Clc09G22890 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc09G22890
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr09: 36243198 .. 36247680 (-)
RNA-Seq ExpressionClc09G22890
SyntenyClc09G22890
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGATGGGATTTTGATCAGTTTGGTCCCTGGGGGAGCGAAGACCGTGAGGTCTCTCTTGACGTGGTGGAGGTTTGTCGTTGGGCAAACATCAATACAGAACGGGCATTTGCCACAGCTGGGAGGATTCTGGAAGCTGTTGCTTTGGCCACAGATGCCAGGTTAGTTATTTCATCCCACCGTAATGATACGATCTGAATTATTAGCTCCACAGATTTATTGGCCTCTATGCAGTATCTTTGTTTATTACTTAAAAGTCAACTTAACTGAGATTCGATTGCTAATTAGACAAATGGATAAAAAAGTTATTCAGTACTATAAGATTAGAAGTTCATGTTCAAGTTTAATGGGCAAACTTTTAGATTGAAGTGTTTCTTTCTTATTTAATGTGGGTTAATTTTCCAATTATTCTTGTTTCATGTGGGTAGACTGAATTTATTTATCTTTTGAATAGCTTATTGAAATAAACTGAGGCATTAACAGAGTGGTAGATGAATCAATCTCGCTTAGCAAAGGTTTTATGAGAAAGTTCGGAGGCTGATTCAAGGATGGGATATATATCCCACTCTCAATTTTGTTTAGAATTTGGTCTCAAACAATGAACTCAGTTCTAATGCGTTTATGGACAGAGCGAAACAGTAGGTTGGCTGGCAAAATTGATGCACTTATGTATTATCACACCAAGTTGTTAGATTAGCAGATAAATGAACCATTGACTTTTTCAAAAGTTGGATTAATCATAGACTTCGACAAGAGCTCGACATTCCCTTTCAATGGTTGGATTGAGTACCAAATTGAGTTGATTGGAGCACCATGATTCATGACATGAATTTGAAGCCAAAGAAAACATAACACAACTATTTTTTATTTTAATATTCGTGAGTGTCATGACCAACTTATGTGTATCTCGTCATTTGGGTCTAGCTCACAGGACAACCCGTCTGACTGTACAACATTTGAGTGTCAAGGAAACCATAGGGATATTAAATCCTACGTAGGTAGCGACCAAGGATTGAATCCATGACCTCTTAGCCCTTTGTCAAGGTCATGCCCATTTACCACTAGGTCAACCCATAATGATTCACAACACAACTAACTTCCAATATCCATTAATTATTGACATTGTGTGCTCTTGATTTCTAATAATGGATATATTATTCAATTTCTTCTGTAATTCAATCTTGGGGGACAGGGACTTGGGATTGATCCTCCTCTTTAATACTTTAAATAATTAGGTTGGCAGATATTATTCCAAGAATGGGACCAAAAGCTTGAATTTCTCAATTTTTTTTTTTATCATCCATATATAATCTAACAATTATAAACCTATAGAATTTGAGTCCAATGATCTAAAATTTAATTGATTAAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGACCAACAATTGTGAGGTGAGGATGAGAGACTGAACCTTCCACCTCTAAGATAGAAGGTCATGTAAATTACCATTGAACTAAGCTCACTTTGACAAATATTTTGTTTAGTTACTCATTTCATTTATCTATTCACCAAAAAGATTGAGGTCCTTTGTAATTTTTATGTAATTGTGATGGTTCATTATGGTATATATAGAGGGGAAAGTTGGCACTTAGAACCTCATAGCTATTTTGACACTATGTAAAACTATCATTATACTCAAAATTTTAGCAGTATAGGTTAAATTGCTAATCTTTTCTAATAATATTCTCAACCATACATGTTGAAATTGATTCAAAATAGTTTGATTTGCATTATACGGTGGTTTGATATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTGTATTTTCTGTTTGCAGTTTGCACATAGATAGGAGGACCTTCTGCTTACGTTATAGTGCATTTACTGCCTTGAACTTGGTACTGTGCTATGGATGTCTCACCAATTGCAAAATTATCATAGTCCTAATTTGATGGCAGGATTTATCGCAGTTTTCATTTTTTTTTTCATGCTTTTGCCAATCTGCATCGTGGGTGCCCTCCCACCATGAAATTCAAGCGTAGATTTGTCGCGATTTTAGAATTAAGTCCAGATCAACCAACCACCCAAAGATGGTTCGCCTAATTTGAAAATTAACGTCATATTTTACTTACAATTCATTCAGATTGCAATCGGAACTCAGTTATTCGTAAAAACTCCCTTACACTAACACTACCTTCGTCTGAGGAAACATGAATTCGCGCACAGTACCCACACAGTACATACGGAAGATACCAGAAAACGGCCAACAACAACCATTTCAGAGGAAACGTTACTGTGATGCATGTCTTACAACTGAAAAATCCAATTTTTATTAAACAAGGGATACCTGAGACGAAAAACAAATATGATGAATAGAAAAAGAGAATCAAAACATCGGAATTCCAAATACCTACTGCAGTTAGAAAGATATTCATAGAGGATGATAGTTGGAGAAGACTGGGTGAAGCCGATTCATAAATCTGAAGAGAAGAAGAAGAAATATACACATGCTCAACAGTTGATAGATATGAAAAGAGAAAAAAAGAAATTGAGTCTTTTGGGATTCTGTTTAATTTAAAAATTGAAATAGAGCTACACTCGAATATCGCGATGGAAGGGCACCTACAAACCTGACTGATGAAAGCTTGAGAAAAAATTACCATCGCCATAGCTGTTGCCATCAGGTTAGGGCTACCATAATTTCGAGATGGGTGAAACGTTCCTAGAATGATAACAGATCTAGCGGTAAGTGTATAATAACATAATTAAGAAATCTAGAAAATTGAGGGTGGGATACATATATCAATTATCCAAAAATGTCATTGTCATGTATAGACTCATTTTGTTATGTTTAGAAAAAAAATAATGAAAATATTCGGAGGTAGGAAAGTACCCCACAATTGAAAGAAGCAATTAACATGCAACCACCAATCCACCATGATTAACATGCCACGTGACCCCTCCTTCGGATCTTCCCAAACCTCACCATACAAAAAGACGAAAATACCCCAACAGTCCCACCACCTACTACTCACATGTCAGGGGCAATTTTGGATCACAAAGACATTAGAAAAATAATAATAAAAAAACAACCTTTCAGATATATCACTAATAATTGTATTAATCCAAACAAATGTATTAATATACACTCTCCTCTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTCTTTTCTTTTCCCTTTCAAAGAAAAAAAATCATACAATCTCCAAATTTCATTTTAAAAGCAACTTATATTTTTATCCATTAAACTTTTAAATTGTCGTAAATCAATCAACTTAAATCCATTATTAAGATTAACTTTGCAAATCGTTCATGCATCAATTTTTACACACATGTGGACTTTTTCGAATGTCGAATTAACAAAACAGGTGATTAAAATTTATGGATAGATGATTTTCAAAAAAATTTCTAACTTAGAGTTTAAATTGATTAGTTTATGAAAATTTAAGTCATTAATTGATAGAATTATAAGTTTACTCGATGTCTATCCAAATAGAAAATAACGAAAGGTATAAATCGACATAATTGTGAAACTTCAAGGTTTAAATTAATACAACTCCCAAGTTTAGGCAGTTTTTTTGTACGGATAGTCCAATTTGCGTTGCATTAATGTTGAATGACTCGAAGTTTGAAAATAATGAATACTAACCTTTTACTTACATCAAACTCGCTACTTTCTTTGTCCCTCTTACTTGGGCTCCTTTCTCTCTGCTCCACTCACGCTTCTTTCTTCTTCCCTCCCTCTCTTGCTTGCACTTGTGGTCACCGTTCCAACCATTTATCACCCTCTTTGAAGATGCTCTCACTTGCGATTTAGCCCATCGATCGACTGTTCATCACTCGCTTCAATAAACCCTTGCGCTCGTGTTTCTAGCTACTATCCAACTATTTGTCGCGAGCACGAGGATCTAAGGAAGGAACACAAGAATTTGCTTTTCTATTAATGTTTGATCTAAGTGTTTCGTGAAGTAAACAAAATGTTAGTTTTATTATTTTCAAAATTCGAGTGATTCAAGGTTACTGCAACCAAAACTTAAGTCAACTATAAAAAATCTCAAGTATCATATATGAATTGATATTAAAAAAAATGTGATGCTTGGAAGAGGCAAATTTGATTCTCTGCCAGGTTACTTGGGTATATAATTTTTTTTCCTTTTTCCTGAAGGGGTTCAGCGAAATAATACGTTAGAAACTTTGTATTGAATCATTGTTTTTTTTTTTTTCTAGGATAGGGGATTCGAACCTACCACTCCTAAAATGAAAGGTTTGAATCTATAATTATTGTTTAATCGAAATTGCGATTTGAATTCAACATCGCGTTTTCCTTGATTATCGGCCAGAAAGGGATTCTTTTTTTCCCTTCATAATTTATTCTCTGTGTTCTTTTTCTTTTTTCCTTTTCTCCTTTAAATTTGAAGTTTCTTCGGGAATCGTGTTGGGCGTGGTGGTGTTAATCGTTTTTTTTCCTCCTTTCTGGGCTTTAGCGCCCTGTGGCCACTGA

mRNA sequence

ATGGATGGGATTTTGATCAGTTTGGTCCCTGGGGGAGCGAAGACCGTGAGGTCTCTCTTGACGTGGTGGAGGTTTGTCGTTGGGCAAACATCAATACAGAACGGGCATTTGCCACAGCTGGGAGGATTCTGGAAGCTGTTGCTTTGGCCACAGATGCCAGAGGCAAATTTGATTCTCTGCCAGGTTACTTGGGATAGGGGATTCGAACCTACCACTCCTAAAATGAAAGTTTCTTCGGGAATCGTGTTGGGCGTGGTGGTGTTAATCGTTTTTTTTCCTCCTTTCTGGGCTTTAGCGCCCTGTGGCCACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATGGGATTTTGATCAGTTTGGTCCCTGGGGGAGCGAAGACCGTGAGGTCTCTCTTGACGTGGTGGAGGTTTGTCGTTGGGCAAACATCAATACAGAACGGGCATTTGCCACAGCTGGGAGGATTCTGGAAGCTGTTGCTTTGGCCACAGATGCCAGAGGCAAATTTGATTCTCTGCCAGGTTACTTGGGATAGGGGATTCGAACCTACCACTCCTAAAATGAAAGTTTCTTCGGGAATCGTGTTGGGCGTGGTGGTGTTAATCGTTTTTTTTCCTCCTTTCTGGGCTTTAGCGCCCTGTGGCCACTGA

Protein sequence

MDGILISLVPGGAKTVRSLLTWWRFVVGQTSIQNGHLPQLGGFWKLLLWPQMPEANLILCQVTWDRGFEPTTPKMKVSSGIVLGVVVLIVFFPPFWALAPCGH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc09G22890.1Clc09G22890.1mRNA