Clc11G05575 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATAACTCTCAAAAGATGAGCTACCACGCTGGAGAAGCCAAGGGTCAAGCTCAGGTTCACACCTACCCATCATCATTTATTGATTGCATGTTTAATTATTGTATTTTTAATATACATTATGGTAATTGAATATAAAATGAATTTGGTAATAATTGCCAAATATAATAATTTAATTCCCAATATTTGTGTTATCTTTTAATGCCATTTTTTATTCTTTTATTTCATGGATTTTATATTGCTTTATTGGTTGTCATCAGAAAATGCCTTATATTTAGTTTATGTTGGTGTGATTATAAAAGGGTGATAGAGTAACATGTTAATTAGTTTGTCTTTATTTAGGAGAAGGTGAGCAATATGATGGACAAGGCAAGTGATGTAGCCCAATCAGCTAAGGAATCCGTGCAAGAAGCAGGACAACAGGTGAAAGCTAAGGCACAAGGAGCTGCCGATGCTGTCAAAGATGCAATTAACAAATGAAAATACCATCCATTTACTCTTTTCTTTTAAAATTTTTCAAGAACTCTCGTCAATTTTGTTCTTGCTTAGACATTTTTCCCCTTTTTTAACTAAATAAAGCCAAGCATTATGTAAGAGACTTAGCCTTGACAAAAAGGTCTCATATTGTATGGCTCATGAGCCTTTTCAACCAATAAGAATCATGACTAGTTGACAATTGACATGGCCAAAACCTAGTTTGTTTTCCTCGTCTGATTAAATATTATAATTATGCCACAAAACATATGATTAAAATTAAATAGGAAAAAAATAGAATAATTGTTTTGAATAGTGAATACGGGTAGAAATATTTTTAAATATAGTAAAATATCATTTGCTATTCGTGACACTAATAGACTATACTATCATCTATCACTGTTTAACAATAATAAACATTATATCACATTTTGTTATATTTGTAAATAAATTGACTCATTTTAGTCGGAAAAAAATATCAATTTATACCTTCAGATTTTGAATTTTTTTTTATAATATATTTTTAAAAAATATTTAAAATATGAGGTTGTTTTGAACCTTATTATTAAAATATTGTAGTTTTATTCATCCTCTCTATAAGAGATGATTCAATCCATGATAACCATTTACCTAGGATTTAATATCCTACGAATTTTCTTGACATACAAATATTGTAGGGTCAGATTGATTGACTTGAGATTAGTCGATGTGCGTGTAAGTTAGTTGGAACGTATATCTTTTTACTTATCCTCGTCATGATTAAATTTATTAAAAAAATTGGAACAAAACACGAGATGTAGAATAATATCAAATCGAGAGTTCGGGTAAAATTGGTTTCCATACATACTTATTAATTAGAGGCTCCCCTAAACGTGCACCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTTTTTTTAATACCTAAATTAAAGAAAAACATCAATATATACCTTTTATCAATTAAATCCATTTATGTTTCGTTTTTACCATCAATATATAACTTTGAAAATTATATCAATTTTTACCATCAATTATGTTTCGTTTGAATCAACATTATGTAAGACATATAATTTTATCAATTAAATCCATAAACTTCGAGAAAATCAATTTAGACTTTTTTTTGAACTTTTGTTTTAACCTAAATCAATTTTCCATTATAATTTCTACTAATTTTTCTTTCAAATATACCTAAGACTGCGATAGACTACCACAAATAAACTGTGATATTTTGCTATTAATTATAAATACTTTTAACAATTTTACCATTTGAAATAATTGTCCTTAATAAAATGTTAGATATGCATTTCTATGTCTATAGATAATTTTGGAATAGTGACAGCATGCATATTATTTTATTAAAGTCACTTGCGCTCGAGTATACCTCTAAATAATATAACGTGCCTTTTATCCTTTCCTTTTTTTTTGTTTTTGAAAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAATATTTAGAATTAGTCATATTATAATTTTTGTGAAGAATAAATTATTAAATCGGTTCTTAAAAAAAAAATTATCTTAAATGACAAAATTATTGAAAATATTTATAATTAATAACAAAATACGTAGTCTACTTGTGATAGACCGAGATAGATTACTATAGACTACTATTTGTGTCTAGTCTATCGCGATCTATACAGATCTATCACAGACTATCATAGATAAACAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTAGTTTCTTTTCTTATATTTGAAAATAATTTTAAAAAATAAAATTAAAAAATTAAAAATTTAACCATTATAATATTAAATAAAACTTATAAAGCATCTTGATATATTCATTATAGAAATTTTAATATCGGTGGGATTTTTTTTTTTTATATAAATAAAGAGAATTAATTTTTGCAAAGAATAAAAAGTTAATGTGATTGTTATTTTCTAAATTAAATCTACTAAAAACCTTCTAATATTACTTTGTCGACACGTTACTCTAGCATGCACCACATTCTAACATTTTATCATTGGATAATATTTGATTGCATTTTTCTTGAATTTTTTTTTTAAATAATCTTTTTTAAAAAAGAAAAAATTTTGTTACATGACAATGTGTTATTGAGCCGACTAGATGCACCCAACTATTTATTTTTCTCACTCCCACCCTATAAATCTAACTTTGCTTCCTTTTCTATCCAACTAAGATGTTTATTGTTCTTCTTCTAGTTGTCATTGCTAAAATAATAATGATAATAATAATAAATAGTTTAAGATCTTTTAAACTTGTTTTTAAAAATTTAGAGACTAGAAAAAACGTTTTAAGAATTTAGGGACGAACCGCATCTATACTAAAAACTTTTAAGAATCAAAAGGTATGTTTTGAAAACTTAGATCAAACGACCCTATTTTTCAAAAGAAAAGATAATAACATAATTTAAAGATTAAGCAAATTTAAATTGAATTTGAAGTGGGAGATTTGAACATTTGGCTTTTTAGTCAAAGACATATACTTTAACCAATTGAACTATGTTCGCACACAAAAATTAGCTCAACATAGGATTATGCCTATGTTTTAACTATTATGATTTGCTTTGGTTGTCAAATAAAAAACATAATCTAAATTTATGAACTTTTATTTCAATTAATTAAGGTGTTAGATAAAATTTATAAATAGAATTCAAGTTCTCGATAAGGGATCCCTTACTCTAGCTCGGGATGTACTGGAAAAAAGTACTCAATTATGTAATGATAAAACTAAAAAATACTATTTACCAAAAACATATGATCCGTTGTTGAGCGGACCTTACCGCAGACGAATCCATTTTGTTTTTTCATTCTCAATGCTAAATGAAATTTCTCGAAAAAAATGATAGTGAGAACGTTTGGACAAATAAGATTCATGCTATCTTTCTTAATACTAATTACCTACAAATTGAAGATAAAATTGAGTCAGAAGATCGAATAAAATCTTTAAACTTTTTATTCGATGCAGTTATAACTCCTTACAACGCTAAAGCAAGTCGTCAAAACTCGATTGGAATAAGAGAAATCAGTAAAAAAGTTCCTCGATGGTCATCCAAATTAAAAGACGAGTTAGAACAAATGGAAGGAGAAAACGAAGAAAGTATGGCAGAAGATCATGAAATTCGTTCAAGAAAAGCCAAACGTGTTGTAATTTTTATTGATAATAGAGAAACTAGCGATACTTATACTAATACCAAACATACTAATAATCCTGCTCAAACAGACGAAGTTGCTTTGTTAAATTTAAATACTAATTTGTAGTTTAAAGGTTTTTTTGCTAAGAGGAAAAAAGGAGGCTCATGCATTACTAATATGCTTTTTGGTTAAAATACAAATTTAGCTCCTAAATTTTTAAGGATTTATTTATTTTGTCAACTTTAAAAAGTGTTTATATTCTAATAATTTCTTCAACTCTTAGATTTGTGTCTATTTGGACATTGAATTTTAAAAATTTTCTGATAAATTTTTCATCTTTTAACTTTATGTTTAGCAAATTTTTTTCATTTTCAATTTCGAGTTGGCATTTAACATATTCAACGTTTTCTTTTTTTGAATGCATGGACATACAATCACAAAGTTGAAAGTTTATGGGCCTATTAATTGAAAGTTATTAAACAAAATTTAAAACTTATAGGCCAAATAGACATAAACTTGTAATGTAACCATACGATGTCAATCCATTTATAACTTCTAAGTTTTACATCAACTAGTCGTTGATTATGATGTTCATACATTTCTTTTAAAAGAATGTCGCAATCTCTATTACATTGTTAATCGTTAATCATTATATAATGTTGTTTTAATACATTTATCATTATATATTGTTGTTTTAATACATTTATCCCAAGTGACCTTATTTTAATTAAATTTGACATGAAAGAAAAGGAAACCAATGACATGGAATTTGATTTGATCTCTAAAGTTTTTAAATAAGAGATTAGCGAAGATGACGTGGGAGATTACTTATATGCCACGTGGGTTTTTTATGAAAGAACGTGTTGCTTCGGATAAAGTTTTATTTATTTATTTATTTTATTTAAATCATTATTATTATTTCCATAATGTAGATGTAGCTAACATCTATGTTTACTAGATGTGTGTTTCTTTGAAGAACAAGAAAACCAAACAATTACATAGATGAAGAGACAAAATTTGGCTCTATTAAAAGACGTAACGCAATTAGAAAGAAATTTCCCACCACACATACAAATGAGACCCATCCTTTACTAAATGTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTCAACATTTAATTTTTATGGGCTTCCAAACAAAATTTAATGCAATGGTGACGTGGCAGGAGACAACAAAATTTAAGGAATCACCAAACACAAAATAAATTAAAAGCCTTTCTTAGCAATTTTTTAATAATGAACTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTACAAATTTAGGGCAGTTTTCTAAATAATAATTAAAATAATGTTAAATAAATAAGAAATGAAAAAAATGGAGAGGAAAAGCCAACTATTGACAAATTTGGTGTACCCAAATCGCATACGTGGTAC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Match: KAF7822332.1 (stress-induced protein KIN2-like [Senna tora]) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 7.4e-25 Identity = 70/99 (70.71%), Postives = 88/99 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. NCBI nr
Match: RXH68262.1 (hypothetical protein DVH24_028409 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 9.9e-22 Identity = 72/120 (60.00%), Postives = 88/120 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. NCBI nr
Match: XP_022159706.1 (stress-induced protein KIN2-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 5.6e-17 Identity = 57/65 (87.69%), Postives = 59/65 (90.77%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. NCBI nr
Match: XP_038891080.1 (late embryogenesis abundant protein 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 1.3e-16 Identity = 54/59 (91.53%), Postives = 55/59 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. NCBI nr
Match: XP_011011268.1 (PREDICTED: late embryogenesis abundant protein 1-like [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 1.3e-16 Identity = 60/98 (61.22%), Postives = 70/98 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49817 (Late embryogenesis abundant protein 2 OS=Cicer arietinum OX=3827 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 2.7e-06 Identity = 39/95 (41.05%), Postives = 50/95 (52.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96270 (Late embryogenesis abundant protein 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LEA7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 3.6e-06 Identity = 42/109 (38.53%), Postives = 56/109 (51.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49816 (Late embryogenesis abundant protein 1 OS=Cicer arietinum OX=3827 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 51.2 bits (121), Expect = 7.9e-06 Identity = 38/95 (40.00%), Postives = 49/95 (51.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P13934 (Late embryogenesis abundant protein 76 OS=Brassica napus OX=3708 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 3.9e-05 Identity = 36/94 (38.30%), Postives = 49/94 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LW12 (Late embryogenesis abundant protein 29 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LEA29 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 3.3e-04 Identity = 40/116 (34.48%), Postives = 54/116 (46.55%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498HEG5 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_028409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 4.8e-22 Identity = 72/120 (60.00%), Postives = 88/120 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4Q8 (stress-induced protein KIN2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111026049 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 2.7e-17 Identity = 57/65 (87.69%), Postives = 59/65 (90.77%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4S0 (stress-induced protein KIN2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111026055 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 1.8e-16 Identity = 55/65 (84.62%), Postives = 58/65 (89.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9IMZ1 (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS53617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 2.3e-16 Identity = 73/164 (44.51%), Postives = 81/164 (49.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TJP0 (Stress-induced protein KIN2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1167G00300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 3.9e-16 Identity = 54/65 (83.08%), Postives = 58/65 (89.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. TAIR 10
Match: AT5G53820.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 6.9e-13 Identity = 40/65 (61.54%), Postives = 52/65 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. TAIR 10
Match: AT5G38760.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 1.5e-12 Identity = 40/64 (62.50%), Postives = 51/64 (79.69%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. TAIR 10
Match: AT3G02480.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.9e-11 Identity = 38/67 (56.72%), Postives = 47/67 (70.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. TAIR 10
Match: AT1G52690.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 2.5e-07 Identity = 42/109 (38.53%), Postives = 56/109 (51.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G05575 vs. TAIR 10
Match: AT1G52690.2 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 2.5e-07 Identity = 42/109 (38.53%), Postives = 56/109 (51.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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