Clc11G14890 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTCTGACTCAACTCATCACACCAAACAGACATTCCAATTAAACTCAACTCTGCGCCCAAAACACAGATAATCTAACTCACCAGACAATCTAATTCTGCTATAATTATTACCAACTCAACTCAACTCATATGCCACAAACCCCCGAAATGATTCTAACTATTTTAGACTCATGAAAAACATGATTTTTAAGTCTCTGCTATATAATACCCCACTCACGCTCTATTCCAAGCATCCAAGTACCTTTGTTGCAGTTCAGCTAATGGCGGACAATTACCCCTTGAAAAACATCCTTCAGAGCACCGCTCTTCTCCAGGTTCGCTCCTATTCTGTACTTTGTTCTTGTTTTCACTCCCATTCCTGAAGTAATTAATTTATCCCTGCGCTGCGCCCTGATTGCGTTAACTACTCCCGATTACGCTACAGAGTAACTAAAATTATACTTGAAATCTGATTACGTTCATTACTCGCGACTGATTAATTAAACTCAACAATCGTTGAATGCTCGAAAAAATAAAATGGCTGGCATTAATTTCGAAGTCGAAACACATGTATTTGATTGCAGTATATACTCGAAGCCAACGCCTATCCGAGAGAGCATGAACAGTTGAAGGAACTCAGGGAATCAACCATTAAGAAATTTGAAATCGCGTGAGTTTCCGACTCTTCAATCGTTTCGATTCAATTTTTAAATGACCGATCCATTTGGATGGGTTTAGTCCGATCATCATATAAGATCAGAGTGGTTAATAATTTAGATTAGTAATTTTGGGGATTGAGTTGCAGGAGTATGATGAATGTACCGGTAGATGAAGGATTATTTCTATTAATGCTTTTGAAATTGATGAACGCAAAGAAAACGATAGAGATCGGTGTATTCACTGGCTATTCCCTCCTCACCACTGCGCTTGCACTGCCCTCCGATGGCCAGGTTGGCTATGGCTTAATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAAATATATATTATCTTAAATCACCAAAGTTAAACAAGAAAGTTTCCTATTGTGCTTTATACAGATTTCTACTTTATCGTTTTTTCATATAATTATTTTCAATACTTTGGTCATGCCTTCAAATAATTAAGTCTGTGAACTTTTAACTTAAAATTTCAACCATATGGTAAATAAGTGAATTCCAAAATTGTTTAACTACTTATATGATTAAGACTCTTTTTTATAATTATTTAATTTTTATTTGATAACTATTTAGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTAAAAATTAAGTCTATAAATACTAATTCTACCTCTAATTTTTTTTTTCATTTGTCAATAGTTTATAAAACCAAGCCAAAATTTGAAAACCGGACTTATTTATTTATTATTTATTTTTATTTTTTAATTTGGCTAAGAATTAAAAAATCAAATACTAAAAACAAAATGGAAATGGGAGTTAGTTTTTTATTTTGAAAAATTAAGCCTATAAAATTCATTTTCCTCCCTTGGTTTCAATATTTTGAGTATATATTTTAGAGGTGTTTTTGATGTGACAAATTTTGAAAACTAAAAAGAATAATTTTCAATAACTTATTTTTATTTTAAAAATTTAACAAAAAATTCAAATGCTTTACAAAGGAATATATGAAAACCACGAGTTAAAAATTAGGAGAAAATAAACACAAATTTTAAAAACCAAAAATTAAAATCCCATTTGATAATTACTATTTCGTTTTTAGTTTTTTAAAAATTATTTATATTCCCTCTTAATTTCTTACCTAGTTTATATCTTTGTGAAGAACAAAAGTTAAATTTGAAATTAAAACATTTTTTAAAAAAAAACTATTTTTTTGTTTTCAAATTCTAGATTTAAAAGCGTAAAAAACAAATAACAAAAAAACAAAAAATTTAGAAAGTAAGAAGTATTTACACGCCTAAAAATAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAATCAAATAATTATCAGATATTAATTAATTACTAAATCTACCTCCAAACAAAACGTATTAGATAAATAATTTTTAAAAAGTAAGGGATCTGTTAATGCATGAATAATTAGAAGGTGGAGTGTCGACTACATATCATTTTAGAAGATTTATTATGGAATGTGTAGATAAACAGAAAATTCTTTTTTCTTTTCCTCTAAAAATTAGGGGCAATTTGGTTGTTGGTATAGAGGGTGAGAATAGACATGAGCTTATAAATTCCATGTTTGGTTGGTGGGTTTTCTTAATTTACCTTAAAAATATATTTTTCATGCATATTTTAATCGGGACATTCCAAACCTCTTGAGAAGCAAGAGTTTTGCGTTCCTTCCCATATATCTCTAGCTCTCACGGTTTTCTATCTTAACTTCCTTTCGCTATTTTCTATCTTCACTTTCTCTCTTCTTCATCCTTCTCTACAAACATTTTTTTTTGTAGAGTGAGAAAGATAGAGTGAGAGAGAGCGAGAGAGATAGAGTAAGAAAGAGCGAGAGAGATAGAGTGAGAAAAAGAGCGAGAGAGAGCGAGAGAGATAGAGTGAGAGAGAGCGAATAAGGTTGATATCATTTCCTGCACAATCAAACATATTTATTTTTTATCCTCAAACATCCTATTTCTAGGTATCTTTTATTTCCAAACATTTTAAATCTTTAACCAAACCGCCCCTTAAAGAAATTAGATTGAAAACAAATTCAAAATATATGCGATAAGTATATTGATTAATGATTAGACAGGTTTGTGAAAGTTTTTATCAAATATTCAATTTAATTCAATTTTATATTATTATTATTATTATTTTATTTGTTTATTTACTTGGATGGTAGATAACAGCAATTGATGTTGATAGAGAATCATTCGAGTTTGGTTTGCCATTTATAAGAAAGGCGGGAGTTGATCATAAGATCAATTTTGTAGAATCTCAGGCATTGGTTGCCCTAAATGACCTCCTCAATGATGTAAGTTATTCTTTGGAAGTTGAATTCTAAAGATGCTTTTCTATTTTTTAGAATACAAATTCAGTAGAAGGAAAATATTTAGGTGATGTTAGGCTATTTTTGTTTTCTGTTATTTAGTTTTATTTCAATATTTTCTTCATTTTTGTAATCAAATTAGTTAGTTATGGATTCTTAAAACAAAACGAATTTTTAGACTTAGTTTTAGAGATATATGGTAGTGGGGTTTTTTAGATTTGTAGTTAAATTGGAAAAAAGTAGAGATAATTAAGGAGATTTTTTTAGGTTGAACTTATTATTTGGAGTTTGAAATCCTTGAAAAATTTGGAAGGAGGTTTTCTATTATCTCTTTTATTACCATTGATTTTTAATTTTCAATTTGTGTCTAGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATTTGTCTTCTGCTAAATCGTCCAATCATAAACTTTTCTTTTTTTTCTTTTCAAAATATATTTTTGATTTTTTATTGTTATATTTTTTTTAAGTGAGATTGATAAAGTATTGTCTTTCTAAAATTCAAAAAAGTCTAAAAAAACAAGTTGCTAGTTCGTCCTTAGATTGTTGTGCATCTAATTAAATGGAAAGATAGCATTAGGGGAGTTGGGACACTGAGTTAAGTTATGAAGTCTGAAGTTAGGAAATTTGGAAGTCTATGTTTGGGGTGCAGAATTGTAAAATGAAATTCTTCGATAAATGTTTAAAATAGAGAAAGAGAGGAAGATAAAATTTCTAAATAAATTTCAAACTTTAATAGTGTTTACTCTTGAAGTTGAGTTGTTTAACACCTACTTACGTAGTTGGTGGGCCAAAAAACTCTACTTTTTTTATTTTTTATTTTTTTAAATGACCATTAATATTTTGTTAGTTCAATAATCAACGAAAAATCAATAAACGAGCTTTAACTCAATGGTAATTGATATGACCTTCCATTTAGAAGTAGAACTATGTTCATTTTGGCAATCTCCAATTCATGTTATCCACTATGAAATAGAAACTTGCATATAAGAAAATTTAATCCATCCATTTTTGTATATTTATTATTACTGTTCTTCGGGCATACGTACTACTACAATTGAGTCAACAAAATTGAGTTATGTACTATACGACTAGCTTGAGCGATGATGGTTAAAGGGAAAGCAAACAAGAATCATATTTGATATATTCAAAGTACATTAACAACTTTTAAACAGAAAAATCTTTCTTTAAGTGTTGTAGGCAAAATTTTCAAATAAAGTAAATAAATGAACACAAATGTGTGCTGTCTAATAATTACCTGTCTACAAAATAATAGAGAATAGTTTGATGAAAATTTTACTTCTCGGAAAAAAAATTGATATTATTGTTTCTTTGAATCAGGGTAAAGAAGGAGAGTTTGATTTTGCATTTGTTGATGCCAATAAATCAGAGTACATTAAATATCATGAGTTCCTTCTAAAACTCGTGAAGATAGGTGGAGTAATTGTCTATGATAACACTCTATGGTTCGGATCAGTGGCGCTAAGTGATGACGCCGTCCATGAAAATTTGAAGGAGAACAAAAGTTATTTGCAACGATTCAATGCTTTTCTAGTCAATGACACACGGGTGGAGATAGTTCTCCTCTCCATTGGAGATGGTATCACTCTTTGCAGGCGTATCAAATAATTTGGTTGTTTTAAATAACATGCCAAGATTTCAACATAGGTAAATTTTATGAGGAAAATTATGGTGTGTGTGAGATGAGATTTTCGAAGAAATTTGATTCGTTGAATTTGAACTTCGTATTTGTATTAATTTCAGTATTTTATGAGTACAAACTCTATCATTTAATCTTTTGATTCTTTATCTCGAAAAGTTACAAGAAGTTTAAGTTTCCAAATCTTTTTAGAGCTTCGACTTCAAAGCCTTTAGGAGTTTTGTCTTCAATTCTTTAGAACTTGAGAGTTTCAAGAACTTGTGAGTTTGGGAGCTTCAATCTCTTTAATTTCCAAAGCTTCGGCACTTCCTTGCCACGGTTTCTAACCTCTCAAAATGAAGGAGAGGAGCCTCTATTTATAGGAGACTTCCA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BLAST of Clc11G14890 vs. NCBI nr
Match: XP_038892937.1 (caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 396.4 bits (1017), Expect = 2.0e-106 Identity = 204/237 (86.08%), Postives = 220/237 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. NCBI nr
Match: XP_022151835.1 (flavonoid 3',5'-methyltransferase-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 1.4e-99 Identity = 190/250 (76.00%), Postives = 224/250 (89.60%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. NCBI nr
Match: XP_004135317.1 (putative caffeoyl-CoA O-methyltransferase At1g67980 [Cucumis sativus] >KGN51677.1 hypothetical protein Csa_008738 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 369.8 bits (948), Expect = 2.0e-98 Identity = 193/235 (82.13%), Postives = 215/235 (91.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. NCBI nr
Match: XP_022945592.1 (caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 3.4e-98 Identity = 187/235 (79.57%), Postives = 212/235 (90.21%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. NCBI nr
Match: XP_022966735.1 (caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 4.4e-98 Identity = 187/235 (79.57%), Postives = 210/235 (89.36%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93711 (Caffeoyl-CoA O-methyltransferase OS=Populus kitakamiensis OX=34292 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 288.1 bits (736), Expect = 1.0e-76 Identity = 150/234 (64.10%), Postives = 183/234 (78.21%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C9W3 (Putative caffeoyl-CoA O-methyltransferase At1g67980 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g67980 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 285.8 bits (730), Expect = 5.0e-76 Identity = 145/233 (62.23%), Postives = 182/233 (78.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C7AE94 (Flavonoid 3',5'-methyltransferase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=FAOMT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 283.9 bits (725), Expect = 1.9e-75 Identity = 140/228 (61.40%), Postives = 184/228 (80.70%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A077EW86 (Norbelladine 4'-O-methyltransferase 2 OS=Narcissus aff. pseudonarcissus MK-2014 OX=1540222 GN=N4OMT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 5.1e-73 Identity = 149/235 (63.40%), Postives = 183/235 (77.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A077EWA5 (Norbelladine 4'-O-methyltransferase OS=Narcissus aff. pseudonarcissus MK-2014 OX=1540222 GN=N4OMT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 274.2 bits (700), Expect = 1.5e-72 Identity = 148/235 (62.98%), Postives = 183/235 (77.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DCA7 (flavonoid 3',5'-methyltransferase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019721 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 6.7e-100 Identity = 190/250 (76.00%), Postives = 224/250 (89.60%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTC8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G589940 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 369.8 bits (948), Expect = 9.6e-99 Identity = 193/235 (82.13%), Postives = 215/235 (91.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G1C7 (caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449784 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 1.6e-98 Identity = 187/235 (79.57%), Postives = 212/235 (90.21%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HSF7 (caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466357 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 2.1e-98 Identity = 187/235 (79.57%), Postives = 210/235 (89.36%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G1B9 (flavonoid 3',5'-methyltransferase-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449785 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 1.1e-97 Identity = 184/234 (78.63%), Postives = 210/234 (89.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. TAIR 10
Match: AT1G67980.1 (caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase ) HSP 1 Score: 285.8 bits (730), Expect = 3.5e-77 Identity = 145/233 (62.23%), Postives = 182/233 (78.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. TAIR 10
Match: AT1G67990.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 265.8 bits (678), Expect = 3.8e-71 Identity = 134/233 (57.51%), Postives = 176/233 (75.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. TAIR 10
Match: AT1G24735.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 262.3 bits (669), Expect = 4.2e-70 Identity = 133/228 (58.33%), Postives = 168/228 (73.68%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. TAIR 10
Match: AT1G24735.2 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 6.5e-63 Identity = 133/279 (47.67%), Postives = 168/279 (60.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14890 vs. TAIR 10
Match: AT4G34050.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 1.0e-60 Identity = 124/228 (54.39%), Postives = 158/228 (69.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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