTGGAAATGTTGGCGTCGGATGTTGCTGGGGCTTTTGTGCATGGCGTAGAAGATGAATTCTATCAGGTAACTTACGTTGGCAAATATGTTTTGATTGAAATATACCTCTATATTTGGATATTGTAGATTTTAAAATTTTCTGATCTCCATCATCCTTGTAATCAATCATCATAACACGTGGCACAGTTTGCTTTTCAAACTTCAATTTTCTAGTTTCTTCATGTCTTATGCCAAAGGCCATTAATGATAGTTGTTTCCGCTTGCTTGTTTAAGCATCATACCAACACCATAATGGTTCAGAGGTCTGCCTTCATCATATGAACATTTTTGCAAATAAATGTGATTATGATATTGACACTTTCTCTCAATCTCAAGGTGCGCAGGTCTGCCTGTGATGCTTTGTTTAATTTGACCATCCTATCAACTAAATTTGCCGGCGAGGCTTTAAGCTTATTGATGGACATCCTGAATGATGATTCAGTTTCTGTTCGCTTGCAAGCTTTGGAAACATTACATCATATGGCAATGTCCAATTGTTTGAAATTGCAAGAGGTGCATATGCACATGGTATATAATTAATCCTTGTTCTATGTTTCGGAGTCTTTTTGTTACTTATAAATCATAATAGGTAGGTGTTCATTGATGGTAGTCTAAGGTTACTATTGCATGTGTATATAACTTTTGTATTTGCAGTAGTTTACTATTGAAAGTTTGAAATGTACAATATTACTAAGCTGTTCACCACACGTTAAGTCCTCCAATGAATCAATTTATTTGTGTCAATACTTGAGATGGGATTATAAAGGTCAATATCTATATTCGATTGATATTATTCTTATCATCATTGGTTCACTTTGCAGTTTCTCAGTGCTTTAAATGACAATGATGGTCATGTAAGATCTGCTTTAAGGAAACTTCTTAAATTAGTGAAACTGCCAGATTTGGTGACATTTCAATTGTCTTTTAATGGTCTTCTCGAAAGTTTAGAATCATGCCCACAGGTTTTGTCCTCCTTTGACCCATCCCTTGTATTCGTTCTTCCTTTATGTTATTGTTTTTAATTTCTATAGATTTGTTTTACTTACTATGTCCATTCCTTTCTGGAAATAGAATCTACATCCAACACAACTTCAATCTTATTGACATGCCATTGTCAACTTCGTTAATTGCTAGGATGAGTCTGATGTGCTCTCCGTGCTGTTTCATATGGGTCAGAATCATGTAAATATGGTCGATTCCATTATCAAGGATGTTTTTGAACAGGTTAGCTTGGTTCTTTAGTGCTCTGTATTAACTTTCAAATTGAATGACATATGAGATTGTAGTCACTAGTATAGGTTCTTGATTAAATTACTAGTTCGATTAAAAAATATCTATTTATATTTTTAAAAAACTGATGTCTAGTTAAAAGAACCTGATGTGAATCTGTGCAAAGCAGACTTGAAATATTCACCGAGGATTAGCTTTCAGCCATTATTGCTTAATCCCGTTTTCAGTAGTGCATCTCTGCCATATCTTTATTTCAATGTTTTATGTATATTAATAGAAACTAGAAAGCTAACTATATATACCGGCTATACATTGTCATAGTTTTTCTTTCCTTATTGCAAATTGGAAACACCTTTTATATACCCTTTGATTGGGACCCGTTTGTACCTTTGAATATCTTTGAATATTTCATTCTGAATGAAATTGTTTCTATAAAAAGAACTCGTGAAGGTTAATGGATGATGGTCATACTGTTAACTCTCTTGTACTTGTCCTTCACTTCAGATAGACCCAACATCTGAAGGAAAACTTGGATTTGATAGTGTGAAGGTGATTGCATACATTGTTCTAGCTATTTCAGCTCCCCTTTTGGACAATCATACTCTTAGGATTCCACCAAGAATATTTTCTTATGCAGCTACATTACTTGGAAGGATCTCTCATGCTTTGGGCGACATTATGGATCAAAGCACCGTTTTTGCTTACTTGCTGCAAAACAGTAAACACATTGGATTATCTGATCTGGGGTTTAATCCAGAGGGAGCCCCATGCTCACCTACACCTGGAAGTTCTGTCAATGATATACCTGCCATCGCCTCTCTTAAGATGATACCTGCAATGATACATGAGCAGCGGCAGAAAGATGATGATGCCATAGAATCTATTAAGACTATCCTCTTAAAGGTGCAAGATATTTGGCCACTAATACAATCAGGAGTTTTGCATGAAGTTTTAAGGACTTTGAGGTTTGTACATCAGTTCTTTCATCTTTGTTATTGCCTTTTAGGTTATAGATTAAATAACTTGTTCTTTACATATGGTAATACTATGAACCTGTTGTTAGAAATGTATGATAAAGTCAATATATTTTTAAAAAATAATCAATACGATTTACCTGACAATTATTTGCCTGTAAATTTTGTTCTTGGGTTGGAAAGAAACAAAGGAGTATTCAATGATCATAGAAGTTTTTGAGCTAGCTATATTCTGCTCTGCCCTTTGGTTGCATATGGTAATACTACGACGTTTTTGCCCTTTGGTTGCATTAGATAGGGCCTTTGTCACTATACTCTCAGTTTACCAACACTGGCTTTTGTAAGATAATTGGGGAATGTTTGTTTTTGATTAGTTGGTGTACACTTTTTTGCATCTTCCATCATACCAATAAAAATTGTTTTTTTTTTCTCCATCTTTTAACATGAAACTGAGGCTCGCTTTTATTATAATCACCATTCCAAATATGTAGCTTTATTATTATTATTATTATTTTGTTCTCATTAGTTCTCAGCCTTATCCTTTGCAGCCGAACAATATAAATTCGATCTTTGATCTAACTTCCTCATTTTCTTGGAGTTCAGGTTCTGCAAGGAAACATTGGAAATATTCACATATCGAACAGACAAATACAATGGTGCTTTAGCTTTTACATTGCAGTATCTCAAGATAATGAAACTGGTTGCAAAGGTATGGAATTTGATGTCCTCAAAACATAGTTGTCCTTCTAGAATTGGAGAATGGGGATTCCTTTTAGGAAAGCTAGAAAGGGGGCTGAAAGAGTTGAGAAGTAGATTCATTGGATTCTCTAAAGAAGAAGAACGACATATCTTAGAACTGATGTTAGTCACTTGTACACTCAGGTTGTCTAATGGAGAAGTTTGCTGTCATCTCGCAACTATGAGA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BLAST of CmUC03G052490 vs. NCBI nr
Match: XP_038894154.1 (protein SIEL [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1476.1 bits (3820), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/843 (88.26%), Postives = 777/843 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. NCBI nr
Match: XP_004147305.1 (protein SIEL [Cucumis sativus] >KAE8652744.1 hypothetical protein Csa_013395 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1427.5 bits (3694), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/843 (86.00%), Postives = 762/843 (90.39%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. NCBI nr
Match: XP_008463329.1 (PREDICTED: protein SIEL isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016903038.1 PREDICTED: protein SIEL isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0051891.1 protein SIEL isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK17144.1 protein SIEL isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1404.0 bits (3633), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/844 (85.19%), Postives = 759/844 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. NCBI nr
Match: XP_023527352.1 (protein SIEL isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1389.4 bits (3595), Expect = 0.0e+00 Identity = 710/842 (84.32%), Postives = 755/842 (89.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. NCBI nr
Match: KAG7017202.1 (Protein SIEL [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1384.0 bits (3581), Expect = 0.0e+00 Identity = 709/842 (84.20%), Postives = 752/842 (89.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZA0 (Protein SIEL OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SIEL PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 567.8 bits (1462), Expect = 2.1e-160 Identity = 330/858 (38.46%), Postives = 482/858 (56.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CIM8 (Integrator complex subunit 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ints4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 2.7e-22 Identity = 102/400 (25.50%), Postives = 170/400 (42.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96HW7 (Integrator complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=INTS4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 5.9e-22 Identity = 101/403 (25.06%), Postives = 170/403 (42.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68F70 (Integrator complex subunit 4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=ints4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 8.5e-21 Identity = 101/400 (25.25%), Postives = 167/400 (41.75%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9W3E1 (Integrator complex subunit 4 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=IntS4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 3.0e-18 Identity = 79/343 (23.03%), Postives = 149/343 (43.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CKJ8 (protein SIEL isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501508 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1404.0 bits (3633), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/844 (85.19%), Postives = 759/844 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UEC0 (Protein SIEL isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2273G00030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1404.0 bits (3633), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/844 (85.19%), Postives = 759/844 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7A9 (protein SIEL OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441512 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1380.9 bits (3573), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/842 (83.97%), Postives = 751/842 (89.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J0A1 (protein SIEL OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481532 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1364.4 bits (3530), Expect = 0.0e+00 Identity = 699/842 (83.02%), Postives = 748/842 (88.84%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CIY4 (protein SIEL isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501508 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1329.3 bits (3439), Expect = 0.0e+00 Identity = 689/844 (81.64%), Postives = 729/844 (86.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G052490 vs. TAIR 10
Match: AT3G08800.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 567.8 bits (1462), Expect = 1.5e-161 Identity = 330/858 (38.46%), Postives = 482/858 (56.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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