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Clc07G07810 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTCCTCTGGAAAATTTGATAATTCAGTCTATTCTTGATGTTCATGATGTTGATTTTCAATTTTGTGGAGTTGACTTCCTAGAGTCGTTGGTTTCAGAATTTTCACCCTCTACATCAAGTGCTATGGGTATTCTTAGGGAGTTTCATGTAGTTGAACTAACTGAAGACGTTCTACTGTTGGGTAAAAGATGTTGCTGTAAGTGGCTCCAGCATAATATTTGATTCTCAGTCCAAAATTCCAGAAGTCAAGAGGATTGTTTGTTGATGTGGAAAAAGGAAATCTTTGAAGCAATTGGAGATAATTATGGGGGATTCATCCTATGTGCAACTATTATTCCTAGTGTTCTCCCTATTTCCTTTATTCATTGTCAACAATTTGCCCTTTCAATTGGGTTAGTTCCAAAGATGCGGAACCCTGCCTCTTGAAACCATTCTTCCAACTTTTTTTGGTTAAAGATAGAAGCAATTCGGTTGAAGTTTTGCAATCAGCTACATCAACAGTTTATCCTTCAATTCCTCCCAAATTTCATTCCTTAATTGAGGTTTGTGGATTACAGATGAAAAAAATCACACCTCAATCACCACAAAATAAGATCTAATTATGATTCAATGTGTAGTTCTTCTCGGTATTTCAAAGGATTTAGGGGTTGTTAGTTTTATGTTGTCTCGAAAATTGTTCAGTTTCATTTTGAAGTTCAATGGTTGAAGCCTTTTTTGGAAGTCTGTGGGGCCTTTTATTTTGGTGGTTTGAATTTTTCACGGTTGGGCATTTTTTTGAATTCCAAGTCCTTTGTTCTTCAGTTTTTGGCTCATGCTTCATTCAGTCTTTTGCTCAGAGGACAACGTTCTTGGCCTTTATTTTTGGTGTTTTGTTTGGCAGTTATTTTTGGTTTTTCTTGAGGAGGTTTTATCTTTATTTGAATTGTTTTTGTTCCTTTGAGCATTATTCTCTTTACATTATTTCAATGATTTTTCCTCATTCTTTGTTTCAGAAAAAAACAAAAAACTTTTCATAGTTTTCATTTCTCATTTTATTCCATCTCTTCTCAATACCGACTTAATTTTAGATCTATCCTCTCATCCATTCCAGCTTGCATTCTGCCATCCTCCCTTCCAATGTGTTGATTCTTGCTTCCATCTTACCTTCCGTTCTCCTAAACATTGCATTGATACTAGAACTGATAGGCCTCAGCCACTGATTTATTTTTCAACAGAATACAAGCCAAGAAGGTATTAAAGAGGTCCCCACCTATCACACTTCTCACAAGAGAGCCTAAGAAAATACTCGGCAAAAAAGATACCTCTCTTTACAGTGACATATTCTATATATTTTTCTATCACTGTGGCTTCTCACCTAACCAACAAAATAATATGGACCCCACTCAATATCCTGTAAACTCTATTCTCATAGATTTTTGAAGACCATGTTTTTCTGATTCCAACATTCTTCCTATTGGTGGTGTTCAAATCATAGGAAGTCATATGATTATTTACAAGGGAAAAATAAAAAATTGCCTTAGGTTGGTCTTTTGTAGCCGTTCTTATGAATGTATTTCTTTATTTCTTATTTTAAAAAAGAAAAATCAAAACGGAGGAGCAATTGGATCGCTTCTTCATAATAAATATCTCAGACAATTGCTAGGGAAAAGTGCTAATGTTAAGTGCATGTAATTCATATTAATGCATAAATTTTCATGTTGTTGCTCATCCTTTTTTGTCTTTTTTTTGTTAGGTGTCAGAATTGATGGTTGAGGACTCTGGTAGAGTAAAAGGGGTCAGTATTTACATCCTGCTGACTTTGAAGTATTGATCTTAAAGTGATCAGTGATGACACTGGAATTATATAGGTGAGTCTAGTCGATGGGACATGTGTGCAAGCTTCAACTGTTCTGTCAAATGCAACGCCTTATAAAACATTTATGGTAAGCAATGTAAATTTTATAACAAGTCTTAATTACTACTTATAAAGGGTGCGGTCACATTAGCTGATTAAAACTTATTTAATAAATTGTAATAGTTTCTTGAATTTCACCACAAATATGATAAATCAATTGCACTCTGTACTTCTTATGCACGCAGGAATTATTGCCTCATGATATACTTCCTGATGAGTTTCTTCGTGCTATTAAGCATGTTGATTACCGATCTGTAAGATTTCTTTCTTTTCTTTTCATTTAATATTTTATTTTATTCTATACATACACATTTATCTGTCTATCTTTTTTTTTTTTTGAGTGTCCGAGCCAACTTACATGCACCTCGACTAATTCTCAAGGACAACCGTCTGATCTTACAACATTCTATCTATATAAGAAACAATTTCATTGATAAGGGAAATTACATAAGAAGGGGAAAAAGAGATCCCCAATTCAAAGGAGTTTATGAGAACATTGCCAAAAAATTGTCTATTAGTTGTCTCCTTCTAGGATGAAAATATCCGTCGATATTATAGTTCAGGAAGTTATCCATGCCCACTACATAGTCTACACTGTGTCGGTCCATGTCTCCTTGACTGATGGCTGTTCATTTTGGCTCTCTATTGTTTACGGCTTGTCGGATAATGCTTTCATGCTGATTTCTAGCAAGAGCTAGATGACCTGGCTGGTTTGGGTGGTGATAATTGGGTTATTGGTAGAGACTTCAACGTTACTAGGTGTTCATGGGAGAAATCACAGGATAATTCTATTTCTGTTATTATACTCTCTTTCAACCAATGGTTTTCTAGTTATCAGTTGTGAGATATTCCCTTGTCCAGTGGATGTTTCACTTGGTTTAGCTCTGGACCCACCCAATATCTCTCTTCTAGACCATTTTCTCCTCACAGAGAATTGCCTTCGCAAATTTGGGGCTGTTCATCTCAAAAGGTTGGCGCGTGTCACGTTTGACCATTATCCTTTAGCCCTTGCTACGGGAAACATTGCATGAGGTCCTTGTTCCTTTCGATTTGAAAACTCTTGGCTTAAGGTTCCAGGTTTCCGCACTTTAGTGGAGGATTGGTGGAACCTCCATCCTATTACTGACTGGCTTGGACATGGTTTTATGACGAAATTGCAAGGTTTAAAATTAGTTATCCGTGAGTGGCACAATACTCAACATACAAAAGCTTCAAAACTTCCATCTCTTATCACACAATTGGCACAGTTAGATGATTCTGAGGATAGAGGTTTTCTTACTGAAGATCAGATTATTAGGCGTCAATTGATTTGGGACCAGATTGAAAATTTGACCATTCAAGACCATATTCATTGGCAGCAACTTTGTAAACTAAAATGGCTTGTTGAAGGGGATGAAGACATTTGTTACGGCTCGGCATTGAAAAAGTACAATCACAAAAATCCCCTCTAGAAATGGTACTAATCTCCTGAGCGACAAGGACATTGAGACTGAATTCTTGGGTTTTTATTCAAACCTTTATACTAAAGACGATAATTATCGTTTTCTTCCAAGAAACCTTGATTGGAGCCCTATATCAACCTCTCAAGCTACTGATTTGGAGCGCCCCTTTTTGGAAGAGGAGGTTCTTGGCGGTCTCCTCCCTTGGCACAAATAAATCTCCTGGCTCTGATGGTTTCACTGCTGAATTTTTCAAATTCTTTTGGTCCACCATTAAATCTAACATGATCTGCCTGATTCAAGATTTCTACACATTTGGGGTTAGAGATGCTAAACTGAATGAGACCTACATTTGGTTGCTGATTGCTTGAGTCGCCTCCTTGACCATAGCTCCTCTTTGGGTCTTATTTAGTGCTCACCCAGTTGGTAATTCAACCTTCTCCATGAACCATCTTCAATTTGCTGATGACACATTGCTTTTCTCTATTGCTGACCGTCCTGCTATTCAGAATCTTTTTGAGGTTGTCCATATTTTTGAATTTGTTGTTGGATTAAAAGTAAATTCTCTAAGAGCGAGCTCCTTGGTATTCATGTTCCCGATTCTGATATTGATTGGTTGGTGAGTTCCTTTGGCTACAAAAGGGGTTTCTGGCCCTCTACTTATCTTGGGCATCTATTAGGTGGTAACTCCAATTCTATTATTTTCTGGCAACCTATGCTGGAGAAATTTCAGCATAAACTTCATAATTGGAAGTATGTATATATCTCGAAAGGGGGAAGATATACTCTCATTCAGGCTACTCTTTCTAATCTGCCTACGTATTATTTATCCTTATTCAAAGCTCCTCCTCTCTTATCAATTGCTTCAACAAGATAATTCGTGATTTCTTTTGGGAGGGTGCCCGGGGCGATGGTGATGTGCACAATGTGAATTGGGGGACCACTCAACGTCCACATGCCTTGGGGGCCTTGGTATTGGTAATTTTAAGCTTTGTAATTCCTCCATTCTTCCAAATGGACTTGGCAGTTTCTTACCGAGAATGATGCTCTTTGGAGAAATCTTATCGTGGCAAAATATTATGGTGTGGTTTGCTATTGGCCTACTCCGATCTCTAATCCCTTCTATAAGGCCCCTTGGAAGTTTATTAGTCACTGCATTGGTTTGGTTATTGATCGTATCCGTCGGAGAATTGGAACTGGTTCTACTACATCTTTTTGGAATGACTCTTGGCTTAATTGTGGTGTCTTTTCAACTACATTTTCGAGACTCTTTCGCCTTACTTAGCTTTCGGAGGCTACCGTGGCAAATGTTTGGATTTCATCATCCAATGCTTGGGACCTTAATCTTGGTCATAACCTTACTGAGTTAGCAACTGAGTTAGAAATTGCTAAATGGGCTTCCCTGTTGCATCATCTAGCATCTGTTAGATTGACCTCCTCTCCTGATGCTTGGATGAGCCTTTGGACCCATCTATGACTTTTATGGTTAAATCTCTCATGGCAGATTTGGAGGATATTTCTGACTCAACCTTAGCTGATCTCTATACTTTAATTTGGAAAGATTGTTGTCCAAAGGTCAAAATTTTCTTTTGGGAGTGCCATCAACACCAATGACCGATTGCACGGATGTTTCCCATACATGTATCTTTCTCCCTCCT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MTPLENLIIQSILDVHDVDFQFCGVDFLESLVSEFSPSTSSAMGILREFHVVELTEDVLLLGKRCCYRSNSVEVLQSATSTVYPSIPPKFHSLIEVSELMVEDSGRVKGVSLVDGTCVQASTVLSNATPYKTFMELLPHDILPDEFLRAIKHVDYRSATTKINLAVEKVPHFPCKFSPSEAGHQLVGTIHIGAESMEEIDSACQDAVNGIPSRRPIVEMTIPSILDQTISPPGKHVINLFIQYTPYKPSDGSWEDPVYRESFAQRCFALIDEYAPGFSSSIIGYDMLTPPDLEREIGLTGGNIFHGAMGLDSLFLLRPVKGWSNYRSPVKGLYLCGSGAHPGGGVMGAPGRNAANLLNILLIGPPSALPFAFAFTFTHELLILWLAEYKHISDTVARIPRELVSSFPNGSFRENIELQYLKRSCWTGPALRCKTLQIRHTTKCAFDASSEDFANESAAIFPRIHVRDPYKRLGISKEASEDEIQAARNFLIQRYAGHKESVDAIESAHDKIIMQKFYDRKNPKIDIKKKVREVNQSRVVQAIRSRFQTPSTKFIIKSSIVFLVLGVLTILFPTEEGPTLQVAISLIATFYFIHDRLKSKLQAFLYGAGAFIFSWLLGTFLMVSVIPPVIKGLRGFECSASLPLGLVN Homology
BLAST of Clc07G07810 vs. NCBI nr
Match: XP_038895218.1 (pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 2.0e-144 Identity = 255/264 (96.59%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. NCBI nr
Match: KAA0044812.1 (pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 520.8 bits (1340), Expect = 1.7e-143 Identity = 252/264 (95.45%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. NCBI nr
Match: XP_004146508.1 (pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 2.2e-143 Identity = 250/264 (94.70%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. NCBI nr
Match: KAE8649186.1 (hypothetical protein Csa_014853 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 2.2e-143 Identity = 250/264 (94.70%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. NCBI nr
Match: XP_008452062.1 (PREDICTED: pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like [Cucumis melo] >TYK16652.1 pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 1.1e-142 Identity = 251/264 (95.08%), Postives = 256/264 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MHH6 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 OS=Bos taurus OX=9913 GN=PYROXD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 2.4e-71 Identity = 134/266 (50.38%), Postives = 184/266 (69.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8N2H3 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYROXD2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 266.5 bits (680), Expect = 7.6e-70 Identity = 134/265 (50.57%), Postives = 178/265 (67.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RAP5 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=PYROXD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 4.9e-69 Identity = 133/265 (50.19%), Postives = 177/265 (66.79%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3U4I7 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pyroxd2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 263.5 bits (672), Expect = 6.5e-69 Identity = 130/266 (48.87%), Postives = 182/266 (68.42%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68FT3 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pyroxd2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 2.5e-68 Identity = 131/266 (49.25%), Postives = 180/266 (67.67%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TNA9 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold74G001030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 520.8 bits (1340), Expect = 8.3e-144 Identity = 252/264 (95.45%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KY37 (Amino_oxidase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G047340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 1.1e-143 Identity = 250/264 (94.70%), Postives = 257/264 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CYL0 (Pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 5.4e-143 Identity = 251/264 (95.08%), Postives = 256/264 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BSD5 (pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 5.4e-143 Identity = 251/264 (95.08%), Postives = 256/264 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J6Y6 (pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase domain-containing protein 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483124 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 5.9e-142 Identity = 247/264 (93.56%), Postives = 256/264 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. TAIR 10
Match: AT5G49555.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 432.6 bits (1111), Expect = 5.7e-121 Identity = 203/264 (76.89%), Postives = 233/264 (88.26%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. TAIR 10
Match: AT3G51140.1 (Protein of unknown function (DUF3353) ) HSP 1 Score: 292.7 bits (748), Expect = 7.1e-79 Identity = 148/198 (74.75%), Postives = 169/198 (85.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. TAIR 10
Match: AT5G23040.1 (Protein of unknown function (DUF3353) ) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 3.0e-29 Identity = 76/189 (40.21%), Postives = 115/189 (60.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. TAIR 10
Match: AT3G04490.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G38092.1); Has 75 Blast hits to 64 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 36; Fungi - 0; Plants - 22; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 7.0e-10 Identity = 32/43 (74.42%), Postives = 36/43 (83.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G07810 vs. TAIR 10
Match: AT1G57770.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 1.0e-08 Identity = 70/278 (25.18%), Postives = 114/278 (41.01%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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