
Clc09G10750 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACAAAATTGAAAAAATATCAGTGCCACGTATGCAGTAATGTTAAGCTCTCACAGCGCTTCTAAAGATCCTTTCTTTCTCTCTCTAAACTCACAGCCATTGTAAAGATCCTCTCTTTCTCTCTACCAAAAAGAAAGAAATTAATTCGCATAAAAACAGGGGAATATACCTTCTAGAGAGAGAGAGTTACAGTTTGTGAAATTTTTGTGGGTGAAGCGAAATCGATTTAGAGGTACTTCTCTCTATTTCTACCGTTTGTTGCTGTGTATTGGTGACGATTTAGAATAGAAGTTGCGAAATCTGAATTGAAGCTTCTTGTTCTGATTTGTATTAGCTGTTGTTTCTGTTTTGAGTTGAGTTCCTTGTGTAAGAATTGTTTGCGTTGTTCATCTTTGGTTTAAGAATTGTTCATAACTTCATTTTGTTGGTTATAGTTCATTATTTGTTGGATTTACGTTATTTTTCTTTGTATTTCATCTTGTAGAGGTTTGGTTATGGCAATTGTAAATATGGGATTGTGAACTTGGTTACTTCTCAGAAACTTAAACTTGGAACATCAATAGCGGTACAAAGGGTTGGGTTTTGGTGAATTTCTTAAAGGACCTGCGGCTAGACTTTGGATATTTAATACATTTCTTGGAGCGATTTTTCTTTTTCGAGTTCGTGGCTAATCGAAATTGGTTGTTGTTTTGGGATGTTGAATTACGACATTTGGATTCTTGATTGGTAAATATGAAGATGGAGTTTGTGCATTTACCTGGTTGATGTGTTGGCAATTGAGGAGGTAGCTTTAAGGGAAATTTATAGAAAATAGATGGCAACTTCGAGTGAGAGATGGATTGATAGACTTCAATTATCCTCCTTGTTTTGGCCTCCCCCAGATGACGATCAGCAAAGAAAGGTACAGAGGCTTTCATGTTTTACATATGAATCAATTTTTGGGATGGTACATTCCCACATATTATGACATTGTTTTTCAATATAGTCCAAGTTGATTAGTCTGTTTTAATAACTCGTGAATCAGCCTGAAGTTGTATTTATCATCCTTCAGAAAGCTGCTGAGTCCTAGCTCTTAAATAATGTTCTATGTATATCATATAACGAAATGTATCTCAACTAGATAATAAATGTCGATATATGTATGTATGTGCTCAATTTGGGAGACTTAGCAAACAGAGTTTGTGTTTTATGAGGAATTTCAGTACAAGGGACTTAATATTTTTGCTTAATTTTCCTTTATGAGTATCTGCCACATGCACTACCTATTAACTTCTTTGCTTGTAATGGTTACACTTATTCAAAGAGTAGATTGTTAAAGGGGCTACCTTCTTACTATTCATGTGTTTTTTTAATTATTATTTTTTAAAAGGAAGCAAAAACTTTTCAGTGATATAATATTAAAAGCTACAAGCTACCCTGAAGGGAAAAGAAAAGCATAAAAAACATAGAAACAATACAAAACAAAATATAATGGAAATATAAAAGCGTTCCAATTAAGACAAATATCTTGAATTCATTTTGTATTAGATAGATATTACAGGCGAAGATAATATTGAAAAAGAATATGATCGCAATGAGAATGAATGAAATATTATATGAATGGCCTTAGTGCCCTTTAATGCCCTCTTTCCTCATGTAAATGCTGGGTTATGATGTGAATATCAAATGCAAAATAATTACACCTCAGTTTAATATTGTGGTATTGAACATAAGGGAATTGACCTATAACTTCTAATTGTTATGCCTAGCCAATCATCATAGGTTGACCTAGTGGTAAAAGGGAGACATAATCTTAAGACATGATTAAGAGGTCAAGGGTTCAATTCATGGTGGCCACCTACCTAGGAATTAATTTCCTACGAGTTTCCTTCTCACAGGTTGTCCCGTGAGATTAGTCGAGGTGCGTGTAAGCTGGCTCGGACACTCACGGATATCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGTTATGCCTAGCCATTGTGTTTCTTTGTAAACAACCTTTTTAGGGAAGTTAAACCTAATTATATTCTTTAGAGATTAGAAAAGTTTAGCCTTTTTTTAAATGGATTTAACATGTTTTAGTACCAAATGGGAATCAAATCAAATCTTGTTTGTTGATGGTCATCTATGAGGCCTCTTATCATGCAAACTTCATCTAGGAAGGATTAAAAAGGGATCTAGCTACTGACAGTTAGTTAGTGGGGGCAAGGGAGACTTTGCATGGTACGGAAAAGGAAGTTTGTTGGCTTTTATAGGGGAGGGAAAGGAGGTAGAAGCGTTGTGTGATTTTTTGGTTGAATTGCTTGGTAGGAGAGGTTCCCAGCTCTCTGGAATTAGCTGGTTGTTTGTGGTCTTTTCTGGTGTTTTTGTGCATAAAAAGTTAGAACCACCTTCTTTGAGCCTTATTTTTCGTTGATTATTGAAACATGAGGAAATTTCTGCCTTGCAATCGTCTTTGGAGATCCTTGCTTCTTCGAAGGTTGGTTCTTATGAAGATTCCAAACTTTGGACTCTTGGTGCATCAGGATTGTTTTCAATGAAGTCTTTGACTTGTCATTTATCCTCAGGATGTCCTATGCAAAAAGACTTATTTTGATCTATTTGAAAATCAAAGTGCTCCAAGAGAGTTAATATTTTTCTTTGGATTATGCTAAATGGAAGTCTTAACCCTTCTGATTTACTCCATAAGAAGTTGCCTTTCTTCAAGCTCATGACTTCAATTTGCCTTCTATGTTTAATGAATTGAGATTTTTTATTTCACACTTTCTTTAGATGTGACTATTTTATGAAGTGTTGGCTCAAGCTCCTATCTATTTTCAATCTCAGGTGGGTGTTCTGTAATGTCTTAGAATAATGTTCTCTGTCCTATATTGGCTACCAAATCGGAGTTCATATGAGTAAATGCAGTTAAAGTCCTTTTGTTAGAATTATAAATGGAAAGGAATCAATGTATTTTTTAGGCCAAGCATCTTCCTTAGTCCTATCGATTTGAATATGCTAGATCGAAAACTTCCTTATGGTGTTTTCTCTTCACATTTTCGATAGATTTTTCAATATTTGGATAGTAATTATAATTGGCATGCTTTTGTTGTCTTTTGTAATTTGTACTTTTGCTTTACAGTTACCATCTATGATTCTTGTATTTTTTAGCATTAGTCTCTTTTCATTATTTCAATGAAGAGTTCGGTCTCTTGTTTCAAAAAAAAAATAATAATAATAATAAATAAATAAAATTAAAAGAGATAATGGAAGGTCCTAAAAGAGACATCATCGAGATGAAAGGCATGCTGCAACACTTGGCCAGAGTCTTGAACAATTAACGACTGGAATTCTTGAGAGCAAACAATTGGAGGAGGAGAGTAATGAGCAGTGGTGACTCTCATCTTGGAATCATCTAGTGGTAAGTTTCCCTTCACTTCCATGATGACCAAGGCCTCCTTGCAAAATAGAGGTTGATGATGTGTTTATGGTCTGTAAGATTCTTGAGGAATGGGAATCGTCTCATCAAAGATGGAGGACAAAGAAGTGCAACTGTGCAACAAATTTAAGAAGGTTGTGATGCCTTTGTTTACTGGAGAGGAGTCCAACTCCTGGGTGTTTACGACGAAGAGGTACTTTGAGATTCACCATTGCCGTGGTAAGTTTTGATGACGAGGTAATGTCATGTAACAGATTTAAGTTTAAGGATTGGGATGATCTGAAAAGTCGATTGTTCGTGAGTTTTTTACTGTAAAAGTGTGGTACTGGTAGTTTATGTGCCCGACTTTTAGGCGTAAAACAAGAGGGGGCAGCGATTGAGTTCATTTAGAAGTTTGAGACCTTATTGGTGTTGTTGCTGCATCCCTATGTGCTCAACTATGAGGTCAGGGCAATCTTATCACAACAGCAGAATGTCCATAAGATTATGGTTTGTGATGAAAGAATGTTATTCATCCCACAAACGCATGTAGTAATTATGTTTCTAGAAAGTGGGGAAAGTGATGATCTTTTAGATGTTAGCAAATAAGATCTTTGTAATATGGAGACTATCGCCCACCTTTGAGCGAGGCATTTCTTCAAGCTCCTCAAGAAGTTGATTTCTTCAAGCATTTTACCTCTCGTCCTTACTCTCTAGCCATCTTGCAGTTCTCTCAAGCTTAACGACATCATCTTCTACTTCTATTAATGCCCTCATAGAGACAGGGAATACACCTGAATATCTTATTTCCTCCACTTCTAAATGGGTCATAGACTCTTCCGCTACAAATCATATAGAGGTAACCCCAATTTATTCTCTAAACTTTTCCATCTACATCTTCACCTAAGGTCACTATAGTTGATGGAACCACCACTCCTGTTTTAGGATTGGACACAATCAACCTTACTAAGTCAATTTCATGGGCCTCGATTTTAAATTTACCACAGTTTTCCTTTAATTTGCTATCCGTCAATAAACTCACTTGTGACCTTCACTGTTGTGTCTCATTCTTTCTTGGTTATGCTTATTGTTAGAGTATATATGTATAAATATAAGAGCTTATTAGTTCTTTTAGTCTTTTGTCCTTTATTGCCATTTAACTATTCTTAGTTTAAGGCTTTCATGTATGCCTATATATATTGGACTCTAATGTAGAGAATAATGAGGATTCTTCTATGGTTTGGTCTCACAATAACATGATATTAGAGCTATAGGTTTTCCTCGGGTAATTAGGGTTTTGTGAGTGATTAGGAATCCTTAGGGTTTGTGGTTTTGAACACCTTTTTTCTTTGGAGAGTTTGACCGAACATTTACTTTGAGTTTTGTGTATCACCACCCACTGGCAGAATCTGTTGCTGTCGAGGTTTGTTAGTGGAATAGTTTTTTGTTACTGCCAAATCCAAAAGGCAACCCTTATGCTGATCTACATAAATCGAAAATCCGGCTGGAAGATCATTAGCGATGGGCCACAAGCATCACCAGAAGTTTCTGTCATCAGTCCCACCATCCATCGCTTGGTTTCGTCTCAAGTTTTGATTTTTAGGCAT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MATSSERWIDRLQLSSLFWPPPDDDQQRKVQCSAYVEYLGQFTSERFSEDIAELIRSRYQSKEKRLFDDVLALFVLHHPENGHAIILPIISCIIDGTLEYNRNDPPFASFISLFCPGTENDYSEQWALACGEILRILTHYNRPIYKMERKNGETERSSNGETERSNNGSLSTTSDTDDGEFFRVPQQQERKPVRPLSPWITDILLAAPLGIRSDYFRWCSGVMGKYAAGELRPPTSASSRGSGKHPQLMPSTPRWAVANGAGVILSVCDEEVARYETATLTAAAVPALLLPPPTTALDEHLVAGLPALEPYARLFHRYYAIATPSATQRLLLGLLEAPPSWAPDALDAAVQLVELLRAAEEYATGIRLPRNWMHLHFLRAIGTAMSMRAGIAADAAAALLFRILSQPALLFPPLRQVEESDVQCESLGGYDSSYREQIEVPAAEATIDATAQGIASMLCAHGPEVEWRICTIWEAAYGLIPLSSDVVDLPDIIVATPLQPPILSWNLYIPLLKVLEYLPRGSPSEACLMKIFVATVESILQRTYPSESSREQYRKTRYFSSLGSASKNLAVTELRTMVHSLFLESCASVELASRLLFVVLTVCVSHEAQSNGSKKLKREQSNLLDERIEDLQAIPENHKGLRRKTKKQGPVSAFDSYVLAAVCALACEVQLFPFVARGSDHLNTTDLQDVIKLVKGNGTSTELQNSVGSAVCHTHRILAILEALFSLKPSSVGTSWSYSSNEIVAAAMVAAHISELFRRSKACMHALSILMRCKWDDEIYNRASSLYNLIDIHSKAVASIVNEAEPLEAHLIQVPKWKESFIGLNGKKQIRYEDSTCFHPGQSSVQKCDNSSHSETKIVFERASHSNEELGNSSEKGLASFSIDASDLANLLTTDRHIGFNCCAQVLLRSVLAEKQALCFSVISLLWHKLISAPETQPSMESTSAQQGWRQVVDALCNVVSASPAKAATAIVLQVYIS Homology
BLAST of Clc09G10750 vs. NCBI nr
Match: XP_038898097.1 (protein GIGANTEA-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1825.8 bits (4728), Expect = 0.0e+00 Identity = 931/976 (95.39%), Postives = 953/976 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. NCBI nr
Match: XP_038898094.1 (protein GIGANTEA-like isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038898096.1 protein GIGANTEA-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1810.8 bits (4689), Expect = 0.0e+00 Identity = 931/1004 (92.73%), Postives = 953/1004 (94.92%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. NCBI nr
Match: XP_011659108.1 (protein GIGANTEA isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8646179.1 hypothetical protein Csa_016390 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1796.9 bits (4653), Expect = 0.0e+00 Identity = 916/974 (94.05%), Postives = 943/974 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. NCBI nr
Match: XP_008461912.1 (PREDICTED: protein GIGANTEA-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1787.3 bits (4628), Expect = 0.0e+00 Identity = 914/974 (93.84%), Postives = 942/974 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. NCBI nr
Match: XP_022976904.1 (protein GIGANTEA-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1753.4 bits (4540), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/975 (91.90%), Postives = 933/975 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SQI2 (Protein GIGANTEA OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GI PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1364.7 bits (3531), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/975 (73.95%), Postives = 803/975 (82.36%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AWL7 (Protein GIGANTEA OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GI PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1250.0 bits (3233), Expect = 0.0e+00 Identity = 672/987 (68.09%), Postives = 777/987 (78.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CG99 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500402 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1787.3 bits (4628), Expect = 0.0e+00 Identity = 914/974 (93.84%), Postives = 942/974 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F5V5 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442632 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1753.4 bits (4540), Expect = 0.0e+00 Identity = 898/979 (91.73%), Postives = 936/979 (95.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IPZ2 (protein GIGANTEA-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477137 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1753.4 bits (4540), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/975 (91.90%), Postives = 933/975 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1INH7 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477137 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1747.3 bits (4524), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/980 (91.43%), Postives = 933/980 (95.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBN3 (protein GIGANTEA-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442632 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1746.9 bits (4523), Expect = 0.0e+00 Identity = 894/975 (91.69%), Postives = 932/975 (95.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G10750 vs. TAIR 10
Match: AT1G22770.1 (gigantea protein (GI) ) HSP 1 Score: 1364.7 bits (3531), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/975 (73.95%), Postives = 803/975 (82.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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