Clc11G00240 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAGAAGGGAGAAGGGAGGAGGAGGAAGGAGGAATGGGGGAATCGGAAGAGAGAAGGCGAATGCAGACCTCTGAAGGAGAAGCGTCGGGGGTGGTGGCAAGTGAAAAATTAATTATGGAAAGAGAGAATGCGAAAAGTCGAGGCGTACGACACGGGAAAATCAGCCGGTAGATCGATTGATAAAATTGGTGGGTTTAAAAACCACCATTTTTAATTACCCCTTTAACAAACGTGGGTAGTTATTACCCACCCAACTCAACCCACTCTAAACCCCAAAACAAACACCCCCTTAGTATAACTACTAGAAAAGTTATTTTAAATAACAAAATTGTTAAAAATATTTATAAATGATAGTAAAATCACAGTCTATTTGTAATAAACTGCGATAGATCGCAATAGACTACTATTTGTGTCTATTATGATACAAATAGATACAAATAATAGTCTAGACAGTAAAATTTTATTATATTTTGTAAATATTCTGGTTCATTTTTATATATTTGAAATCGTCCTAATTATTAAGGCATGGGTCTGAATCTCATATCTCAAAGAGGTAATACAAGCCAATTATAATTAATATTTCTTTACTTCAAATCCAATATTTGATGTGTGATATTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTCATACTTTGGTTATATATATATTTCAAAATATATATTTTAAACCATTCATATTCTAACCAAAGAAAGATAAAAATTCTAGTAACTCATTTGTTTGTACCATTTAAAATAATACATATTTCAAAACCTACCAAATCATTAGTAGTTCATCCAAAAAACCATTATTTAGTTTTTTAAGATTAAATTTATAAATATTAGTTATGTTTTGTTATCTAAATTTTAAGGAATATTTTCAAAATTTAAAGTGAAATTTTTAAAAATGAAAAAAATAGTTTTAAGATAGTATGACCTCAAAAAACAATTTGTTGGTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTGGATTTGATGATGATTTGATGATGAATATAATTAAATGATTAATTGAGAAATATAAAAACTAGAGTAAAGAAATTGCGAGGACGTCTCTAAAAAAAATCGACAAGTTTAATCAATTTGATTAAAAGAAAACTAAAGATAAGATGGGGTGAAAAGTGAGTACAACCAATAAAATGGTCTCTCCAAAAGAGGACAAAAGAAAAAGATGAAGTAGGGACATAGAATGGGTTTACGAAAATGAAACTCCTTCCAATGGCCTTTATAAGACCTTTGTGGAAATAAAATTTAATCTAACTAGAAAGTTTGTTCTAAGATAGCTCAATAGTAAAGGAGGAGAAGCAAGAAATGGAGGGTGAAAAAGAAGTAGGAAATGCAAGATACACAATTATAATAAGTGGAGTGAGCAAAGGGTTGGGAAGAGCTTTAGCATTGGAGTTTGCAAAGCTTGGGCATATCATTGTTGGTTGTTCTCGCAACCAAACCAAATTGGATTCACTGCAGGATGAGCTTTCTATCATTTCTTCACTTAATCATTTGCTCCTCAATCTTGATGTGGTATGTAATTCCTCGTTATTCCCATGTCTCAAATTTAAATCGTTTAGATCTTATTTGGTAACTATTTGGTTTTTATAAGTTTTTAGTTTTTGAAAATTGTATTTGTTTTTCTCATGATTTCTTACTCGTGGTTTTCATAAGGAAATATTTGAATTCTTAGTCAATTTCCAAAGATAAGAAAAAGTTTTTAAAAACTACTTGTTTAAATGACAAAAATACCTTTTTGGTGAACATGTGCATTCTTTGATGTTTCAAATTTGTCATTTTAGTTCTCATGTTGAAAGATCTCAATACTAATGGAACTATTAAATTTAAATAAAAAAAAATCATAGATGTGCTGATACAACAAATTATTTTTTAATCGCTTGTAAAAAAACATTTTGAGTTGAGGGTCTTTTTATGTCCAATTGAATACTAGATAAAGGAGATGGACGAGAGAACAAATGAAAGAAGAGAACGAGAGCACAAAGAGAAGAGAACGAGAGGGAGGAAAGAGAGCATTAGGGAGAACAAGAGATGAGGGAGAAAGAGTTAAAACATAATAAAATAAATATTTTTTAGGGCAATGATTAGGTTAAGCCTTCACTACACCTATCTCTCTACATCCCCTTCATTTATCATATGATAAGAAAATACTAATTTAATTTTTTTAATTTTTAATTGGACAACTAGTAGGTCCGTAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTAATATAAATCTAGTAGTTCTTTTAGAAGGAGAGACCTTCCAAACCTATTCTTAAAAACTCAAAGACGATAAAGATATAATTTTTTTCTTTTTTAATCTCAAAATTTGGTTTAGATTTTGAAAACATTCCTAAAATATATGGAAGAAAACATAAAAACAACTAGATGAAAGTAATATTTATAGGCTTTTTAATTATCAAAAACAAAAAACTAAATATCATATTATTACGGGCTTAAATATAGATTTAGATACTACTTTAGCCTTTCTACTTTCAGTTTTGTTTCATTTTGGTCTTTGTATTTTTAAAATGTTTATTATAGTCCCTATACTTTCAACTTTAGTTTCTATACCTTTAAAAAATAATCATTTTAGTTTCTTTTAAAAGAAAATGAAATAAAAATAAAAATAAGAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAGGGACCAAGATATCAATATTTAGCCAATAAAATTTTTAATTACCCTTGAATATATTATTATTTTGTAGAGGTCAAATGATAGCGTTAAAGAGATGGCACAAATTGTGTCGCACAAAATGGGCTCTCCTCATATTATTGGTAATTAATGTCTGTTTTGATTTATAATTATCTTGTAATTATATGTTCTTTTTATCCCCTCAATTAATCAAGTAGTGACGTCATTTTATTTTATTTTATTTGGTATAGTTAATAATGCAGCCGTGATTAATGAAAACGTGAAGATGTGGGAGGGTTGTGTCAAGGAGTTTGATAATGTGATTGACACAAATATAAAAGGAACAGCAAATGTGCTACGTCATTTCATCCCTCTCATGATTTCTAACAATAATCAAGGCATTATTGTTAATATGTCTTCCATTTATGGAAGAACTGCAGGTCCTCTGGTATGTAAAACCTTTACTTTCCTCTATATGCATATATAAATTAAGAAGGTTCAAAATCAATTACAACTATGTAGGTTTTCTAATATTTTATTTAATTAAACAGATTGTTTTATGAGTTTTGAGAAATTGGCTTCAGAGTACAATGACAAACGTGTGACTGAAATTAAAAACCGTGTGATTGTAGATTTTCAATATCGGTCACCTTTAATATCAGACAAAACTCAAATATGAGAGTTGGTCATATAATCTTAGTAAGTGATCAAACCAGCAAGCTTAGTCTTCTACCTACTTATAAAAAACCCAAAATGGGTCACAAACAATAGGGTAGCCAGAAGTTGCACATTAGCCATATAAATCACTTTGGGATGACATAATAGAAATTTTAGGATAAAAAATTTCACCTCTAGCAAATAAATGATCCAAATTTGAAAATGAAAGTACATCTCAACCACCTTTTTGTCTGATAGGGAGATTCACCCACGAGGCTCACTAAATTTTGTTTATTGAGTAGATCTCACAATTCAACCATAGCTTCGATACCAATTGATAAGAATATCAAACCATCTACATAACTCTATCATGGTATAATATTGTCTATTTTGAACATATATAGACGCCCTTTATGGCTTTCCTTTTAGAATCATCTAAAAGGTCTCATGCCAAAATGTAGATAATTTACATTACTTCTATACCATGAATTTCTCATTTCCATAGCTAACGTAGAACTTTGTTTGTCCCTAACAATTGAAGACAATATACTAAAGTTCAACAAGTTTTCTATACAAACTACCTAGCCTATTGAAAACATTCGAAATTGTAGATAATGGTCCATAAAACTTTCTATATGAAACTGGGCTAAATTAAGAAAAAAAATACCTCTTTTACCATTATGAATTTGAATCCATCGGGATTTCAGCAACCAATCGTCGTACAATATTGCGGTATGATCAAAGTTTCACTTAGATAAGGAGAAAATCTATGGTATATTCAAAATAGACAATATGATACCATTGTAAAGATATATGTAGAGGGTCATTGTACCTAACATATATATGGCCTCTCACATCTTTAATTCTTAAAACATTTTTTCACAACTCCTTTCTTTCTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAGCTTAAAATTACCCCACTCAAAGATGCTAAATCCACACGAAACCTATATAACAATAACTCGCACCAAGATTTGGGAGAAAGGGAGAAAAAGAGCGATGGCAGCAGAAACCGCACACAAGTCTTAAGGTGCTCCTACGGCTTGCTCTTTTAGTCTGGTCTTGTCACTAGATCGAATCTACATGGAAGTACTTGCACTAGTGTAGTGTTGAGCCAAACATGATGCTTAAGTTAGTCAAGCAATATTTAGCCCAACTTAGAGAGTTAGAGTTTCTCCTTTAGAGTTACTTACCTTGAGGTTGTCAATATGGATCTACTCATAAGACCCTCCCTCCATCATCTACTTAGGTTACGTGTAAAGCTATTTGTGCCAAAATGGGTACAACTCTTGAGGTTGCAAGATGCCAGCGATAAACTCGGCTCAATTATTTATCTTGTGGTGAAACTTTACAAGCTAGACAGGTTGACGACCCAGATCCTAATGGTTTTACTTTCTCTTTTGGGATCGTGGATTCATAGACTATCCCTTATTTTTCTTTGGACTTGAGCCTACTCATGATCTTTAGACTTTGTCAAGGGCAACCCTTACAAGGAGGAAAGAGTAATAAATTTAAGCAATTCATTGCTTATGAGAAACTACTAATGGAACAAAGGTTTTGAGTAAAATATCTAATTTTGAAGACATCCACCTGAAAAATCTTTTGTGTTATATTGAAATGATTGTATTTTGTAGGTT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ATGAGAGAAGGGAGAAGGGAGGAGGAGGAAGGAGGAATGGGGGAATCGGAAGAGAGAAGGCGAATGCAGACCTCTGAAGGAGAAGCGTCGGGGGTGGTGGCAAGTGAAAAATTAATTATGGAAAGAGAGAATGCGAAAAGTCGAGGCGTACGACACGGGAAAATCAGCCGCTCAATAGTAAAGGAGGAGAAGCAAGAAATGGAGGGTGAAAAAGAAGTAGGAAATGCAAGATACACAATTATAATAAGTGGAGTGAGCAAAGGGTTGGGAAGAGCTTTAGCATTGGAGTTTGCAAAGCTTGGGCATATCATTGTTGGTTGTTCTCGCAACCAAACCAAATTGGATTCACTGCAGGATGAGCTTTCTATCATTTCTTCACTTAATCATTTGCTCCTCAATCTTGATGTGAGGTCAAATGATAGCGTTAAAGAGATGGCACAAATTGTGTCGCACAAAATGGGCTCTCCTCATATTATTGTTAATAATGCAGCCGTGATTAATGAAAACGTGAAGATGTGGGAGGGTTGTGTCAAGGAGTTTGATAATGTGATTGACACAAATATAAAAGGAACAGCAAATGTGCTACGTCATTTCATCCCTCTCATGATTTCTAACAATAATCAAGGCATTATTGTTAATATGTCTTCCATTTATGGAAGAACTGCAGGTCCTCTGGTTTCAGCATATAGTACCTCAAAATGGGCTGTTGAAGGATTAAGCAAATCATTAGCAAAAGAGGTACCAAATGGAATAACAGTTGTGGCATTGGACCCTGGCATTATAAATACAGAGATGCTTGCTTGTCATATCGGAGATCATTCAGCTTCTCAATATCAAACTCCTCAAGAATGGGCTACAAAGGCAGCTTCTATGATTCTCAACCTTTCAACTGCTGATAATGGTGCATCTCTCACTGTTGATGATCCTGGTATTCTAATTAGGGAAATTAGACCCACGATTTCAGTCTCCCTCACGCGCCCTCTTAATTTCTCGTTCACGGCTCCCACGCCGATTCGCGCCGCCGTAAGCTCTCTCCTCCATTTTCTCTCTCTAATCCGAGCCCTGCACATCACGAAGCCGCGTTTCCGATCACTGTCTCCGATCACGAACGCCGCCACCTTTGACCGCGACGCACGCCGCTCCTGCCGCCGAAGACTTTCTTCTCCATCGCCTAAATATTGTCTTACCCGTGATCTTATGAAGGGAGCTGTTGTCAGAGCAAGCGTTTTGATAATATTGGTTCCGGCTTGGCTCTTGGTGCGAGTAACGAGGAAGAAGCATTACAGGCCTCCGGGGAAGAAGAAGGAGGGTAATGCAGCAAGATATGTGACAAGGTCACAAGCCCTGAAGCACCTCCAACTTAGTTTGCCACTTTTTAGGAAGCTATGCATTTTCAAGGGAATTTTCCCTAGAGAGCCAAAGAAGAAAGTTAAAGGAAATCACCACACTTATTACCATGTGAAAGATGTTGCTTTTCTTCATCATGAACCACTGTTGGAGAAATTTAGAGAGATTAAGGCATATGATAGGAAGATACACAAAGCTGATGCAAAGAAGAATAAGGAGCGTGCAAACTTTCTAAAACATCATAGGCCTACTGATGAATCAGAAAGAATGCGAATATTAAAGGAGAGGTATCCAAAATTCATGGATGCACTAAGAGATTTGGACGATTGCCTCTCAATGGTGCACCTTTTTGCGGCATTACCTGCACAACAGAGGGTAAAGGTTGAGGCAGAGCACATTCATAATTGTCAGAGGTTGAGTTGTGAATGGCAAGCATTTATTTCTCGAACTCATAAATTACGAAAAGTTTTCATATCCATGAAAGGCATTTATTATCAGGCTGAGGTAGAAGGCCAAAAGATTACATGGCTTGCTCCTCATTCCTTTCGTCAGGTGATCGATGATGACTTAACCGTTATTCTTAACTTCACGGACTCTTATGAGAAACTTCTAGGTTCTGTGAACAATCACTTATATAAATCGATTAATTTGAACTATCCACCGATTTTGGACCCTCATTTGGAAGCTTTGGATGCAGATCTTTATGCTTTGTATAGATACTTCGATGCCGATACTAGGTCTTCCCAGTTAGATCTTCAGACTTCTGGTTCTTCTAGATCTAGGCAAATAGATGAGCCAGTTGCATTGATGCATCTTGTTGGAGATACAACTTTTAAGTATGATGACAAGGATGAGGATAACGATACTAGAGAGTGTAAGAAACTTTTTAAGAACATGAAGTTCTTTTTAAGTCGTGAGGTTTCTAGAGAATCACTGCTTTTCGTCATTCCTGCTTTTGGTGGCATTGTTTCTTGGGAAGGAGATGAGGCACCATTTAAGGAATCCGATGAAACCATTACTCATCAGATTGTTGATAGGCCAACACTGACTCACAAGTTCCTTTCTAGAGACTATGTTCAGCCACAATGGGTTTTCGATTGTGTGAATACACGAATCATCTTGCCAACTGATGCTTATTTGGTGGGAAGGGATCCTCCTCCACACTTGTCACCTTTTGTTGACAACGAGGCAGAAGGATACGCTCCTGATTATGCCGAGACCCTTAACCAGTTGAAGACTGCTGCCAAAATCAAAGTCCTGCCATTGCCAGGAGTAGGGAAAGAAAATCTGGATGATCCTCAGAATTTATTGGTTGAAGGTATAACTGAGGCTACTGTAGCTGCTGAGAAGAAAGAGAAGATGATGGCTCTTGAGAAACAGTATCATGATGAGTTAAAATTGGAGCTTCAAGGAGCACAATATCCTTCAGCTATTTCAAAACTTGATAAGCAATCATCGGACGAGGATTCTGACCTCCCTGATTATCAGCAAATTGCTGAAGATAATGCTAACCTGTCAATGGTTTTGATGTCACGAAAGAAGAGAGGCCTTTTTAAAGCTATACAGATTCATCAAAGAAGGAACAAGGATCGTAATAAACTTTTGGAGGATAGGAAGAGTGACAATGGATAG 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Homology
BLAST of Clc11G00240 vs. NCBI nr
Match: XP_022983630.1 (pescadillo homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 7.4e-255 Identity = 460/601 (76.54%), Postives = 512/601 (85.19%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. NCBI nr
Match: XP_022935270.1 (pescadillo homolog [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 4.1e-253 Identity = 459/601 (76.37%), Postives = 506/601 (84.19%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. NCBI nr
Match: KAG6581051.1 (Nuclear pore complex protein 210, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 6.9e-253 Identity = 461/603 (76.45%), Postives = 508/603 (84.25%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. NCBI nr
Match: XP_023528649.1 (pescadillo homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 884.0 bits (2283), Expect = 1.2e-252 Identity = 460/601 (76.54%), Postives = 505/601 (84.03%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. NCBI nr
Match: XP_022152145.1 (pescadillo homolog [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 8.5e-251 Identity = 459/598 (76.76%), Postives = 504/598 (84.28%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYK7 (Pescadillo homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PES PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 682.6 bits (1760), Expect = 6.8e-195 Identity = 351/586 (59.90%), Postives = 438/586 (74.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q851S7 (Pescadillo homolog OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PES PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 655.6 bits (1690), Expect = 9.0e-187 Identity = 338/601 (56.24%), Postives = 441/601 (73.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8JBB2 (Pescadillo homolog OS=Chlamydomonas reinhardtii OX=3055 GN=CHLREDRAFT_206018 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 1.2e-111 Identity = 247/609 (40.56%), Postives = 341/609 (55.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9EQ61 (Pescadillo homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pes1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 352.4 bits (903), Expect = 1.6e-95 Identity = 231/582 (39.69%), Postives = 334/582 (57.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3B8N8 (Pescadillo homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pes1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 352.4 bits (903), Expect = 1.6e-95 Identity = 230/591 (38.92%), Postives = 335/591 (56.68%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J6F1 (Pescadillo homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482185 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 3.6e-255 Identity = 460/601 (76.54%), Postives = 512/601 (85.19%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FA59 (Pescadillo homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442209 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 2.0e-253 Identity = 459/601 (76.37%), Postives = 506/601 (84.19%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DD37 (Pescadillo homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019934 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 877.9 bits (2267), Expect = 4.1e-251 Identity = 459/598 (76.76%), Postives = 504/598 (84.28%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2H7 (Pescadillo homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469308 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 9.1e-251 Identity = 452/598 (75.59%), Postives = 502/598 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HM21 (Pescadillo homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464816 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 876.3 bits (2263), Expect = 1.2e-250 Identity = 453/598 (75.75%), Postives = 501/598 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. TAIR 10
Match: AT5G14520.1 (pescadillo-related ) HSP 1 Score: 682.6 bits (1760), Expect = 4.9e-196 Identity = 351/586 (59.90%), Postives = 438/586 (74.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. TAIR 10
Match: AT1G10310.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 3.1e-73 Identity = 144/231 (62.34%), Postives = 176/231 (76.19%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. TAIR 10
Match: AT3G55310.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 5.0e-15 Identity = 61/192 (31.77%), Postives = 107/192 (55.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. TAIR 10
Match: AT3G55290.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.1e-14 Identity = 58/191 (30.37%), Postives = 101/191 (52.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G00240 vs. TAIR 10
Match: AT3G55290.2 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.1e-14 Identity = 58/191 (30.37%), Postives = 101/191 (52.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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