Clc08G03600 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTGGGGGGGAGCAAAAGATCCAGAGGAAGAAAAAGCTCTCCGTTGCACTCTTCCCTCTCCCCTCCTCCCCTCCCATCCATTCATCCATTTCGTCCATCTGAATCTGAGGGAATCCGGGGGCTCACATGGCGTTCTCTTCTTCTCCGGCAAGACGTCCAATCATCCCTCTCTTCTCACTCCTTTTTCTCGTTTTTCTCTTCGGCATCTCCTCTGTCTTTGCCGACGATGTCTCGCTCGATGACGATTCCGCTCCCAAGTCCGGAAATTGCAACAATCCCTTCGAATTGGTAATTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAAATTTTGCTTTTTTAATTGAAATATTTCTTGTCCTCTGCCATTCATATTGGCATCTTCGGTTTTGATCGTTTTATTTCGCTTTGCATTTACTCCATTTGTGTGTTCCTTTATTTTGGGTCGATCTAATTTTGTGGGTTGGATGATCATGTTGTGAGACTTGCCCATGATTTCTGAAAGGATTTAGCTAAAGCATGAGCAGCGAAATAAGGCAATCTTATGTGATTGAGATTGCCGTTTTGGTATAACTTTGACCTCAACTGTACTTTTCAATAGCAATTCTGGTAAAAATGGTTTGGATCAATAAGCTTTGGAATTTCCTTTATACCTGGAAGATATTAGGAGGGTGGAATTCTCCATGTCCAGATGGTTTCACTATAGGCTTCTACTAGGATGACTGGGATTGCATTAAGGATGATTTCTAAAAGGTCTTTGTGAATTTTATCTGAGACAATTTTGGCCGATAGACTAAGGAAAGTCCTTACTCAGACAATTTTTGATTCTTAAGGAGCCTTCTTGGGATACATGGAGACAAATTTTGAATAATTTTGATTCAAACTCTTATTGCTATTTAACAAGAACTTTCTTTTGCACTGACGAGGAAGAGCCTTGACCAATTTTTAATTCTTAAGGAGCCTTACTGAGTACTGACATAATCACTGACACTCTTGGTGGATTTTGGGTGGGGAAGGATAGCATACATTTAATGAGGACATGATCCTTTTTTCTTTTTTTGCACTGACAAGGAAGAGTCTTTGTTCTTTTGAAAAGGATACCACACTTATTCATTATTAAGAAAATGGAAAGAGACTAATGCTCCAAGATACAAAAAACCAAAAGAAACAAAACAAGCCTAATGAAACAACACAAAGTTTAGTAACAAGGTCAAGTAAAAAAGAAAGAAAACTAAAAAGGAGGTATGAAAAACTCCTAGCTCCTATTGATGTCTTGAATTGAAAGCCCTTTGAATTTTTGGAGAGAGAACACTCTGATGCAAACTTTAAACGAGTTGATTAAAAAATGTCATGCTGCAAACGAGAAGATCCCTAAAAAATATGCTGATTTCTTTCCATCCATAGCCTACAAAAAGGCCTTTTATTGCATTAATCCAAAGCAAAGAGGTGCCGAACTTCAAATAGGACTACATAGAATTTGCAAGACATCGTCCTTTAAATTGGATGAGAACACCCACTGGAAGCCAAACATATGAAATAATCGGACCAACACCACAGTGAAGGAAGAGTCTTTTGTTAATCTTAAGGGTATTTCGAAGTTAGATAACATTGGACAAAGTGTCTCTGATGTATTAGGATCAGTGTTGTTGAGCCGAGCTTGGGCGCTTGCCTATGGCGAGAGGCGAGGCAAGGTGAAACCTCTGCACCTTGGAAGTATCCAAGGTGAGTGCCTTCAACAAGGCGCTCGCCTTGGTGTGCCATTTCTCGCCTTTTGTACCATTGTCATAAAATCAGGCGAGCGCCTTTTAACATTGGCGATAAAGAACTCTATGAAATATGGAAGAGTTGGGAGAAGAAGATAATAATAGAAAGATGAAGAACAAGAGTGAGTCGTAGCTTGAAGAATAAGAAGAAAACTAAGAAGAGAAGAAAATATAATAAGAAGACGTAAGAAAGAAAAAGAAGAGAGAACGAAGAAGAAAAAAAAAGAAAGAGAAGAAGCATTAAACTCGATCAATAAGAAGTTGAAGTGACTAATGAAAAAAGAAAGCTAAAGAAGAAAAAGAAGAAAAATTGGGAACATTAAAACTGCATGTTGCATGTTTGTGACATATGTCAATCCTACCTCTTCCATTTAATTTAAAGCAACGTATTTTCTTCCATGATCAACAGGTGGCACTGTTTGAAGCTTGTTTGGTTTATTTACTTCCATTAAATTTGAAGCAACAATATTTTCTTCCCGAACCGGCCTTTAATAATATTAGAAAAAAATTTCTACTTTATTTTAGTAGATCCCTACTTTTTCCAAACATTATTTAAATATCAAATAGTTTTGTTCTTATTTTCATATATTTAATATTAGGGGTGTTTTAAAAAATAAAAAATTGTTGAAAATAATTACAAATATAGCAAAATTCTGTTTTCGATCTCTGATAGACCGCGATAGACCCAGATAGACATCTATCACTTTACCAGACAGACATGGATAGATGTCTACCTCGGTCTATCACAGGCTATAACAGATAGAAAGTAAAATTTTGCTATATTTGTAAATAGTTTTATAGTTTTTCTATTTATAATAATTTTCCTTAATATTAAGTATTTATTTTTTTACTTATAAAATAGTTTTATGTAATATTTATTTAGCATTTTATTATATGGCCTCGCTTCACTCAGGGGATGATTTTTTATCGCCTCTCATCTTAAGGCGATTAGAAGACTAGTCACCTTAGAGTGCGCCTTGCGCTTTGAAAACACTGAGTAGGGTTAGGGTACATGAAGATATCCTGGTCAAGTCCTTATTTGAATAGGATTAGGGTTAGTTTTCTTGATTGAGAAGGTCTAGTATTTTTTGTTTTTATTGGGTAATGAGTGGCTTTGGAACCTATTTTTCGAAGTTAGAGCTTGGATTCTTCTAGAAATTGTCCGTTAGCTCCCTTTCCAAGCTCTTGGTTGCCTCTATATTTATGGATAAATTTGTTTACAAAGCCTTGTGGATTTCCGAATGCACTAGTCGAGTTTGTATTCTTATATGGTTTTTGTTTTATGGGTTGTTGACTTGCTTCTCCAACCTCAGCGGAAGCTTCCCTCCCATGGCTTGTCTCCCTATTTTTGTCCTCTTTGCATGGTCGTTTGTTCTCCTATTTCAAATCTAGTGGGTGTTTGGTGATTCGTTCTAAGCCAATTTGTTTTGTTATGGGTTGTATTTGGTGGTTGTTATTGCTTTATTTTTCTTGATTAGTTTGTGTTATGGGTTATACTTGGTTGTATTTGCTTTATTTTGTTTCATTGTATTTTGAGCATTAGTCTCTTTTCATTTCATGAAAGAAAAACCTTGTTTCCTTTTTTAAAAAATTGGGATTAGGATTAGTTTCCTTGGCTAATTAGGATTAGGATTAGAGGAAGCTCCTTCGATTGCTATTTTGAACTATCTTTCATGCTACGAGTTGGTGCAAATGTACATCTTTCTTTAGTTTATACACCCTTCCTTCATTATCTTTCATCCTTTGGCGGCCTCTTTTTGTATTCGTTTCTTATAGGAAAAAAAAAATAGTTTGTTTTTGAATTCTCTATAAATAGAAAAATTGTCTTCTTGTATTAGTATCTTTTGTTTCATAATAAACTTAATTGGAATGCTTTTGTTCTTCCTATGTAATAATGTATTCTATAGTCTTATTATGGGAATTCTCGTGTAAGGATATGATGAGGGTGCTGCTAAGGTGGTGTCAACCTAGTTGAGATGACCTGGTGCATCTACTGATCCTATTTTTACCAGTTTTATTGTATCATTTGCTCTTAGTTTCTTTGTACTGAGCATTTGTGTCCATTACATCAATGAAAGTCTATGTTTCTGTTTAAAAAAAAGGAAAAATTGTCTTCTTGTATTAGTATCTTTTGATTCATAATAAACTTTGATTTTATTCTTAGAGATCTCTCTTTTTTATCCTTTAGGCTACATTAGTTTCCAATCTTTCGAGATTTGACCCCCTTCGTCAAGCAAGCTGTCACTCGAAATTGTAGTCGACAGATATTATCTTTAGCAAATCCTGATTTTGTCTTCACTAAAGGAGTCATTCGTTTAAAGACTTTCCACCTTCTCTCTCTCGTTATGATGATGATTCAATTACTTTGTGCTATGTGGAATCTGTTTTACGACCAATGGGAAATACCTCATGATATTGGTGTTGAAGATTCTTTTGTTGATGATTTAGTTTTGTTATTTTAGATTGTAACAAGGGATTCCTTTTGTCCCAGTGCCTTGCAAATTTGCTTCTCTTATTGAAGTTCTATGATTATTGAAGGAAACTGTTTCTGATGTTTGTATGCACATTCTTGAAGGTCTTTGATAACTAAGCAATCAATTATCCCATAAGTCAAGAATGCACATAATTTAATTGCCTCTTTCAACTTTCAAGTGCAAATTGCAATTATACCTCCTAGTGCATTCTTTGTAAATATTTTGTAGATTTTTTCCATTCAAGATCTATGCTTAAATTGGAGGGATTCAAGATCTATGCAAATGGGGTCAAAGGCACACACCGAAAGCTGTGGAAAGATATCTCCTCCCAAGTTCCTTCATTTTCCCATCTTGTTTTCTATGTCGTGGGGGATAGACCTCTATTAGCGGCATTTCCTAGATTATATCATCTGTCTTCCTTGAAAAATTGGGTCGTGGCAGATTTGTTGGTGTGGACGGGGAATTCCGTTCCGTTTTCCTTTGGTTTCTGTTGAGCGTTGACCATTAGGGAAACGACGAATGTGGTGTTTATCTTTCTTTGGTGGAAGGTTTTGATTTTAGGTTAGGGAGAAGGGATGTGCGTGTTTGGAGTCTGAGTCCTGTGGAGGGTTTTACTTGCAAGTCTTTCTCAAGCTTATTTTGAACCCTTACCACGTGAGCGGCATGGCCCGCACTTCTCCACGCACTGCATATGTGCGTGCGGGCTTCTCGCCCCATCCTCGGCGCATGCCCAAGACACTCGCGTGTCTGCTTGGCGTGCTACGCGCCTC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ATGGCGTTCTCTTCTTCTCCGGCAAGACGTCCAATCATCCCTCTCTTCTCACTCCTTTTTCTCGTTTTTCTCTTCGGCATCTCCTCTGTCTTTGCCGACGATGTCTCGCTCGATGACGATTCCGCTCCCAAGTCCGGAAATTGCAACAATCCCTTCGAATTGGTCAAAGTTAAGAGCTGGGTTAATGATGCTGAAGATGAAACCTTTGTTGGTCTAAGTGCAAGGTTTGGGACTTTGGTGCCTTCACAGGCTGAAGATGATCTCAAACTACCAGCTGTTTATATGAATCCTAGAAATGGCTGTGCTAGTTCTTCTTCAAAGCTATCTGGATCAATTGCCTTGTCTATACGTGGTGAATGTGACTTCACAATTAAGGCAGAAATTGCACAGGCAGGGGGTGCTGCAGCCCTGTTGGTGATAAATGACAAAGAAGATCTTTACAAGATGGTCTGTTCTGAAAAAGACACTCCTCTCAACATTTCAATTCCTGTTGTGATGCTTCCCAAGTCCAGCGGAGATGCTCTCAACAAATTAATAACCGACGGAAAGAGAGTGAAACTTCTATTATATGCTCCAAAACGTCCAGTTGTGGACTTCTCTGTTGTATTTTTGTGGATGATGGCTGTTGGAACAGTTGCATGTGCTACGCTTTGGTCAGAGATCACTGCTGAGCAGACTGAGGAGCGCTATAATGAATTATCACCGAAGGAATCTTCCAATCGTGGAGCAGCCAAAGATGACTTTGATAGTGAAACCCTCGATATTAATGTTAAGAGTGCAGTACTATTTGTCATTACGGCATCTAGTTTCTTGGTGCTGCTATATTTCTTTATGTCTTCTTGGTTCGTTTGGCTGTTGATTGTAATGTTCTGCATTGGTGGTGTAGAGGGTATGCATTCCTGTGTATTAGGACTGATATTAAGAAAACGGAAAAGTTGTGAGATGAAGACTGTGAATTTGCCTGTAGTAGGGGAGGTCACTATTCTTTCACTTGTTGTGCTGCTTTGTTGTATAACTTTTGCGGTTGTCTGGGCTCTGAATCGGCGTGCATCATATTCTTGGGTTGGTCAAAATATTCTTGGTATTTGCCTGATGATAACAGTCTTGCAGATGGCCCGATTACCTAATATTAAGGTAGCAACAGTACTTCTTTGCTGTGCATTTATCTATGACATCTTCTGGGTGTTCATATCACCAGTAATATTCCACGAGAGTGTAATGATTGCGGTTGCCCGAGGGGACAATAGTGGCGGAGAATCCATTCCAATGCTCTTAAGGGTTCCTCGCACTTTTGATCCTTGGGGTGGTTTTGATATGATTGGATTTGGGGATATACTCTTCCCTGGTTTGCTTGTTTCGTTTACTCACAGATTTGACAAAGCACACAAGAAAAGCAAGTGTAATGCATATTTTCCATGGTTGCTTATTGGTTATGGAACTGGTCTCTTCTTAACGTATTTGGGCTTATATTTTATGAATGGACATGGTCAACCTGCACTCCTTTATCTTGTCCCGTGCACCTTAGGTGTTACTGTTATTTTGGGTTTGATCAGAGGCGAGATTAAGCAACTTTGGTGTTATGGGACAGAAAATCCCTTGCATAGGGAACCTTCTGGAGACGCTTAA MAFSSSPARRPIIPLFSLLFLVFLFGISSVFADDVSLDDDSAPKSGNCNNPFELVKVKSWVNDAEDETFVGLSARFGTLVPSQAEDDLKLPAVYMNPRNGCASSSSKLSGSIALSIRGECDFTIKAEIAQAGGAAALLVINDKEDLYKMVCSEKDTPLNISIPVVMLPKSSGDALNKLITDGKRVKLLLYAPKRPVVDFSVVFLWMMAVGTVACATLWSEITAEQTEERYNELSPKESSNRGAAKDDFDSETLDINVKSAVLFVITASSFLVLLYFFMSSWFVWLLIVMFCIGGVEGMHSCVLGLILRKRKSCEMKTVNLPVVGEVTILSLVVLLCCITFAVVWALNRRASYSWVGQNILGICLMITVLQMARLPNIKVATVLLCCAFIYDIFWVFISPVIFHESVMIAVARGDNSGGESIPMLLRVPRTFDPWGGFDMIGFGDILFPGLLVSFTHRFDKAHKKSKCNAYFPWLLIGYGTGLFLTYLGLYFMNGHGQPALLYLVPCTLGVTVILGLIRGEIKQLWCYGTENPLHREPSGDA Homology
BLAST of Clc08G03600 vs. NCBI nr
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BLAST of Clc08G03600 vs. NCBI nr
Match: XP_038886604.1 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 994.6 bits (2570), Expect = 3.4e-286 Identity = 499/541 (92.24%), Postives = 524/541 (96.86%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. NCBI nr
Match: XP_008464341.1 (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 992.3 bits (2564), Expect = 1.7e-285 Identity = 501/542 (92.44%), Postives = 518/542 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. NCBI nr
Match: XP_011656474.1 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 991.9 bits (2563), Expect = 2.2e-285 Identity = 498/541 (92.05%), Postives = 519/541 (95.93%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. NCBI nr
Match: XP_011656473.1 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 987.3 bits (2551), Expect = 5.4e-284 Identity = 498/542 (91.88%), Postives = 519/542 (95.76%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MA44 (Signal peptide peptidase-like 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPPL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 638.6 bits (1646), Expect = 6.2e-182 Identity = 311/512 (60.74%), Postives = 402/512 (78.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4V3B8 (Signal peptide peptidase-like 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPPL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 634.8 bits (1636), Expect = 8.9e-181 Identity = 317/522 (60.73%), Postives = 401/522 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q53P98 (Signal peptide peptidase-like 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 622.9 bits (1605), Expect = 3.5e-177 Identity = 314/520 (60.38%), Postives = 398/520 (76.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DWA9 (Signal peptide peptidase-like 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 494.2 bits (1271), Expect = 1.9e-138 Identity = 253/525 (48.19%), Postives = 356/525 (67.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5Z413 (Signal peptide peptidase-like 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 488.8 bits (1257), Expect = 7.9e-137 Identity = 251/514 (48.83%), Postives = 348/514 (67.70%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CMS6 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 996.9 bits (2576), Expect = 3.3e-287 Identity = 501/541 (92.61%), Postives = 518/541 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CLP1 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 992.3 bits (2564), Expect = 8.1e-286 Identity = 501/542 (92.44%), Postives = 518/542 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JYL1 (signal peptide peptidase-like 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 951.0 bits (2457), Expect = 2.1e-273 Identity = 480/542 (88.56%), Postives = 507/542 (93.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ENS8 (signal peptide peptidase-like 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436325 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 4.6e-273 Identity = 477/538 (88.66%), Postives = 504/538 (93.68%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H7H1 (signal peptide peptidase-like 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460877 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 896.0 bits (2314), Expect = 7.9e-257 Identity = 449/530 (84.72%), Postives = 487/530 (91.89%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. TAIR 10
Match: AT1G05820.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 5 ) HSP 1 Score: 638.6 bits (1646), Expect = 4.4e-183 Identity = 311/512 (60.74%), Postives = 402/512 (78.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. TAIR 10
Match: AT2G43070.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3 ) HSP 1 Score: 634.8 bits (1636), Expect = 6.3e-182 Identity = 317/522 (60.73%), Postives = 401/522 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. TAIR 10
Match: AT1G05820.2 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 5 ) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 1.8e-173 Identity = 298/493 (60.45%), Postives = 385/493 (78.09%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. TAIR 10
Match: AT1G63690.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2 ) HSP 1 Score: 488.0 bits (1255), Expect = 9.6e-138 Identity = 244/501 (48.70%), Postives = 345/501 (68.86%), Query Frame = 0
BLAST of Clc08G03600 vs. TAIR 10
Match: AT1G63690.2 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2 ) HSP 1 Score: 486.5 bits (1251), Expect = 2.8e-137 Identity = 243/501 (48.50%), Postives = 344/501 (68.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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