Clc08G01700 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc08G01700
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr08: 3014211 .. 3018843 (+)
RNA-Seq ExpressionClc08G01700
SyntenyClc08G01700
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGATGGCTATTTTGAAGTACTTGCATAGATGGATGGAGATGAACTCTAACTTTCCAAGAGGTGAATCTGAGCTCTCGCTCATAATTCCTAAGCTTGAGGTTGAAGATGGAAATGGAGGTGAAGGAGATTCAACAGAGCTTTCACTACTTAGTCTCTCAATTCTTTGAAATTGAATTCTTGTAGCCTATTTATAGGCGTCCAAAAGGTAGTCCTCATGATTGCCTACTGTCTTTGCATTTAATTTCATGCCCTGCTGCGCTGACTTTTCGGGTCACAGATCCATTGGCTCTGTCATGACTTTGTCAAATCAGTCGTCCACTTGCATTTTGACACGACAGTCATCGCGCACACGTTCATGAATTCCTTTTCTTCTTGATTCATCTCGATGGGGAATCTACTTGTTGCCTTGATCTCACTTTGTTTGGCAGCATCTTTGATTGTCCTTAGTTGTTTTCGACTTCTTCTCATTGAAATCATGGGTCCAGAGATACAAATCTCATAATTTCCTGGATAAAAGATTTTGTAAACAGTTTAAACGCAGAGTTGATCTTCTTACACGATTTTCTTCTCAAGTTAATGTGTTTTTTTCCAAAGTATCATAATTATTCCAAATAAAGACTATAATAACTTATATTTCTATAAGTTATCACGGGCCAAAACAGAGTTGAACACGCGGAGATGTCCGTCAAGCGCCGTGGCGCTATCAGGATTTTATAAAAAAGAATTTCAGCCACTAGGATTCATCATCTTGATTTCCAGCTGAATTCCTAGCAATTTCTCTATACTTTTCATAATCTCTTGGTCTGTTTTGTGTATCTAAACAATTGTTTGACGTCCACTATGAAGATTATGGGCTAAGGTACTTATTCTAACTTAGGCGTAGAGCGATTGCCCCTTTGTAATTGTGAACTTGTGAGATTTTAGATCCATTTTTATAATTCTTATTATTGTTTTTTAACTATTCTTTGATTTTGTATGATTTTTGCTTACGTAATTTCATGATTGTCTGACAAACTGGATTGGAATTGTGTAACTATATATGCTAGAGGTTAGTTGTGATACATGACATATAATTGCAATCTAATCTAAAAGGTAACAATATGTTAGTTAGACTTGTAATTTGTTGTAGGAAATGAAGAACGTTGATCTGTCAACCTAGGGAAGAATCAATTCGAATGTTTAATTCAGCGTCCTGATTAAATGTTTGACGTAACGAATTCCGTAGACTTAATGCGATTGATAGATTAACTAGGATGCGTTTCATTTAGTTAATTCGACTAATTTGATAATTTGGACACTTGCCTAGTGTCACAATCAGACCTTCGGGCCTCATGAAACGATTATGCGACACTTGTTCTAGCTTGCGAACAAGTCAGCCTGATCGAATTCAAATCACCTACGGCACACCAAGTGCCTCTCGCAACCTTTACCCCCGTTTCTAGATAAAACGGTTTTAGAAAACGGGTTTAGAGAAAAAAGTAAGTTTGTTTAACAACGACTTTATAGCTCACAACTCCGGATATGAGGATTTGATGATTAGTCTTACCCCCATATAGTACATTATAAGTATTTTTAGAAATGTCACCCTTGCATATGCAAAATGGCTAGCGGTTATTTACAAAGAAAAGTACTAGGAAAGTAAACTAACTAGTAAAACAAAAGACATAAGATGAAAGCATGATAAAAAGAGGTCAAGGTGTGCATGCGGCCACGGGCAACACACCCTAGACAAGCATGACAGTGACACTTAGCGTTTTTAGGCAAGTTGTCTAAGATTAGAACAAACATAAATTAATCTGATAAGTCAGTGATCAACCCACAATAAGGGAATAGATCAAAAGCCTAGATTAGATTCTTAATTATCGAGTTTATTTCCAATTTAATTTTCTACAATTTATATCCTCTTTAAATTACCTTGCATTGAAACAAACTCCAAACCCCCCTTTGGTTACTTGAATTGTTCACAATTCTGTTGAGAAATTCAAGCGCTCTATGTGTTCGACCCGGTCTTGCCACTATTATGATGTGAGTAAGAACGATTAATCATTTGGTACGGATTTGGGCGACAAATTCCACTTGCCAGTCATTGGCTACCATGAGTCATCGGACTCTCATTGGTCAGTATAAAATAATATTAATAATTCAAAGTTTTGATTGTTGGACTTTTTATTATTTTTATTATTGAATTCGTTTTATTATTTTATTAATAAATTTGCCATATGTCGCAGTATAATTGGATGACGTGTTCATGTCATCATCCACATCATATGTAGCGTCATCTGCATGTCAATAGTTGACCATTGATTGCTCATGTGTCAGGTGCCACTTCAACAGTTTACCATATACTTCACCACGCCAATTGCCACATTATCATTGCATAATGATTTTTCTTCATTTTTGTTTTGACCATAATTTCTTCGCTTGAGGTTCGATATGAGTGATTCAAATTGCATTGAATTCGTTATTTTGAATTCTACACAATAGACTCTTCAAGATACTAAAATTGTTAGTAAATAAAAGTAAGTTTGTTATCATCAAAACATTAATTAATTAATTAATTTGAGATTAAGAGCAAAAAAGCTAACAAATTACTGCAAAAGGAAAATTTCATTTATCCATCGAGGCTTACATAGATCATGAAGATTTTTCAAGAGGTTAGTTTTCGGCTTTATGATCCTCCATATTGTAACTATTCATGTTTATAGGTCACCTGTGTTAGTTATTTTTTATAGTACAATTAAAGCGGTAGGAGGTTACAAACTTTAACATGGCTTAGTGGCTAGATTTACTGTAACACATTTTATATTTGTTTTTTTCAATGAAATTGAAGTCTTTTAAGCTTAAGGTCACAAGCAACTTTATTTGCATCTCTAATTTGCATACTGAATCATTTAAAATTTTCATTATGGATCTTGATCATCTAGGTAAATTCGTTCTATCTTCTTCCTTGGAATGAAAACATGTTGATTTGGAGGTTTAGCATTTGAGATCTAGGGGAACTAGGAGGGTTGCTAGATCTATTTGGCTAGGGTTTCCTCATCATAAAGATCTTGCACCTATATTTTAGGTCAAGATGGAAATATTAATTTAACAATGGAGGAAGGGAATAAAAAGATGAAAAAACTAAAAATGAAAAATATATGATCTGTGATAAAATCGAGGAGCAAAATGACGGAAAAACAGGAGTACGAAAATCGAAAAATTATAATATTAAAATAATAAATAATAAAATAATATTAAATTAATTAAAATAACCAAATTAAATAAACTAAACTTAAAATAAACTAAAATAAAGAAAGTGAGATTTTATGGAAAATGAAATTTCTCAAATTTTCTTTTATCTTATTTTCTCTCCCAATGTGTGTGTTACAATATCCATAAAAAAAGACATTTCATGGCCACTAAAGATGTATCTTTAGGAAGCACATGACTTTTAGCCATTAAACTTAGCTACATAATGAATATCTATTTACAAATATAATATTTATAATAGGATCATCAAATTGAAATTTACAACAACAATAACAACAATTATCCTAATATAAAATACCTTCAATGAAAGTCCAATAAGAAGGAAGATATTTGGCGGTGGGAGAAGGAAGTGATTTTGCGGAGATAGTTGTTGAAATACTTCTCCGTAAAAAATAAGAGAAAAAACCTCATATCACACTACAATTATGAAGTTAGTAAACATCAAATTGGCGAAAAATAAGACAAGTCTATTTTTGTTACTTTGTGATTTTGTCACATGGTAATTTGTGATTGAGCACTCTAGATGGGTTACACGAAATATAATTAAATTTAATTATTTTTCTAAAAAAATGCTTAATTTAAAATTTTTTTATTATAAATAGAAAATATATCAAACTATTTATAAATATAGCAAAATTTTATTTTCTATAAGATAAAGTTAGATAGACAATGGCTAAAGTGATACACATCTATCTGTGATCTATCACAAATAAAAAGTAAAATTTTGCTATATTTGTAATTATTTACGACCGTTTTTCTATTTTTGAAAACATCTCTAATTTAAATTTAGTTTCACAAATTTAAAATAATTTCTATGAAGAAAAAAAAAAAAATTAAAGTTCAAATACTGTTACAGAAATCAGAAATCAGTTCAGTAATTTAACCGAAAAAATCTTAAAAAGAAAATGAAAAAAAGAAAAAATGAGTAAAGTAACTCCATCTTTCCCTAGTAATTTTCGAAAAACTTTCATTTTATAACTCTAGAACCCAACAGAAGCAGGGTTGGTTTTCAATGTCATAGACTGATTACTATTAGGACCTTTGATATAACAATGGCTATTTTACCCTTTCGAAAAACCCTACGTTCTCCCTCCCAAACACGGACGTTGCCTCCTCCCCTCTTTACACGCACGCTTCTCTCGCTCTAGCTCCGGCTGCCACTGGACAACCAATCTCTGCGTGAACTCCTCGCGTAACTCCCATAGACGACAGCAACTCCCATTACCAGCGCCGGCGACTGGACTGGGACTCCGACAGAGACTGCAACTCGACGGTGACGGCGACTTTGACTCTTATTACGACGGCAACGGCGAAGCATACAAAATCACGACGACTTCTTTCTCAAACTTCAACCATTTGTCAGTGATTTCGTTTGGGTAA

mRNA sequence

ATGATGGCTATTTTGAAGTACTTGCATAGATGGATGGAGATGAACTCTAACTTTCCAAGAGGTGAATCTGAGCTCTCGCTCATAATTCCTAAGCTTGAGGTTGAAGATGGAAATGGAGTCATTGGCTACCATGAGTCATCGGACTCTCATTGCTCCGGCTGCCACTGGACAACCAATCTCTGCGTGAACTCCTCGCGTAACTCCCATAGACGACAGCAACTCCCATTACCAGCGCCGGCGACTGGACTGGGACTCCGACAGAGACTGCAACTCGACGGTGACGGCGACTTTGACTCTTATTACGACGGCAACGGCGAAGCATACAAAATCACGACGACTTCTTTCTCAAACTTCAACCATTTGTCAGTGATTTCGTTTGGGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGATGGCTATTTTGAAGTACTTGCATAGATGGATGGAGATGAACTCTAACTTTCCAAGAGGTGAATCTGAGCTCTCGCTCATAATTCCTAAGCTTGAGGTTGAAGATGGAAATGGAGTCATTGGCTACCATGAGTCATCGGACTCTCATTGCTCCGGCTGCCACTGGACAACCAATCTCTGCGTGAACTCCTCGCGTAACTCCCATAGACGACAGCAACTCCCATTACCAGCGCCGGCGACTGGACTGGGACTCCGACAGAGACTGCAACTCGACGGTGACGGCGACTTTGACTCTTATTACGACGGCAACGGCGAAGCATACAAAATCACGACGACTTCTTTCTCAAACTTCAACCATTTGTCAGTGATTTCGTTTGGGTAA

Protein sequence

MMAILKYLHRWMEMNSNFPRGESELSLIIPKLEVEDGNGVIGYHESSDSHCSGCHWTTNLCVNSSRNSHRRQQLPLPAPATGLGLRQRLQLDGDGDFDSYYDGNGEAYKITTTSFSNFNHLSVISFG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc08G01700.1Clc08G01700.1mRNA