Clc10G00620 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc10G00620
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr10: 616424 .. 621216 (+)
RNA-Seq ExpressionClc10G00620
SyntenyClc10G00620
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCGGCCCGTAATTTTCCCCAGCCCATGAAGCCCGTTGCTTCTAAGTAAGTGAGAGATGAATCGTGTTATATTTAAGAGGTTGTATCACATTTGCATCAATTTAAAATACTATTAGCTATCTTGGAATTGTGTCGATTTTAATGATTAATTCTCTAAGTCATGCTTTATTGTTTTGTTTTCATTTGTGTAATTAGATCTATAAACTTTAGCTCACGTTGCCTTCTTTTGAAGAACAATATTTTTTCATTCAACTTAATAGATTTATAATCTCTTGAAATCAAGTTAGGAAACATGGCATTAAACGTAGTCGTCTTCAATATTATAGGTACGATTAGACATGCAACCCTATCAAATTGAACATTCAATCTAACATTATTGATGGTCAATCGATAAAGATTAAATATGATAACAATGAAAAACAATCAATTCAACAAACATCCATAAAAATCCTTGAAACTAACTCGAATTAATAATCATGTTCATTAACACCCTAAAATTGAAACGTAATCTAAACAATCAAATATCAAGAAAAACAAAGAATAGATAAAGGAAGAACTACTATCGAAATACTTCCCTATTGTTGGAGAGCGTCCACTATTCCTTGATTCGGACCTCAAAATGATCAATTGGGCTCCAAGTACCTTTTCCACTGTTTGCCTCTTCGCTTTGTAGCCAAAACGCTTTGTGGACACATGAAACTCAATAGAAAAAGCAGATAGTCAAACCCTAATTTTATAATATTTTTCACGATTATGTCGCAACGCTATCAGACATAATAGACGATTAATATTTGTAGTGTTGCGACACTGCCCAAAATTGAGCTCTAGGGTTGAAGCGGCATGCAAGCACTGGGGGAGCGCTATGATGCTACTTCAACACAATTGGCCTATTTTTCTCTCTTACTTGGTAGAATTATTCCCTAATTGTCTTTATTGTAATAAATTGACCATTTTTTACTCTGTTGAACTTCAAAACTTGCTCTTTTACTTAACTCCTAAAAATCATTAGTAAACAACATCAAACCTAATAATATTAAGTCAAAACAACTCGATATTAAATGCAAATAAAGCACTTCTTGAGTATTTTTATATGGCACGTACCAACTCTATCATACCTCTATTATTAAAGTAGAAACCCATTAGAATGTTTGATGAAAAGTGAGAGAGGTAATAATGTGACTTTAAGTTGAAACAAAAATTGAAACTTGAATATCAACATACCAGTTAAAACTTGTCAAAATTTATAAAAAAATTCATTGAGTTTATGCTCACACAGTAGTTTTGAATAATTTATGAAATGTTAAATATAAAATTGCAACTTTTTAAATGACACACCTACAATTTAAACTATGAGATAAAATATAAAACTTGGGTGCAATGCAACCCATGTTGTATATATCTATATGCATCTCCTTCAATCACAAATGTGTGTGTATATATATGTTAACAAAAAAATTAAAAAACGTTTTTTCACGTGACGACTTGTGATTGTGCACTTGAGCGAGCTACACAAAAATGAGTGTAGCATTGGTTGTATTCAATTATTTGTTTTTAAATAAATACGAGGTTCAATCTCAAAATAGTCAGTAATAAGAGGATTAACCTATATATCTTATAAAAAAATGTTTAATTGTCGTAAACCAAACTTGTCTCACTTTTCAAATTCTTCCAAGTCTTAGGCTAGGAATTGGATTAGTCCACTAGCGGGGGTGCTGAAGTTAAATGTCGATGCACCTTGGAAGCCTGAGTCCCCCACAACTGGTTTAAGTGTCATCCTCAAGGAGCCTAATGGTATTTTGAGAGCCCTGTTCTCAAAATCAATAAATTTTGTTTTTGATGCTTCAATGATTGAAATCCTACCAACACTTTAAGGTGTTCGTTTTGCAGCTTCTTTATTAGTCTCGAATCTAACAATCAATCTAATTAGAGAATAGTACTTAGTTTTGAGAGTAGCAATCTAGTGGATTGAAGAGATTGAACAACTAGCAAATTCCTTCAATGTTATTTCTTTCAAATTTTATCCTCTATCTATAATGAAGTAGCTCATAAAGTTACAAATAGAGATGACATGTGTGATTATGTATGGTTATCCCGTTATCGTTATTATATAACCAAACTAACCATGTTGGACTTTTGTCCTAATTGTGCTCTTGGTGACATTTTAAATAAGAAGTATCCTTTTTGCAGAAAACATAGGATTCTCAACATAAACACTATGCAAAACTCAAAAGTACTTCTTGTAATGTAGCCATAGCGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACGTGACACATGATCCCAAGGGCGTGGCGGCACGTGAGGAGTGGAAGAGGCACACGTGCAAATGAAATATCCATTATTAAAGTTGGTCTCAAATGAGTTTGAATGGATTTGACTTTTCTTCCACACGCATTATTAAAATGTATTTGGTGCAACCAAACAAGATTTGCTTGCGTGGATTTCAAATCTCACTCCCACACTAAAATCAGAATCCAATGTTCTATTTTTATTTATTTTTTTCATTATATATATATATATTTATTTATTTATTTATTTACTACCATTGCACATAATTGATTTTCTTTTTTAAATCCATTTGTTTCTTTTTCATGTTTGATTTATATTTCAAAAAATATATTAAACTACTTCAAATTTAAGTTTAGTTTGAAATGTAAAAATATCAACTAATTTTTAAATATTCAAATTTATACTTCATAACAACTAATTTTAATTAAATTAGTAGTATAATTTCTAGATTTTCACGAGTGTACTTGTTCAGTAATAAATTTTTAATTTAGTGTTCTAACTTTAAAAATGAATAATAAGTCTACCAACTTAAAGATTTGTGCGGAATAGATTTTGTATATTTGAAATTCTTACAAATTAATTGATTTATATTTATAAGATACAAAAATGATTTTTACGTCAAAACATACCGTAAACTTCCAATTTTATGTTTGGGATGTTCATAATTTTTAAATCCCACTTGTTAAATTTCATATCGATACAAAATTAATCATCCATATACCAAATAAACATGTAACTAAAAGTTTATGCGCACATCTTAAACACAAATTCCATGTATACGTTTGTTTACTTATGGACATTTTACTAATGTTTTGAAAAACATATCCGAGAAATATATATATATTTATTTATTTATTGTTTTTTTTAAACAAAAATTTATTAAGAACCAAAAACCACATCATCCATTTTCAAGAATAAGAGGAAGTGCAAAAGCTGAAAGACATCATTTTAGGCCTCCGAGAGCTTCGAGAGGAAGTCCAAGATGCTAAGTTGTGAGCAACTTTAGTTTGATGTCTACAATTTTTTTTAAAAAAAGAGAAATATTTAATTAAAAATTCAAATGTTTATTATTATTATTATTATTTTGCCTTCATGTTATTTGAGTGAAACTAATTTGGACGGTAATGCCCCTGAACTTGGCCTGAAATAAAGCTCCAACTCACGAGTGATTCACGTGGCATGAATGGGTTTATTTGTACTTCTCCAAATATTAATATCTCACATGAAATTTCCCCATTCACAGCCCTTTTCTCCGCTTCCTATATCTACCCAAAACCCACATTTACAATTTTAGCCTTAGATGTTTTGTTGTCCATTACTCTCACTTAAGGATATTTTTGTCCAATCAAAATAATACATTCCGTACCATTTTCTCTTGGAAATGAAAATAATTTTAATATATATATATATATATATTTAAAACAACTCATTGGAAAAATAACACACTATAAGTTAAAAACATATAGTTTTCATGTAACCAATATTTGACCTATTAAAAATAAAAATAATTGAACTGTATTTAAGTAGATACTAATATTTAATTGATTTTTTCTCGTCAATATGAATTATGAAAAAATCAAACCTTTAAATTAAAAATCAAAAATTTGATAATATATCTTTATGTTAGTTGAAGTATATTCATTTTGACATTAAAAAAATAAAAAAATTTGAAATCTTATCTTAATTTTTAAAAGAAAAATTTAAGACAAAAATTATATTATTGATATGAACCAACTGACCTAACATTTATTAATTAAATGGATGAAATCAATGAAATAAGAAAGATGAAATAAAGCATTGAATGAGGGAAAAACTTTATGTTAAATGTTAATTTCCCTCCAAAATGCATAAAGTATATTTTGGTTTTCCCTCCCACACCTAATTTTTAAAAATAAATAAAATATCACATACTTTCTATATCTAAGCAACGCAATTACCGCCATTTCCCATGGCCCACTCTTACACGTCGCATAGTCTTAACCAATATTAGCCTGACACGTGTCCTACAGTTTTTTTGGCGGGCACTTTCGTGAAATTCAAATAAAGATGAAACCCTAGCCCCTCTTTCTCTTCTAGTCCCTATTTTCCCTCCCTTCCTCTCACTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGCGCATTTCGAGGAATTTATCCTGAAGTCTCTCGATTCCGAGGTTTGTTCTGATTTCATTCATTCTCTTTTCTCCGTTTTGTTTTTGTTCCATTTCGATTCTTGCTGCGTTTCTTTTTATTTAAATTTGTAATAGATTTCTTGTTTTGAGGGATTTAGGGTTGATTTTCAGCATTTTTTTGAGGTGGGTTTTTCCTTTTTCATCCGTTCTTGAACGCTCAAGAAATCATTTTTCAGTTTCTTTGATGGTTAATGAAATCGGAAGCGTTTGAATTTTGTGTGGCAGGTTTTGTTGATGGGTTGGTTTTAATTATTGATGTTGAGGATTTATTGGAGTAG

mRNA sequence

ATGCCGGCCCGTAATTTTCCCCAGCCCATGAAGCCCGTTGCTTCTAAGAATTGGATTAGTCCACTAGCGGGGGTGCTGAAGTTAAATGTCGATGCACCTTGGAAGCCTGAGTCCCCCACAACTGGTTTAAGTGTCATCCTCAAGGAGCCTAATGTCCCTATTTTCCCTCCCTTCCTCTCACTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGCGCATTTCGAGGAATTTATCCTGAAGTCTCTCGATTCCGAGGTTTTGTTGATGGGTTGGTTTTAATTATTGATGTTGAGGATTTATTGGAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCGGCCCGTAATTTTCCCCAGCCCATGAAGCCCGTTGCTTCTAAGAATTGGATTAGTCCACTAGCGGGGGTGCTGAAGTTAAATGTCGATGCACCTTGGAAGCCTGAGTCCCCCACAACTGGTTTAAGTGTCATCCTCAAGGAGCCTAATGTCCCTATTTTCCCTCCCTTCCTCTCACTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGCGCATTTCGAGGAATTTATCCTGAAGTCTCTCGATTCCGAGGTTTTGTTGATGGGTTGGTTTTAATTATTGATGTTGAGGATTTATTGGAGTAG

Protein sequence

MPARNFPQPMKPVASKNWISPLAGVLKLNVDAPWKPESPTTGLSVILKEPNVPIFPPFLSLSPSLSLSLSLSLSFCAFRGIYPEVSRFRGFVDGLVLIIDVEDLLE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc10G00620.1Clc10G00620.1mRNA