Clc09G13530 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc09G13530
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr09: 14288429 .. 14295815 (-)
RNA-Seq ExpressionClc09G13530
SyntenyClc09G13530
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACACCCAAAAAGAAAATCTTCATCACCAGTCAAGAAAATGAAGTGTGGAAGCTTAAAAGATCTCCTTATGGTCTTAAGCAAGCTCCCAAACAATGGTATGAAAAATTTAATAATACGTTAGTAAACAAAGATTTCAAGGTGAATTCCTTTGATACCTATGTTTACTCAAAATTGTTTGGAATTTAATGTGTGATTATATGTTTGTACATTGATGATATGCTTTGGAACAAACATAGATGTAATCAATAATACTAAGTTACTATTATTGTCACATTTTGAAATGAAAGATTTAGGAGAAGTTGGTGTAATACTTGGTGTTAAGATAAGAAAAACTGAGAATGAGTTCTTTCTGTGTCAATCACACTACATAGAAAAATTGTTAAAGAGATTTGATTGCTTTGATGACGCTCCTGTAAGAACACCTTATGATGCTAGTATGAGCCTTAAGAAAAATAAAGGAGATAGTGTCTCTCAGCCTAAATATGCAAAGATTATAGGAAGTGTTATGTTTTTAATGAACTATACTAGACTTGATAGAGTAGAATGAGTAGATTTACACATAACCCTAATAAAGATCACTAGATTGCAGTTCGTCATTTGTTAAGGTAGCTTAAAGGTACAATAGGTTATTGTTTGCATTCCAATAAATTTCCTGTTGTATTAGAAGGGCATTGTGATGCTAACTAGATAAGGAACAACGACGAAGTAAGCTCCATTAGTGGTATGTGTTCTTACTAGGAGGACGAGCCATATCATGGAAGTCTGCAAAACAGACTTGTATAGCTAGGTCCACCATAGTGTCAGAGTTTATTGTTCTAGAATTGGCAGGATAAGAGGCTGAGTGGTTTAGAAGCCTACTAAGAGATGTACCATTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAGCATTAGTACCGGTCTCTTTACACTGTGACTCACAAGCTACCATAGGAATTGCCAAAAATAGTGTATATAATGGGAAAAGGAGACATATAAGTCTCAGACATGGAACTATGAAACAGTTGGTGAAAGATGGCATTATCACCTTAGAGTTTGTGAGGTCGGAGACGAACTTGGGGGATCTTCTAACCAAAGGTCTAACAAGGAGAATAATTCAAGAATCTCCATTGTGCATGAGACTTAAACCCATAAAAACTCCATAGCCCTTCCTTTGGATGGTTCTAATACAGACTTGATGGAGATAACTAAAACCTTAAAGTTCCTTAGCTCTTTCTTTGGGTGGTTCTGATATGGACTTGATGGATAGTTGCAAAATCTTCATAGCTCAGTTTTGAGTGGTTTGACTTTTGACAGATTTGATGGAGTTAGTCCAGGTGTGGAATAGATGTGAAGTCTTCATGGCTCAGTTTTTGAATGGTCTATTGCTATAGACTTGATGAAGCAATAACTATGAATGTGAAAGTGTGACTACCTTCTATGAAAGAGTTTAAGGTCTCTTTCTAGAGCTTTCACGGTAACCTGAGGTTTAAAGTCTCTTTCAAGGTTTTTCTACTTTCTTCAAAAAGAGGTTTCTTGTATCTCTATAATACACACATAAACCCTAGCCGTTTATTCTCTTTGTTCTTTACGTTTCTAAGTTGCTTTTCTGACTGATTTCAATCCTTCCTCCGACGCGTGCACGTCTAAGTCCAGGTGTTATGCGAACCTTGGGGAGCAACCAACTTCTTGCGATATAGCACAGAGGTCACGCTGTTCTTGCTTTCATGGCAGTGGGCTTATCCACGCATAACAATCTTCATTTAGTTTTACATATATCCAATTTTTTAGTAAAAAAATATGTAATCAATTGACGGGGAATTTGAACAGTATGTGTCTTAATTAGTTGAAAAATACTTGAATTTATAGTTAAATTCTGAATTATTATTCCTTAGTCCAAGTTGTGAACTAATCCATTAGTTTTTATTAGGGTAATATATATATATATATATATATATATATATATATTTGTCTGTGTGCTTTGACTTTGAATTATTTTAGTCCCTATATATAGTTTCAATAGATTCATTTTGACTTTAACTTTCGTTGATTTTGGTTCCTATAATTAAAATGTTTATTTTAGTTCTTGTAATTTTAAAAGTAACCATTTTAGTTTATTCATTTTCATTTTCATTTCATTTCATTTTTAAGGGACCAAAATTGCCACTTAAGTTCAAGGACCAAATTGAACCAAAATTAAATATACAAGAACTAAAATGAACCAAATCGAAAGTAGAAAGACTAAAGTTGTATTTAAACCATATTATTATAAATGTTGACTACAGGGCTATTAATAGTCCTAAAGATGAGATTCAGCAGACCAAATCTAACCCTAGTTGAAACCAAAGATAAGTGAAAAGTAAAAAAAATGTGAATCTTCACAAACATTGCTTGCTTGGAGTCACTTAACTAAAATACATAAAACAAATAAACTGACCTCAAAGTAAAATCTTGTTTTCTTCTATAAAATAAGCGAAAAATATAAAATAATTTTAAATCTTATTTTTATGAATCAAGCTTGACTCGTCTTACATGTTGGGGGAATTCCATCTCCCTCTCCTGGATCTATCTCTAGCTAAACTCACCAAAGATTAGATTAGCCCAAACTCATGTAGTGTAATTTTAAAATATGATAAGCAAACTATTAATTTTTATTCAATCTTCTTTTCAATTTAACATTACGTAGAGTGAAAGACTCAAAATTTTCATTGATCAAAGACACACGTTCTATGTCAATTGAGTTTTGTCATGTTTGGACACTCCCTATCCATTCCATTCTCATTGCATTGATATTGAACTGTGGGAAGGCCCAAAAATGGGCCCAATTTTGTAGCAAGGCCCATTAATAGGTGCATAATCAAACTACCAAAGTCCAAGTAAATTAGGGTTTGATTTGTGTTTGAAATAAATAAATAAATGAAATAAACTATTATTATATTATGCATTTTAACCCTTTTATAGGAAACCCAGCTGCGGGGAAGGAGAAAAAAACACCCACGCCGTATTCCTCTCTTTCTTAAACCCTCTCTGTTTCGTTTTCTTATCCAGCCGTTGCAAGCGGCCGCTCCATTCGTCTGCCGCCTTAGTCCGCGCCACGACCAGCGCCGCCGCCGTCGACTGTGAGGTGCCGCCGCTGCTTGTGTTTCGCCGACGGTAATAGATTCGGCTTTGGGTTTTTGGGTTTCTCCCTCTCTTCCTCTCCCGTTTTCTCACTCTCTTTTTTGGGCTCTTGGGCTTTATTTTTTGTTGCTGCATTTTCATTGTGCACTGGTCCTTCCTGCGTTTTCATGGAGAATTTCTTTGCGCGGCCCTTAAGATCGCCTTCCTCAGTGTGAAATGGAAGCGTTTCGAGTCATAGCTGCGTTACAGCGAATACTTTTTTCGGAGAATTCCATTTGGGTTTTCCTTCTGGAATTCTCTCCATTTCCCACTGGGACTTGTTCTTGAGGCATTTGTTCTCCGTATTTGGACCTCCTACTACTTGTTATCTGAAACCCTAACGTCTTGGCTTTTTGCTGTTTCGTTAGATAAGTTTAAGGTATTTGGAGTTTCAGATCCGTATGGGTATTGTCTATGTCTCACTGTAAGGTGGATTACATTTCATATTCGATTCTGGTCTTCTTTGTATTTAGCTTTATTATTGTTTTCGTTTTTTTTTCCTATTTCGAACATGTGAAAAGATGGTTCATTAGTTCATGGCGAGCATGATGATTCAATTAGATGTATGAAAGGATTAGTCCTTCCTGAACTAAGCTTTTTGAGGCATTTTTATTTGTCTGACTTGCCAGAGTTTTTAACTAAATAACCTCTTACGAAATCATTTTTCAATTGGAATGGTTGTTGTTGATGAGCTTATGCGGTGACTGAAATGAGCCAGCTAGTATCCTAAATGCCTTGGAATGAGTTTTTTCCTCTAACTATTTAGAGGATATTTCTAGATCAGATTATTAGAATTGTTACTGTTGATATAGGTTCCTTTCAGTTACTTGTATTGGAAATCTTTATAATCAAGCTATTCATCTAGGATTTAATAGGTTGTGATTTGAACTTTGTTCCCTTTGGTTGTTTTCACATATTTTAAATTTTGTACATCGCTATCGAGTTTCTGATTCACTATGTCTTGTTCATTTTGTCATGTGTTTAGAATTTGTGAATTCATAATTTCGAAATTGGGTGATTTAAGTATTTGGTTGGGTTTTCTAATTTTTGATAAAATGATTTGCTTATCTTACTTGAAATAATCACATTGCCTTTTGCCTATGATGGTGTTAAATATACTTTGAGATTAATTTCTGTGAAAAGAATTTACTCTGAGGCATCATGGCTCTTGTTCTTTGTTGTCTGTTTGATATACGAGTTTTCTTCTGTTTTTAGTGGTTATGTGCCTTGCCTTTGTATTTACATTTGGTTATTCACACATTGGCTTTGTAGTTTTTTATTCTCTAATTTCATTATATCAACGAGATTTTTAGTATTGTGCAAGTGATGATAAAATAGACAGGGACATCAGCACTCTGTAAGAGGATGATGATTTGTCGTTGGGAATCTCTCTGATGCACTTGATCATTATTTATTTATTTATTTTATTTGGTCAGTGATGCATATTTATGCACGTATTCTCAGAGAAGAGATGATATACTGATGATTGTCACTACCTCTGAGGCCAAAGTTTCTCTTTTCACAAATTTGTTTTGTTCTTCAGTTAGTATTCTGTTAGTGTGCGTGGGCATGTAATTGTGGAGTCTAATTGTTTAGAGGTTGTACTTCTGTTAAACCAAAAGACAGATCTTATTGAGGTGGCATTTGTTGTTGAAGACGTCAGATCTTTGGCTATAAATTGTGGGGAGGTTTCCTTCACTCTCACTTGTGTCGTTTTAATGGATTATCACATTCCCTTACTCATAAGTCTATGGAGATTTGCAGGTTTTCCAAATTCCTCCCCGAGTGATTACGTTGAATGATGTGGAATTTGGAACTCTGCTGTGTTCATGTTATCCTTAAAAGAGTGTCCTTTATTTTGGATATTTGTTGTGGCAGCTCAAGGAATTTGGTATTAATGCTGGTGTGTTGAGGTCTGCCTTGTCGACGATGAGCATAAGGTTTTTCCTCTTGTGGACGGAGCATAACGTGGGTGATCGTTTCGTCTTTCAATGAATATTATTTAAGATTCTATGTTTTTTAAATCCATTTTACTTTTGTTGAATTAAAAATGTATTTCTCGAGGAAGAATTATAATATATATCATATATTACACTATAATTTGAATGATATAGTAAAATATTAATTGTATGAGATGAGTTCATATGCTAATTAATGGTTGAATTAGGATTAGTTTTATGGTTTAATAATACACTTAAAATCCATTTCAGGCTGTTCAATATGTTGATGTTTAGAACATATCATGCGACAAAGACTATGATATAAAGGGTTAAGGGGGAAGAGAATGAGTTTAATATATGGTGGTCATGTAATTTACTAAATGTGTTTTCCTATCTAAATATTGTAAGGTAGGCAAGTTGTCGAGGAATAAAAAAATGGTAAAAAATGTGCTTTTCAGGTTTATCAAAAGTTTCAAATTGCAATATGAAATTGCAAAATGGAATGTTGATTGGACCATTGGGTATTTGATGGAAATGAGATGGAATATTAATTCTTCCTCTTCAGCTGGAAGAAACAAGAAGATTCTTTAGAGGATGAATAAAAAAAATGATATATTTCAGACTTGGAAAAAGTCGGTTGTTTTGTTCAACTACCGATGGAGGGTGGACTTTGTAGCTCCATTCAAGAAGTGTATGGAGAATCTTCAACATAGCCCAAAAAAATGTTGGTGTTTTTGAGGCTCTTTCACCTGTCTAATTCATCTTCTCTAAATAGGTGGAAATAGGGGGTGCTGATTCAAACTAAATTGAAAATCAAAATAAAAAACAAATCATATGCCAAACTGAAATAAAAAGAAAAGAAACATTTGTGCTTTGCTACATGGTCTCGCTAAGAGAGAAAAGAGTGTGAGCTGTACAAAACTAGATCAATTAGAGAATTTTACATGATAGTAAAAGAAAATTCACTTAGTTGATCTTTTTTTGGTGAGTAGTTGCTCTTCACGTATATGCTTGTGTATTCCAATTTTTGTAGTGTTTGTTTGATTTCTAAATTATTTTTGAACTTCTTCCCAACATGTGGTATAGGAGCAACTACGATTTGTATTGGAAATAGTGTTTGTTTGTAGATCTGCTAGAATTGAGTGAATGTGTCAACTTTTATAGTCTCTAAAGTTTTATGTGAAGAAATTTGAAAGAATGATCAATTCAACTTGTGGCATGTGCGAGTCAATGATGTGATGATACAATTGGAGATACACAAGGTCTCCATAGAAACACCAAGCAATGATGTTTTTGAAGAGTTAAGCAGTGTAAGTGGTTTAGGGGGTTCATGAGTGATTCAGTAGAGGTTTCGATATCAAAACCGTAGCAATTGAAATTAGGAACCCTTTTCGTGTGTTTAAACTCCTAATTATGAATCACTAAAACTCCCAAAATCAATTAACACAATTCCAAGGGAGAGTTAGAAAATTAACGAGAGGTTTGGTGATCTCAAAGGCAAACAGTGAAGTATAGAAGTAAACTTAAAAAGATAACACACAAAGTTTGGTGACCTAGTTAGCGATATACCACCAATGACTAAGGGTAGTGTGCCAAGGAAAAATATACTAATATGAAGTCAAACAATTACAACTTTGTACTTTTATGTAAATAAGCATTAAATGCAGTGACATACAAGAGCTTAACTTGATGAATGAACACTTAGGCTCCATGTTAAAGAAACTTAAGTTTTCCTAAGTACATGCATGTAAGCAATCACTTAGGTCACTCCTAAATGTGGGACTCCCTTTTAACCACAATCTTTCCACTTTCAATTGGAGGCTACTCTTATTTATGCCAAATTTTGGCCAAGGGAAAACACAACCTTCACGTGACAACAATAGTGAATTTGTAATTTGGGGAGGAATGTAACCTACAAGATAAAAAAGTCTGCACACCGGTGTGGTGCTTGCCACATAGGCTCCAACGCTTAAGTTAGAAAGTGTGGATGTGTAGCAAGTTAGAGTTTCAGTAATAGAAAGGACGTCCTTCCTTTAAGGCTTTTCTCTCTTATTTATAGAATCCTTCCCATCTTTTCCTTTTCTTCTTAGGATATTCAGCGATTATCTCTTCCCTATTTTCACTTGGGCTTCCTTCTCACGTGCTGTCCCCATTCAGGGGTGTGTTGGATGGGTCGGCCTTGGCTCGAGTTGAGGCTAAGCCTCATGGCTTGGGTCAGACTCAAGTTGCATGCCTTTTCTTGATCTCGATTGATCCTAGGCCTTTCTATTTGACCCATTTTTTGCCTGACTTTTAG

mRNA sequence

ATGACACCCAAAAAGAAAATCTTCATCACCAGTCAAGAAAATGAAGTGTGGAAGCTTAAAAGATCTCCTTATGGTCTTAAGCAAGCTCCCAAACAATGCCGTTGCAAGCGGCCGCTCCATTCGTCTGCCGCCTTAGTCCGCGCCACGACCAGCGCCGCCGCCGTCGACTGTGAGGTGCCGCCGCTGCTTGTGTTTCGCCGACGCTCAAGGAATTTGGTATTAATGCTGAATCCTTCCCATCTTTTCCTTTTCTTCTTAGGATATTCAGCGATTATCTCTTCCCTATTTTCACTTGGGCTTCCTTCTCACGTGCTGTCCCCATTCAGGGGTGTGTTGGATGGGTCGGCCTTGGCTCGAGTTGAGGCTAAGCCTCATGGCTTGGGTCAGACTCAAGTTGCATGCCTTTTCTTGATCTCGATTGATCCTAGGCCTTTCTATTTGACCCATTTTTTGCCTGACTTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACACCCAAAAAGAAAATCTTCATCACCAGTCAAGAAAATGAAGTGTGGAAGCTTAAAAGATCTCCTTATGGTCTTAAGCAAGCTCCCAAACAATGCCGTTGCAAGCGGCCGCTCCATTCGTCTGCCGCCTTAGTCCGCGCCACGACCAGCGCCGCCGCCGTCGACTGTGAGGTGCCGCCGCTGCTTGTGTTTCGCCGACGCTCAAGGAATTTGGTATTAATGCTGAATCCTTCCCATCTTTTCCTTTTCTTCTTAGGATATTCAGCGATTATCTCTTCCCTATTTTCACTTGGGCTTCCTTCTCACGTGCTGTCCCCATTCAGGGGTGTGTTGGATGGGTCGGCCTTGGCTCGAGTTGAGGCTAAGCCTCATGGCTTGGGTCAGACTCAAGTTGCATGCCTTTTCTTGATCTCGATTGATCCTAGGCCTTTCTATTTGACCCATTTTTTGCCTGACTTTTAG

Protein sequence

MTPKKKIFITSQENEVWKLKRSPYGLKQAPKQCRCKRPLHSSAALVRATTSAAAVDCEVPPLLVFRRRSRNLVLMLNPSHLFLFFLGYSAIISSLFSLGLPSHVLSPFRGVLDGSALARVEAKPHGLGQTQVACLFLISIDPRPFYLTHFLPDF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc09G13530.1Clc09G13530.1mRNA