Clc09G08270 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCATGGCTTCGCTTCTTCCACCTTTTACTTCCCTTCTCTGCTTTTCTTTTGTTATGCCTCAAAAGAATGGTTCTCGCAGGTGACCCCTACGTCTTCTTCGATTGGACTGTCTCCTACATCTCTGCTTCTCCACTTGGAGTTAAACAGAAGGTTTCTTCTCTTCATTCTTATTCTTCTTTTGCTTCTTCTGCAAATTTCAGATTGCTCCAGGAACTATGGGTTTTCCAGGCATTTGTCTTAGTACTGATTATTCTGATACTTTAATGTAGTTTCAATTTGCTGTTACTATTTTGACATATGTATTTTTTAATTTACGTGTGATGGATTGATATTGTGTATTTGGCTAACTGGGTTGGTTTACTATACTATAGCTCAGAACCGAGTTAAAAAAAATGAAAGTAAATAGGTGGAGGAAAGATGGTTCCTAGACGATTTGTAGAGATAATTGTACTGTTGACCCAAAATTGAGGCCCAAAATGGAATTTGCCTCACTTTTTAAAATGTAAGTTTTCTGACATTTTGTTTGCACCATCATCGATGGAAATTACCGAAATGATCTTATTGTGCATACGTGTTGGGCTCTTAACTTTTGACTCTTGCTCTTTGCTCTTTGCTCTCTCGCTTTCAATCTTGCAACTCTTGTTATTTGCTTTCTTTTGATAAAAAGAGTGAGAGCCAAGAGCCAAGAGCGAGACCAAAGAACAAAGAGCGAGAGCGAGAATGACTTTCAAGAGAAAATAGAGAGAGTGAGGAGTGGGAAAACCTAAACTCTAAGGAGCGAGAGTAGCGAGAGACCCCAACTTGCATGCACATTGTTCCATTTTGGTAATTTCACATGATATGACGTAAGCAAAATGCCAAAAACATTATTTCTAAAAATTGGGTTGGTTTTCATTTTTGCCTTTTAAAATGGGAAAAACCCCAATTTGTAAGATTAATCTAACTACTAGGACGAAATTAAAACTAAGTCTAAACTATAGTGGTTTAATTAGAACTTTAGATCTCAAGGACGCAGTTGTACAATCTATAGAACAAATTGCTTAAGCAAGGTTGTGATTTAATTAAACTTTTAAATTATGGGGACCAAATAGAAATTTAGTCCAAAGAATAGGGACTGGGTAATAATTTAAAAGTTCTTATAACATGGATTAAAGAGTTCTAATATTCCCTAATAGTGGCAATTGTGTGTTTCTACTGTTCTAATATTGGCTAAGAAGGACGAATATAATGGGTATATGAGTAATGACACCTATGAGCATTTGGATGAACTCAAAATCAAAGTAGCATTTGGATGAACTCAAAACCAAAGTCATAAGAATTCATGATCGTCATGAAAATGTGTGGAGGTTTTGTTGGTATCTAACTCATTACTGTGGAGTTTTCTTGATTGACAGAGGGAGAAAATTCAGATTCTGTTTTAGCTTCAACTTTCTTTTAATATGGTCTCGTTGACTAGAACTGCAAATTCCGAGATGTTTTTGTCTCCTTACTGACTTCATATTTTATGTAATTTTATTCACAGGTCATTGGGATTAACGAACAGTTTCCTGGACCTGTGCTCAATGTAACTACTAACTGGAATGTTGTTGTCAATGTTAAAAATGACCTTGATGAGCCTTTGCTTCTGACATGGTATGAACCACATTCACTAGAGATATTGAGAAAACGTATCTTTTAAGTTACAAAATTTAGTACCTTAACTTTGTTAGTTTCACATTTTTAGTTCTGACGCTTAAAATCTTTTTAATTATGTCTTTAAGTTTGAACTGCGATTCTATATTCCATTAATTTAATAATGGTATACTATACCTATTAGACAAATCTTGGCAATTCAGCATGATGTGGTACACAAATTGTAAAAAGAAGCAGACAATTGGATAAAATAGTGTGGCATGAACTATAAAATAAATTCGATATCTTGCTCGAAAAGAGATAGTGCCAAATCATTCGATCATTTAAATGTTTGTTGGACAAGCATGTCAGATTATATAGCAATGTGAATGGTAAAGAATACATAAAGTTACCATTCAAAACTTAGAGACATCATTGTAACTTTCTAAATAAATAAAAATTTGGAGTTCAAATAAAAAAAGCTGTAGCAAGTTCTTGAAGTATTGACTTTGTCGTTATTTTTAATTCAGGAATGGTATACAACACAGAAAAAACTCTTGGCAAGATGGTGTTTCCGGGACTAATTGTCCAATCCCTGCTGGGTGGAACTGGACGTATCAGTTTCAGGTCAAAGATCAAATAGGGAGTTTCTTTTACTTCCCTTCCTTGAATTTCCAGAGAGCTGCTGGTGGATATGGAGGAATCACCATAAATAACAGAGACGTTATACCATTGCCCTTCCCGGTGCCAGATGGAGATATCACAATCTTCATTAGTGATTGGTATATTAAGAGTCATAAGGTCAGTGTCAACTGTCAAGCCTGATTGGGTTCTTGCTTTTGCTGATGGTGAATTGGTGATTAGTGACTTTGAACCTGACTTGGTTTTCCCTGTCTTGATTTCATGTTTGATGGTGATAATGCAAAACGTAGGAATTAAGGAAGAATGTTAAGAATGGGATAAACCTTGGTGTTCCTGATGGTATCCTCATCAATGGAGAGGGTCCTTTTCGCTTTGATAATGCTCTTGTTTCTGATGGCATTCCTTTTCATACAATAAATGTTGAACCTGGTAAGTTCCATTTTTATAATGGATTTTTATGTTGATATGTGATTGAATTCATGACTTTTCTGTATTAAAAGGATATCCCTATTATTATTTTTTTAAATAAAAAACTTGCTCTCGTTAAGGAAAATGAATGTAGAAGGAAGGATCTAACAAAGAATGGCGCATGACGCAGACAAAGGAGCAAACCTAAAAAAGGAAAAATAAAAAGATTAAAATAAAACTGTAAAGCAAAATATGAATAATTGCTTTGTTTGTTGAGGAAAGAAGAGGATGATTGCAAAATACTCCAAATGAGAAAACTGAGAGCAAGGCTTGAAATGTGCCATGTTCTAACTCAACATGTTCCTGTCTTTAAAGGTTCTCCAACATTTCTCAAGCTTTGTGTTTTACAAAATAGCAAATAAAACTTCTTGCCAAATCTGACTTCTACTATACGAAGGGAGGTTTGCGAGCACCTCTTTTATTACATCCTGACCTGTTGAAGGAACCAACTTTCCTTCAGGTGTGTTCAGGCCTCCACTTTAAAGTTTTTAGCAGACTCCGAAAGTGTATGATCAAGATCTTTCTCAGAGCTCTTACTCATTACATGCCACTGGGGTCCTGGGGGGATATAAAACTACAGTTGAGCTCCGGATGAAGTTTATGGTATTTAACCTCTCCTACGAAGCCAACCAAGCAAAAAACCTGATCCTCTTCAAGATTTTGGCCTTCTGGACCAAAGTGAATGAATGGGAGGCTAGCAAATCTGGCTGAGACACCAAATGGGCAAAAATAATACCTACTCATTGGATGTTGAGGAAAGGCAAACCTCTCGTAACAACCAAAAAGAAGATTAGCCAAATCTTGAACCATGAAATCTCAAAGTGGTCTTCAAAAATTAAAATCAGTACAAAAATTGTCATTAGGAATTAAACAGAGTTCACACACGCCCTTTTTCATAGTACGGATTAAAGATGTGGGGGAACAACTTGGAGACTCCATTATCAATCTAGAATCTTCCAAGAAGGGAATGCTAGTAGCGAGCCCCATTTCCCTCTGAAAATTTAGTAAAACTATTGGGGGATGCAATGAGAGATGGTTTTTCAATGACTTGTTAAATGTGCCTTTACTACAATGGAAAGTTTAGACCGTATGAAATCATTCATCTAAGGAGCAAGAACTCCATTTCCAAAATTGGAACTCTAAGGTTTTATTTTAAAATTGACAATGCTCATCTTGTTTAGTTTTGCGGGAGGGGATTCCCTCGACCCCCTGCCCTTAGGTTATTCTTATGGTTCTCCTGATGAATATATACCCTTGTTTCTTATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAATGCTTTGAAGGGGTAAATGTACTTTAATTTAATACACGTGTTGGAAATTAACTAGTAATACTCATAGTCAAGAAAAATTTCAATATGATTGTCACTCCTACGAGCTTGAGAGACACTGAAGAGAGAAAATTAGAAGTTCCCCCCCTCTGCATCTAACAATTGTGGATGTGGTGGGTGCTTCTAGTAAGTCTTCCTAGTCTTAATACTGACCTAGAACATTTAAATGAACTTTTTAGTGGAAATCTTCAGCTTCCCAGTAATGAGCCCCAACACTTACACCTTTACTCTCGGTAATACCAATAGAAGCCGTTTTATCTTGATGCCAAAAATGGCTTACAAATCTACAAAGCTATTCAACTTATTTTATCTTGGGAAAATCCCTGCCCCTTGAATCCTAATGTAGTTGTATCATTGCATGGATAGCTCATGAAGCCATGTTAGGGTATTCTTTCGTCTCTGATTCTAGGTTGATAAGAATTATAAACTAATTATTTACCACTTTGATATTGTGTTAGTTCACTGAAAGGTCATTACCCATTCTTGGTAGATCTTGAAATTGACATGATGTAGTCTTAGGAGGGAAGTTTTGTTTTATTCCTTGAAAATCTTAATCTTATGGCCTTAAAGTTAAAGAAAGCAAACTAGATATTCTCTTATGCTTTCCTCTACGATATCTCATTAGCTGTTCTGCAACATAGGATTAGACACTTTGTTCTAGCTCCAAAAGATTGTCTTAAATTATTTATTTAATCTGTACTTGTGTGGTACAAACTGTGTATATGCAAGCTTTCCCTTGTCATGATTAACATTTCTCTTGTCTATTAATTGATTACTAAATTTTGGAAATTAATCTTTACCAGGAAAAACATATCGCCTCCGAGTGCACAATGTTGGAATCTCAACGACCTTGAATTTTAGAATACAAAATCACAACTTACTTTTGGTTGAGACTGAAGGATCATACA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MPWLRFFHLLLPFSAFLLLCLKRMVLAGDPYVFFDWTVSYISASPLGVKQKVIGINEQFPGPVLNVTTNWNVVVNVKNDLDEPLLLTWNGIQHRKNSWQDGVSGTNCPIPAGWNWTYQFQVKDQIGSFFYFPSLNFQRAAGGYGGITINNRDVIPLPFPVPDGDITIFISDWYIKSHKELRKNVKNGINLGVPDGILINGEGPFRFDNALVSDGIPFHTINVEPGKTYRLRVHNVGISTTLNFRIQNHNLLLVETEGSYTVQQAYANMDIHVGQSYSFLVTMDQNASSDYYIVASSRFLNSSSLAGTTGVAILQYSNSQGPASGPLPDPPNELDTFFSMNQARSIRWNVSAGAARPNPQGSFKYGQITVTDVYVILNRPAELINGKWRRTVNGLSYFTPSTPLKHAQQFSIPGVYKLDFPTRMMNRPPKLDTSLINGTFKGFMEIIFQNDDKNVQTYHLDGYAFFVVGMDFGVWTENSRGTYNKWDGVARCSTQVFPGAWTAVLVSLDNAGIWNLRSENLDSWYLGQELYVSVVNPEVDKSEMPMPDNTIYCGLLSSLQKDQSQRFKFSGVASSADPFHSIMAVLIMTLMAIFISIIHCLLFFSSLPRSQLSLFSFSLSLLSPPFPAAGATSSLSSHPVLQPLFPSISSHSSIRSSIPLFPRSLFQFPLIFPRLFAFRLPFAAEL Homology
BLAST of Clc09G08270 vs. NCBI nr
Match: XP_038899769.1 (monocopper oxidase-like protein SKU5 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1187.9 bits (3072), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/595 (96.13%), Postives = 585/595 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. NCBI nr
Match: XP_008447201.1 (PREDICTED: monocopper oxidase-like protein SKU5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1173.7 bits (3035), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/598 (93.81%), Postives = 579/598 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. NCBI nr
Match: XP_004148963.1 (monocopper oxidase-like protein SKU5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN44715.1 hypothetical protein Csa_016088 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1167.9 bits (3020), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/594 (94.28%), Postives = 574/594 (96.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. NCBI nr
Match: KAG7014566.1 (Monocopper oxidase-like protein SKU5 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1162.5 bits (3006), Expect = 0.0e+00 Identity = 555/593 (93.59%), Postives = 575/593 (96.96%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. NCBI nr
Match: XP_022953761.1 (monocopper oxidase-like protein SKU5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1158.7 bits (2996), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/593 (93.25%), Postives = 574/593 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SU40 (Monocopper oxidase-like protein SKU5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKU5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 780.4 bits (2014), Expect = 1.7e-224 Identity = 375/588 (63.78%), Postives = 457/588 (77.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VXX5 (Monocopper oxidase-like protein SKS1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 749.6 bits (1934), Expect = 3.1e-215 Identity = 349/584 (59.76%), Postives = 452/584 (77.40%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FHN6 (Monocopper oxidase-like protein SKS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKS2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 726.1 bits (1873), Expect = 3.7e-208 Identity = 334/572 (58.39%), Postives = 439/572 (76.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q00624 (L-ascorbate oxidase homolog OS=Brassica napus OX=3708 GN=Bp10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 535.0 bits (1377), Expect = 1.2e-150 Identity = 268/557 (48.11%), Postives = 372/557 (66.79%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P29162 (L-ascorbate oxidase homolog OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 525.8 bits (1353), Expect = 7.4e-148 Identity = 266/550 (48.36%), Postives = 363/550 (66.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGV8 (monocopper oxidase-like protein SKU5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489708 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1173.7 bits (3035), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/598 (93.81%), Postives = 579/598 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K4S5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G374570 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1167.9 bits (3020), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/594 (94.28%), Postives = 574/594 (96.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GNZ7 (monocopper oxidase-like protein SKU5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456192 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1158.7 bits (2996), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/593 (93.25%), Postives = 574/593 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JRN2 (monocopper oxidase-like protein SKU5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488283 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1158.3 bits (2995), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/593 (93.42%), Postives = 574/593 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D3S2 (Monocopper oxidase-like protein SKU5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold306G002100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1158.3 bits (2995), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/627 (89.47%), Postives = 579/627 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. TAIR 10
Match: AT5G48450.1 (SKU5 similar 3 ) HSP 1 Score: 888.6 bits (2295), Expect = 3.1e-258 Identity = 427/573 (74.52%), Postives = 489/573 (85.34%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. TAIR 10
Match: AT4G12420.1 (Cupredoxin superfamily protein ) HSP 1 Score: 780.4 bits (2014), Expect = 1.2e-225 Identity = 375/588 (63.78%), Postives = 457/588 (77.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. TAIR 10
Match: AT4G12420.2 (Cupredoxin superfamily protein ) HSP 1 Score: 780.4 bits (2014), Expect = 1.2e-225 Identity = 375/588 (63.78%), Postives = 457/588 (77.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. TAIR 10
Match: AT4G25240.1 (SKU5 similar 1 ) HSP 1 Score: 749.6 bits (1934), Expect = 2.2e-216 Identity = 349/584 (59.76%), Postives = 452/584 (77.40%), Query Frame = 0
BLAST of Clc09G08270 vs. TAIR 10
Match: AT5G51480.1 (SKU5 similar 2 ) HSP 1 Score: 726.1 bits (1873), Expect = 2.6e-209 Identity = 334/572 (58.39%), Postives = 439/572 (76.75%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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