Clc09G24610 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGTGAAATGAAAGAGCAAGAAACGAGAAACCGATATAAGACCTTCGCTCCTAACACTTGCATTCTTATGTGAAAGTGATAAGTACACCTCGGATGAAAGTAAAAGGCTAAAATTTATTGAGAAAAGCTTTTGGACTAATTTTTAATGGCCCCCTAAAAAGGGTATTGGGAAAGACCAAGAAAAAAATATTAGGGGTTAATTGTGAAATATGAAAGTATCATTTAGGACAATTTCCCTATTTCGTACCTTCGACAGAACCGGTGGTTGATTCCATCCTTGATTATGGTGAAGCTTGGAAGATTCTCTGTCCTTGGCCGGGGATCAGTTTCTTTCTAGAACGACGAAGCTATCAACTATCTAGGATGAAGAATGGATTCGCTTGAGTGGATCGAAAGTAGTAGACAGCAGGTATGTACTCCTGTAAGAATGAAAAGGAAAATTAGATCCAAGAGATATGAATTCGTTGGTTGGGGATCAAGACCACTTATTGAATTTCTTGAATCAATTGGTAAGGATATCAAAGAGAAGATTTCTCGACACGACGTAACCTCCATTATAAATGAATATGTCAATATTAACAATCTTCTTCATCCCTCTAGAAAGAAACGAATCCTTTGCGATGATAGGCTCCATTCCATTTTCGGAAGGAAAACAATTGGCCGTATTAAAATCCATGACATGCTAGAACCACACTTTGCTGAGAATCAAGATGAATCAGATGATGACTTTTCTTACAGCTCTGACGAGACGGAAAATCTTTTAAATACCCTCAAACGGGAGAATGGTATAATCCCAGGAAGAAAGCTAAGTCAGAAGACGAGAGTGGTTGTGAACCCAAACAGCTCTTTTGCTGCCGTGGTTCCTGGAAATATTAATCTTGTCTACTTGAGAAAGAGTTTAGTAGAGGATCTGCTTAAAGATCATGAAACCTTTGAGAGCAAGTTGATTGGTAGCTTTGTCAGGATTAAATCTGATCCCCATGACTATCTTCAGAAAAATACTCATCAGCTCGTGCAAGTTATAGGTAACTAAACAATCTCTTTTTATTCATGAACAGGGAAAACGCTACCTGAAATAATTTATCTCTACAGATAAACTTTGATGTAATCTGAATTGTCTTTGTTTTATTTACATCCTTCATGAAATAACCGCAAATTGTCGTCATGAAAAAAATTGAAAGAATGTTACTAAAGTTAAATAGGTGCTACTGTGAATGCTTCTAAAAGTTCGCTTGGTCAGTTGTTATGGTGGAAAAAGAACAGAAGAAAGTAAAGAGAACTCAAAAATTTGAAATGAGGTGTCCTAGCAGATGGTTTACTTCAAGTTGGTAAATTTGATTACAGATACTTTGAAGACAGCTCATTATTCAACAGATTAATTGTAATTAGTTTTCTATTAGTTGTCTTAGTGTCCTCATGGTGTTCTCTTTCTAAGCTATATGTTAATTTCTCTATCTTAGTTGTCTTAGTGAGAATCAGAGTGATCAGTGATGTTATGCATATGGTATTCAATCGGTAGTATATATGAGCTTGTATCAGTACATTACAGATGGGGAATATTATCTTGATATTTCTCTCGTACACGATGTCTCTCTATTACACTTCTTATTTGAATGCACTTGTTTTTTTTCTCTCTAGGACAATGAGCCTCTTGGCTCTTGAAGCCATCTTTGAAGGTGTATTGGTTAAGTTTCTTCTTTTTCTTCTTTCAAGGTTCCTCTTCCATGCCTTTTGTTTTGTCTATCTCTACAAATTGTTATATCCTTACCGTCCAACCATATGTTATCTCAGATAATCAATTCAATGATCTTATCTTTTGATATCCTTTAGGGGTGAAGAAAATTTCTATATCTGGCGATTTGGGTACAGGATTCCTTCTTCATGTTTCCAATGTGATGAAAGACGTCAGCATTTGCATGCTTTCGGATGAAAATTTTTCTGAGGTAATTTGTCCCGTGTTATTATTATTATAGATAATATACTTTTTACCCCTCTAGGCAACATTGTTCTAGCTGGGCCCTATTCCTCTAATGGGTTTTTGTGAGCTTGTTTTTTTTTGTATGCTCTTGTATTATTTCATTTTTTCTCAATGAAAGCAGTTGTTTTAATAAAAAATATACTTTTTTTCCCCTTTAGTGTAATATAGAGTATGTATGAATTATATAGTGTAAACAAAACGATAAGATGTCCTTCTTCATAGAAGAAGAAGACTGCAAAAAAGTCATCTTGCTGACTAAAAAATGATATAACTTAAATGATTACGATATAAAGAAAAAAGAGGTTCCATGACTCTCCTCTCTCCTCTCTCCTTTCCTCTCCCCTCTTCTCCCTCCTCCACCTCCCCTCCGGTGATTCTCCTCCTCCTTACCGACAGCATCCATACTTGCCAGTCAAGCCTCTGTTAATAGATAGTCGTCTTGTCAAGCATTAGTCATCGAAGTAGTCAGTTGCAAGATTAATGGACTTTTCTTCTGTACATGGTTCGAAGATGGTAATTTCATAATAGAAGACATGGAAGTTAGAAAAGCAATTTACTTATCAAAATCCCATTTGCTTTGGATGGTGAAGCAAATTTCAGACCTCCTCAATGGATCAAGTGTCCCTTTTTTCTTAAGGGAAGTGCGTGACGACTCGGGAGCAATGAGATTATCAAAATTCAAGAGTCAGATGGGTTGGAATCTTAGATGTGTAGTTTGGCTCGCTACCGGAGGTCGTTTCTTTATTATGTACCAGAAGGGACAGCGCAACAAGGATGGATTGAATTTTTGGGGATGATTAATAGCTTCATTATTCGAATTGGGTGTTATACGGACTTTTCAGCAAAAAAAGGAGTTGCTTCAGCTGAGCTTTGCAGAGATTTTAGCAAAAGGAGTGAGCCATCATAATCATTATGCTCAAGATTCCACTCTATTGCAACCAAACTCCTCTGCTTTTCACAATAAATAGAGCACATATCTTGGATGGATTAGAAAGGAAAAAGAAGTGTTTAAGGAAGATTTCGAAAATTTGTGGGTGGTTTCAAGGTTGTTTGCTTTCGATGAATGGAAAAATAGTCAGTTTTTTGGAGGATCTTTATCAAACTAAAATCAGCATTAACCCTCTGTTTGCGGATAAGGCCTTGATTAAAACATCACAGGGAAATTTAGAAAAGATCATTGCAACGCCTAGAAGATGGTTTGATTATCGTAAATTCCATCTTCTATTTGAAAAATGGAATTCAATTCATCATAGTAGGCCTACTTGCATAAAAGGTTATGGAGGTTGGTTGATAATAAGAAACTTGCCACTGGAATATTGGTGTAGAGCAACCTTTTGAAGCTATCGGATCCCATTTCGGAGGTTTCGAAGATATAGCATTAGAAACTCTCAATCTTTTGAATGTGTCAGAAGCAAAAATTAAAGTTTAAAGAAATTTATGTGGTTTTATGCTTGCTTCTATTGAAATAAAAAATGTTATGAGAGGCTCTATTTTTTTAAATCTTGGGGATGTCGAAGTCATGGAAGGTCCGGGTGTCAACCTGGTTGAGATGTTCGGGTGCACTCTCTGATCCATTTGGCCTTTGTTTCCGTTTCCATTACCATAGTGTATTGTCTCATTTCATAATCTTAATGAAGAGGCTTGTTTCTTTTTTAAAAAAAAAATACCTCGAATAAAATGTAAGTTTGAGCGAGGGATTTTAAACTCCGAATGGGAAGAGGAATTATTTTTGAAAATAGAGTGATCTGACTTGGTGTGGGATGAACCTTGATAATGAATTCTGACACAACACTCTTCGAACAAATCCAAATTTGCAATGGCTGTCCATGAGTTGTTGAAGGATGTTTTCTTTCGGATGAAGTGCTTTATGAATTGCCTGAGGAGTTTTCGTCTTCCTATGGAGCTCCCGCCTTGGTCCACAATTGCTGAACTATCTTTATTGATTTTTGATATCCAATATGATCTTGGAATATTGCCAATTTATATTCAGGAAGGACTTCAATTGGGGTGGCTATCTCTTCTGTCATTGGTTCATGGATTACCAAAATTATTATCTTCTATATTTATTCTGCACAAGGCTGATTTATCCCAATTAACCTTCTGACCTGAGCACCATTCAAATAACTCTATAGTTTTGTGCAAGTTCTCTAGCATCTCCCCATCATATTTGCAAAAAATTAGTGTGTCATCTGCGAATTGGAGCAATGGAATGTGAACTCTATCTCTTCCGACAATAAACCCTTCAAACTTCTTTTTCTTATGTAGTCTAGAAATGAGGCTGCTCAAAACTTCACTGATTAATAGAAAAATGAAAGGAGAAAGAGGTCACCTTGCCGAATTCCTCTAGTTGCCATAATCCTCCCTCTTGGCCGCCCATTAATGAATATTGAGTACTTTGGGTTTTTCATGCAACCCAAAATCCACGATATCCATCTAGGATCAAATTTCTTTTCTTTTAAGACCTTCTCCAAGAAGGCCCAATCAACTCTATCAAAGGCCTTTTCCAAGTCAAGTTTGAGGAGCCATCCTTTCTTCTTTTTGCATCTATATTCTTCCACTACCTCGTTTGCTATGAGGATTGGATCTAAAATTTGACGACCCTCAATGAAAGCACTTTGAGTTGGGGCAATGATACTTGGCATGACATGCTTCAATCTTTCAGCAATTACTTTGTACATGAATGTTGTGAGACTTATTGGACGGTAATTGCATCTTCTTTCTTTTTAATCAAACAAATAAAGTTCTCTTTAACACAGGAATTCAAGCTTCCATTTAGAAAGAATTCATTGAAGAGGCTAATGAAGTGAACCTTGAGCTTCTCTCAAAATTTGATAAGAAATTCTGCTGTAAAACCGTTCGGCCCTGACACTTTGTTCTTTCCCAACCCTTATAGAGCTTTTCTGATTTCTCCATCTGTGAAGCCTGCAACCAGCCGACTATTTTGTGAATTTGAGACCACTTGCCAGTCTAAATTGCTTGAAAAGGAGCCAGCACTGGGCATCTTGGTGTATAAGGCT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ATGGATTCGCTTGAGTGGATCGAAAGTAGTAGACAGCAGGTATGTACTCCTGTAAGAATGAAAAGGAAAATTAGATCCAAGAGATATGAATTCGTTGGTTGGGGATCAAGACCACTTATTGAATTTCTTGAATCAATTGGTAAGGATATCAAAGAGAAGATTTCTCGACACGACGTAACCTCCATTATAAATGAATATGTCAATATTAACAATCTTCTTCATCCCTCTAGAAAGAAACGAATCCTTTGCGATGATAGGCTCCATTCCATTTTCGGAAGGAAAACAATTGGCCGTATTAAAATCCATGACATGCTAGAACCACACTTTGCTGAGAATCAAGATGAATCAGATGATGACTTTTCTTACAGCTCTGACGAGACGGAAAATCTTTTAAATACCCTCAAACGGGAGAATGGTATAATCCCAGGAAGAAAGCTAAGTCAGAAGACGAGAGTGGTTGTGAACCCAAACAGCTCTTTTGCTGCCGTGGTTCCTGGAAATATTAATCTTGTCTACTTGAGAAAGAGTTTAGTAGAGGATCTGCTTAAAGATCATGAAACCTTTGAGAGCAAGTTGATTGGTAGCTTTGTCAGGATTAAATCTGATCCCCATGACTATCTTCAGAAAAATACTCATCAGCTCGTGCAAGTTATAGGGGTGAAGAAAATTTCTATATCTGGCGATTTGGGTACAGGATTCCTTCTTCATGTTTCCAATGTGATGAAAGACGTCAGCATTTGCATGCTTTCGGATGAAAATTTTTCTGAGGAGGAATGCAAAGATCTGGATCTGAGAATAAAAAATGGCTTGGTCAAGAGATTAACTATTGCAGAGGTTCAGCAAAAAGTTGAGGTCTTGCACGTGGATATTACCAAGCATTGGCTTTCAAGAGAAATTTCTTTGCTGCAAAACCTCATTGATCAAGCGAATGAAAAGGGGTGGCGCAAGGAGCTCGATCAATATCTGGAGAAAAAGCAGCTCCTTCAAACTGCAGAAGAACAGTCGCGTATATTCCGTGAGATTCCACGAGTGATTGTAGATGAAACAGAATTTAAAGGCATTTATGCTGGTGCAAATCAAGGAGATAATGTCACTAATGAAGGAGATGAAACAAAATTGCTGGTGATGAGGGAGCTTTTAGATGACACAAATCAAGGAGAAACTGTATTTAGTTCAAACCCAAATGGTGATATTTATATCGCAGAAAACCCAACTACAGTTTTGATGTCCAACGTAAAAGAATTTGCAGAATCTAGACAGAGTGTTCTTGGTGAAGAACAGCCCCCACAGCCAGTAGAATCTACGTATAATAGCTTTAAAGAGACAGAACCTATAAATGTTATGGATAAAGGCTGTCAAGCGAATGAGCAGATTAAAGGATCTAGAGTGATAAATTTGAGCGACGATGATGAAACACCAAGGGCTGAAGAGCATGATTGGAATAACATACTAAGAAGCTTGATTTGGTATTATTTAGATCCTCAGGGGGACGTTCAAGGGCCCTTTTGTCTTGCGTCATTGAAAAACTGGAAGGATGCTAACTATTTTCCTTCAGATTTCAAGGTCTGGAAGACGGGGCAGACTCGAGATCAGGCTGTTTTATTGAGCGACATTCTTTCCCCCTTCTTTTCATAA MDSLEWIESSRQQVCTPVRMKRKIRSKRYEFVGWGSRPLIEFLESIGKDIKEKISRHDVTSIINEYVNINNLLHPSRKKRILCDDRLHSIFGRKTIGRIKIHDMLEPHFAENQDESDDDFSYSSDETENLLNTLKRENGIIPGRKLSQKTRVVVNPNSSFAAVVPGNINLVYLRKSLVEDLLKDHETFESKLIGSFVRIKSDPHDYLQKNTHQLVQVIGVKKISISGDLGTGFLLHVSNVMKDVSICMLSDENFSEEECKDLDLRIKNGLVKRLTIAEVQQKVEVLHVDITKHWLSREISLLQNLIDQANEKGWRKELDQYLEKKQLLQTAEEQSRIFREIPRVIVDETEFKGIYAGANQGDNVTNEGDETKLLVMRELLDDTNQGETVFSSNPNGDIYIAENPTTVLMSNVKEFAESRQSVLGEEQPPQPVESTYNSFKETEPINVMDKGCQANEQIKGSRVINLSDDDETPRAEEHDWNNILRSLIWYYLDPQGDVQGPFCLASLKNWKDANYFPSDFKVWKTGQTRDQAVLLSDILSPFFS Homology
BLAST of Clc09G24610 vs. NCBI nr
Match: XP_023554021.1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 954.1 bits (2465), Expect = 5.1e-274 Identity = 479/545 (87.89%), Postives = 502/545 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. NCBI nr
Match: XP_004148294.1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X4 [Cucumis sativus] >KAE8646125.1 hypothetical protein Csa_016053 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 952.6 bits (2461), Expect = 1.5e-273 Identity = 481/544 (88.42%), Postives = 501/544 (92.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. NCBI nr
Match: XP_022952439.1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 949.5 bits (2453), Expect = 1.3e-272 Identity = 476/545 (87.34%), Postives = 501/545 (91.93%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. NCBI nr
Match: XP_022969375.1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 948.3 bits (2450), Expect = 2.8e-272 Identity = 478/543 (88.03%), Postives = 501/543 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. NCBI nr
Match: XP_008447064.1 (PREDICTED: uncharacterized protein At5g08430 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 945.7 bits (2443), Expect = 1.8e-271 Identity = 478/544 (87.87%), Postives = 499/544 (91.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FT92 (Uncharacterized protein At5g08430 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08430 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 4.4e-119 Identity = 252/576 (43.75%), Postives = 347/576 (60.24%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIV5 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NERD PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 2.1e-49 Identity = 154/575 (26.78%), Postives = 264/575 (45.91%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SD34 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 44 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g51120 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 178.3 bits (451), Expect = 2.3e-43 Identity = 140/522 (26.82%), Postives = 240/522 (45.98%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Y7W8 (GRB10-interacting GYF protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Gigyf2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 4.7e-04 Identity = 34/96 (35.42%), Postives = 46/96 (47.92%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLQ2 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455126 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 949.5 bits (2453), Expect = 6.1e-273 Identity = 476/545 (87.34%), Postives = 501/545 (91.93%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HZR7 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 948.3 bits (2450), Expect = 1.4e-272 Identity = 478/543 (88.03%), Postives = 501/543 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BH52 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 945.7 bits (2443), Expect = 8.8e-272 Identity = 478/544 (87.87%), Postives = 499/544 (91.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGI1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 939.1 bits (2426), Expect = 8.2e-270 Identity = 478/550 (86.91%), Postives = 499/550 (90.73%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V6F1 (Binding protein, putative isoform 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold357G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 929.9 bits (2402), Expect = 5.0e-267 Identity = 473/544 (86.95%), Postives = 495/544 (90.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. TAIR 10
Match: AT5G08430.1 (SWIB/MDM2 domain;Plus-3;GYF ) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 3.1e-120 Identity = 252/576 (43.75%), Postives = 347/576 (60.24%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. TAIR 10
Match: AT5G63700.1 (zinc ion binding;DNA binding ) HSP 1 Score: 268.1 bits (684), Expect = 1.6e-71 Identity = 138/346 (39.88%), Postives = 222/346 (64.16%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. TAIR 10
Match: AT5G23480.1 (SWIB/MDM2 domain;Plus-3;GYF ) HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 1.4e-64 Identity = 188/595 (31.60%), Postives = 282/595 (47.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. TAIR 10
Match: AT2G16485.1 (nucleic acid binding;zinc ion binding;DNA binding ) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 1.5e-50 Identity = 154/575 (26.78%), Postives = 264/575 (45.91%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G24610 vs. TAIR 10
Match: AT3G51120.1 (DNA binding;zinc ion binding;nucleic acid binding;nucleic acid binding ) HSP 1 Score: 178.3 bits (451), Expect = 1.6e-44 Identity = 140/522 (26.82%), Postives = 240/522 (45.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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