Clc08G05965 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc08G05965
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr08: 17331619 .. 17333738 (-)
RNA-Seq ExpressionClc08G05965
SyntenyClc08G05965
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATTGACGACGATGCCTCATGCCCGTTTCCCTTAACGCTGCACAGCTTGACTGCACAGAGAGGAGTCCTTCTCTTTCGTAGTTCGCTTGTAGCCTGTAGTGCACGTCCAACTGATTCCGTTCGACCGTTTGATTTCGTTGATCGGCCATCCACATCTAGAAAGTCTCCACAGTCCAAAGTAAGTTTTTTTTTTCAAGTTTTTTTAACTATTTCAAGTTTTATTTGAGTTTTTAAATTCAAAGTTATGGTTTTTTTTTTTAATTAAGTTTTTGCTTTATTTTTTGGTTAATTATTTTATGCATTTTATAAAGTTATAACTTTTAAGTTTAAAGTTTTGATTTTTTTGGTTTTGTTTGTGTGAATGTAAAAAGTTTATATTATGATTTTTGTGTAGGATGAATATGGAAATGGAAAAGTAAAAAAACTATCAATACAATAGAGAAGATTCTGATGAGGCAACCGTCAATGTTAATGAAGATAAAGAAATCCGTGAGAAAGGTGTAAGAAGAATAAAACATCCTATAGTTTGGGAACATTTTGAGTGTTTGAATGGTGATCCAAATAACCCTTATGCTAGGTGTAAATATTATGGAGCTACTTATGCATGTAATTCAAAGCGTAATGGTACGGGGACGATGAAAAATCACTTGGATAATGGTAAGAAATACCCATACTAAAGGAAGAGAGATCCAACTCAAAAGACCTTAGCTTTCAAACCTAAAGAAGAAGGTATTAAGGATGGTCATTCCCAACTTGTATGCGAATCATTTAGTTTAGAAAGTTGTCGTGAGGCTTTGGCTAAAATGATAATCATAGATGAATTGTTGAGAATAAAGGGTTTAAGAGATTTGTCAGTAAATTAACATGTTCCCAAGAGCCTAAGTTTGACATTCCATCTCATTTCACCATGGCTAGGGATATCGTGAAGATGTATGTTAATGAAAAACAAAAATTGAAAGATATGTTTGGGAAAATGAAATATAAAATTTGCCTCACTATTGATTGTTGGACTTTAGGACAGAATATGAACTATATGGTATTGATTGCACATTTTTTTTATCCTGATTAGAAGCTACATAAAAAATTCTTAGCTTTGGGGTTATTGAAAATCATAGAGGGGACACTATTGGTAGGGCTATGGAAAAGATTTTGAAAGATTGGGGAATTAAAAAGGTCATGGCTGTTGATAATGTTAGTTCAAATGATACTGCTATTGCTTTCATGATTAGGAGATTCACTGAAGGGTTGATATGTAATGGTGAGTATTGCATGTTAGATGTCGTACATACATATTTAACCTTATTGTATGTTATGCTTTAAAGGAGCATAATGAGAGCATTTGTAGAATTCGAAACGCTATTAGATATGTGAGATCTTCCCTTGCACGTATGATGAAGTTTAAAAAGTGTGCTGAAAATGAAAGAATATCTTGCAACAATATTATATGTCTTGATGTTCCCACTAGATGGAACTCTACGTATATGATGCTTGAAATGGCTATTAAGTTTGCAAGAGCATTTGATAGATTAGAAGATGATGAAGATGCTTATAGGAATGATTCACCACTTACTAAAGAGGATTGGTCAACTGCAATGATGTTGATTATATTTTTTAAAGTGTTTTATACTGTCACATTGAAAGTATCTGGATCTTTGTATACAACTTCAAACTTGGTTTTTCATGAGATACGTAGAATTCAGAATTGCATACAAAAGAATGCTAATAGTGGAAATAAAATGATTTCTACTATGGCTAATAATATGAAGCCTAAGTTTGACAAGTATTGGGGAAATGATGATAGGAAAAATAATATACTACTGTGCATTACTGTGGTTTTAGATCCTCGTTCAAGGTGAAGTACTTAACATATTGTTGGACAAATCTTTTTGGGCTAGACATTACCAAAATTAAGGTTAGAACAATTGAAAATGTTATGAGGCATCTTTTCTATGAATACAACAATGGGCAAATTAATGGTGTTTGTGTTAGTTCTAGTGATAGTTGTAATGCAAGTGTTTGGTGTTGGTGTTAATGCAGGTGCTAGTTGTAGTCCTAGTTCGTGTGAATCTACTAATGATCCTCATATTCGTGGTCGTAATTTTCAACTGTTTTGGATAG

mRNA sequence

ATGATTGACGACGATGCCTCATGCCCGTTTCCCTTAACGCTGCACAGCTTGACTGCACAGAGAGGAGTCCTTCTCTTTCGTAGTTCGCTTGTAGCCTGTAGTGCACGTCCAACTGATTCCGTTCGACCGTTTGATTTCGTTGATCGGCCATCCACATCTAGAAAGTCTCCACAGTCCAAAGTGCTAGTTGTAGTCCTAGTTCGTGTGAATCTACTAATGATCCTCATATTCGTGGTCGTAATTTTCAACTGTTTTGGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGATTGACGACGATGCCTCATGCCCGTTTCCCTTAACGCTGCACAGCTTGACTGCACAGAGAGGAGTCCTTCTCTTTCGTAGTTCGCTTGTAGCCTGTAGTGCACGTCCAACTGATTCCGTTCGACCGTTTGATTTCGTTGATCGGCCATCCACATCTAGAAAGTCTCCACAGTCCAAAGTGCTAGTTGTAGTCCTAGTTCGTGTGAATCTACTAATGATCCTCATATTCGTGGTCGTAATTTTCAACTGTTTTGGATAG

Protein sequence

MIDDDASCPFPLTLHSLTAQRGVLLFRSSLVACSARPTDSVRPFDFVDRPSTSRKSPQSKVLVVVLVRVNLLMILIFVVVIFNCFG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc08G05965.1Clc08G05965.1mRNA