Clc09G17550 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc09G17550
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr09: 28822272 .. 28825051 (-)
RNA-Seq ExpressionClc09G17550
SyntenyClc09G17550
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGACCTATGCATCCAACCCTAGGTATGGTGAAGTTTCTCCTTCAACTTTCCACCATGTGTTTAACCTTCCTTCCCAAGACCTAGGTTTCCTTCCAACACTCAACACTTAACCAATTTCCTCCTAAAATGGTCACCATGCGTCCACATTCACCAACCATGCGTCCAACACGGTGGTTCTTCTCCCAAGTATATGTCCAACTCACAACTAGCTCCTAACTATGCTTCCAACTCTTCCTTCTTTAACACTTAGTGAGATTTCCTCTCTTTTCTCCAAGCTATGAGTCCAAGCCTTGCCTTCTCATAACATACAACTTAGAAGATTTCCTTAGCTCATAAGCCACCTTTATCTTAATTGAATCTTTAGGAAGCAATCTTTTCTTTTACGTACTTAAACCCTAATTACTAATTTCTTGAAACTAGGTGATTAAAAAAAACATTAAAAACCTTCATCAACAATCTCTACCTACAACTACTTTCTGTGTTTTCAAACATTACAAAAATTTCCACCTTCCATGACTCTTATACAGTAGCAAAAATAGAGGAGAAAGAGAAAAAACAGTCATTAAAGCCAAAATCATGCATCTTTTGCGGGAAAGTTTTGGGGGGTAAAAGATGTGAATTTTCAGATTTTTTCGACTATGTTGACATTTTTTTTGTGTCACCAAATTATGACTGAAATTAACAGTCATTAAAAAGTGACAGTTTCTAATAGTCATTAATATTCTTTAATATTTCAATTTTTTTTTACTATTTTTTTGTATCATCAATCTATGACTCGTATTAATTATCATTAATAAGCATTAAAACATAAAAAACTAGTTATAGTGTTAGATAAATTGAGGGCATGTTTGGATTGACTAGAGAAAGAAAATGTTTTTCAAAAAACTTGTTGGGAATGACTCACATCACCTTTGTCTCACATTGGAAAATTAAGGAATGGTGAGAGGTTATATAATACGAGCACTTCTAGCACTTGTAAAACTGGAGAGATTAGGAGTGAAGAGTCTTTTTCCTCCGTGATTGTGGTTGTTGTTTGTGGGTGAGCAAAAAAAAAATTTACTTAAATGATGTTATTTTTTTTTTTTAAAAAAGGTTAAATGACGTCATTTTGAGCTTTATTATGATATCTGCTTTTAAACATTTTGGGCTATTACTTAAAATGATCATTTTTTTCTAAAGGTTAAACGACGTCATTTTGAGCTTTATTATGATATCTGCTTTTAAACATTTTGGTGTTTGGGTTATTTTTTACTTTATTGGTTATTGAAATGTTTTTTTTAATGGAGTACAATTTGGTGGAAAAAGATGGTAAATTTCGAATTTTTGTCTATTTTGACATTTTTTTGTGTCAACAATTTATGACTAAAATTAACAATCATTAAAGAACGACAATTTTTTAGAGTCAATAAGAGATAATAACACTACAAGAATTTTGTCTCTGCCGACATTCTTTTTTGCCAACGCAACAAAAAATGTCAGCAAAGCTAATTTCTAAATTCATTTTCGAACCAATTTGAGGTTTAAATTTATTCAAATACTAACCAGCAAAGTTTCGACTTGTGTTGGGTAAGAATAAGTGGTATAACACTCTAAATTCATTTTCGAACCAATTTGAGGTTATTTAGATTTGTCTCTGATGCTTGGAAGCTCTTATTTGTAGGTTTTAAGTAGTTTTAGAACTATTTGGGCACTTTTCAATAAGTACCCAAGTTCTTGATGAGTTTTAAGTGTTAGAACCCAAAGTGTTAATTTAATTTACATTGTTAGCGATAAAATATTTGAAAATTAGATTCTATTTTAATTGAATTTAAGTATTAAACAATTTTAAAGTTTTAAATTAAATTAGGAGGGAGAAATTTTGGATTTTAGGTAGATAAAAGTTAAGAATTGGAGAGGGAGAAGGAAAATAAGAAAAGAGAAGAAAAAAAAATTTAAGCCCCTCATCTTTAGAGGTTAAGCTTAGAAGTTTAACCTAATTAAAACAAAGAAAAAGAAATCTCTATTCAAGTAGATTTTTTCTTCTCAAATTGTTGTGAATTAATTTGAGTCTTATTCTCTGTTTGCTATTAGATTTTTGTTTTTTATACTTAGATTTTTTTTAAAAAACTATTTTTAAATTAAAATGTCTTTAAATCACTTTTAATACATTAATTTTAGATTAATTAGTCTTTTTAGGATTGATTGAAAATTTTGAAAAAAGGAGGGAAGTTGAAATTTAAGTGAAATTACATCTTTCCTACTTTTTTTTAATTTTTATTTTTTATTTTACATATTTCTACTTAATTAAAGGAAAATATCAATACATTTTAGCTCTAATTTCTATCTCTTCCCTTTAAAATCTCTTATTAATCCTCAAGTTTAATATTTCCTTTTTTTTAAAAAAAAATTAAGTAAAGAGAAAAGGAGTTGAGCCCTACCCACCTTCACTTTTACCCAAATTTTATTTCTCCCATTTTTTTCTCTTTTCATTTTATTTCTATCTCTCCACACAAAATCACGCACGATTTTTCCCTCCACACAGAAGAACGCTCGACGCCGCACGAGAATCACACTCCTGTTCGCGGACTGCCGCTCCTGCTGCCATCAAGCACCGCTCCTGCTCGCCGTCAGTTGCTGCTCCCTACTTGTAAGCATTTCTTAGGGCTTCGTCTTCGGATAATTTCGCTTGAGCAGCACCGTAAGTGATATCGTCCTTGCTCTTCACCATTTTCAATTAGCTTCTTTCAAGCACAATCTCTCTATCTCTCTTGTGATTAATTTTGCAGAAGATATAGATTAG

mRNA sequence

ATGACCTATGCATCCAACCCTAGGTATGGTGAAGTTTCTCCTTCAACTTTCCACCATGTGTTTAACCTTCCTTCCCAAGACCTAGAAGAACGCTCGACGCCGCACGAGAATCACACTCCTGTTCGCGGACTGCCGCTCCTGCTGCCATCAAGCACCGCTCCTGCTCGCCGTCAGTTGCTGCTCCCTACTTGTAAGCATTTCTTAGGGCTTCGTCTTCGGATAATTTCGCTTGAGCAGCACCAAGATATAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACCTATGCATCCAACCCTAGGTATGGTGAAGTTTCTCCTTCAACTTTCCACCATGTGTTTAACCTTCCTTCCCAAGACCTAGAAGAACGCTCGACGCCGCACGAGAATCACACTCCTGTTCGCGGACTGCCGCTCCTGCTGCCATCAAGCACCGCTCCTGCTCGCCGTCAGTTGCTGCTCCCTACTTGTAAGCATTTCTTAGGGCTTCGTCTTCGGATAATTTCGCTTGAGCAGCACCAAGATATAGATTAG

Protein sequence

MTYASNPRYGEVSPSTFHHVFNLPSQDLEERSTPHENHTPVRGLPLLLPSSTAPARRQLLLPTCKHFLGLRLRIISLEQHQDID
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 21..48

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc09G17550.1Clc09G17550.1mRNA