Clc09G09040 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc09G09040
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr09: 7785584 .. 7789998 (+)
RNA-Seq ExpressionClc09G09040
SyntenyClc09G09040
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGGAGTTGGGTTGGTATGGGGAGGCTACGACGGGGCACCGACGAAATCGTGATTGGATAGATGACCTGTCATTCATGGTAAGCCTTGTAATTTTCACACCATTTTTTCCTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTTATGTTCTCTTCAAAAAATTTGCAAAAATCACTATTCAAAACTATCACGTTTGTTATCATTATATCAACTTTTAATTTCATCCATCACATTTCCAACAATATGAATTTCATTAATTATTTTAAAGGCTACTTGTATATATATACCCAAATAAGGCTAAAATATTGCAGACGTAGTAAAACTTAAAATTAAATAAAACAAAATTTACCTTCAGTTTATATAAAATGTCAAAAAAAAAAAAAACCCACTAAAGGCACAAAAATACACTTGAGTCACGAAATTCTTGATTTTTGAACTCTAGTGATAGACTTTTTTTAAAAACTAATTACAAATATAACAAAATTTATCTTCAACCCTTTAACCCATAGAAAATGTCCAAAAAAAAAATAATAATAAACTATTGAAAACATGAAATTTCCAGTTTTTGAATTCTATCATTGATAGACTTCTATTAGCCATAGAAGTCTATCACTGATACCACAATATTATCGCTGATACCACAATATCATTGACAAGCCTTCATCACTAATATTTTTTTGTATAACCAATACAATTTTATCAAGGGCATGTAATAGTCTTGTCAATGATAGCACCGATAAGTCTCTATCACCAATATTTTTGTATTACTAATATGGTTCTATTAAAGAAATATATTATAATGTTTTTCTCCAAAATTAAAAGTTAACATATTTTATAATTAAATTTTTTCTCATATGACAATAATAATTTTAATTATGTGAAATGTTAAAACTTTATGGATGTCAAAAACAAAATAAATTGAATCAAGATTCTATCTAACTAATTCCTTTTTGTTTTGTTTTTTAAATTTTAAGAAGATATGATTGTTTACTAGTTACTTATTTGAGAACTCATGTAAATATAATTAATTAAAAAAAGTTATTTGGAGTTTTTCCTTAAAAAAATCGTAAATAGCTGATTTGATAATATTTTATGTACATTCAAATTTTTTTTCCTAACATAAACCAATTATACATATGAATAATTCTATTTTGTTTTTTTTTTCATAAAATAATTATTTACTAATATCTTATTTAAAAGTACATAAAAATATAATTTAACAATTCATTCTAATAAATATTTATATTATTTTAAAATTATATTTCACTATTATCTGCTCATTTTAGTTGAATTTAATGTAATTCCACATTGTTTTAATAGATATGTCATGGGTTCATATTAAAAAAATCTCACGTATACTATTGATAATTTAATTTTATTCAAAGCCTTTTAAAATTATAAATTTACAAAAATTATATTCGTTTAATCTTTTGTATTTCACACTATGAAATAATTATACTCCAAACATTTTAAGCTGCATCCAACATTTCATATTCATTATAAATTAACTAGATATAAAACATATATATAATTTTGGTAATTATCATGTTTTTCACTACTTTTAAATTTCATGTTAGATATTTCCTATCTAAATTTAATAAAAAAATATTTATTTAAAAATTTATGTTCTAAAGATTTTAAACCATTGCATCGCACGTTTCCCGACTAGTTAATTTAAAAAGTGGCTAGTTAATAAATAATCCAAAATGAATTATAAAATAAGATAAAATAAATATATTATATATAATTGTATATTGTTGGTGGATATATTTAACCAAACTCAATTATCGGTAAGAATACCTCATTATAAGGGTATAACTGGGAATAAAAAAAATAAGCGAGGAGATTAGAAAAAGATGCTATATTTACAATTATTTTAAAAATGCTAACCATTTTAATTACCCTTTTAACAAAAAAAACAAATTTCCATTTGTTTTACTAAAATAGATGCTGCGTATTCATTTGGGCCGGGTACCCGATGACCCGGCGGCCCCATATGGTTCTATAAATTTAAAGCCTTCGTCTTCAACAACTAGTCTCAACGTTTACGATTCGACGTCTTCAGAAACTAAGAAGCGCACCAAATTAGGGTTTCGTTTTGTTTTGTGAAAGCTCAATATTCATTATCGATAATGATCTACGACGTTAACTCCCCTCTCTTCCGCTCCTTCCTCAGCCAGAAAGGAGGCCCTTCTGACAAAAGGTATTCTCTATCTTAACAATTTGTATGAATTATGTCTTGGACACATCTGAAGTTAGTAGGCTAGGATTTGAATGCATATATCTAATATTCTTTATCAAGTTTCATAGAGATTATTGTAACAATATTAGAACTTACCCGTTTGGGAGCTTAGCTATTGTTTTAGAAATTTGAAATTCTGTTAAACACTCCCTCTTAATTTGTAACTCAGAAGCTTCTTAAAATTTATTGAATTTGATATAATGGCATTTGTCAATATCATTTCTGTTGTGAAGTTTTTCACCAGATGTCCAACGAGGTGATAATTTAATTTAATATGTTTTAATCGAGTATGGAAGATTGGATTCTTGGTCATTGCAAATTTCGCACATATTGTTCCAAAAGCTTTTTTTGGGCTTTAGCTACTCCATTTAGAGATTGTTTAGAATCTTCTTTGGTCAAACAACTTCACAATCAATTGTGGTTGTGCCTGTAAATTCTACCTTGGGTAAATGAAGTGGTTTTTTCTTTTTTGTTGGATTGAACTTTTTTAGATATGAGGTTTGATCATAAGCGTACTTGTAGTTTGAAGTGCTTCTTTGATCATCAAGGACTTGCCCAATCATTGTTTGTATAGCCAACCTGCTTATCATCTCTTCCATTCTTGATGCTAACAACTATAACTGAGGATTTGATCTTTTATCATGCCATTTTTCCTTATCGTCTTGTTGATGTTGATGCTACTTCTGTTTCTTACTTTTTCTTTGCATTCCACCATTTTTTAGTTCTGATTCTTAGTATCAACCTTGTTAAGCTTCTTTTTCTGTATTATTTAGCTTGGAATGATAGACTTGCTTCATAAAGTGAATTGGAAACTTCGTCATTCTTTCTTCATGAGCTTCCCGTTAACTAAGATTATATTATCTCTGGGTGGGCGCAATGCAACCATGTAATGGAATTTTGAATATGAAGCTTATACACTTGAGGTATCTATGTCCAACACGTATGTGACACTTCAACACATATTGAACATAATATTGTATATGTGTCAAACATTTGTTGAACATAATAGACATGTATTAAGGTGAACAATTGTAAGACATGTGTTACACACTTGTAAACATAAGGTGAACAATTGCTGGGCACTTGAATTTCAGTGTTGAGGCAAATCTTTAAGTCCCATATTATATAGGATATTAAATCATTTAAATAAATGTTAGTTGGGTGGGTGTTGTTTATAAATATTTTCATATAGATTACTACGGTCCCCTTTGATAACCATTTGGTTGTTGGCTTTTGTAAATTGAACCTATAAGTCTTACTTGCACCCATAGTTTCTATGCTTTATTATCCACTTTCTACCCATGTTTATAAAAATCTAAGTCGAGTTTCAAAAACTAAATAGAGTGGCTTTTGAAGACTTATTTTTGTTTTTAAAACTGAACTAAAGATTCAAGCGTTTCTTCAAGAGTGAACCATAATTGTTGGATAGTTTTTTAAAACTATTTTTTGTAAATTTTTCTAATCATCTCTAGTCTTATTAGTATTGAAAAATCAACAAAAAAGATAAAGGACTTATTAGCTTCTTGCTCTGAATAAGATTAAAAGTTGAAACATTGTTCTTCCAATTCTTCTTAAAATCCATCTGTTGATACTTGTGATCCCATAACCTTTTTCCAAATGTTATTTCTTTACTTCCCTTGCTACCCTCTGATGAGGGAAGGAGGGAGGGGTTAAGGGTTTTTGATATTATTCAGTGTTTAATCTTTTGAATGAATTGAATGGTTATAGGAAAACGGAGGAGCAGAAGCCAAAAGAACAGAGACCAAAAGCCAGTGAGAATAAGCCTGTTATGACTGAATGAGAATGCGTTGGGAGTGAGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAAATTGGTCAATATTATGGACAAGCTTTGTATTGTGAATCCAAACCGTAAATCGTTTAAAATTGTACTGAACCTTCTTATAAACATCCAATGAAGATCATGTTGAATGTGGTGGGATAATCTTTCCTCTACTATGGACAAGTCTTTCCCCATGTTCGATTGTAAGTGCTAGCGTTATCATGTTTTTTCTGGTGCTGAAGTTAAAATTGACGTTAGTTTGTACATGTCTTGGTTTCAAGAGGGGTTTCGTTCTGTCCACCATCGCTAATATCTTAGTCACGTAATGAGTAGATAGATAGTTTTATTTATATGATTTTCACATTATGGAATAAATTTTTCTTT

mRNA sequence

ATGGAGTTGGGTTGGTATGGGGAGGCTACGACGGGGCACCGACGAAATCGTGATTGGATAGATGACCTGTCATTCATGATGCTGCGTATTCATTTGGGCCGGGTACCCGATGACCCGGCGGCCCCATATGGTTCTATAAATTTAAAGCCTTCGTCTTCAACAACTAGTCTCAACGTTTACGATTCGACGTCTTCAGAAACTAAGAAGCGCACCAAATTAGGGTTTCGTTTTGTTTTGTGAAAGCTCAATATTCATTATCGATAATGATCTACGACGTTAACTCCCCTCTCTTCCGCTCCTTCCTCAGCCAGAAAGGAGGCCCTTCTGACAAAAGGAAAACGGAGGAGCAGAAGCCAAAAGAACAGAGACCAAAAGCCAGTGAGAATAAGCCTGTTATGACTGAATGAGAATGCGTTGGGAGTGAGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAAATTGGTCAATATTATGGACAAGCTTTGTATTGTGAATCCAAACCGTAAATCGTTTAAAATTGTACTGAACCTTCTTATAAACATCCAATGAAGATCATGTTGAATGTGGTGGGATAATCTTTCCTCTACTATGGACAAGTCTTTCCCCATGTTCGATTGTAAGTGCTAGCGTTATCATGTTTTTTCTGGTGCTGAAGTTAAAATTGACGTTAGTTTGTACATGTCTTGGTTTCAAGAGGGGTTTCGTTCTGTCCACCATCGCTAATATCTTAGTCACGTAATGAGTAGATAGATAGTTTTATTTATATGATTTTCACATTATGGAATAAATTTTTCTTT

Coding sequence (CDS)

ATGGAGTTGGGTTGGTATGGGGAGGCTACGACGGGGCACCGACGAAATCGTGATTGGATAGATGACCTGTCATTCATGATGCTGCGTATTCATTTGGGCCGGGTACCCGATGACCCGGCGGCCCCATATGGTTCTATAAATTTAAAGCCTTCGTCTTCAACAACTAGTCTCAACGTTTACGATTCGACGTCTTCAGAAACTAAGAAGCGCACCAAATTAGGGTTTCGTTTTGTTTTGTGA

Protein sequence

MELGWYGEATTGHRRNRDWIDDLSFMMLRIHLGRVPDDPAAPYGSINLKPSSSTTSLNVYDSTSSETKKRTKLGFRFVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc09G09040.1Clc09G09040.1mRNA