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Clc07G16450 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGACCTCCATGGGTCTTGCAAAGGTCACTCATAGGTACTCCAAGGTCTTTCATGTTACCCCTACATCCTCCATGGATCATGTAGAGGCTCTCTATGGCTCCTCCAAGGTCCTTCATGTGATTCTTACGTCCTCCATAAGTCATGTAGAGGACCTTTATGGGTCCTCCAAGCTACCTTTAAGCTCTCTTCCAATGGGTCCTCTAAACTACTATTAAGTTTCCTCATGGGTTCTCTGAACTCCTTCTATTCTCCACATGGGTCGTATTAGCTACTTCTAGACTCCCTCATGGATCCTATAAGCTCCTCTCTCTAGATTCCCTCATGGGTCATCTGAGCTACCTCTAAGCTCCCTCATGAGTCTCAACCAATCCACTCGGACTGGTTCCCTAAGGGCATGGTTTGATATTGATCGGGTGTAAGTCTTATTGGCCTTGATCTATCATCCCAAGCCTCTATCTCTGACCAGGGGCATTCTTTCGTGTGAAATTAAAAAAAGTTGAAATGTAATTAAGGGAATTATTTAGATGCATTTTTTAGCCTACTAAAAATAGCTTCAAATTTAAAAATATTATATAAAAAAGACATTTCTATCTATTTTAAGTATATATATAGATGTGATCGCCTACACCGATTAAATTACATATATTTATTGTGACATCTCAAATTTTAAGATAATTTTAAATTAATTATCATGAATTGTTTGAGTAATTATTGAGTTTTAAGACTTAATGGAGTTATGTTAAAAAGATAATTCAATTTAAATTAAACGTGGAAAAAGATTTGGATTTAATTCTGAAAAATTGAATTTATTTTGGGAGATTTGGAAGTTAATATTAATTTGGAGATTTGAAATTGGGTGAGATTTAAGAATTTTGTTGATTTAAGTGAAATTATCTTAAATGACAAAACTACTGAAAATATTTACAAATATAGCAAAATACACCGTCTATTGAAGTGTATCACAGATAGACAGTAAAATTTTGTTATATTTGTAAATATTTTGATTTATTTTGCTATATTTGAAAGTTGGTAGAGTTATTTTTTTTGGAGTTAATTAAATTAATTTGGATGGTGGTGAAAGATTTGATTTTGTTAGTAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATTAAACAGGTATATATATTATTTTGTTTGTTTGGGAGGAGGAAAAGAAAAATGGAAAGATAATATATATATATATATATTAATTAGAGATCCTCATTGTTCGTGCAAGTTAAAAAAGAAAAGAATTCCTTTTTCCTTTCTTCTCTTAGCCTCCGCTCGCTTCTCTCCCTCTCTCCCTCTGTCTGTTCAACTCTCGCCGCCAACCGCTTCACGCCATAGCCGCCTCTCGCCGTTCAATTTTCGTAATTAAATTAAATTCAAATCTTTTATTAACGTTTAATTTAAATTAAATTATTTTTTTAACATAATTTCATTAACTCTTACCATTTAAATAATTATTATTCAAATAATGTCATGAATTTACAATCTTGATATTTAAAAGTACTAATTTAATTTCTTTGGGCCACATTTAAAATTTTACTATAAAGAATATCTAAACTCAACTTTTGTGCCCTAATTCCCAAACATAAACAAAACCCCCCAAAAAGCATTGGGAATTAGGGTTCTAATAACTTAAAAAAAAAAAAAATAATAAAATAATTCCTTAACTTTTTCTATTAAAAGAAAGAATATGATGAAACTATTCGAACATTACTAGTCAAAATAATCTTTATGGGACATTGAACTTTAGCAGACTCTTTATGATAAATTAATAGAAGTTTAGGGAGAATATGAAGTTATACTCTAAATTTTTCTTTCTATTAATTAACTTTAAACTTCCACAACTGTATTATTTTATATACCTTTTCATTACATTTAGTTTAGATACACATTTTGGGAGAAATTTAAACAATTTAGATTCTTAATTAAGATTAATTTCCTTTGGAAATCATCACTCAATTATATTCTTCTATCTTGTTAACCAAGTATTTGAAAAATTCAACATACATGTAAGATTGATGCATGAGCAATTTTCAATGGTAATCTTCATAAAAAGTCTAAAGTGATTCACTTAAGGCAATTTAGAAGTTTAATTAATACAATTACATGTTTCACATGCAATTGTTTCAATGAAATTTAAGCATAGTATAAATTGATATACTTAGTATTTAAATTAATACACAATTATTGTCATAATAATTAATTGATACAACCTCCAAGTTTAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTGCATTTTATTTCTTATTATCTCAAAAATTTTAGAAAAAGGAAAAGAAATGGTGGCTATGTACCATGGATGTGATTTTGATTTGCAGAATCAGATCCCCATCAAAGTAGACCACTTGATTAGGAAAGATGAACCCCACATGATTCATCATAAAATATTATATATCAAATTAGTCCTTTATGTGCTAACTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATAATAAATAAAAATAAAGGTCCTTTGTGTGCTTTAATTTCATTTTAGTTCCCTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCTTTAATGTTAGTCTAATTAAAGTTTATTAGATGTTATATACATTTAGTAAGTAATAAAAAAAAATATTTTAAATGACAAAATTATTTAAAATATTTATAAATAATAGTAAAATATCACAATTTATCTGTGATACACCACGATAGTTCGCGATAAAGTACAATCTATGTCTATCATGACACAGAAAGACATAGATAGTAGTCTATCGCAGATAGGCAGTAAATTTTTACTATAATTGTAAATATTTTGATTCATTTTTCTATATTTGAAAATAGCCCTAAAAAAGTATATTTATGATTTTCTTTTCTTTTTGTAATTGTTTTAAATAGAAAAACTGCTGGAAATATTTTCAAATATAACAAGATATTACAGTCTATAAGTGATAATCACTGATAAACACTGATATATACTGATAGACATCTATCGATAGAGTATCATTGATAGACTGTGATATTATGTTATATTTGTGAGTAAATTTACTCATTTTACTATATTTGAAAACAGTTTTTTTACAATATATTTGTGATAAGTTATTAGTAGTTGCATAAATAAATAAAAATAAATAAATAAAAGGTCCTTAAAAACTAATGTTTATTATTAATTGGTTATGCTAAAAGAAGATAGAGAATAATTTTTTGTTCGGTTTTCTTAATTGTGTATACATGTGAAGATGTAGGGTTGGTTTTTTCTTTGTTAGCACTTGCTTATAAAATATATTTATTTTTAGAAAATGCTAAATACATCTTTGACCTTACAAACTGACAAGAAATTAGGTCTTAAGACATTTTTTAAAGAAATAAAAACAGTAGAAACCAAAATAAGATATTTCATTGTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGTACAAGATATTTTATTGTAATTAATGTGTTTATTAATTTTAAATTACCATAATTTATTCGTGTCAGTTAATTTTTTAAAATATAACTTCATCTAAACGTAATATATTTTAAATAGCAATATATTGAAGAAGTAAGGTCAAAATGTAAAATATGCTTCCACAAACACAAACAGTTTTCAAATTAGAAAATAATGAAACTCAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACCTAAAAATGTAGGGTTCTTCCGCAATAGACTGTTATTAGTTAAAACAAATTTGTTATACCTATTCACAACTACATTGTTCGTTAAAACAAATTTGAAAAAGCTGCTTTCTTATTATTTAGGTTGATTAGTTTAGAATTCTATAAAAGGTTAGCTTGCAGCCCATGGTTATCACTCAACAACAAATTAGTGACATCGCTTGGTTATGCTTTAATTTGGGAGAAAAAAAGACTAAAGATGGTTTAAAATGATTCTCATTGAATCACATAAGAGATGATCTTTAGTTAAATAATAAATTAAATAACAATCACTCAAGAGAAAATTAAAAAAATGGCCACAAAGTAGACAACTTGCATGGGGAAAGTTAGATCCCACATGATTAACAAAATAAATTAATAAATAATAATAATAACTTTAGTCATTCTTTCAAAAAAAAAAAACCCTTTGGTCATTGTACTTTAATTTAATTTTAATATACTTACTATAGTTTTAAATTTTATATTATCACTAGTTTATTACACGTTCATAACATTAGTGTAAGAATGAACAAATATCTTATGATGACAAATTATTAAATAGTTATACTCGAAAAGGAGAGTCATAAAAACCTTAGTGAGTTTATTAGTCGAAATTGATCATTTCATCCAACTTCATTTTCGTAACTTATTTCAAGAAATCATTTTCTTTTAATATTTTTCCAAAAGCTCTATACTATTTGGTTCTTGGAATTTCAATTTTGATTTTTTTTTTCTCTCAAGCTTGTAAAATGATTCTAAAAATGATCTTGAAATTAAATTTTAATCTAACAAAATAATAACTAGACCGTTACGTGGAACCATGTCAACTTTATATTTTATTACTTGACGAGCAAATTGAATAAAACTAGTCTAAAAAGGTAGTTTAAAATATTCATAATTTAACCTGTTATAAGTTATAACTTTAAAATATATATTTCATTCTTTTGTGCAAAATTGAATTCCATAATATTTATCAAAATGTTCATCAACCATATCAAAAAAAATATATATATATATATTTTAAAACATATTCACAAAAATTCAATCTGACATTTTTTTCTGACATATATTTTGAACCTTATTTATATGACACCAAATTATGAACCCTATTTTTAACCTTGGGGGAATGGGGGAATACCTTTAAATCAATTTTGAAGAAGGAAAAAGAAACTCATTTTCAATTTTTATATCTTGTGGATCCCTCTTGTCTTATTCTTATTATTATTATTATCCTTTTGTCTCCACTTATATGAAGGGCCTCTTAATTATATTGATTCTCATCCAAGAAATAACAAACAAAATATGCAATCCTTAATTAATTTAGTTAATTTCTATTCAAAGTAGTTTTAGTAAACACAATATCAGAGATTTTATTCTGCTTCAACAATTTTCCTTTCTGATGTTAATTTTCATTCTCATTATTGTAATTTATATATTGTGGTGAATAATTGTTTGAATTCAGAATGCATTAAAAATGCAAATAAATAGACTCAACTAAGAAAGGAAAAATACATAAAAAAAGAAGAAATTATAAAATAAAAGGCTCTTTGCAAATATAGTAAAAGGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTCACTGTCTATCGTGGTCTATCGCGAATAGACAGTATATTTTGCTATTAGTTATAAATATTTTCAGCAGTTTTGATATTTAAGATAATTTTTCTAAAAAAATACTAATTAGAAATTAATTAATTAATAATAAATCTTAATTTACTTTTAACACCCATGTTTTTCTCATTAATATAAATTCCCATTTCTCATCAATTATGATTGGAATAAGGAAAGCATCATAATTAGCACCAAAAGGAAAGAGTATAATCTCTAGTGTTCATGATCTATATATTATTCTTCAAGCTAATGCAGATATATCTTTCACATTTTATGAGTATTATATTGAAGAATATTAAAAATGTGACAAATTATCAATTGCATTATTGAGCAAATTTCAAGTCAATACATGATTATGAAAGGCCAGAAATTTGGTTCCACCACTTTAAACTAACCTAAACCAAACCTAACCCTCTTTACCATTTTCTCCATTTGAGTGTTTGAGAAGTCAGCCACAGATATAGAAGAGAGAGAGGTAAGAAGTTACAACCACACAAGGCCAAAAATGCCCTTTGGTTTACCAACCTAAACAATTATTATAAAAATAAGAGAGAAGTTTACTCTTAGGTAATATTCTCCCATTGTGTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGGGTTTTCATATTAATTTAGTGACAGATTCACATCTTGCCCCTTGAAGGATATAGTGCAACTGGTTAAGGTATTATAGTTAACTTTAACTAAAAGGTTTTAAAGGTTTGAATTTTTATTTTACATGTGAGGCACTACAACAATGTCAATTTTAAACTGGCATCATATATGTATGATGACGGATTACAAATTGTCAACTTCGTGAGTGTCATTGTAGGATACGTGATGAATTGGATATGATGGTGGTTTAAAACCGCCATCAAAATCTCCATCGTCATATATGTACAATGATAGTTACTTATGATGGTGGTTTATAACTTACATCAAAGTCCATGTCATCGCGGTGACAGTTTGTTATATTGTCAGTTTAGAACGGGCATCATACGCATATCATCATACATCAACAGTATGATGTATCCATTTTTTTTCTTGGCTTCATTCCCATGTAGGTGCAATGCAAAGTGACAAAGTAAATAAGCGTCGTAACGATCGAGACTTCTGGCATGCACGACGAGCGTTTTTAAAAAGCTATAACTTCTCCAATGGATATGGAAGAGATGATGGGTTGAAAGGAAAGATGAAGAGGTCGATGAAAGAGCTCAATAGATCAACTAGTCGAATGGTTGGAGGCATTTGTGAAGAGATGGCTAAAAGGAAGATTGGAATTAGGGTTTATAAGCTCACAATAGGTCTGCCATCAATGGTTTTTATGACAGTGAGATGTTTTATGCCATCATTTAGGAACAAAGCTAGAGACTACACTACACAACTCATCTAG ATGAGGACCTCCATGGGTCTTGCAAAGGTCACTCATAGGTACTCCAAGGTCTTTCATGTTACCCCTACATCCTCCATGGATCATGTAGAGGCTCTCTATGGCTCCTCCAAGGTCCTTCATGTGATTCTTACGTCCTCCATAAGTCATGTAGAGGACCTTTATGGGTCCTCCAAGCTACCTTTAAGCTCTCTTCCAATGGCTCCTCTCTCTAGATTCCCTCATGGGTCATCTGAGCTACCTCTAAGCTCCCTCATGAGTCTCAACCAATCCACTCGGACTGGTTCCCTAAGGGCATGGTTTGATATTGATCGGGTTGACAGATTCACATCTTGCCCCTTGAAGGATATAGTGCAACTGGTTAAGGTGCAATGCAAAGTGACAAAAGATGATGGGTTGAAAGGAAAGATGAAGAGGTCGATGAAAGAGCTCAATAGATCAACTAGTCGAATGGTTGGAGGCATTTGTGAAGAGATGGCTAAAAGGAAGATTGGAATTAGGGTTTATAAGCTCACAATAGGTCTGCCATCAATGGTTTTTATGACAGTGAGATGTTTTATGCCATCATTTAGGAACAAAGCTAGAGACTACACTACACAACTCATCTAG ATGAGGACCTCCATGGGTCTTGCAAAGGTCACTCATAGGTACTCCAAGGTCTTTCATGTTACCCCTACATCCTCCATGGATCATGTAGAGGCTCTCTATGGCTCCTCCAAGGTCCTTCATGTGATTCTTACGTCCTCCATAAGTCATGTAGAGGACCTTTATGGGTCCTCCAAGCTACCTTTAAGCTCTCTTCCAATGGCTCCTCTCTCTAGATTCCCTCATGGGTCATCTGAGCTACCTCTAAGCTCCCTCATGAGTCTCAACCAATCCACTCGGACTGGTTCCCTAAGGGCATGGTTTGATATTGATCGGGTTGACAGATTCACATCTTGCCCCTTGAAGGATATAGTGCAACTGGTTAAGGTGCAATGCAAAGTGACAAAAGATGATGGGTTGAAAGGAAAGATGAAGAGGTCGATGAAAGAGCTCAATAGATCAACTAGTCGAATGGTTGGAGGCATTTGTGAAGAGATGGCTAAAAGGAAGATTGGAATTAGGGTTTATAAGCTCACAATAGGTCTGCCATCAATGGTTTTTATGACAGTGAGATGTTTTATGCCATCATTTAGGAACAAAGCTAGAGACTACACTACACAACTCATCTAG MRTSMGLAKVTHRYSKVFHVTPTSSMDHVEALYGSSKVLHVILTSSISHVEDLYGSSKLPLSSLPMAPLSRFPHGSSELPLSSLMSLNQSTRTGSLRAWFDIDRVDRFTSCPLKDIVQLVKVQCKVTKDDGLKGKMKRSMKELNRSTSRMVGGICEEMAKRKIGIRVYKLTIGLPSMVFMTVRCFMPSFRNKARDYTTQLI Homology
BLAST of Clc07G16450 vs. NCBI nr
Match: KGN53119.1 (hypothetical protein Csa_015375 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 3.2e-24 Identity = 59/71 (83.10%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. NCBI nr
Match: KAB1213284.1 (hypothetical protein CJ030_MR5G009621 [Morella rubra]) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 2.7e-07 Identity = 32/62 (51.61%), Postives = 47/62 (75.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. NCBI nr
Match: KAF3456114.1 (hypothetical protein FNV43_RR00762 [Rhamnella rubrinervis]) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 2.3e-06 Identity = 26/67 (38.81%), Postives = 51/67 (76.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. NCBI nr
Match: KAF3455730.1 (hypothetical protein FNV43_RR00372 [Rhamnella rubrinervis]) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 2.3e-06 Identity = 26/67 (38.81%), Postives = 51/67 (76.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. NCBI nr
Match: XP_030940520.1 (uncharacterized protein LOC115965432 [Quercus lobata]) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.0e-06 Identity = 28/61 (45.90%), Postives = 46/61 (75.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KW75 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G017070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 1.6e-24 Identity = 59/71 (83.10%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A1VKL6 (Uncharacterized protein OS=Morella rubra OX=262757 GN=CJ030_MR5G009621 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.3e-07 Identity = 32/62 (51.61%), Postives = 47/62 (75.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6N2MPT9 (Uncharacterized protein OS=Salix viminalis OX=40686 GN=SVIM_LOCUS393885 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 3.0e-07 Identity = 27/61 (44.26%), Postives = 46/61 (75.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7N2MT50 (Uncharacterized protein OS=Quercus lobata OX=97700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 1.5e-06 Identity = 28/61 (45.90%), Postives = 46/61 (75.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G16450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A072UKX4 (Transmembrane protein, putative OS=Medicago truncatula OX=3880 GN=MTR_4g067330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 2.5e-06 Identity = 29/61 (47.54%), Postives = 43/61 (70.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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