Clc11G09120 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc11G09120
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr11: 11337772 .. 11341032 (+)
RNA-Seq ExpressionClc11G09120
SyntenyClc11G09120
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGCCTTTCATTCTGATGTCAGTGTTCACTTTCGATTGACATTTCGACACGATAGTGAGAATATCGACCGAAGCGGTTTCCATTTCTTGTGTGGAAGACAGAGCGGGGTGTCTTTTAAAGAAGATATTGTTGTTTTTGAACTTGTATCCATTAGTCGATACATTGTTGCAGGTGGAATGATGAACCTTGGCCCAAGTATTGCAATCACATTGAATGTTTCTTTAGGTTCGGTGGGTATTTCGACATCGGCCGTGCCCCTGTAAAGGTGAAAAAGTGTGCAGTTCGCTTGGTATACGTGGAAGGAAAAACGCAAACTACTTTCTTACTCGGTTCCTTTGGTTAGTATCATTTTCTAAATCGTAATAATAAAATCTCTCTTTAACTTTCTCATTTACTTTTTCCTCTTCACATCTTTTAACTTACATTTGTGTTTATCATTTTTGCTGGCATTATATTTTCAGTTTCATCATATGCATGAAAATTTAACATAACTTCTTAGCTATGGGACAGAATTAGTAATCTATATCAATTAATAACAAGTCACGTTGTATGAAGAATAAATATGTAAGCTTCATTGATGTAGTTTGGAAGTGAAATGTAGATATGTGTGTTTTGTATTGGTTGTTAAGAACATAGTTATAATAAAAGATTGTATCTCTTTCATAAACCATAATATTTTGGGTTTGGTTTGTTCTCATGTGTGTTTCAATAATGTAACGTATGTACGTAGGTTGACAACACTGGGGTGTGATACATAGGCATAGATCAATAAGTGTGAAAGTGGGACCACGTGGTTTGGATTTGTAGTGTTGTGGTGTGATGAGTGTAAGGTAAGCGTGGATAACATTTTTTTTCTTTTTTTTAAATACAACAATTGGGAGGGATAGGAGTCGAACATGAAGAAGGAAGGTTATACCAATTATCGTTAAGCTCAGTTTACTTTAATTTTGCTGTCAAATTATCATCGAGCTAAATTAACGTGAGTTAAAAACATGGTAGACCAAGTTCTGTTATCAGGTTATGGTTTGCGCTCAAGTATTATAAGTACACACTTCTCAACTGCTTGATTTTTGTTAAGTGAACGTGAGTAGTTTTCTTATTTATTTATTTATTTTAAAAAACCTATTATTTCATATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACTCCTATTTCACTTTCTTTTGTCCCAAAATTTTTAGATAATTTGTAATTTTTCTTTTTAAAAACTTTACCCTCTCTAATTTTTAATTTTTACTCTCTTCTAATTTTGTTTCTCTTCAAAGGTTTTCTAATGTTTGCCACTAATTTTATTCTATTTTTTAAAAGTATCAATTTTCTCACCTTTTCTATTTTGGTTGTTAACTTTTTATTATTTTATTTTGAACTCTTTCTCGAATGTTTTACTTTTGTAATTTTTTTTGTTTCTCACCTTTTATATTCTCCATAAACTTTTGTCATTTCTCTCCAATTTTGTATATCTCTATAACTTTATTAATCTATCGTTGAATTTCCGATGTCTCTAAATTTTTCCTCTGGCTCCAACAATGTTTCTGTTGGATTATTAGGATCCATCGGTTCAGGCCTATAACGCCTCCTGTACAAAGAGTGCTTATAATTAAGTTGTTTATCAGCCGAGACTTCGAGTTCTTCTGATGGAGCGCTATCTTGGTGGTCTTTACTAATCCCTAACAAAGTAAAGTTGATGGTTTGGAAAATGTTAGAAAACATTCTACCTTCCAAATTCATTTTAAGCAGGAGGCATATCATGTGTGAGCCCTGGTGGTGTGTGATGAAGAGACCATGGAGCATATAATATTGTATGGCTGCGGTTGGGGTTGGTGGCTCTGTCGGTCTTCAATAATTCTGTGATGCCTGGTTCTTGCATCCAGGAGGTGTGTAACTTTGCAGTAGCCAAGCTTTCTAGAATGGAGTTGGGAATTTTATGTGTGGGTTGTTGTTTGTCTCTATGGACTGATTGGAATCATGTTAATCAGGGTTGCCCCCCGATTTGCAACCTGCAGTCACCAGCTAATTGGACTATATTCCAGACTTCCAAACTCGGCAATAATATTACTAAACTACCATTTCAAATTTCAATGAATCAGCAGATCAATAAACATCAAAATAAAATACTAAAATACATACAAAACCCACCAACAGAAAAAACGAAATAAAAGGTCAAAAACCCAATCAATTTATTTTTACCAATATTTGTTTGGTTGTTTTTCTAGGTTTTTGCCTTTGCTTCTTGAACCATCTCCTGATTTGGTTTTAAAATTTATCATATTTTAGGGTTTAATTTTTGCAAAGAGTAAGATCTTAGGTTGGCCATAAACGGTAATAATGCCTCTGTCAGTGTGAGAAACTTGAATGGAAGTGGAGAAGACGAAGGAATTTAGAAGGGAGAAGAAGAAAATGGTGAAATTCGATGATCCATGATGATTTCTTTCTTAAACCTTTTTGGCTATGAAATCCCCGTACATAGGACCCACTACTGATATGATCATAACCCTATAAAAAGAAAAAAAAAACAATAAAAATGGCTTTTATTGAATGACCCTTACCCATGAACCCTATTCATTGCCCCGATAAATGATTACGCGTGAGGATAAAAATTTTAAAAATGTTCAAAACATCATCAGCTCTGTGTTTGTTGATTACAAATTTTTTTTAGTAAATTACAATTTTTTTTAGTGAATCTGATTACCCAACACAACTAAACAATATAATAAAATAGGGTCACTTTTTAATCATTAATTTATTACGGGATCACTTTTTAAATTATCATTAATTTATTACGTTTCATCTCAAATAAACATGGTGTTAGAGTAGAGTAAAATTTGAGCAATCTTGTTTCTTGAATTTTAAAATGTCATGAAATTATTGTAAAAAAAATTATAATATGAGATGGCAGGTAAAAATATGTATTAATTAGTTTAGATTTCACTCTTCGGCCTACCCCTACAACATCAGCCACCATAGTTGTGCTATAATTTATGTATTATGTGTGTTACCTTATATATTGTGCTATAATTTATACAATTAGAATCTTCATCATGCTTTCCTAATTTATATATATATATTTTTTTTTCTTATAATCTCTTTTGTATGCACACTTGTATTCATGTTTGTAAACATAATAATTACGTCAATAATATACAGAAATTTACACGGTATCATATCCATTTTAAGGTTTTCTAGTTATTTCCAGAAGTCGCCTACCACCTCTCCCACCTTCACGCCGGCCACAGCCAAATCTCGCCGTTGA

mRNA sequence

ATGGCCTTTCATTCTGATGTCAGTGTTCACTTTCGATTGACATTTCGACACGATAGTGAGAATATCGACCGAAGCGGTTTCCATTTCTTGTGTGGAAGACAGAGCGGGGTGTCTTTTAAAGAAGATATTGTTGTTTTTGAACTTGTATCCATTAGTCGATACATTGTTGCAGGTGGAATGATGAACCTTGGCCCAAGTGAAAAAGTGTGCAGTTCGCTTGGTATACGTGGAAGGAAAAACGCAAACTACTTTCTTACTCGGTTCCTTTGGATCCATCGGTTCAGGCCTATAACGCCTCCTGTACAAAGAGTGCTTATAATTAAGTTGTTTATCAGCCGAGACTTCGAAGACCATGGAGCATATAATATTGTATGGCTGCGGTTGGGGTTGGTGGCTCTGTCGGTCTTCAATAATTCTGTGATGCCTGGTTCTTGCATCCAGGAGAAGTCGCCTACCACCTCTCCCACCTTCACGCCGGCCACAGCCAAATCTCGCCGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCTTTCATTCTGATGTCAGTGTTCACTTTCGATTGACATTTCGACACGATAGTGAGAATATCGACCGAAGCGGTTTCCATTTCTTGTGTGGAAGACAGAGCGGGGTGTCTTTTAAAGAAGATATTGTTGTTTTTGAACTTGTATCCATTAGTCGATACATTGTTGCAGGTGGAATGATGAACCTTGGCCCAAGTGAAAAAGTGTGCAGTTCGCTTGGTATACGTGGAAGGAAAAACGCAAACTACTTTCTTACTCGGTTCCTTTGGATCCATCGGTTCAGGCCTATAACGCCTCCTGTACAAAGAGTGCTTATAATTAAGTTGTTTATCAGCCGAGACTTCGAAGACCATGGAGCATATAATATTGTATGGCTGCGGTTGGGGTTGGTGGCTCTGTCGGTCTTCAATAATTCTGTGATGCCTGGTTCTTGCATCCAGGAGAAGTCGCCTACCACCTCTCCCACCTTCACGCCGGCCACAGCCAAATCTCGCCGTTGA

Protein sequence

MAFHSDVSVHFRLTFRHDSENIDRSGFHFLCGRQSGVSFKEDIVVFELVSISRYIVAGGMMNLGPSEKVCSSLGIRGRKNANYFLTRFLWIHRFRPITPPVQRVLIIKLFISRDFEDHGAYNIVWLRLGLVALSVFNNSVMPGSCIQEKSPTTSPTFTPATAKSRR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 147..166

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc11G09120.1Clc11G09120.1mRNA