Clc09G10410 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview


Name	Clc09G10410
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Extensin
Location	ClcChr09: 9189874 .. 9191084 (+)
RNA-Seq Expression	Clc09G10410
Synteny	Clc09G10410

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACCTCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAAGTAAAGTATGAGTACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTATTTACCATTCTCCTCCTCCTCCAGTTTACTAGTCTCCACCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTCCGATTTATTACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCATCTCGTGTATATCCCTCTCCTCCTCCCCCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTCCCCCACCTGTTTATCACTCGCCACCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATAACTCTCCTCCTCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACAAGTCACCACCACCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCACCTATTTATCACTCTCCTCCAACTCCAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCACCACCATCAATTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCTCTACCTCCAGTTTATTATTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCACCTCCTCCAATTTATTTCTCTCTTCCACCACTTGTATACCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCGCCCAAGAAGGACTACAAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAAAATGACTACGAACACAAATCTCCACCACCTCCTCACCACTATTAGATCTATGAACTTTTTACCATTCCATTGAGGTATATGCTTCTTATAAATGCATTTCTCCTTGGTATAACCCTTTTTTTCATATAATATTCAAGAAAGTTTCTCATCTTGCATTGATATTCACCAAAATCGTATTACATTCTTGCAGAGAAACAAAGAGAATATCAACATCAAATAAAAGTGATGGGCTAATGAAGATTTTTACTACGTACAAATTATGGCCCTCTAATTATTTACTTCGTGTGATGTATGTTTCAATATTTTAG

mRNA sequence

ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACCTCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAATCTCCACCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTCCGATTTATTACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCATCTCGTGTATATCCCTCTCCTCCTCCCCCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTCCCCCACCTGTTTATCACTCGCCACCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATAACTCTCCTCCTCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACAAGTCACCACCACCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCACCTATTTATCACTCTCCTCCAACTCCAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCACCACCATCAATTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCTCTACCTCCAGTTTATTATTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCACCTCCTCCAATTTATTTCTCTCTTCCACCACTTGTATACCACTCTCCTCCACCTCCAATCTATGAACTTTTTACCATTCCATTGAGAGAAACAAAGAGAATATCAACATCAAATAAAAGTGATGGGCTAATGAAGATTTTTACTACGTACAAATTATGGCCCTCTAATTATTTACTTCGTGTGATGTATGTTTCAATATTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACCTCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAATCTCCACCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTCCGATTTATTACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCATCTCGTGTATATCCCTCTCCTCCTCCCCCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTCCCCCACCTGTTTATCACTCGCCACCACCTCCGGTTTATCACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTGTTTATAACTCTCCTCCTCCACCTGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACAAGTCACCACCACCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCACCTATTTATCACTCTCCTCCAACTCCAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCACCACCATCAATTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCTCTACCTCCAGTTTATTATTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAAGAGTATAAATCACCACCTCCTCCAATTTATTTCTCTCTTCCACCACTTGTATACCACTCTCCTCCACCTCCAATCTATGAACTTTTTACCATTCCATTGAGAGAAACAAAGAGAATATCAACATCAAATAAAAGTGATGGGCTAATGAAGATTTTTACTACGTACAAATTATGGCCCTCTAATTATTTACTTCGTGTGATGTATGTTTCAATATTTTAG

Protein sequence

MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYELFTIPLRETKRISTSNKSDGLMKIFTTYKLWPSNYLLRVMYVSIF

Homology

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr
Match: XP_038899768.1 (extensin-3-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 8.6e-82
Identity = 208/316 (65.82%), Postives = 225/316 (71.20%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-------------- 60
           MG+ RSSM YLVVAILVATLS  SVI  +YVYSSPPPPYYVYKSP+              
Sbjct: 1   MGKSRSSMTYLVVAILVATLSSTSVITADYVYSSPPPPYYVYKSPVYQSPPPPKVKYEYK 60

Query: 61  -------------------PPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPP 120
                              PP+Y SPPPP   SP PPVYHSP       PPPP+YYSPPP
Sbjct: 61  SPPPSVYYAPPPPVYHSPSPPVYHSPPPPVYHSPSPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPP 120

Query: 121 PKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSP 180
           PKKQEYKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPKKQEYKSP
Sbjct: 121 PKKQEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKQEYKSP 180

Query: 181 PPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYH-----------SPP 240
           PPPVY SPPPP+YHSPPPPVYKSPPPPVY S PPP+YHSPP PVY+           SPP
Sbjct: 181 PPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKQEYKSPP 240

Query: 241 PPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQE-----YKSPLPPVYYSP-------PPPKKQEYKSPPPP 251
           PPVY+SPPP +Y+SPPPP  +      Y SPLPPVY+SP       PPP K+EYKSPPPP
Sbjct: 241 PPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPLPPVYHSPPPPVYYSPPPPKREYKSPPPP 300

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr
Match: XP_004139745.3 (extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 304.7 bits (779), Expect = 8.9e-79
Identity = 203/322 (63.04%), Postives = 216/322 (67.08%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--------- 65
           S MAYL+  ILVATLSL SV+A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP         
Sbjct: 7   SLMAYLLATILVATLSLPSVLAAEYVYSSPPPPYYVYKSPPPPVYSSPPPPKVKYEYKSP 66

Query: 66  ------------------------------------KSPPPPVYHSP-------PPPPIY 125
                                               KSPPPPVYHSP       PPPP+Y
Sbjct: 67  PPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 126

Query: 126 YSPPPPKKQE---------------------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTP 185
           YSPPPP                         YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S P
Sbjct: 127 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 186

Query: 186 PPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PP 245
           PPVYHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS PP
Sbjct: 187 PPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP 246

Query: 246 PIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSP 254
           P+YHSPP PVY SPPPPVYHSPPP +Y+SPPPP    YKSP PPVYYSPPPPKK EYKSP
Sbjct: 247 PVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYKSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSP 306

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr
Match: XP_022976067.1 (extensin-3-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 7.5e-78
Identity = 197/282 (69.86%), Postives = 211/282 (74.82%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK--- 60
           MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIA +Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPK   
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  -------------------SPPPPVYHSPP-------PPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRV 120
                              SPPPPVYHSPP       PPP+YYSPPP  K+EYKSPP  V
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPP--KKEYKSPPPPV 120

Query: 121 YPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVY 180
           Y SPPPPVY SPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPP VY+SPPPPVY
Sbjct: 121 YYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---IYKSPPPLVYHSPPPPVY 180

Query: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYK 240
           HSPPPP+YKSPPPPVYHSPPP +Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP +YYSPPPP    YK
Sbjct: 181 HSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP---VYK 240

Query: 241 SPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           SP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPPIY
Sbjct: 241 SPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIY 271

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr
Match: KAG6592187.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 1.4e-76
Identity = 192/269 (71.38%), Postives = 208/269 (77.32%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---- 60
           MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP    
Sbjct: 1   MGESKPSMAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKKEY 60

Query: 61  KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQE-----YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPP 120
           KSPPPPVY+SP       PPPP+Y+SPPPP         Y SPP  VY SPPPPVYHSPP
Sbjct: 61  KSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP 120

Query: 121 PPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP 180
           PPVY S PPPVY+SPPPPVY SPPPP    Y SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYKSPPP
Sbjct: 121 PPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP---VYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP 180

Query: 181 PVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPP 240
           PVY+S PPP+Y SPP P+YHSPPPPVYHSPPP +YYSPPPP    YKSP PPVY+SPPPP
Sbjct: 181 PVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP---VYKSPPPPVYHSPPPP 240

Query: 241 KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
               Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPP+Y
Sbjct: 241 ---VYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY 260

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr
Match: XP_022936196.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 7.0e-76
Identity = 193/270 (71.48%), Postives = 206/270 (76.30%), Query Frame = 0


Query: 8   MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP----------- 67
           MAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP           
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 68  -KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVY 127
            KSPPPPVY+SP       PPPP+YYSPPPP    YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY 120

Query: 128 HSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 187
           HS PPP+Y SPPPPVYHSPPPP  +      Y SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPP
Sbjct: 121 HSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP 180

Query: 188 PPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPP 247
           PPVYHS PPP+Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP IY+SPPPP    Y SP PPVYYSPPP
Sbjct: 181 PPVYHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPP---VYHSPPPPVYYSPPP 240

Query: 248 PKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           P    YKSPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Sbjct: 241 P---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY 261

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 218.0 bits (554), Expect = 1.4e-55
Identity = 177/283 (62.54%), Postives = 189/283 (66.78%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP-- 65
           S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPP  
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  ----KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPP----V 125
               KSPPPPV H   PPP+Y+SPPPPKK   YKSPP  V    PPPVYHSPPPP    V
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHY-SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 122

Query: 126 YHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSP 185
           Y S PPPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSP
Sbjct: 123 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 182

Query: 186 PPPVYH-SPPPIYHSPPTP----VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP---- 245
           PPPV H SPPP+YHSPP P    VY SPPPPV H  PP +Y+SPPPPKK   YKSP    
Sbjct: 183 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 242

Query: 246 ----LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP 251
                PPVY+SPPPPKK   YKSPPPP+    PP VYHSPPPP
Sbjct: 243 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPP 284

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 4.0e-50
Identity = 165/286 (57.69%), Postives = 185/286 (64.69%), Query Frame = 0


Query: 31  VYSSPPPP--YY----VYKSPLPPIYQSPPPP----------KSP--------PPPVYHS 90
           VY SPPPP  YY    VYKSP PP+Y+SPPPP          KSP        PPPVY S
Sbjct: 70  VYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKS 129

Query: 91  PP-------PPPIYYSPPPPKKQ-----EYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPP 150
           PP       PPP+Y SPPPP K       YKSPP  V    PPPVY SPPPPV H +PPP
Sbjct: 130 PPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPP 189

Query: 151 VYHSP--------PPPVYHSPPPPKKQ-----EYKSP--------PPPVYNSPPPPVYHS 210
           VY SP        PPPVY SPPPP K       YKSP        PPPVY SPPPPV++S
Sbjct: 190 VYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVHYS 249

Query: 211 PPPPVYKSPPPPVYHSPPP-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPP-----PKKQ 253
           PPP VY SPPPPV++SPPP +YHSPP PV++SPPP VYHSPPP ++YSPPP     P   
Sbjct: 250 PPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPP 309

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 9.0e-34
Identity = 147/248 (59.27%), Postives = 160/248 (64.52%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPP-KSPPPPV-YHSPPPPPIYYSPPPPK 89
           YVYSSPPPP Y       YKSP PP +Y SPPPP  SP P V Y SPPPP +Y SPPPP 
Sbjct: 75  YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYNSPPPP- 134

Query: 90  KQEYKSPPSRV-YPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPP-VYHSPPPP-----KK 149
              Y SP  +V Y SPPPP VY SPPPP Y  +P   Y SPPPP VY SPPPP      K
Sbjct: 135 ---YYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPK 194

Query: 150 QEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPV 209
            +YKSPPPP VY+SPPPP Y   P   YKSPPPP VY SPPP Y+SP P   Y SPPPP 
Sbjct: 195 VDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPY 254

Query: 210 YHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLV 252
            +S PP  YYSP P  K +YKSP PP VY SPPPP      K +YKSPPPP  +S PP  
Sbjct: 255 VYSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPP 314

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIL9 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 7.7e-33
Identity = 139/246 (56.50%), Postives = 154/246 (62.60%), Query Frame = 0


Query: 34  SPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP---KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSR 93
           SPPPP  ++  P PP+Y  PPPP     PPPP  +SPPPPP  +SPPPP      SPP  
Sbjct: 500 SPPPPSPIHSPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPVHSPPPP----VHSPPPP 559

Query: 94  VYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPV 153
           V+ SPPPPV HSPPPPV HS PPPV HSPPPPVY  PPPP      SPPPPV+ SPPPPV
Sbjct: 560 VH-SPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVYSPPPPP----VHSPPPPVH-SPPPPV 619

Query: 154 YHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYK 213
            HSPPPPVY  PPPP  HSPPP   SPP PV HSPPPPVY SPPP +Y  PPPP     K
Sbjct: 620 -HSPPPPVYSPPPPPPVHSPPPPVFSPPPPV-HSPPPPVY-SPPPPVYSPPPPP----VK 679

Query: 214 SPLPPVYYSPP--PPK------------------KQEYKSPPPPIYFSLPPLV---YHSP 254
           SP PP  YSPP  PPK                   Q  ++PPP   F +PP +   Y SP
Sbjct: 680 SPPPPPVYSPPLLPPKMSSPPTQTPVNSPPPRTPSQTVEAPPPSEEFIIPPFIGHQYASP 725

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 4.3e-28
Identity = 134/260 (51.54%), Postives = 146/260 (56.15%), Query Frame = 0


Query: 31  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKSPPPPVYHS-------PPPPPIYYSPPPPK--- 90
           VYS PPPP      P PP+Y  PPPP  PPPP  +S       PPPPP  YSPPPP    
Sbjct: 435 VYSPPPPP-----PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPP 494

Query: 91  -KQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPP-------PVY---------HSPPPPV 150
                 SPP    P PPPPVY  PPPPVY S PP       PVY         HSPPPP 
Sbjct: 495 PPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQ 554

Query: 151 YHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPP--PPVYHSPPPPVYK--SPPPPVYHSPPPIYHSPPT 210
           + SPPPP+   Y SPPPP  + PP  PP  HSPPPP+Y   SPPPP    P P+   PPT
Sbjct: 555 F-SPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPP----PTPVSSPPPT 614

Query: 211 PVYHSPPPPVY---HSPPPSIYYSPPPPKKQEYKS--PLPPVYYSPPPPKKQEYKS--PP 250
           PVY  PPPP       PPP I YSPPPP    + S  P PPVYYS PPP    Y S  PP
Sbjct: 615 PVYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPVVHYSSPPPPPVYYSSPPPPPVYYSSPPPP 674

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IER1 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 3.6e-78
Identity = 197/282 (69.86%), Postives = 211/282 (74.82%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPK--- 60
           MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIA +Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPK   
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  -------------------SPPPPVYHSPP-------PPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRV 120
                              SPPPPVYHSPP       PPP+YYSPPP  K+EYKSPP  V
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPP--KKEYKSPPPPV 120

Query: 121 YPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVY 180
           Y SPPPPVY SPPPPVYHS PPPVYHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPP VY+SPPPPVY
Sbjct: 121 YYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---IYKSPPPLVYHSPPPPVY 180

Query: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-IYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYK 240
           HSPPPP+YKSPPPPVYHSPPP +Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP +YYSPPPP    YK
Sbjct: 181 HSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP---VYK 240

Query: 241 SPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           SP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y+S PP VY SPPPPIY
Sbjct: 241 SPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIY 271

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6U4 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 3.4e-76
Identity = 193/270 (71.48%), Postives = 206/270 (76.30%), Query Frame = 0


Query: 8   MAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP----------- 67
           MAYLV  +LVA LS  SVIAT+Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPP           
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 68  -KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVY 127
            KSPPPPVY+SP       PPPP+YYSPPPP    YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY 120

Query: 128 HSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE-----YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 187
           HS PPP+Y SPPPPVYHSPPPP  +      Y SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPP
Sbjct: 121 HSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP 180

Query: 188 PPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPP 247
           PPVYHS PPP+Y SPP PVY+SPPPPVY SPPP IY+SPPPP    Y SP PPVYYSPPP
Sbjct: 181 PPVYHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPP---VYHSPPPPVYYSPPP 240

Query: 248 PKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           P    YKSPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Sbjct: 241 P---VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY 261

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6XCN3 (Extensin OS=Thalictrum thalictroides OX=46969 GN=FRX31_002868 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 269.2 bits (687), Expect = 2.0e-68
Identity = 177/234 (75.64%), Postives = 188/234 (80.34%), Query Frame = 0


Query: 31  VYSSPPPPYY------VYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ 90
           VY SPPPP Y      VYKSP PP+Y SPPPP  KSPPPPVYHS PPPP+Y+SPPPP   
Sbjct: 153 VYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPPVYHSPPPP--- 212

Query: 91  EYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPV--YHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPP 150
            YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPV  YHSPPPPVYHSPPPP    YKSPPP
Sbjct: 213 VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVVLYHSPPPPVYHSPPPP---VYKSPPP 272

Query: 151 PVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYY 210
           PVY+SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS PPP+YHSPP PVY SPPPPVYHSPPP +Y+
Sbjct: 273 PVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH 332

Query: 211 SPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIYE 254
           SPPPP    Y SP PPVY+SPPPP    Y SPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y+
Sbjct: 333 SPPPP---VYHSPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYK 373

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7A8 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 3.8e-67
Identity = 182/265 (68.68%), Postives = 201/265 (75.85%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNY---------------VYSSPPPPYYVYKSPLPPIY 65
           SS+A LV+AILV  LS+ S IA  Y               +Y SPP P  VY SP PP+Y
Sbjct: 3   SSVASLVIAILVVALSVPSSIAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSP--VYYSPPPPVY 62

Query: 66  QSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQEYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVY 125
            SPPPP  KSPPPPVY+S PPPP+Y+SPPPP    Y SPP  +Y SPPPPVY+SPPPPVY
Sbjct: 63  HSPPPPVYKSPPPPVYYS-PPPPVYHSPPPP---VYNSPPPPIYKSPPPPVYYSPPPPVY 122

Query: 126 HSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQEYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYH 185
           HS PPPVY SPPPPVY SPPPP    YKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY+
Sbjct: 123 HSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPP---VYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYY 182

Query: 186 S-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQE 245
           S PPP+YHSPP PVY SPPPPVY+SPPP +Y+SPPPP    YKSP PPVY+SPPPP    
Sbjct: 183 SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP---VYKSPPPPVYHSPPPPM--- 242

Query: 246 YKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           YKSPPPP+Y+S PP VYHSPPPP+Y
Sbjct: 243 YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVY 252

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6D2HCM3 (Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MERR_LOCUS720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 258.1 bits (658), Expect = 4.6e-65
Identity = 173/239 (72.38%), Postives = 183/239 (76.57%), Query Frame = 0


Query: 31  VYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPP--KSPPPPVYHSP-------PPPPIYYSPPPPKK 90
           VY SPPPP Y+YKSP PP+Y SPPPP  KSPPP VYHSP       PPPP+Y+SPPPP  
Sbjct: 133 VYKSPPPPVYLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPRVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 192

Query: 91  QE-------YKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQE 150
           +        YKSPP  VY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPVYHSPPPPVY SPPPP    
Sbjct: 193 KSPPPPVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYL 252

Query: 151 YKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS-PPPIYHSPPTPVYHSPPPPVYHSP 210
           YKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY S PPP+YHSPP PVY SPPPPVYHSP
Sbjct: 253 YKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSP 312

Query: 211 PPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPPVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPPIY 253
           PP +Y SPPPP    YKSP PPVY SPPPP    Y SPPPP+Y S PP VYHSPPPP+Y
Sbjct: 313 PPPVYKSPPPP-VYLYKSPPPPVYKSPPPP---VYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 366

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 218.0 bits (554), Expect = 1.0e-56
Identity = 177/283 (62.54%), Postives = 189/283 (66.78%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPP-- 65
           S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPP  
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  ----KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPPPPKKQ-EYKSPPSRVYPSPPPPVYHSPPPP----V 125
               KSPPPPV H   PPP+Y+SPPPPKK   YKSPP  V    PPPVYHSPPPP    V
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHY-SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 122

Query: 126 YHSTPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKQ-EYKSPPPPVYNSPPPPVYHSPPPP----VYKSP 185
           Y S PPPV H  PPPVYHSPPPPKK   YKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSP
Sbjct: 123 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 182

Query: 186 PPPVYH-SPPPIYHSPPTP----VYHSPPPPVYHSPPPSIYYSPPPPKKQ-EYKSP---- 245
           PPPV H SPPP+YHSPP P    VY SPPPPV H  PP +Y+SPPPPKK   YKSP    
Sbjct: 183 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 242

Query: 246 ----LPPVYYSPPPPKKQ-EYKSPPPPIYFSLPPLVYHSPPPP 251
                PPVY+SPPPPKK   YKSPPPP+    PP VYHSPPPP
Sbjct: 243 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPP 284

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 8.4e-43
Identity = 167/262 (63.74%), Postives = 170/262 (64.89%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKK 89
           YVYSSPPPP YVYKSP PP  +Y SPPPP    KSPPPP  VY SPPPPP  Y  PPP  
Sbjct: 155 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 214

Query: 90  QEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPPK 149
             Y S  PP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY S PPP  VY SPPPP  VY SPPPP 
Sbjct: 215 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP- 274

Query: 150 KQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP 209
              Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPP   +Y SPP P
Sbjct: 275 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 334

Query: 210 --VYHSPPPP--VYHSPPPSIY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPP 253
             VY+SPPPP  VY SPPP  Y YS PPP    YKSP PP Y YS PPP    YKSPPPP
Sbjct: 335 PYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 394

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 167.5 bits (423), Expect = 1.6e-41
Identity = 166/268 (61.94%), Postives = 172/268 (64.18%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPP----KSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPKK 89
           Y+YSSPPPP YVY SP PP  +Y SPPPP     SPPPP  VY SPPPPP  YS PPP  
Sbjct: 65  YIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 124

Query: 90  QEYKS--PPSRVYPSPPPP--VYHSPPPP--VYHSTPPPVY-HSPPPP---VYHSPPPPK 149
             YKS  PP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY S PPP Y +SPPPP   VY SPPPP 
Sbjct: 125 YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPP- 184

Query: 150 KQEYKSPPPP--VYNSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPP---IYHSPPTP 209
              Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPP   +Y SPP P
Sbjct: 185 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 244

Query: 210 --VYHSPPPP--VYHSPPPSIY-YSPPPPKKQEYKSPLPPVY-YSPPPPKKQEYKSPPPP 259
             VY SPPPP  VY SPPP  Y YS PPP    YKSP PP Y YS PPP    Y SPPPP
Sbjct: 245 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPP 304

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10
Match: AT1G23720.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 8.7e-40
Identity = 153/252 (60.71%), Postives = 160/252 (63.49%), Query Frame = 0


Query: 28  TNYVYSSPPPPYY-------VYKSPLPP-IYQSPPPP--KSPPPPVYHSPPPPPIYYSPP 87
           T YVY SPPPP Y        YKS  PP +Y SPPPP     P PVY SPPPP +Y SPP
Sbjct: 560 TPYVYHSPPPPPYYSPSPKPAYKSSPPPYVYSSPPPPYYSPAPKPVYKSPPPPYVYNSPP 619

Query: 88  PPKKQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPP-VYHSPPPP----- 147
           PP    Y   P   Y SPPPP VY SPPPP Y  TP P Y SPPPP VY SPPPP     
Sbjct: 620 PP---YYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPS 679

Query: 148 KKQEYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPP 207
            K  YKSPPPP VY+SPPPP Y   P P YKSPPPP VY SPPP Y+SP P P Y SPPP
Sbjct: 680 PKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPP 739

Query: 208 P-VYHSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPP-IYFSL 252
           P VY SPPP  YYSP P  K EYKSP PP VY SPPPP      K EYKSPPPP +Y S 
Sbjct: 740 PYVYSSPPPPPYYSPSP--KVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSP 799

[Close]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10
Match: AT3G28550.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 9.6e-39
Identity = 149/247 (60.32%), Postives = 160/247 (64.78%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYV------YKSPLPP-IYQSPPPPKSPPPP--VYHSPPPPPIYYSPPPPK 89
           YVYSSPPPPYY       YKSP PP +Y SPPPP   P P  VY SPPPP +Y SPPPP 
Sbjct: 684 YVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPP- 743

Query: 90  KQEYKSPPSRVYPSPPPP-VYHSPPPPVYHSTPPPVYHSPPPP-VYHSPPPP-----KKQ 149
              Y   P  VY SPPPP VY SPPPP Y  +P  VY SPPPP VY SPPPP      K 
Sbjct: 744 --YYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKV 803

Query: 150 EYKSPPPP-VYNSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPIYHSP-PTPVYHSPPPPVY 209
            YKSPPPP VY+SPPPP Y   P  VYKSPPPP VY SPPP Y+SP P  VY SPPPP  
Sbjct: 804 VYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYV 863

Query: 210 HSPPPSIYYSPPPPKKQEYKSPLPP-VYYSPPPP-----KKQEYKSPPPPIYFSLPPLVY 252
           +S PP  YYSP P  K +YKSP PP VY SPPPP      K +YKSPPPP  +S PP  Y
Sbjct: 864 YSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 923

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Clc09G10410 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038899768.1	8.6e-82	65.82	extensin-3-like [Benincasa hispida]	[more]
XP_004139745.3	8.9e-79	63.04	extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucu...	[more]
XP_022976067.1	7.5e-78	69.86	extensin-3-like [Cucurbita maxima]	[more]
KAG6592187.1	1.4e-76	71.38	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_022936196.1	7.0e-76	71.48	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9FS16	1.4e-55	62.54	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q38913	4.0e-50	57.69	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9M1G9	9.0e-34	59.27	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q9XIL9	7.7e-33	56.50	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thali...	[more]
Q9T0K5	4.3e-28	51.54	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]

BLAST of Clc09G10410 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1IER1	3.6e-78	69.86	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F6U4	3.4e-76	71.48	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1	[more]
A0A7J6XCN3	2.0e-68	75.64	Extensin OS=Thalictrum thalictroides OX=46969 GN=FRX31_002868 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F7A8	3.8e-67	68.68	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1	[more]
A0A6D2HCM3	4.6e-65	72.38	Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MER...	[more]

BLAST of Clc09G10410 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	1.0e-56	62.54	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	8.4e-43	63.74	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	1.6e-41	61.94	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	8.7e-40	60.71	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	9.6e-39	60.32	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01217	PRICHEXTENSN	coord: 86..98 score: 47.69 coord: 54..70 score: 45.88 coord: 101..122 score: 43.64 coord: 35..47 score: 36.92
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 118..146
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 198..230
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 53..97
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF18	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 150..256
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF18	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 89..188 coord: 26..141
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 89..188 coord: 150..256
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 26..141

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Clc09G10410.1	Clc09G10410.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall