Clc10G07905 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACGTATTAATTTGTACTTTAGAGTGTTTGGTTGTTGGAGAAAATACAAGATGAAAAATCTGGATGAAAGTGTTTGAAATATTTTTTTTAATATAGTGATGAACCAAACAGAGAAGAAAGGAAATATCTTCATTTGTATTCTCGAAATGAAGCCCCCACCATAGATATGCTCCAAAAACACTTCACCTATAAATTCAAGCTTCTTTAACTATTTAATATTCAAATTTAATGTGTTAAGTTGTTAAGTATTATCTAAACAGGTTCTATCTTTTCTCTCTCTCTAAGAACTTTATTTTTCTTTTAATCAAATACAATTGGGAGAGGGAGATTTTGATAAGCACTTGAAAAGTGCTTTCTATTCTCTCAAATTAAGGGAGTTTATATTAGATTTCACTTGTTTGCTAGTGATTTTTAGGTTAAAACGAGGAAAATTAGAAGAAACGACTAAAAGATCAAAACCGAGCAAGAATACTTCTCCTAAGATCAAAACCGAGAAGAAACTCAAAAGAGCGAATTTTGGGACACCGCCGCGACGCTGAAACATGAACGCATCGTTCTAGATGCATAGTATCATCGCGGCACCAAGATGGCGCTGCCTCGACGCATCATTGTTGAACGCATGACAGTGTCACCGCGCTTGGACAGCGCTGCCGCGACACTAATGCCGGAGAACAATATTTCTTAAACGCATCAGAGCGTCGCGGCGCTTGGACGGCGCTGCCGCGGCGCCAGCTTTCTTTTAATGAAAATTTTGTATTTTTGGTAAATTTTTGGGCGGCCAAACTCTATAAATTTGGGGGTTTTCAGCAGCCCAAATCATCAAAAAGAAGATCAAGGAAAATCAAAGCAAAGCAAGGAAGTTACAGACCTAAAGAGGCACAAAAAGAAGAGAATTAAGTGAGAGTTCAGAGAGTGAGTTAGTTGCAAGGAAGAGTAAAAGAGTTCGAGATAGTCGGGGTGCCCTTTGAATTCCGACGTGAGAGCCAAGGAGATCGTGACGGTGCTACCTCAATCAAGAGCCTCTTTTCAGTAGAGTTTCCCTTTCTTTACATTCTTTCTTTGTTTATTTTGCTTAAACATGTTGCTTCAAGCTATGAGTGGCTAAACTCTTTAGTTTTAGGGTTTTGATGATTTGTTTATGAATTTATGTTGATTTTGTAGACTTTCATGGTTTTGTTGGAATGATTATGCTTTTCATTGTTATTGTGTTTAATTCTTGTGGATTGGCCATCCTCACATGTTAGGTTAGATGTATGATTGAGAGATTGTATATTTAACTTGATCTATAACAATGAATTGTTGTTAATCTATCACGAGAGTAGTTAGGTTGACAATAAAAGTTCCTAAAGACTATTTTTAATGCCATGTAATTTTGTATTGGTTTTAAGAGATTAATAATCAATCGAGTTGCATGAGAAATGGTTGTTTTTGAGAGAAAATAACTTGGAATTAAGTTTCTAGACTTAGGCATATGAATTACAATAAAATCCATGAAATCTATAATATTGCATGATGAAATAAACAAGGATTCATTACCCTAGAACTCTCTTTGACTCTTGTGTTTCTCACTTTAATACTTTCCTTATTTGATTTGTATTTTCCATAACTCATAACATTCAATTTCAATCCTCAAATAAAATTGATTCAACTCTAAAATAGCTAAGTAACTTAAACCTTCCCAATTGGATCTCCAGTGGAACGATATTCGAACTTAACCGTCTTATATTATAACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAACATTCAAAGTGCGCATCAGATTTCAATAGAGAATTAAATCTTTTATTGCCTTTTTAATTTTATTCTCTAGTTTTACTAGTAACCTAATAGAGGCAGAAATTTTTCTGATCATCATTAAAAGATTGTTAATTTGTATGTACATAGTCAAAAGAACAATGATGGAGTTATGATTAACAAAAAATATGACCTATTATGCTTACACTATAATAAAATATAGATTGAAATTTGAAGTTTGAATTGTAATTAGTCAGATTACAGAGTGAAAAAAGATTTTGTTAGATTCCATCACTAAAACAAAATATAGAAGGAATTGTGCATAAATCAAGTCATATGAGATGTTGGAAAATATTAATGAGATAGAATAATAGTATTTTAACAGAGCCTCAAATAATGTTCTCCAATTGAATTGTTGTCTTGAGAAGCTTTGTTGTGGGCATAGGATATAGAAATCTTCTCATGTGTTTTCATTCTGCTACATTTGATTTGGTTGCAAAATAATCCCGAGGTTGAGATTGAATCAAATGGTTAAGGATGTTCAATTCACACATTGTTTGAATCCATCTTGTTAGTTTCTTCTCCATTGTTACTCACTTGGTAAATTTGTTACTTCTTTATAAATTTCCCTTGTTTCCTTTGATTTTTGTCAATCTACACTTAAACCCTTTATAGCTTACATTCTTGAACATTAGTTTATAGCTTACATTCCATACGTGATTGTAAAAATATATGTAACATGTTTGTTGATTAAAATTTTCATCTTGTCCACATAGTATTTTGCTACTAGTATGAGAATATCGAGGAGAGCTGGAAAAATTGGCGAGTTTGTGTGCCTTTGTGAATGAGAAGCAAGTGAGTTTCTCTTCTGCTCTTGTTCCAATATGCTAAATGTGCCAACTACTCTAGGTTTGTTCTCATAAGTATAATATTAAGCACTTATCGATAACAGTATGTAGTGGTTTTTAGCATAAAGTTTTAATTTATACATGTATTGTTATAGTCACTTTAACCTATTAATTTGTTGAAGGAATTCAAGCAACATATTTCATTTTAAATGCCTTAAGCCTTGATAAAGTGTATTATACCCTATGTATCAATCATATTGTTTTGAAATTCGCTAGTATATAAAAATGTTTGATAATATTTATGCTGAAGAAGCTGAAAAAGATTGCATTGTTTGTAGTGGAAATGTGACTTTCCATGTATTCATGTTTACATGTAATCGAGATACTAGTTTTATGAGACCATGTTCCTACTTGACTAGGCCTATGATTTCCTTCTACATTTTAAATATCAATCCTATTTTCTGATATTTTTTTTATATTTGCAAATTCTTAACGGTAAAAGAGCAAAAGGGAAGCATTTTTCATTTTGTTTATGAACTCTTTTTTCCTTGATCATCTGATTTTTTTTTATTGAGTTTCCCACTTTTGTGTTTCCATTCATCCTCATCTTTATTGACTTAATTTCGCTGGTGTATGATTGTATTTCTATCCTCTTTGTTGGTAAATTTTGTTAGTTGTTTTAGGGCATGTTTCGAAGTGATTTTAAATTGACTAAAATCACTTTTGTCATTTTCAAAATCACCACTAAACATATTTTTAATATTTCAAACTTAATTTTGATGATATAAAAATTGCATAAAAGTGTAAAATTGAATAGCTAGGAAATAGAAACATGAAAATTAAAATACATGTCACTGGCCCAAATGGTTAAATTGAACCTTAGCTTACCAAAGTGTTCTAAGAATAATTAATTTAGAGCATATTCTCTGTGAAAGTTGATATTCACTTTTTTCAAATAGTGCTTGGTGACCAAGTCATTAATGATTGAACCAATCATCCAATTAAGGTTACCAATACCTTGAAAATGTTCAACAAAGATTGGGTGCATCTAAATCGGTATGAAAGTGACAACTGCTATTGGCTTTTGAGTTAATCTTTTGATGCATACTTAACAAAATTAACTTTGTCTAATAGTTCTAGTGATGAGTATATGGAAGGAGCATGGAGTTTTCTACAAGAGGTGAAGAAAAAGAAGTCAAATACTAGTAAAGTTTTATGTTCGTGTAAAGAATGTAGAAATATGAGACATTTTGATTTTCAAATCATATGTGAGCACTTGGTCATTAAGGGAATGGATCCTACATATAATATTTGGTATCATCATGGAGAAGTATGTGAGGAGGATAAAGTCGAGAATAAAGTTGATGATGATTTTATGTTTGAAGCAACTGACTTCTATAAAAGCACATATATAGGAGAAGAGGACAACATTGATCATTGTACATCAAGAAGGGAAAACAATTTTTCTCAAAATGTCCAAGAAGCAAATAGGCCATTATATGCAAGTTGTACAAACTATACAAAGATGTCTGCAGTTGTAGCATTGTTGAAAACTTTTAATGGTTGGTCAGATGCAAGCTTCACTAGCTTCTTAGGCTTTTGTATGACATGCTCCTGACGGATAATGTTATCTCAAGATCTATTTATGAAGTTAGAAAATTATTCAAGGAATTTGATTTAGGCTACCAAAAAATTCATGCATGTGTTAAGAATTGTTGCCTATTTAGAAATGAGAATGAAAAGTTAGAAAGTAGTCCTCATCGTGCAACTTCAAGATGGAAGATTGATGAACGAACAAATCAAATTAAACAAGGTGTGCCTGCCAAGGTATTGAGATATTTTCCCATCATTCCACAACTTAAGCGGATGCTCAAAATAAATGAAGTGAGTGAAAGTTTAAGTTGGCATTCTAACCATAAAAGTACTAATGGAATGATTCGACATCTAGTTGACTTTCTTGCATGGGAGACAATTGATAAAAAATGGCTTGAGTTTTCTATGGATTCGCGTAATCTTAGGTTAAGCCTTGCTATAGATGGGTTTAACTTGTTCTCCAATTTGAGTAGTCGATATAGTTGTTGGTGTAACACCCCTGTCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTACCTAGGAGAGAGTGTTAAAACTATTCTTCATCCTGCTAAAACTGTTATATACACATTTATAAATCATAACCTACTAATATAAGACTTAGCTTTACATTAGTTATGCAAAGATCTACTGATAATATAGTACCATGAGTAATTTTTAAGAGACTATGTGTAATATTTACAAGTACGCCTGATGTTTCTCACTATGCCACTCAAAATAAGAACAATATCTACATAGGGATGGGATTTACAAGTTCCCAAGTGCAAAAT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BLAST of Clc10G07905 vs. NCBI nr
Match: TYK07512.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold1702G00300 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK21220.1 uncharacterized protein E5676_scaffold359G00290 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.9e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. NCBI nr
Match: TYK13531.1 (putative TNP1-like transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.9e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. NCBI nr
Match: KAA0036985.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold86G00660 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.9e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. NCBI nr
Match: TYK17902.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold306G001840 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.9e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. NCBI nr
Match: TYK08453.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold654G00690 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.9e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DCM2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1702G00300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.8e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T672 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold86G00660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.8e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DQG5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold190G00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.8e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DLF1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold205G001200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.8e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc10G07905 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLC3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold25G00950 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.8e-04 Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 31/44 (70.45%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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