Clc09G21870 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc09G21870
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr09: 35258411 .. 35263115 (-)
RNA-Seq ExpressionClc09G21870
SyntenyClc09G21870
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGGTTTATTTATTTGGTGTCAAAGGATTAGAGATATCCACAGGGCGGGACAGGGATGAGGAAGCCTTCCTTGTCCCCATCCCCGCCCCCTTATTCCATTCCCCTTCCTCGCGAATTTGCCCATGGGGAACAGGGCGGGGATTGCGTGGGGATCAGATTCCCAGCGGGGAAAAATCATCGCCTTGGTTTTTTTAACATTTTTATTTCGGAGAAATTTAACAATTTTTTTAGTTCAATTAATTATATATATTTTTAACAATTCTTTAATGGAAGGATATCCTTTACAATTTTTATTCAAATAAAACATATTAATTTTCCTAATAAAAACAATAATACATATGCAATTTGAAAAAGATATAATTAAAATGCTAAATTTCCATAATTTATAAAAATTAGAATTTAACAATTAGAACATCCTATCTTAAATATTAAAACATCTAAGCAATTAAAGTAAATAAAGTCTTAAACTTACATAATTATATAACATCCATAATTATCTAACAAAGTTTTCATATATATATATATATAAAATTATAAATAAATAAAATCCGGGGAGGGGTAGGGCCGAGGCCGAGAAATATAATCCCTGTCCCCGACCCTGATTTGTAAATGGGAAAAAATCACCACTCCCTCCCCCATTCTCCATGTATTCGGGGATTCCTCGCCCCGTTCGGGGCTAGTCCCCTTGAGGCCCTGGTCTTGTTGGTGAAATGAACATCTCTACAAAGGATGTAATTTTGTAGTTTTGTTTGCTTATTTCCTAAAGAAAAAATGAAGTACTGATGTTTGGTAAATTTCAACTTTATATCTAAAAAATTATACTAGTGTGTGGTAAATTGATTACTAAATTATTGTGGTTCCAATACATAAACTAAAATAGACATACTATGCCATATTGAGTTTAATAGGTCAATATGAGCATAACTCATCTATTTTTTTTAATAATTGAGCTATGCTTATTTACTTTTGACAAAAAAAAAAAAAAAATTAGAGGTTTGAATCCTCCATCTTACATAAAAGCCAATGAATTTTTATAGGTTAAACTACAAGTTCTTGAAATTTGGAATTTATATCTTTTTGGTTATAAAGTTTTAAAAATGTTTAGTACAATGAGTTTTCAATTTTGTATTTGATAAATTTCTAACAAATTTAAATTTATTAAAAATTAATTGATCTATTGAAATAAATTTGGATTCTCAATCTAAACTTTCATTTTGTGTATGGTAGTTTGTATTTTTTTTTATAAAATAATAAAGTCTAAATTTGTAATTTTAAAAATGAATAAATTAAATATATATAGATTTCAAAGTTGAGGGACTTAATTTTTTAGCAAATTAATATAAATAAAAATAATATTAAATTATTTACAAATATAAAAAATTTTCAGTCCATCAATGATAAACTTCTATAGCTTGTCTATCACCGAAGTCATGTACGTCTATCACTTACTATATTTGTATATTTATAAATAATTTGGTTCATTTTACAATATTTGAAAACAACTCTAATTTTTTTAAAAAAACTATCTGTTAAATAATCTCAAATAAAAAGCCTAAACCAGTGAGAAACTCGAAGTAATCTTATTTTCTGCTCGAGTGGAGAGACGACATGTCGACTTTGGCTGTACTGTACTGCATCGTAAAATCATGAAGCGGAGTCGACAAATCGACGCAGATTGTGAGGTAGCTGGGCGCAAAATTCTCTGGTTGGTAGAACTTAGAAATTAGAAGGAAGAGAGTTCAAAATCTCAGTTGGTTTAGGGTTAGGGTTTTTGGGGATATGGAGGTCAAGAATCTTCTCAAGGACAAGAAATTCTGGTTCGCCTCATTCCTTATTGCTTGGGCCGCAGGTCTCCAGGTGCAATTCCCTGTTTTCGGTTTTAATTTTCTACTTCACCGCCTTTCTTTTTCCATTCCTACTGTCTGTTCTTATATTGAAGTTGAAAATTGTTGAACTGATACTTCATGTTTTGGGATTGATTTTGAAACTCTTAAATTCACCCAATCATACTGATTTTGATGGTATGAAAATCAGATTTAAAAGTGTGAAACCAAACATAATAGATCACTTATAAGCAATCGTTTTTGCTAAGATCACTATTTCTGATTCATTTCCAATCATGCCATTAGTTGATTTGGATTCTGGGCTCGATTTGAACTTTAAAGTTAGATGTGGGGGAATTTCTGGTACAGGGTCATATGATGTATTTGCAGAAGCAGGATTCTTTCAAGCAGAAGTTTGGGACTCCCAATCAAGAAAGTGATACTGAAAAATGAGGCACAATTTCCATATCACTGCCCTGTAAGTTCTATTGCAATTAAAGGGGCTGCATTGGTGGGGTTAATTCCTCAAAATGAAAATTTTTGGCTGGTTCCATATGTGTAAACTTACTAAGCAAGATTTCCTGGAAATGCAATAACCTCTGGTCATTTTGATCTCTATGAATGAGAACATTTGGTTATCTTTCGTCAGTGGCTTTATTAATTAGGCTGTTTTGTGGAACATACAATCCGATATTGATGGCAGTTGTTGAATGATCCTTAATGCTAGCTTGTCTGGATTATCAGAAAATTAGCAATTAAGTTTTTGTGTGTAATCAACGATGATAGCAATTGTAGCAACTGCAGGTATTTGGTGCTATAAGTCAATGATTGCGTCTGTTGGCAAATCACAAGCTCACTTTAGCTACATGGGTCCATTATTCTTCAAGGGGTTGAAAATCCAGGCTTCATTAACATCTTCCAGAGTTGCTATTATAATGTGTGAGAGATTAGAGGCAGGGTAAAGATACCAATTCATTCGCTTCTTCCAAACTACTTTAATTCAGCTTTGCTTATACCTGACTTGCATAGTTTTCCCGCTGTTATTTTGGACCACATTTACACTTCAATGAGTTTCTAATGCAGAATGTCTACTGATTTCTGCATTACACAGTCCCTGACTATAGAACAAAGTTCATGTCCTTGTTTTAGTTACAGATTTGTGCTGAAAGTATCCTAATTAGAGTCTTCTTGTAGTCAGAATTAGCTGGCATATGAGTGAACTTTTGGGATTTAGGTCAAATACATTATCGATGAAGAATCAGGAGTTGTCCATTTCAGAATAGATGGACCCTGGGTCTACCTTACAATTTGACTCATTTATAGACTAGCATAATAGATATCCTTTCCCCCAAAGAAAACATAAGCAGAGAGAATCGGCTGCATGGATCATCTCCTAACCCCATCATATGGTTGTATAAAAGTTTTGGTGATTGGTCTTTGTTGCTCACATCAAACAGAATCATCCACTGTTTTTATCCTAGCAAGATCAACTCCTAGTTCTTTATCTGAAGTCTTAGGTTTGTCAGTTATGGCAGTCAGTTTCTGATCTGGTGGGGCCATCTTCTCACTATCTGATTTGTATAGAGCGTGATCCTTGATTTTACCCCACAGAACCAAATAAAGGCCTGTAATAATTACAGCTGCTCCAATAACCCTGCAAAATATTTAGTCTCATTTAGAAATTAGACCATTGTCACAAAACTGTCTCTCTCTCTCTCTCTGTAAGGCTACTCTCACCAGAATTCTGCATTCGTAGGCAGTGGAATAGACAGGTTAATTACCTTCCAAAGTATAATATCTCGGATAATGCGAATGAACTAATGATTGCAACAATAATCATGCTCAGGGGACTAAATGTACTTGCAAAAACTGGCCCTTTCCTTTTCATTACTGCTGCTTGGATAGTATATGAAACCCCTGAAGACATGATTCCCTACAATAAACACCACCTATAGTTTTGAGTTTCTACTCGGAAACAGAAAAAATATGAACTGCATTAAAATTTTTGAAACTGGGTTATGTTTCAATTGATGATTTCTTACACTATACAAAGGAGCTAAGAGGGTTGAATCTAAATGTAATGACCAGGCCGCAGGTTTGTGCCCTTCCATTGCGAAAGCTATTACTGAGGCTTGTATGGCGCCGGTGAAGCATATCAAAGCTGTTAAGGAGAGTTGTGCTGGGTATACTTTTACTGTAATTGCCTGGAAGATGAAGGAAATAAGAAATCAAGAGTCATTTGATAATGTTTTAATATTTTGTTTCTCTATTTCTGTTTATTGTTATTCTTTATCTCTTTGGAGAAGAAACAAGTCATGTGTGTAACTAGTTTCTTGTCAACCCTTTTGATTTGATAAATTATCATATCTCTTCGTGTTATGTCCAATCGAGTCATCACTAGTATATGCAGTTCAATGGATCGAAAATCATGGAAGATGGATTTACCTGAAGAACATTGAAAACAGACCAAAGAATACAACCAATAGTGATCATGAGAGAACCCTTGAGAAGATCTTGCTGGTTAGTTGCAGCTGCAGAATGGTCATGGAGGTTGTGATTTGTCCATGGCAGATTCAAGATTGGTCCTCTTACCAGAGTCATTATCATCGCCCCTCCCACTGCCACCACTGTTCCTAATATCTTCGCCTGGCTCGACACCTGCCTTACGTCAACCTTCTCAAGCCTAAACAGAGAAGAAAATATTGCGTTAAAACACGCTCGCGAGCGAGTTCAGATATTAATTTGTTTTTGTTGAATTCATTACGTGAACTATTGATATCAATCGAAGGGAAAGTTTTGAATTCATGGGACTTTAATGTCATAATCAAGCTACAACTTAAAGTTGATTGGTTAGAATATATTTAGTCATTTGTTATACTTTT

mRNA sequence

ATGGTTTATTTATTTGGTGTCAAAGGATTAGAGATATCCACAGGGCGGGACAGGGATGAGGAAGCCTTCCTTGTCCCCATCCCCGCCCCCTTATTCCATTCCCCTTCCTCGCGAATTTGCCCATGGGGAACAGGGCGGGGATTGCGTGGGGATCAGATTCCCAGCGGGGAAAAATCATCGCCTTGTGAGAAACTCGAAGTAATCTTATTTTCTGCTCGAGTGGAGAGACGACATGTCGACTTTGGCTGTACTGTACTGCATCGTAAAATCATGAAGCGGAGTCGACAAATCGACGCAGATTGTGAGGTAGCTGGGCGCAAAATTCTCTGGTTGGTAGAACTTAGAAATTAGAAGGAAGAGAGTTCAAAATCTCAGTTGGTTTAGGGTTAGGGTTTTTGGGGATATGGAGGTCAAGAATCTTCTCAAGGACAAGAAATTCTGGTTCGCCTCATTCCTTATTGCTTGGGCCGCAGGTCTCCAGGGTCATATGATGTATTTGCAGAAGCAGGATTCTTTCAAGCAGAAGTTTGGGACTCCCAATCAAGAAAGTGATACTGAAAAATGAGGCACAATTTCCATATCACTGCCCTGCCGCAGGTTTGTGCCCTTCCATTGCGAAAGCTATTACTGAGGCTTGTATGGCGCCGGTGAAGCATATCAAAGCTGTTAAGGAGAGTTGTGCTGGGTATACTTTTACTGTAATTGCCTGGAAGATGAAGGAAATAAGAAATCAAGAGTCATTTGATAATGTTTTAATATTTTGTTTCTCTATTTCTGTTTATTGTTATTCTTTATCTCTTTGGAGAAGAAACAAGTCATGTGTGTAACTAGTTTCTTGTCAACCCTTTTGATTTGATAAATTATCATATCTCTTCGTGTTATGTCCAATCGAGTCATCACTAGTATATGCAGTTCAATGGATCGAAAATCATGGAAGATGGATTTACCTGAAGAACATTGAAAACAGACCAAAGAATACAACCAATAGTGATCATGAGAGAACCCTTGAGAAGATCTTGCTGGTTAGTTGCAGCTGCAGAATGGTCATGGAGGTTGTGATTTGTCCATGGCAGATTCAAGATTGGTCCTCTTACCAGAGTCATTATCATCGCCCCTCCCACTGCCACCACTGTTCCTAATATCTTCGCCTGGCTCGACACCTGCCTTACGTCAACCTTCTCAAGCCTAAACAGAGAAGAAAATATTGCGTTAAAACACGCTCGCGAGCGAGTTCAGATATTAATTTGTTTTTGTTGAATTCATTACGTGAACTATTGATATCAATCGAAGGGAAAGTTTTGAATTCATGGGACTTTAATGTCATAATCAAGCTACAACTTAAAGTTGATTGGTTAGAATATATTTAGTCATTTGTTATACTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGGTTTATTTATTTGGTGTCAAAGGATTAGAGATATCCACAGGGCGGGACAGGGATGAGGAAGCCTTCCTTGTCCCCATCCCCGCCCCCTTATTCCATTCCCCTTCCTCGCGAATTTGCCCATGGGGAACAGGGCGGGGATTGCGTGGGGATCAGATTCCCAGCGGGGAAAAATCATCGCCTTGTGAGAAACTCGAAGTAATCTTATTTTCTGCTCGAGTGGAGAGACGACATGTCGACTTTGGCTGTACTGTACTGCATCGTAAAATCATGAAGCGGAGTCGACAAATCGACGCAGATTGTGAGGTAGCTGGGCGCAAAATTCTCTGGTTGGTAGAACTTAGAAATTAG

Protein sequence

MVYLFGVKGLEISTGRDRDEEAFLVPIPAPLFHSPSSRICPWGTGRGLRGDQIPSGEKSSPCEKLEVILFSARVERRHVDFGCTVLHRKIMKRSRQIDADCEVAGRKILWLVELRN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Clc09G21870 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Clc09G21870 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Clc09G21870 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Clc09G21870 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc09G21870.1Clc09G21870.1mRNA