Clc11G14870 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTAACATTTGAAAGTCTAAAATGGTATTTAAATTCCTATTGGTTTCTCATAATCTCATTTGAGTTGCATCAGTGGAATGTTATAAGCGCCGGAGAATCGCAGAGATCATTGGGCGGTGAGATGAGTTTAGTCAACACTCACACAAGCTCCGGCTCAATTCCTTCCCTCTCTCCTTCTTCATCCTCCATTTCCCGCTGTGCTTTCACTCACACTTCCTCCTCTGGTAATCCTTTCTCAACGCTTCTTCTTCTTTTGTTGTTCTTCGCGTTGTTTCTTCCCTTACTCTAATCAGTTTCTGCTTGAATATAATCAAAACGTTTGCTCTCTCTTTGCTGAACCAATTTGTAGGCTTCATTCTTCGAGTATTTCAGGGATACCGTAGTTTTGTGGCTAACTTGGAACTTAATTTGAGAAATCACAGCCTTACTATATATCTTTGAAGAACAAAAGAATGCAGGACTCGGATTTGATTATAAATACGTGTGATGAAATGAGATATTTAAGGCTCCATTTCATAATCATTTAGTTTTTGAAAATTGAGGTTACAAGCTCTACTTCTTACGCCTATAGGTTCTTTGTTTTGTTGTCTCTACTTTTTCACACGTGTTCTCAAAATTCAAGCCAAGTTTTGAAAAATAAAAAAAAAATTTTGTGGTTTGAAATTTGGTTATGAATTCAAATTTTTACTTAAGAATGATGGAAACCATGATTAAGGAATTGGAAGAAAAGAAGCTAAACCAAATGGTCGGATCTTAGTGGCACTTCATAATCCTTTGGAAACAGAGCCATCGGGTGAAGGTTTACTGCCTATTTAGGTAGAATCAATGTCTATTTAGCGATTGCTACTTTGGATCCTTTTGAACCATGCTTACATGTATGCCTTTCTACACATTCCCATCTCATCCGTTAAAAAATTGACAATCAAAGATAAATAAAACAATGTAAACATTTGAAAATCGACATAAGGATTTACATAGTTCAGTAATAATAGTGTGTTACCTACGTCCACGGACGGAGGAAGAGAGCAACATTTTATTATTAGAGAGAAAATATCAGATTAAAAATTTAGAGGGACTAGTAAAGTTAGAGCGTTTCTACATCGCACCCCTCTAAACCCAGGACAAAATTCGTAAATAACTTAAAATAACATAACAATATATGGTCCCTGGTTAGCTCGTTTTAAGATAGCATTAAAATTTAGCCTTCTTTGGTGATTACTGCAAGTTTCAGTAAGAAGCACGCAAACCAACCTCAACTTGATAAAGTGGTTTTTTCTCTTTAAGACTGGATATTTTCATAAATATTTTCCAGCCCCCACTGATTGGCTTTTCTTTATGAAAGAGGGGAATGAGAAAGATGGAAAACGAGGTAGAATAGGGAAAGGCCGGATACTGTTTTTTCATGTTACTCATTGATAAATAGGATAAGTCATCCTCCCCGAGCACAGTAAAATCATCACTAGTGGTTTCTACTCAAGCTGCTGTTATGATTTTTCTCAAGTGTGATTCACAAGTCAAAGTATTTAAGGTTGATTTCATTCAGGATTAAATGACAGCAATGCATGTATTCAAACTGCATAAAGGAAATGGCCGATTTAGTGGCAATAATTTCAAGTCTAAGCTTAAATTTGAACCTCAATTGTTTAATGTGCAGATTATGTGACGTGTGGGACACCAACTTGGATTGGGAAGGGAATCACTTGCATTTGCTTCAAGCGGAAGGGAACTTTTGAACGAATTTGTATCAACCTGACTCCTGTACAGGCAAGTAAATTATAAAACTGTCAAATTGATATGAGTAAGAAGGGGAAATAGTAGAGATATCAACAATAATGTTACCATTTCCATCGTGGGTGTAATTATTGATGAATTTATATTGATCCTTGGCCTTCTGTTTCTGTCTTTGTTCTTTGCTCGCTTTTACTTGCAAACATTGCCTTGGTGGCCTTGCAGCCTTTTTTCTTGAAGGTGCGAGATGTAACCCTCAAATTAAATTAAAAACATTTTACAAACCCTCAATTGGTATAACCAAGTATTGTTGAATATGAGTCATATAAAAGTCTAAAAAAAGAAATACCCCTGCAATTTTCACTAAATAAAAATTCTTAAGTCACACTAGAGGAGTAAAAATAGTAATAGTTCAAATTGTCACAACTCAAACCTTTATATTTTAAACCTTTATATTTTATAAAATGGGACAAATCAAAATTATTTTTCTAACCATTAGGTGAGGCGTAGAGATCTTAAGTTTCGGTGCGTTTTTACGAGGGCGTAGGTCTTGTGGCTAAAAGTTAGAGCCTTGATAGCTTTTTAAATCATAAGTTGCAAGTAAGGTACTTCATGCTCGCTGGCCCAATCATGCTCCTTACAAGTTCCATTTTTTGTGCTGTTAATGTCACACAGCGTCATTGCCTTGTTGGAAAACGAAACACTTTGTAAACATTTGATTTCAGATTTTTACTGGAAATGAACAAATTAATTATGATATGGGGCTAAGCTAACAGAAGCCACAACAATCACACACGTTCCTTAAAAATAAGACGTTTCCTCCTGATTGAAAGTTTTCAAATAGTTTTGATGACGATTCTTAACAACTATGTATGTACTGTGAGTCCTTTAACTTGATGAAATTTCTGATTGCCTTAGAAGAACATTTACATTCATGATCTCAGGCAGATAGGTTAAGAAGATTACAGCACCGCATGAAGGTCTACTTTGATGGTTCAAGAATCGACCACCAGGTTTGCTTATTGGTGCAAGAATAAGCACCCTTTTACACATTTGAGTTTATCTTAATTAGTCTCCAATTGGAAATATTTTTTGTTATTTGCCTTTTGATGTTGGGTTTCCCCAATCTCATTAATCAATGAAAGGTTAAAAAAGAAAAAAAAACATTTCCTTCTAATGTCATTTTACAAAATCTTTATGTTATTAGTTCTATGTGTACACCTTGCTTTCTAGGATACTTATTGTGAAGTTTTCACCAAGGACAGGAGGCTTTAAGAGCTCTATGGTATGCAGCTTATCCTGGTCGAGAGCTTCAGGCGTTGGTATCAGATCAATGGAAAGAAATGGGATGGCAGGGAAGAGACCCATCAACTGATTTTAGGTTGTTATTTTGCTATATGAGTTGATGGCTGCTTGTTTATCTCTTGTATTACCTTTTGGCACGTTATCTCCTTTTCATTGCTCTGAAAAGCTTTTACCTAATCCAGAGGAGCTGGATTTATCTCTTTGGAGAATTTGTTGTTCTTTGCAAAGACATTCTCAGTAAGATCCTAAACTTCATTTGACTCGTAAAATTCTTTAGGCCCCTAAGTGAAACATGTTATTATGCTTTCACTAATCCTACTTCTCCTTTTATCGTTCCAGACATCTTTCCAACTTCTGTTGAGAAAACAAGGAGGAAAGCCAGCTGCTTGGGAATATCCCTTTGCTGTTGCTGGTGTAAATATCACATTTATGATCATGCAAATGCTTGATCTGGATGCTTGTGAGTAGCAAATCCATTTATGCGTACTGGTCTACATACAAATATACCATATAGGCTGCAACACTCCAGTAAACTATTACTATTAGAGCTTCAGTTTTATGATGACTTTTAAATTCTTGGAAGCAGAACTAATACAGCTCACCTTTTCAAATGCAGCAAAACCAAGGACTTTTATCAGATCAGTTTTCCTGCAGATGTTGTCAGGTAAATTTCTAAACTAAGAAGCTTGGACACTTTAGTTTGGATGGTATGTCTATGTCGACACGTGTCGGACACTTAGACACTCACATTTGTTGAACACGTGTAGAACACTTGTTAGTACAACAGATATGTCAAACATGCATAGAGCACTTGTTAAGTAGACTTGAAGGACACATATATGATAATAATAATAAATTTTGAGTGTGGAGTACATCAAACCATCTTGTTAAGCATATAAATGCATTAACCCATTTACTTTGAATTTTCTTCTGTATAAAAATTATATATATTTTTAAAAATGTATATTTTAATAAACATGTCCTTATCGTGTCTGTGTCCTAGATTCTTAAAAAATGGAGTGTTGTCGTGTCCATTTCGTATTGTGTCTGTATCCATGCTTCTTAGTCTCTAAACTTAATCCTACAATGTCTCAAGATTGAAGTTGTTTATCGATACAAGATGTATAATTGCCCTTTGTATGGTATTTTCTGATAACAGAGAATGAGTGGGCATTTGACTTGCTATACTGCGTCGCCTTCGTAGTTATGGACAAACAATGGCTGGAGAGAAATGCTACCTACATGGAGTTCAATGTAAGAATAAACTGCAGAGTCAGCTTATTCACTTCAAGAGTTAATTCGTTTAAAAATAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGTCTACGAATTCTAACTCGTATTTACTCTTCGATGTTGAAGTGAGATCTACTCATTTAATAAATATATCATAAAAAATCAATAAAAATGAATAATCGAATTATCCATTTGTGGTAGGATGTGTTGAAGTCCACCAGAGCTCAGTTGGAGAAAGAACTTTTAATGGAGGATGTATTACGGATTGAAGATATGCCTTCTTACAACCTTCTTTTAACATTAGATTACAGGTAGAACAATCTGTCACACCACTCTCAAGGGCAGGGTTAAATTATATATATATATAGTATTTTGTTGATATTAGCTTTGAGGGGGAAAAAACCCTAAGAAGTTCTAGTGGCTAATTTACTTGATGTTCTTTGTATTGTTACAAATATCAGCATAGGTAGATGTAAGATGTTATTTTAGCACAAGAATGGACGGAGGTTTTCCTATTGTTGAGATGTTTAATTCAAGTAGGTAGGTTTTTAGTTAAATATTATTATTATTTAGGTTGCCTTCAAATATAGGAAAATAAACCAAGATATTTACAAATATAACAAAATTTCACTTTCTATCTGCGATATTTTGCTTTTATTTGTAAATATTTTCAACAATTTTGCCCTCCCTTGTCTTGCACAACTTTTT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ATGAGTTTAGTCAACACTCACACAAGCTCCGGCTCAATTCCTTCCCTCTCTCCTTCTTCATCCTCCATTTCCCGCTGTGCTTTCACTCACACTTCCTCCTCTGATTATGTGACGTGTGGGACACCAACTTGGATTGGGAAGGGAATCACTTGCATTTGCTTCAAGCGGAAGGGAACTTTTGAACGAATTTGTATCAACCTGACTCCTGTACAGGCAGATAGGTTAAGAAGATTACAGCACCGCATGAAGGTCTACTTTGATGGTTCAAGAATCGACCACCAGGAGGCTTTAAGAGCTCTATGGTATGCAGCTTATCCTGGTCGAGAGCTTCAGGCGTTGGTATCAGATCAATGGAAAGAAATGGGATGGCAGGGAAGAGACCCATCAACTGATTTTAGAGGAGCTGGATTTATCTCTTTGGAGAATTTGTTGTTCTTTGCAAAGACATTCTCAACATCTTTCCAACTTCTGTTGAGAAAACAAGGAGGAAAGCCAGCTGCTTGGGAATATCCCTTTGCTGTTGCTGGTGTAAATATCACATTTATGATCATGCAAATGCTTGATCTGGATGCTTCAAAACCAAGGACTTTTATCAGATCAGTTTTCCTGCAGATGTTGTCAGAGAATGAGTGGGCATTTGACTTGCTATACTGCGTCGCCTTCGTAGTTATGGACAAACAATGGCTGGAGAGAAATGCTACCTACATGGAGTTCAATGATGTGTTGAAGTCCACCAGAGCTCAGTTGGAGAAAGAACTTTTAATGGAGGATGTATTACGGATTGAAGATATGCCTTCTTACAACCTTCTTTTAACATTAGATTACAGTGTGAGCAGTAACCATCGGCAAAGCCGCTTGGCGATTGCACCGAACAGTCTTCTATCGTTGGTTCCATGGAAGAATTTCAGAGGAAATGCAATAAAGTTTCATGTATTAGCTATGGAGTTCTTTTTAGTTTCTCAGCACATTGATCGGCGCCCGCTGTTCGGAGCTCTCTATCTGGTCATGTACTCTCTCAACGCCCATGTTCTTATTCCTTGTTTGGTTCATACTTCATATATGTTACAAATTTACTATAATTTTTCAGCCTGCTGCTAA MSLVNTHTSSGSIPSLSPSSSSISRCAFTHTSSSDYVTCGTPTWIGKGITCICFKRKGTFERICINLTPVQADRLRRLQHRMKVYFDGSRIDHQEALRALWYAAYPGRELQALVSDQWKEMGWQGRDPSTDFRGAGFISLENLLFFAKTFSTSFQLLLRKQGGKPAAWEYPFAVAGVNITFMIMQMLDLDASKPRTFIRSVFLQMLSENEWAFDLLYCVAFVVMDKQWLERNATYMEFNDVLKSTRAQLEKELLMEDVLRIEDMPSYNLLLTLDYSVSSNHRQSRLAIAPNSLLSLVPWKNFRGNAIKFHVLAMEFFLVSQHIDRRPLFGALYLVMYSLNAHVLIPCLVHTSYMLQIYYNFSACC Homology
BLAST of Clc11G14870 vs. NCBI nr
Match: XP_038892731.1 (ELMO domain-containing protein C [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 2.5e-147 Identity = 263/277 (94.95%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. NCBI nr
Match: KAE8648680.1 (hypothetical protein Csa_008024 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 2.1e-146 Identity = 265/292 (90.75%), Postives = 275/292 (94.18%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. NCBI nr
Match: XP_008446042.1 (PREDICTED: ELMO domain-containing protein A [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 528.1 bits (1359), Expect = 6.0e-146 Identity = 262/275 (95.27%), Postives = 266/275 (96.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. NCBI nr
Match: XP_004135318.1 (ELMO domain-containing protein A [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 1.0e-145 Identity = 262/275 (95.27%), Postives = 267/275 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. NCBI nr
Match: KAG6601596.1 (REF/SRPP-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 6.3e-143 Identity = 260/281 (92.53%), Postives = 264/281 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54YW1 (ELMO domain-containing protein A OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=elmoA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 8.0e-24 Identity = 59/194 (30.41%), Postives = 98/194 (50.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54RS7 (ELMO domain-containing protein C OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=elmoC PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 9.7e-22 Identity = 62/194 (31.96%), Postives = 104/194 (53.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54VR8 (ELMO domain-containing protein B OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=elmoB PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 3.1e-20 Identity = 53/186 (28.49%), Postives = 97/186 (52.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BGF6 (ELMO domain-containing protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Elmod2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 1.0e-18 Identity = 63/210 (30.00%), Postives = 106/210 (50.48%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8IZ81 (ELMO domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELMOD2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 3.2e-17 Identity = 57/200 (28.50%), Postives = 97/200 (48.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KVA2 (ELMO domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G589930 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 528.9 bits (1361), Expect = 1.7e-146 Identity = 263/276 (95.29%), Postives = 268/276 (97.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BE42 (ELMO domain-containing protein A OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488893 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 528.1 bits (1359), Expect = 2.9e-146 Identity = 262/275 (95.27%), Postives = 266/275 (96.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GX58 (ELMO domain-containing protein B isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458352 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 3.4e-142 Identity = 258/278 (92.81%), Postives = 264/278 (94.96%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GXX7 (ELMO domain-containing protein B isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458352 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 1.3e-141 Identity = 256/275 (93.09%), Postives = 262/275 (95.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAA5 (ELMO domain-containing protein C OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493093 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 510.4 bits (1313), Expect = 6.3e-141 Identity = 254/275 (92.36%), Postives = 261/275 (94.91%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. TAIR 10
Match: AT1G67400.1 (ELMO/CED-12 family protein ) HSP 1 Score: 383.3 bits (983), Expect = 2.2e-106 Identity = 185/250 (74.00%), Postives = 211/250 (84.40%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. TAIR 10
Match: AT2G44770.1 (ELMO/CED-12 family protein ) HSP 1 Score: 301.2 bits (770), Expect = 1.1e-81 Identity = 144/260 (55.38%), Postives = 196/260 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. TAIR 10
Match: AT3G60260.1 (ELMO/CED-12 family protein ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.3e-81 Identity = 145/260 (55.77%), Postives = 192/260 (73.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. TAIR 10
Match: AT3G60260.2 (ELMO/CED-12 family protein ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.3e-81 Identity = 145/260 (55.77%), Postives = 192/260 (73.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G14870 vs. TAIR 10
Match: AT3G60260.4 (ELMO/CED-12 family protein ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.3e-81 Identity = 145/260 (55.77%), Postives = 192/260 (73.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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