Clc11G08550 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGAAATGAGTGTTAATAAACTAGATTCCCACGAGAGGAATAGCCAGAAAATTTGCCCAGGAAAGAACCAAACGACTACCGAACAAAAATAATTGAAACATTTCAATTTTTTAACCACCGCACTGCTGCGGTTGCGTCTGTCACCGCCTGTCTAAAACGGTACCATAAGTCACCGCCACAGCCCACCGCCATCCTTCTCCCCACCGAAGCTCTCTCCTCGATTCCCTTGGATCGAACATGCACCGCAATGATCTCAGCGGCTATTGATTCCCGTATTGTGTCTGATGAAGCGAAGTTCTTAAACCGCACCAGGCAAACTCCGTTTCGGAATTCCAAATTGCTGCTAGAAGGCGTGTGTGGTACTTCAATTAGGTGCCTTCTGTGTTTGTTCTTCTTGATTGTTGTGTTTCTGGGTTCTCGAAGGATTTTCTTGACGGAAGAAAACTTGCTCAATCTTCTGAGTTAACCTGCCCTGTAATTGCTTCGGAACCTCTTTCTCAGTGATAGGTTCCGAGGCAAAAGTTATTCTATCGGACGCTGGAATGGATGTAAATAGTTCGAAAGATATGGGTGGTGATGACATGTTGATTTCGGCAGCTATAGGTTCTGTTGAAGTTCCAGAAGCGTCCCCTGATTCACTAAAAAACACGCCATCTAACATTGCAAAATTGGAGGATGTGATCGAGCACTGCGAAGGTAGGCAGAAGTATCTTGCACAGACGAGGAGTCGTTCTGATGGCGGTGATGTCCGCTGGTATTTCTGTAAAGTACCTTTGCTTGGGAATGGTGAGTGCTTTTCATTTTCTTCGTCTTTAATGATACCTTTTCGAATGCGACCTTTGCGAAAGTGACGAGCAACATAATAGAAAACCGAGATGATAAAAATTGGGGCGAAGTTTTAAGTTTAGACTTAGAATCATATTTGAGGAAACTAAGAAATCTATTGTAGGAACAGGAAGAATTTAAAAAAATTTATCCAGATATCGATTCCCTTAAACTACATATACGTATATATTTTGTTTATCTTTTCTATTTGGAACACTTAAAGTTGCAGTTATTTCGATTCTTCTTATGAAGGCTTATTTCTATACTTGTCAACTCTGTGTTTCTCGTTAAACATAGGAGTTCGCTAGGAGATTTTGAATCAAAGGGCTTTCAAACCTTTTGATGACTTTCTGCTGCTTATGTTTCGACAGAGCTAGCTGCATCTGTTCCTAAGACTGAAATAGTTGGGAAGGGTGACTATTTTCGATTTGGGATGAGGGATTCTCTTGCAATAGAGGCATCTTTCTTGCAGGTGTATTTTTCAACCTCTTGCGTAGTCAGTAATGTTTATATGTTCACCCATATTTCATGAATTGCTTGTAGCGAACCATCTTGGAGTTGCCTTCTATTCTACAATGTCTTTAACTCATTATATTGATTGTCTACTCACCTGCTTGTGTATGGAATTCATTTTTGGATGCTATTGTAGTTTTAATTAAGTGAAGGGCGGAGAATTCCATGATGTAATCATATAACGAGTGTAATTAACTTATCAATACACCTTGCCCAAGTTCAAAGCACTATTTGAACTTGAAGTTGCCCATCGCCCCTTTGCCTCTTGTTCTCGTTATTGGTTTTTAATGCTGGATGCTTTTGAGTGGTCATGCCTGGTAAAATATAATCTTCAAGGGGGCCTCTTCCTCCAATTTTGATGGTTTCTTTGGATTTAATTGTATTTCATCCTGTTCACTGTGCAAAAGTATTTCGCTTTTGATGATTATGGTCTTACTACTTTAATTTCTAGTTGGAAACTTTATTGTAATGCACCTTTTGGTATTTGGGGAGTTTTTCTCCTCATTTCATTCTTCAACAAAACTGTTTCCTTTTCATACATACATACATACATACATACATACATACATACGGTATACATACATACATGCCCACACATACATATAAGATTGTTATGACAGAGATGGACGAGTTTCTATCTAAGGAGCTAAGGCAGCTTGTTTGTCCATAAGAATTGGATTTTTGCTTCAAATACTAGAGTTAATGGGTGTACTTTCTTTGGGGTTGCTTTATAAAGGGTGGCTGGTTTCTTGTTTGTTGTTTTTGGAAGTTTTCTGTGGTGGCGGTTTAATATTACCTGTTGGGCTCTGTTTCGTTCTCCTGTTGGAAGATTCTCGAGTGTTAGGAGAAGTTTTCTTTTCAAGATTCTTGGTATTGGTTCATCAATAGCTTCTTTCATCAGATTTTTAGTTTGTGGATCGTTCAAGAATTTTCAGTTTGCTCTTTGTTGGTCTTTTGTTGGGTTGGTGGTCATTTTTTTGGTTTTCTTTTGTAGTAGCTTTTGTTTTCTCAGCAGTCGAAGGAGTCTTGTAGGTCGAAGTTGTTCGAAAGTTTCTCTCTTTTTTGTTCTATTTGTTGATCATATCTTTTCTTTTTCTCTCCTCGTGAGAGTTTATATCTCCTCAACATTTAATCCTTTTCATATTTTTGCTTTGCGCTTATGTATCAATGAAGAATTTGAACAAAGGGAAAAATGCATTTCTCACAGTTTTAGATACCTTGAGATATTTCAATTTTGAACGGTATTATCAACAAGAAGAGATCTCCACATTTCTGTTTTGCCTTCCAAATTTTGGAATCTAGACTCGCAAAAGAGATAAGAAACAAAATGCGAGGAAGAGACTTGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGAGAGGAAGAAGAAGGACCGGGGAAGAAAGAGAGAGAAATGTCACATAAGCTTAAAAAATTAGTATGAATTTCCAACTGCCAATCATGTCAACAAATCTAGTCAGCAAGTTAATTGTCAAATCATCTTTTTGTCAGTTCACTAACAGTCTAAAAGACCTTTTAAAACCATTAAAGAGTGTTAATTTTTGAAACTTACAGACCAAATAAAAACCTATACTGGAACTTGGGGACTAAAAGTGCGTTACCTAAAATTCTAAAAAATGGACAATTTTTGTGGACCTTAGCATCAAGGAAACTGAATGCTGGAATGGTAAGATTCAGAAGACATCTTTTGGTTGCCAGCTATCTCCCAATCAGGTGTTATTTGTAAAAACCATGATGAAAAGAACCAATGCCATCTTTTATCGTTCCTTTGCCAACTCTTTTTGGAACTAGATTTTTCTGCACCGTTCCAATTTTTTTGGATGTCCTCAAAGGGACTGGACTTATTGTTGCAATTTTGGAATTAGATTTTTAGCAAGTTTAACTTGGTGCACCACTCTATTTCAGTTAAAGATATGGTGGGGCCTATTATGTTTGGACACGGATGGAAAGTGGAGAGCTGGAATGTTTTTGGAAACAGTATTTGGCATGCTGGAATCTTTTATGTATTTTTGGGATGCTTATTTTCCCCTACTGATGCTATCTTGTTGTTCTTTTATTTTCTTCGTTTGGGGTTCATATAATTAGAAATTACTCTTTTTATTTTATCAACGAAGAATCTTGTTTTCTTTATTGAAAAAAACAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAAAAGAACACTATTTGACTGGTTTGTAGGAGGAATTTTCGGATATTTGATGACATGTTGTACATAGAAAGGAGGGGTTCATTTTGATCTAGTCGTTATTGTCTCTTCAAGTTGGGTGTACTCTCTCAAATTCAGTTTGTAATTTCCCCATTCTATGCCTATTGGAGTATCTTTTTTATATGTTCGTTTGGCGTGGTCTTTTCAGTTGCAACATTCTTTTTATATATGTTTCTATGTGTGTGTTTTCTATCCTAACTATTTATTTATACATGATGGTTTGTTTTGTCTGCTTCTTTATTTGAAGGAAATGGAAAAAATGTTTAAATATCATTTACTGTTTTTGGATTTGAATGTAGAGAGAGGAAGAACTACTTTCTATCTGGTGGAAAGAGTATGCAGAATGTAGTGAAGGGCCAAAAGAAAGGCCTGGCTCTAGTGTGAGGCTTGATAAACAAAGAAATGAATCTGCTTCAGAGGTTTCTAAATTAGTCAAGTTGTATGACATTGAAGAAGAGCGAGTTGGTGTCCCTGTCAAAGGAGGACTCTATGAGGTCAATTTGATGTAATCTATAATTTAAAGAATTTTCTCCTTGTTTTATACTAGCACCTTCTTTTTATTCTTTCCAGTTTGTTGCTAAATGTTACAAGTTTGAGCAGTAAGAAAATTAAATAGTTTCTGTGACATGAAAACCATTTATTGTTTCTCAAAAAAGTGCATTTTTTCTCGTGGAATGTATCTTACCGAGAAAAGATTTGTTTAAATGTCAAAGGTTGGAAGATGTAAATTATGTTATTTATTCCGTCAAAAGGGGAGAATTAACATGAACCTGAGTTCCTAAATGTCAACTTTTCATAACCAATTGAAATATCAGTATCACTAATTAATGTTTGCCTTCTGGATAGACTCATTCTGGAGATTCAAAAAGTGTGGTCCACTTTAAAGTTGCTTTCTGGATGGATTGGATCCTATACATTTAGATTGAATGGATTTAATTAATGTTTTTTTTTCTTCTATTGGAAACATGAACATTACAAAATTTAAATATCTTGTGAAATTATTCTTTTTTTTTTTCTTTCTTTGTTCAATATACAGATGCTTGCAACTGAAGTCATATTATATATGCAGGTAGATTTGGTGAAGAGACATTGTTTTCCTGTTTATTGGAATGCAGAAAATCGTCGGGTGATGAGAGGCCATTGGTTTGCTCGAAAAGGAGGGCTTGATTGGCTTCCACTTCGGGAGGATGTTGCCGAGCAGTTAGAAATTGCCTATCGTAGTCGGGTTCGTTTTTGTTTCTCGAATAGATCATTTTCTTGTATTTTTATCCAATCTCTCAATTGTTTGAAAATTTTGTTTGCAAAGCATCTCGAAGTCTTCATGATGAAGAAAATGTTTCCATGTGACAATGTTTTCAGTTATTGCTGTGTAGTTTCTAGTTTATCTTCATTTATAAACTTTCAATTTTTTAAAATATCTCAATGAT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MDVNSSKDMGGDDMLISAAIGSVEVPEASPDSLKNTPSNIAKLEDVIEHCEGRQKYLAQTRSRSDGGDVRWYFCKVPLLGNELAASVPKTEIVGKGDYFRFGMRDSLAIEASFLQREEELLSIWWKEYAECSEGPKERPGSSVRLDKQRNESASEVSKLVKLYDIEEERVGVPVKGGLYEVDLVKRHCFPVYWNAENRRVMRGHWFARKGGLDWLPLREDVAEQLEIAYRSRVWHRRTFQPSGLFASRVDLQGFTPGLHALFTGEDDTWEAWLNVDASGFSSVISLGRNGIKLRRGYSPSNSPKPTQDDLRQQREEEMDDYCSQVPVRHLVFMVHGIGQRLEKSNLVDDVGNFRHITSSLGERHLTLHQRSTQRVLFIPCQWRKGLKLSGEAAVEKITLDGVKGLRVMLGATAHDVLYYMSPIYCQDIINSESTFVGGRKVINSCLISNELILMSGIGKINGVSINLSLEMTFGLHDTVLETGKDRFASHQREGVHVSNQLNRLYMKFLRRNPGYDGKVSIYGHSLGSVLSYDILCHQENLSTDWMHGEHARSEGFSGVDSQSSVQNSSFDTEDNCSTAVYRCSDFVHLAKEDDERNMHQMHLHLEDPSVVVDPVASHSSELITKHENPCGVADYDSSERLPRTSDELEELNKNICNLEVPSVNRIGELQFENSKDKDGVIKTLKEEVDYLKKKLAELELMSANRDTDGGLNEGMPKEPMLEEVPPEQDDGSKSFTPSIKYKKLAFKVDTFFAVGSPLGVFLALRNIRIGIGKGQEYWDEENINEEMPACRQMFNIFHPFDPVAYRVEPLVCKEYMLKRPVIIPFHRGGRRLHIGFREFADNLALRSQAMKDNLHTFGVKVLTVCQSRKADGLEGTENFQEGELKSYGVAMMERLTGGEGGRIDHMLQLVDLQDKTFEHPYLQALKSHTNYWRDHDTALFILKHLYRDIPEDPNTPPEYAEPSSKDCWYNQKETIEEEISLTFSDEAVVRNFSRKAKKMMKNRR Homology
BLAST of Clc11G08550 vs. NCBI nr
Match: XP_038884944.1 (phospholipase SGR2 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1729.5 bits (4478), Expect = 0.0e+00 Identity = 878/1016 (86.42%), Postives = 900/1016 (88.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. NCBI nr
Match: XP_008441170.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: phospholipase SGR2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1714.5 bits (4439), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/1017 (85.45%), Postives = 901/1017 (88.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. NCBI nr
Match: XP_004138828.1 (phospholipase SGR2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8652238.1 hypothetical protein Csa_022144 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1701.4 bits (4405), Expect = 0.0e+00 Identity = 864/1017 (84.96%), Postives = 895/1017 (88.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. NCBI nr
Match: XP_023549738.1 (phospholipase SGR2-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1700.3 bits (4402), Expect = 0.0e+00 Identity = 852/1010 (84.36%), Postives = 890/1010 (88.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. NCBI nr
Match: XP_023549737.1 (phospholipase SGR2-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1693.3 bits (4384), Expect = 0.0e+00 Identity = 852/1017 (83.78%), Postives = 890/1017 (87.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W5R2 (Phospholipase SGR2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SGR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1070.1 bits (2766), Expect = 1.5e-311 Identity = 583/1014 (57.50%), Postives = 705/1014 (69.53%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NZC7 (SEC23-interacting protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sec23ip PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 1.8e-49 Identity = 226/853 (26.49%), Postives = 345/853 (40.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80Y98 (Phospholipase DDHD2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ddhd2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 9.8e-48 Identity = 213/815 (26.13%), Postives = 322/815 (39.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y6Y8 (SEC23-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC23IP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 2.4e-46 Identity = 211/863 (24.45%), Postives = 341/863 (39.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94830 (Phospholipase DDHD2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDHD2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 2.0e-45 Identity = 201/824 (24.39%), Postives = 320/824 (38.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B2C6 (LOW QUALITY PROTEIN: phospholipase SGR2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485387 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1714.5 bits (4439), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/1017 (85.45%), Postives = 901/1017 (88.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FF94 (phospholipase SGR2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444941 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1690.2 bits (4376), Expect = 0.0e+00 Identity = 851/1017 (83.68%), Postives = 887/1017 (87.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JYF1 (phospholipase SGR2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489011 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1687.9 bits (4370), Expect = 0.0e+00 Identity = 850/1017 (83.58%), Postives = 889/1017 (87.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DDX7 (phospholipase SGR2 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020169 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1625.9 bits (4209), Expect = 0.0e+00 Identity = 817/1009 (80.97%), Postives = 868/1009 (86.03%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DG04 (phospholipase SGR2 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020169 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1619.0 bits (4191), Expect = 0.0e+00 Identity = 817/1016 (80.41%), Postives = 868/1016 (85.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G08550 vs. TAIR 10
Match: AT1G31480.1 (shoot gravitropism 2 (SGR2) ) HSP 1 Score: 1070.1 bits (2766), Expect = 1.1e-312 Identity = 583/1014 (57.50%), Postives = 705/1014 (69.53%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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