CmUC02G039070 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC02G039070
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr02: 26702193 .. 26708956 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC02G039070
SyntenyCmUC02G039070
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCGCTTAAGGCGGCGGGCACACGGTATCCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTGTGTGCCCACCGCACGGCTCCGTAGGGATTAAGGAAAGCGTGAGCGGGTTTATATAGTAGGTGGACGGGTCGTTTCGACTACTTTTTCCGATGTGGGAATTTCACCTTCTAAAATATGTTTATTCTGTTGCTCTCTCTAATGTCTACCTATCAAAACCCAAATGGGATGTGAAGTGGGATCCTCTCACCACCACTCTCTATGAATTTATTTCATACAAATATAAAATTGAAAAAATCCACTCCAAAGAGTTTTGATGTATGTGTTTTGATTCTTCAAATTTTAAAAGATATATATATATTTTAGTCGTGGAAGTTTTAACAATAGGTGTTCTTGATCCTTTAATTTTTAAGATGTAAATTTTAACATTTAAATTTTAAGAATAAGTTTAAAAGACTTTTAGATAATTACATGACCGATAATTGTTTTAAATGACAAAATTGCTTAAATATTTACAAATATAACAAAACAATAGATGTTGATAAACGCCTAATAGACATTGATAGGCGTTAGCCTATTAGTGTCTATTAATTATAGACTTGACATTTTGCTATGTTTGTAAATATTTTTGCTCATTTTACTATATTTGAAAACAAACCTTATATGACATATTAAATTAGAAAAATAATTATATGACATATTAAATCTACAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAAACTTAAGAATCAAATACATCTATTCTTAAAAAATTGGGACTAAAAGATATATTTTGAAAACCCGGAACTAAACATTTATTCTTAAAAACATGGGACTATAAAGGTACTTTTTTTTTTTGGGAAGAATAATAATTCCCATTTCTAATTATGGGAAAGTTTATGAGATGTGCAAATAAATATTATAAATTTATTATCAATGTTTGGCAAGAAAAAGATCAGCAGGGTGTTTAACTAGAACAATACTTGGGTGCATTTTTTGTACATACCATTTTAATTAAGCATTTATCACATGATAAACTATGATTTGACAATTAGGTACAATGTACAAAGATGGGTATAATCTATAATATACTAAGTATTTTTTTTTTCTCGTTTAACTATTAGTAGTGAACCTTAATAATCAAAATAAGATTATTGGGATTGGGAATAAGAAGAAAATTGAATGATGTTTGAATATCAATATGTTCAAGAAGCAACCTTTAAATGTGTAGTTTGGACGATGATTGTTTTGGACATCTTCAAGAACCTATAACTAGGTCAACAAATTAATAGTTTGTTTGAATGGTGTGTGTAAAGAGTTGTCAAGACATACAAACGAATAGCTGTCTATTGTAGAGGAATTCTAATTGGATTTGAATAATTTGCTAGAATATCGTCTTTATTTGAGCATATTTGAGAACATGATTGAAAAGGATGTCCTTCGAGTTTGTATCCATTCAAGATCAAACTAAAACTACGTTGTAATTAAAGGAACTCATAGTTTACTTGTAAACATCTCAAATTTAGAATTTAGGAAGTGAGTGTTTGTGCATGGAGATATGGATGCCAAGACTTGTTAACATCAATTTTATGATTCAGTATTTTAAAATTAGCTTGGAAATGCTAGAACCAATGCTAGTTGTAAGCACTGATTTGCATTGCCAAGCATTCGGGTGCGGCCATGCGGTTGTGGCTATGCATTTCAAAGGGAGAAGCGGTCGTGAGTGAGAGCAAAAAATTTTGGAAAGTAAAATTATGGCTAAGTATTGACTAAGTTCATGCGTTTATGGTTGATTCACGGAGGTTAGTGAGCTGAGGTAGCTACCCGCGTTGAAGGATAAGTAATTCTGGCGGGAGAAGAAATGTGCTTGAACAATGCGCTAAAGTCACTCTGCATTGAGGACAGTCATGTGTTGAATTCACTTTGCGTTAAGGATAGCCATGCGCTGAAGTCGATGCGTTGAAGACAGACATGAGTTGAAGTCGCCCCGCGTCGAAGACAGAGTGGTCTTGACGCGACGAAGATAGTGGTGTATGACTGAGTTGTATGCGTCAAAAGTAGGAGGTGTTGAGGACGACGCCATGCGTTGGGTGAAGCTAGTTGCTGAAGGCGTTGGAAGAGAATTTTAACATGAGCGCCTCGCGTCGAAGTGAGAACCCCGCGCCAGTCTGCGGGTGAGGGGTAAGTCGGCAACATTAATCTTGGTGTTTGTGAAGGCTAAGTCGGTAGTATATATAGTTGGATTAATTAAATGTTTAATCATTTTTAAGACATTTCAAGAGCTTAAGTCGATTCCATATTTCAAACAGACTTTAGAAGAAGATTGAGGAAGGTGTTCTTGAGGATTTTGGACGAAATTCGACTCATATTGATGTTGAAAACGAAGCTGGAACAGAAGAATGACTGAAGTCACATGGTTTGAGCAGTGACTGATAATCAGAGTAGAACGTGTGGAGGAAGCCGAGTTTAGAGCTGAAACTTGGAGGTTAGTAAGTTAACATAATTTCTAACAACTTTTGTGAAGGAAGGTAAAGCTGAAATTGAAGATCTACTATGTGAATCCTTAGAAAAAGTAGAGTTTACAAGATTATCTCACAATCCGGAACAGCAGGAGGTGATTCCGGAATACAGTGAGAGCGAAGAGGAGTTAAGCCTTGAAACTTTGAGGTAAGCTATAGAACTTAATTTCCTATAAGTTTGTAGAAGAGAAGAAGTCTTGAATCCGTATGGAATTGTGACTTTTAATAGATTGAAGTAAGAACGAGAAGAAAGGAGGGAATAACGGTGCAGACTGCCGCTGAGAATCAAGTATCGGCACACTGTCTGGGTATTGTTAGCGAGACGGGTGTCGCTAAGACGCAAAGGAGCCTTCCGTCTCACAGTTCTCACTAGATAACGCTAAGTATCGCTGCTAAGGTAATGTAACGCTAGTGTCGCTCCAACAAGTATCGCTAGTAACAGTCTTTATTGGTTGGTATCGCTAGAATTCTCGCTTATTAAGTTAATTAGAAAAGGAAGAAGATCTAATGTTCAATAACGCAAGGTACATGTCTCTTGCAGGCCAAGAAGAAATAAGGAAAGTGTATAATTCATGTAAAGCCTAGAAAGAGTTGTGAGTGACTATTTTATTCTTAAAGTCTATTTTATTAAAAATGTTCTTATGAAGTATGATTTAAAATGAATTGTTTAATATGTATAATGTTGATTGCATTACTTATAAGACATGTTATATGTTTTTAAAGTGGATAGTAAGCATTCATATGAAATGTTATTGAATATAGTTTTGTATGATTTCTATGGAAGGATTTTCATATGAACTATTATGCGAATGAAATTCTAAAACGTTTTAAAGGAGGCTCAGTGCTCAAGGACACGAGAAGGCATGTGAGTTTCCCCGGGACCCAGTACTGAAGGACATGAGAAGGTACTTGGGCAACCCGTCATAGTCCTATGTGCACATAGAGGTTGATTTGGCTGGTGCGTCGAGTTTGCTCCGCATTGAGCCAGGGACGATTTCGACGTTGAGTGCGTAGAAGCGTTGCTCCGCCTCAACTAAGGGAAAAGTTTGAAAAACTAAACTGTGATTGATAAACCCCTTGGAATACACTCTTTTATGATTTAAGATTTGATTTATGAGGTTAATGGATTCTATAGAAAGCATGTTTAATTTGAACAAAATGTTAAACTCTTACTTATTCGTTATACATAACATGCCTATTTTCAATGAATGTTCGTTTTACAAAGATTTGTCACTCACTGAGCTGTTAGCTTATGTTTTCGAATGTTTTCCTTTTCTCCCCCAGGTAACAAGGACGTTCCCGGTGCTTAGCCTACTTCAGCTCACCCTGCCTAAGCCTCGAGTTCACAAAATACAGTCAAGTTTGAGAGTTGTACGTTGCATATGTTTTTATGTAATGGCATGTAGATCATGTAGATTTGAGTGAGGATTGTTGGTGGAGTTTTGTTCGTTGTATGATGGATATGGAAATGAAATTATGCTATGTTATAAAAGTGTACTCTATGCAGGGAATCATATTAAGTTACAAGTATGTGTAGTATGACTGAGTTCTATGTTTGTATATGAGTGGAATGTATGCAGGGATAGGGATAGAGGATGGGACAATAGGCGTCACAAGAGGAGTGATGTTTATTGTCTTCACATTCCCTTTCAGGTTAGGTGGGTAATCTGGGAGGGGGTGTGACACTAGTGTTCTAACCTTCCAATGTAACTTAAACCAAGTACTGAGAGACTATTTGAGGAGTTGGAATGTAATAGGATTACTGGAAATCAGAAGTGTATTGAAATGAGTGAACACTTAAAGAACAAACGAAAATGAGATTGTGAACCATGGAAACGGTGGGAAAAAGGATTCAGTTGAAAACTGTCGGAATGGAATTACTTTTGTATTACAAATCGAGCCCAAAATGCTCAATCCAAACATCCATTTTTTATTACATTACATTACAAGTCTATCCTATTATGATTCCCTAAACACCTCTTAAGTGTTATTGGCATTTGGAAGAGTAAAGTAATATGCCAAGACAGTTGCATAAATTATATCCAAAAGATTCATCATACTCCCAAAGAAGGAAAATAAAATAAAATCCATTGGGTGGGAAGCCTAAGTATTTGACAATGTTGGACGAACCCCAATAACTGAGCTCATAAATTGGTTGGCCCAAATAGAGTAGATTATGATCCGTAACAAAGCCCAACAACTCAAGAAAAGACTAGACCGAACTCCAATTGGCGCTCTTACGGTCAAAACTCAGGAAACCTTAGAATGACAAAAGCAATCCACTATAATTGAATTTGTAATTAAAAGTTTCAAAAAAAAAAAATGAATTGAGGAATAGCAAATTTTAAAATTTCATTTGTAAAAATAGTAAAAATGTTTGTAAATTTAAAAAATGGCAAAAAATCAATTTTGTAATCATTAATTTGTAAGTATGGAAGGATGAGAATCTAAGGAGCACATACACGAATACGGATACGATAAGATACAACAGTATGCCATTTTCTAAAAAACAAAGATACGAATACGTCAAATATATATATAATGATAATGCCCAACTAATTGTTATAATATTTATTTCAAGTTGGATTAAAGTAGATTTAAGAAAAGAGTGAGCAAAAAAACAGCATCAACAAAGTTGAGGGGTGGTTGAGCGACATGCTTAGAATAGAGAAGTAGAAAGTAGAAGATAAAGATTGAAGAATGAAGTTGAGAATGAAAGGGGGAGTGGGTGTGAATTTAAATAGTAAAAAAAAAAAGAGAAGAATGAAGATTTGTAATCTCTTTAGTTTTGCATTGCTAGATTTAAAATCTACTTAGAACAATTTAATTATTTCACCACGTCAAATATAGAGTTTGTAACAGACTGGGTTATACTAAGGGCAATCCAAGAATTAGCAAATACTACATATCACGTGTATGGAAGAATATTTACCATTTTGCCAATGAAACCTCAATTTTGCTATTTTTCCAACGAAAAGTCTAAAATTTGCTATGTAACACAACTTTTTGGAAAAAAAAAATTAGTAATAGTCTAATATTATGACATAAGTGAATCTAATAGCAAAATTGTTCCACCAAATGCTACTATTTATAGGCAAATTGGCAAGTAGAGGTAGATTTACTTGGTAGAGATGTGTGGTTGAGACACATGGACAACACATGGGTAATTGGTAAATGTCACTTCGTCTCTTTACACCAAGCATGGATACATAATGAGCATTTATTATTATTATTATATTTATAATACTCTCTCTTAGATACCTATGATATATATATATGAAATATGTCTCATTAAAACCTTACTAGGAAAAAATCCTAGTGATGGAAAAAAAGTACATATTTCATATAACTTAATACTTTTAAAAAAAATACAATATATTTGCTCCCCTCATAGAAACATGACTTGAGATCTTTGATTCGCCATATTCTAATGTTCTACACCAATTTTTCAAAGGTTGCGGTAGGTAATGTTTTTAAAATATGTATGTCAGGTTATCCTTCAAACAAATTTATTATACAATGATATCGTCATTTTCTTCAAAATCATGAGTGTAAAAAAGTTCCGGTGACATATGCTTTGTTCTATCTCCTTTAATATATCTTCATTTGATTTAGGTTATCAATGTTGTGTTGTTTTCGTATAATATTGTTGGAAGATTTTTACAAAAAGACAAGTCAGTTGAGTAGTCGTTATAGTGTGAAAGAGAGTAACTGTTATGGCATGTTTCACTGATCACCAAGATATAGCAGTTATTTCATATAAGTTATTTCATATAAATTTCATATAAGTTATTTCATATAACATATTTGAGATCTAATTTTGTGTGGATTAGATAAATATCTAGATAACTTTATGTCAATAAAACAAACTTATAACGAAGTATATGCTCAATTTCATTTTATCTCTGAAGAATTGTAGCTGGATAAATGACACAATCTCATAATCTTCATAATAAAATACAAGCTGAACTATATTTTCAATTTTCAGATTATTAAATATTTTATATACGGAACAAAGAAATTCGACGTTTGAGACTAAAATTGTAGGGACCAATCACAAGAATGGCCCTCCAAAAATAGGCGTATGCCGCTTTATGGCGACGAGCACACGGTATTCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTCTGCACTCACCGCACGGCTCCGTAATTTTGTAGAATTAGCGTTGCCCACTTTATATAGGCGTTGGAAGTCCCACTTATCGCCGCTTTCCGATGTGGGATTTTGA

mRNA sequence

ATGCCGCTTAAGGCGGCGGGCACACGGTATCCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTGTGTGCCCACCGCACGGCTCCGGACCAATCACAAGAATGGCCCTCCAAAAATAGGCGTATGCCGCTTTATGGCGACGAGCACACGGTATTCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTCTGCACTCACCGCACGGCTCCGTAATTTTGTAGAATTAGCGTTGCCCACTTTATATAGGCGTTGGAAGTCCCACTTATCGCCGCTTTCCGATGTGGGATTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCTTAAGGCGGCGGGCACACGGTATCCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTGTGTGCCCACCGCACGGCTCCGGACCAATCACAAGAATGGCCCTCCAAAAATAGGCGTATGCCGCTTTATGGCGACGAGCACACGGTATTCTTTAGTAAAAGGCGAAAGAATAGTTCGCTCTGCACTCACCGCACGGCTCCGTAATTTTGTAGAATTAGCGTTGCCCACTTTATATAGGCGTTGGAAGTCCCACTTATCGCCGCTTTCCGATGTGGGATTTTGA

Protein sequence

MPLKAAGTRYPLVKGERIVRCVPTARLRTNHKNGPPKIGVCRFMATSTRYSLVKGERIVRSALTARLRNFVELALPTLYRRWKSHLSPLSDVGF
Homology
[Close]
BLAST of CmUC02G039070 vs. NCBI nr
Match: RDX78837.1 (hypothetical protein CR513_40827, partial [Mucuna pruriens])

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.9e-06
Identity = 36/68 (52.94%), Postives = 42/68 (61.76%), Query Frame = 0 

Query: 1  MPLKAAGTRYPLVKGERIVRCVPTARLRTNHKNGPPKIGVCRFMATSTRYSLVKGERIVR 60
          MPL    TRY LVKGERIVR V   RL+++++    K        T TRYSLVKGERIVR
Sbjct: 1  MPLNMTETRYSLVKGERIVRYVSITRLQSSNQENSFKNMRMLLKVTKTRYSLVKGERIVR 60

Query: 61 SALTARLR 69
            L  +LR
Sbjct: 61 FVLITQLR 68

[Close]
BLAST of CmUC02G039070 vs. NCBI nr
Match: KAF7833781.1 (Mitochondrial chaperone BCS1 [Senna tora])

HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 9.2e-06
Identity = 49/106 (46.23%), Postives = 51/106 (48.11%), Query Frame = 0 

Query: 1   MPLKAAGTRYPLVKGERIVRCVPTARLR---TNHKN------------------------ 60
           MPLKAA TRY LVKGERIVR V TA LR   T+H +                        
Sbjct: 11  MPLKAASTRYSLVKGERIVRFVLTAWLRDFCTDHASLFIVSSILKCCKLHDVGHRINNMG 70

Query: 61  ---GPP------KIGVCRFMATSTRYSLVKGERIVRSALTARLRNF 71
               PP      K       A STRYSLVKGERIVRS L A LR F
Sbjct: 71  MGVAPPTKRNLHKNRRMPLNAASTRYSLVKGERIVRSVLNAWLRAF 116

[Close]
BLAST of CmUC02G039070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A371FKJ3 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Mucuna pruriens OX=157652 GN=CR513_40827 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 9.0e-07
Identity = 36/68 (52.94%), Postives = 42/68 (61.76%), Query Frame = 0 

Query: 1  MPLKAAGTRYPLVKGERIVRCVPTARLRTNHKNGPPKIGVCRFMATSTRYSLVKGERIVR 60
          MPL    TRY LVKGERIVR V   RL+++++    K        T TRYSLVKGERIVR
Sbjct: 1  MPLNMTETRYSLVKGERIVRYVSITRLQSSNQENSFKNMRMLLKVTKTRYSLVKGERIVR 60

Query: 61 SALTARLR 69
            L  +LR
Sbjct: 61 FVLITQLR 68

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmUC02G039070 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
RDX78837.11.9e-0652.94hypothetical protein CR513_40827, partial [Mucuna pruriens][more]
KAF7833781.19.2e-0646.23Mitochondrial chaperone BCS1 [Senna tora][more]
BLAST of CmUC02G039070 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmUC02G039070 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A371FKJ39.0e-0752.94Uncharacterized protein (Fragment) OS=Mucuna pruriens OX=157652 GN=CR513_40827 P... [more]
BLAST of CmUC02G039070 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC02G039070.1CmUC02G039070.1mRNA