Clc10G01250 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc10G01250
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr10: 1099545 .. 1106977 (+)
RNA-Seq ExpressionClc10G01250
SyntenyClc10G01250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCGAGGCCTTGTTTGTTGCCGAAGAAGCAGCCCTTTTGCGGTCCCCGAAAAAGGCTTTGGGGCACCGAACACACAGAGAAAAGGAAGAGAGAGAGTCGCGTGGTGGAAAGTGGCGTTGACGATGGCGGCAAGGTGAGGGATCTGATTCCGCTCCTTCTCAAACTTAACGAATCGTCCCAAAATACATTTTTTATTAAAGTTTTAAAATACCTAAAATATTATTGGGTAAGGTTACGAATTTGATTTCTATAATTGGGATGAAGTTATAATTAATCATTTTAAAGGTGGATTTTAGCATGTTACATTTGACTTAAGTTGGTAATAATTGTGTGTGTTTATGTAGAATTTAGCAAAATTGGTAATAATTGTATGAATTGCACAATTAAATTAGTGCAAGAAGTTTGTGTTTGAGATAAATAATTGAATTGAGTTGAGTTATAAATATTTTATATTTTTTTTAACCTAGAAAACCATATGTTTTTTATGATTTTTTTACTGACTTTTTTATCCAAAACATTCAACTATACATACTTTCCCAAATTCTAAATGCATTTGATATGTGAACTCAATGATCAAAATATATTTTACAATTTTCTACATGTAATTATTGTATTTAATGTAGACAAAATATTATTATTTATATAATCAACAACTCTGCAACTTTACTTTTAACAATCTTGAAATGTATGAGTTTAACATGCACAAAAAAATAGAACTGTCGACAGTGGTCAATTCCGATGTTCAAAATCTAACACATGGGCAATAATGAACCAATTTCATGCATACAAAAGACACATCATTCGTTAAGATAGTTAAGCTATATATATTCCTATCAAGTAGACGCAAACAATACCTCTTCCTAAACTGTGACGGGACTATTAAGAAGTAGTCAGTCTTTTGAATGTCTGTGATAAGTAGGTCTATAAGAACGATTCAATCATCCTCAGACAATCTCTTAATGTCAAATTACTATAAAACAAAATAAACTACTAATTTCAAATTTGTATTTAAAAACACTTTTCCCAACCTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTAGTACTAATGAGTCTAGCTAGTTGTTAGAGTTAGTTTGTGGAAATGAAAAACTAAAAGTTGGTGGTTGGAGTTGGTTGCTTGATGTGATCGTCGGAGTTGGTCACTAGACCGTCCATCACACAAAGTTGATCATTAGAGGTGGTTTTCGTTGGAGTTAGTCATCTCTGAGGCGAATATCGGTATTGATAATTAAAGGTAGATGTCACCAAAGTTGATCGTCGGATAGTGTAAAATTGTTGAAATTAAATGAAAATAATGAAGAAATAGGTAATGAAGATAAAATCGAGAGAATGAAAAAAGAAAATGAATATGAAAAGAGAATGCAAAGAGTAAGAAATTCATAGTATAAGAAAGGGAAAATGAAATAAATAAAAACTAGACATATAAAAAAAATAATACAAATTAAAGATGGAGAGAGAAAGTTGTTAGTTGGAAGAGTTCCCTACTCGGGCTAGAAATTCTTTCGAAAATGGCAACCAATTGATAATTTATTTGCATCTTCTCTCCAACATTAAGAGCATGTTTGTGAGCGATTTTAAAAGAGTTAGAATCAAATTATGTTGTTTTAAAAATAACTTTTAAACATACTTTTAATCATCCAAAACCAATTTTGATGATATAAGAATTATATTTAAAAGTGTAAAATTAAGGATTAAATTAATTTTGAGTGATTAAAGACGTGTTTTCGAGTAATCTTTAACATGATAAAAGTGATTTTAACATTTCCAAAATTAGCCACAAATATGCCTTAAAGTGCTTCGAAAATATGGAAAGATTTTCCACTACATATTCTCTCTCCAATTGCCCACCACAAGGTTATTTTTGTCCAAAATTTCTATTAAATCTTATACGTAAAGATATTAAAAACTTTGGACATTTGTGAAAATAAATTTTAAAAAGTAATTGAATCTATAATTACCCCTTTTGGTTGTTTTGTTTGGCTGAGCTTTAGTCCAATGTAATTTTAAATGTCAAATTTAGTTTTGGTATCTTAAATAAAATTTTAACTTGATCCTATTTTTAGTTGATTAATTGAAGATTTATTGAAAGCATTTGAAATAAATTTGGACATTTGAAAACACTGAATTAGAATTGAAACTTTTAAATATATGGACCAAATTGAATTTTAACTCCAATTGAAAATCAACTATGGTCTCTAAAAGCTTTCATAACAAACGTAATAATTTAACTTTGGTTTTTAACAATTTAGTCAATTTACATGTGTAGTTTCAAATTGATAATAATTTAGTTACTCTAGGGTCAATTTGACTATATAACAACTTATTTATTATAGTTTCTAAATAAACTTAAATCCTATCAGTTTTATCAATCTACATATGTAAGAAAACTCATTAATTCTTAATATTAATTTTCACATTAAGGACTAAATCGTTCCAATATATAAAGTTAATGACTAAATTAATACTTATTAAAATTCATAGTCTAAATTGTTACAAATTTAAAAGTATAAGAACTAAATCATTGCAAACTAAAATTCAATAACGAAACTGTTACTTCCATGACAGGTCATGAACTCAATGGCTAATTTTAACCTATAAGATAAATTCATTTAAGTATGGTTTTTCTGTAGTTCAACAATCATACCAACATGAAAATAACTCAATCAACATAAAGTATGTATCATGAACTAAAGTAGATGTTCGAATCTTCCACTTCACATATAATTTAACTAAAAAAACAATTAGTGTGGTGAATTTCAATCATTCAACCATATTCTTTTTGGTTGGTAATTAAGTTCTAATTGATTGAGCTATCATTGAATTAACGTGTATTATGAACTTGATTTAATTGGTTTGTATCTAATTTGTTAAAGTCTAATGGTAATAGGTATTTTATAATAACTTTAAAGAGGTCTAATATAAGCTATTATTTAAAGAGGCTAGTATAAATGAAGGGTGGTTTTGTATGATTTTGAATTTTGATGCATGAAATAGTCGTTGTTACATAATGTTCGTGACCATGTTAAGTAATGTTTCGAATAATAGATATAGAAGCCAAGTTTCAAGTTCCCTAAGTAACGTTCTTGTTCCTTATTTCATATTTATGGCTCTCGATTTTTTAGAAACAAAATTGTTTGATAATCATTTCTATTTTTAGTTTTCCATTTTTAAACTTCTAAAAAAAATAGAAGCAATGAGAAAACCAAACCAATTTTATTCTTTATTGTTAGCAAACATGACGTGACTCATGGACGAATCATTCTATCAAGCTCCCTTGATTAAGAAAATAGTAAACTATAAACATTTACTAAAATCTATAAAGTGAAGAATATATACATAAAGGAGGGGGGAAAAAAAAGAAATGATAAATGAAATCAAAGTTGATAGGTGATTATTTTTCTAAATTTGCAAACCTGTATCTCATAGGTCATTTGATGGATTAAAATATATAAAACCAAAGTGACTATTTAAAAAAAGTTTAAAAAATAAAAACAAAGTTTAATTTAAAAGTTTCAAAGGATCCAAATATAATAAATTTGAAAGTTAACAGACGAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAAACAATTTATTTATTTTAAATTTTTTGCTCTTTCATTTTTAAACCAACAATTATTTATTACTTTGAAAGGCTTCTTTGCTGAGTTTTTCTTTTGGTTACTTCACAAATTTAGTTAAGTGTCTGTTTTAATTTCTTTAACTCTATTGAATTTCAATTTGAAGCTTGTTTATTGCTTACAAAAACCAATTCTTGAATATTGTGTAATACATTAACAAAGTTGGTAAAATTTATTACAATTTATGTCAAGCATGTTAGAATCTGTTTGAAAAGTGGTTATATAACTATGAGAAAAACTTCATCGATAGTTATACAAATTTTTATTAAAGCACGAAGATGTGAACAAATTTGTTGAATGTTGTGAGAGATTGAAATAATTAAGAAAGGGAGATAGATGACTATGCAATAATGTTAAAATAAGATTTAGTTATTGGTGGATTAGATTACTTTCTAGCAGCATCCATTTTTTTTAGTAGTCCAACAATATATGGGATAGAGAGTTCAAACATCTAATATTTTAATCGACCATACATGTCTTAACTAATTGAGCTATTTTTAGGTTGACGAGTCGTGACATAAGTAATATAACATTTTCATACAATAGCATATATATAGATCCAAACAAAATTAACGACATAATAATTTTGCAATACCTCAAATTTTGTATAATAAATTTTAGAAATCAAATAAAAAATTTTAGGATTGAATCAAACCAATTCATAACATCTCCACGCATTTAAAAACTATATAACATACTTTTTGTATATAAAAATATGGAAGTGCTCATACGTGTATTATATTATAAGGATTTATTAAAATATTACATTACAATATGGAGAGAAAATTCAGAGAACTCACTGTTTTATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCTAAAGTTTATTTATTTCGAAAATTTATAATTAAATTTGTTTAATTATTATTATAATGCAACAGTGGGCTACAATATAAACATCAGTTGTTAATCAAAAACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAAATTTGTTTATTTATTTGGTTAATCAAAACCAGTGGGCTACAATATGAAACATCAGAGATTAAAAAAGGTCACCAAATTGAGAAGATTTTTTTCCTTTTCTAAATAATTTTTTTTTTTAATTTTTAAAAAAGAATGGTTGGTAAGTTAGAACCATCGTTATATGTTGATGTGCATCAAAAGGCATTCAAAATTTCGTCCCATTTCTTTTACAATTGAATCAATTTCAACTTAGTTTGAAATTGTTTTAGTTTTTAAAATAATTCAAACGGTTTCTTTTTATTTTAAATAAAAAGAGTTACGATATTTAATATATTAATATTAAATTGGTGTAGTTTAGTCATATACCAACCAAAATAGGCTTATTATTTCAATTCTTTATTTAAAATTTTGTATGGTTTAAATTTAAATTAATTTTGTTTGAATAGGTTTCTATAAGCTAAATCTAAAAGCTATTTATGAATTTTTACACATTTGTTAAAATTAAACAGTGATTATTGTAGATTAATAAATAATTTGTTTTACTAAATAACTTAAGCAGTTAAGATTTTCCTATGTGATTCTCTATATTGGAGAGTGGAAGGGGAAATCTCTATTTACATAACATAAAGGATGGGAATGAAGAACGGGCGCCCAACCCATGCATCTTGAGCAGAGAGCTAACTCAAACTGAAGAACTACAATTGAAACAAGACCAAGATTTGAAAGAAGAAGAACAAAAAAAACAATATATTTTTTTTTAATCAAGAAACCCATAAACTCAAATCGAAATTGTCTAAAGCTTTGCTTTCACTTTTAGACAAGTTGCAAGTGTTTTAGAACTATATTTACTTCATTTCATTTAAAACAAGTTAGGTAACATCATGGGTTAGTTGCAAGATGGTCGAAACAAGTTACTAATAGTAGTCTCATAACCCAAACTTTTTAGTTTTGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGCCAACCACGTTTCACCTTCCTACTACCAGTATACACTTGATATACTTGATATGCTTGATATGCTACTAATATACACGTGATATACTCACTGATATACACTTACACTTGATATATTTCATACACTTGATACACACTAATACACATATATGTAATTGATACACTATTGATATACTTTGTCCTACTAGGGTTTTCTATCACGCCTCTGTTCGCCTTTTACGCTTGCCCATTACAATAAGTCTTGATTCACCCAACCTTCGCTCCAATTCACACGTGCCTCAATCCATGTCATTCAACTTTCATCTTGCACTGCCGTTGTATTTTTGAAGGCCCAGGTTGTTGTCCACTATTCACTGTTTCTAAGTACTTGATTTGTCCATATGTCAAATAGATTAGCACCTCGATCCCAAATTTGTTTGTCTGCCACCTCAGATCCACGTCTACTCAGTCCCTTGCACATCTTCCTTTTGTTATGTTCAGATTCACTCACGATGCCCCCAAATTCATGCATCCCAGGAATGCCTGACAACTAGGTACCCACAATCGTTTGTTGACAAAATTTGCTCCACTTGCGTGCGTTGCTCACTCCTTGCTTGTTTGTGAAGGTGAAAAGTAAAGTGTCATATTTGCAAATTGAGAAAAGTATGTGACACGCTTTACATATGCTATTCCTAAATTGCCACTCATTGCAATTTCTCTAAAATTATTATTAATTAAAAAAATCATATCAATTTAACAAAAAAAAAAATCTATCACGTAATTATTTATAAACAAGTAAAGAAGCGTATAGTACAACAAACTAGAATTTAGTGAAAAGTCACTATCATCTACTTAATTACCACATTTATGTATAATTTACATCAATCATTATATTTTTAAAAAAGTTATACATGTGAAATGCTAAAGTTATAGCAATTTCAAAATATTTATTCTGGTAAAAAAAAATTTGTTTTAGTATAACAAAACGAAAAATCGAATATTCGAGATAATGTCAATTACTGTTTAGATAAGCTAAGTAGTATAAAAAAAAAATATATATAAATCAATTCACATTATAAAAATTTATAAGATTTAAATCGATATAATTTTTAAACCAACGTTACATGTGCGAGGCACGCGATACACCCAGGCGTAAAACATATTTCTGGTCCGAAATGCCCTTTTTCGAGAACCACTAAACTTGCAAATGTTTGAATATTGAAGGATAGTATTTTGGTAATTTGTCATTGTAGTGGACTTTTTATCACCTTGATTGCCGGACTCCTGAGAAAATCAATTTATTATTATAATAATTATTATTTGTTTCATTTTAATAAAAATAACATAAGTTTTGTTTTTGTCTGAGCGGTCCCACGGCTAGTGAAATACACCTTACAAAAGTAAACCCCCTCACCGGTCTCCACCTAGTTTTGAATATATTTGGATTTCGTCACGGCGCCAACTCCCTGTTATCATCACCCCACTATCTTCGTCACCGCCCAATCAACGCCCTACACGTGTCACTCATTCTCCCACCACCCCTCTCCCCTTTTTTGCACTTACGTGGGATCCCTCGCCCTTCATTTCATCAGAATCTTTACCCGCATTCCCAATCGTTCGATCTCTCTCTCATCGCCACCACTTCCGAGATGTCGCCGTTTCTCCGATCCCGGTGCTCCGACGGCTCGCCCGACCGCCCTACAGTTCCTCTTTAAAGTCAATTTTCTTTTGTTTTGTCCTTTGAATTTCTCTCTTTCTTTTAAGGGAGAATGATTTGATTTGTTGTCTTTACTTGTAGACTCGAATTGCAAAAGTGAATTTGTGAGGAATTTGGAATCGAGGTTGAGAATTTTGAAAGTTCTTGTCCTTGTCATGCCGGACGTCTGA

mRNA sequence

ATGCGAGGCCTTGTTTGTTGCCGAAGAAGCAGCCCTTTTGCGGTCCCCGAAAAAGGCTTTGGGGCACCGAACACACAGAGAAAAGGAAGAGAGAGAGTCGCGTGGTGGAAAGTGGCGTTGACGATGGCGGCAAGTAAACCCCCTCACCGGTCTCCACCTAGTTTTGAATATATTTGGATTTCGTCACGGCGCCAACTCCCTGTTATCATCACCCCACTATCTTCGTCACCGCCCAATCAACGCCCTACACGTGTCACTCATTCTCCCACCACCCCTCTCCCCTTTTTTGCACTTACGTGGGATCCCTCGCCCTTCATTTCATCAGAATCTTTACCCGCATTCCCAATCGTTCGATCTCTCTCTCATCGCCACCACTTCCGAGATGTCGCCGTTTCTCCGATCCCGGTGCTCCGACGGCTCGCCCGACCGCCCTACAACTCGAATTGCAAAAGTGAATTTGTGAGGAATTTGGAATCGAGGTTGAGAATTTTGAAAGTTCTTGTCCTTGTCATGCCGGACGTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGAGGCCTTGTTTGTTGCCGAAGAAGCAGCCCTTTTGCGGTCCCCGAAAAAGGCTTTGGGGCACCGAACACACAGAGAAAAGGAAGAGAGAGAGTCGCGTGGTGGAAAGTGGCGTTGACGATGGCGGCAAGTAAACCCCCTCACCGGTCTCCACCTAGTTTTGAATATATTTGGATTTCGTCACGGCGCCAACTCCCTGTTATCATCACCCCACTATCTTCGTCACCGCCCAATCAACGCCCTACACGTGTCACTCATTCTCCCACCACCCCTCTCCCCTTTTTTGCACTTACGTGGGATCCCTCGCCCTTCATTTCATCAGAATCTTTACCCGCATTCCCAATCGTTCGATCTCTCTCTCATCGCCACCACTTCCGAGATGTCGCCGTTTCTCCGATCCCGGTGCTCCGACGGCTCGCCCGACCGCCCTACAACTCGAATTGCAAAAGTGAATTTGTGAGGAATTTGGAATCGAGGTTGAGAATTTTGAAAGTTCTTGTCCTTGTCATGCCGGACGTCTGA

Protein sequence

MRGLVCCRRSSPFAVPEKGFGAPNTQRKGRERVAWWKVALTMAASKPPHRSPPSFEYIWISSRRQLPVIITPLSSSPPNQRPTRVTHSPTTPLPFFALTWDPSPFISSESLPAFPIVRSLSHRHHFRDVAVSPIPVLRRLARPPYNSNCKSEFVRNLESRLRILKVLVLVMPDV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc10G01250.2Clc10G01250.2mRNA