Clc07G07520 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc07G07520
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr07: 19997900 .. 20004298 (+)
RNA-Seq ExpressionClc07G07520
SyntenyClc07G07520
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGCAAAATTTGATATCCTCTCCAAGCTAGTGGCTAGATCAATTATAACCAAAATTAGGTTGGTGCCGCAGTGCTCCAAGCGATGGGCACCTCAGGACCCGTCAAACTTCGTAATGCCACAACGGTAAGGAGCAACGTCGCGACACTCCTTTGAAGATTAGAAAAGGCATGGGAAAAGCGTCATTGTGCTATGCCTTCAGTGGCAATTTTGTAATTCTAGCACCGTTTGGTCAAGTTGCTTCATTAGGGTCTCAAATCGATCCGTTTTAGCTACATTTTCTCTCTAACACCCTAATCTACCTCTCAGGTACTCGATATGTGTAAAATCACTAAATAAACGTGAAGAAACCAAGGAACGAACCCGAATTAAGATAACACATTTGAAGTGCTATCAATAATCTTCCTTTCCTTTTCCACATATAAACATCATAACAGATCGTGACCAAAAAGAGATAATTCTTTCCACTTAATTAATTTGTGATTGGTGATTAGAAGTAAGGTTCCCTTTGGATCGTTGTGGGTGAAAGATGCCATTGAGGATGAGGATAAGGTTTTGCTTTCTGTAATTTAACCTTAAGGAAGAATAGATTGCAAAATGAAAATTGGGGCTTGACCTAATTGTCTAGACCCAAGTTTTAAAAATTTTCAAGTAATTTGAGGAAGTGGCCTGATTAAAAAAAACATGCCACCGAAAAATGTGACCCAAAAATTAAAAACTTGGATGAGAGAGACGTCAGCAACCCACAAACTGAAAAAGAAAATCCTAGAGAATCTGCAACCCACGATGAGATCAGAAAAATCACTTTGTCTATGGTATTAATTCTTCTTCATCTTTGTCTGTGAGCCACGTTTTCAAATTGCCAACTGATGCGAAGCTGAAGGTGAAGCTCTGACGTGAAGAAGAAGAGTGAACTTAAGGGCTTCTGACTCGAAGCTGGATTTTGTTTTTCTAAAGAGTATTGCTTATGACATGAAGCCTAAGTTGTTCTTAAAGACTATGGCTTCTGATACAAAGCTTAACTTAGGGTTTCAAAAAGTGTTGCTTTGATACCGTGTAATTTAGCTAGACAAAGAATTTTCTTATTTCATTCATGTTACAAAGGTACAACCCTAAATTTAAGGGTTTTTTTCAAATATAGCAAAAAGAACCAAAATATTTATAAATATAGCAAAATATCACTGTCTATCTGCGATAGATCGCGATAAACTACTATTTGTATCATAACAGACACAGATAGTAGTCTATCACAATCTATTGCAGTGTATCATAGATAAATTATGATATTTGGCTATTAGTTGTAAATATTTTTCAGCAGTTTTATCATTTAAAATAATTTCCCTAAATTTAAAGGGAAAGAGAAATAAAAAAAAAAAAATTTAAAAGTAATAGATCAACAGTGCAATGGGAAGAAAAATAAAGAAAACAAATACACATAAACAAAAATTGCATAAAAGGGAAAAAACTAGTAATTACAAATGAAGAAACATTCCTATTTTCAACATCATATATCGTCGTTGATTGATAAACTAGATTTACAGAGGGAAAAGTTTATCGATGATATTGTTGATATACCAAATATGAAATATATTATTTAAAATGATATACTTAAAGTATAACATTTGATATTTCAATTTTATATCAGTACTAATTCAAAATGTCTTTCAAGTATATATCATTAGGTATCAATATTATATCATCACTCGTTCAAAATGCAATCTTAAGTATTATATTGGTGTATCAATAGTTTATTGACACCCATTTGAAATTCATTTAAAATTTAATGGTGGTGTATCAGCATTGTATATTAGTAGTCATTAAAAATTCATTTCAAGTATATAATTGGTGTATCAGTGGTATATCAACACTTATTATAAATCCATTTCAAGTCTAATATTGGTGGATCAACAGTGTATCGGTTACATTCATTCTAAATTAAATTTCAAGTATAACATTGATGTATTAGTAGTGTAACACCCCGAGTTTAGGAGGGGGACATAAATGAACGAAGATCACATCTAAATGAGAGAGATCTTGACGATATGAAAATATGACTAAGAAAGGCTTAAAGAATTGAAAGTCACTACCTATACCAACAAGATGCACCTTCCTTTTAGGTGACTAAATCATAGGAACTTCATAGTTAAGCATGCTTAGCTTGGAGAAATCCTATGTTAAGTGACCTCCTGGTAATTTTCCTAAGAAGCATATGAGTGAGGACAAAGTATGTTAAAAGGACCTATGTTGGTGCAGGGGCAAGGATGACATTGCCTCAGGGGAATGTTGGGGTCATCAGGTGCTAAATCTAGATTTCGAATCCTAGGTTTGGGCTGTTACAAGTAGTATCTCAACGTCTATTTAGAATTTATTTAAAGAGGTGTTCATCATGATACAAAACATATTCTTAACATTCTTATGAGGAGTTGTCTTGGAGAGGATGAGATCATTAGAAGCACAAATAAAAAAGGAAAATTTTATGTGAGAAGCGCCTATCATTTAGGGAAACACTTAATTTATTCTCTCTTCGCTTATCAATCATCCAAATGAAAGTTTTCAAGCTTTTGGAGAGCTGTGTGGGAGTCTGATGCACTACCAAGATTAAGATTGCAGGATGGAAAATTATTAATGACAACATTCCCATGGCGCATAATCTTTCAAAAAAAGAGGATTGTTACTAACCTATCTTGTCCTTTTTGCAGCGCACATATGGAAACCATGTGTCACCTCATTTGGGAATGTAAAGTATCTAAGAAGATCTAGAATACTTTTTTCCCCTCTAATGTTGGTGTGTTTTATGTAGGCAGGGGCTCTTGGTCTTCAAGTGATTATTGGGAGTGTTTAAAGGAGATTAATCCTAGATAGTAGATGGGAAAGATTCTCACACTTCTTTGGAGTATTTGGACCCCAAGGAATGTGATTCACTTCAACCAAGGGTCTTCTGATGAGAGATCTATAACTTATGCTGTGGAATCTTTGTTGGAAATCTCTTTCAGGAAGTTTCCCCACTCCCTCCCCTTTTTTCTTTCGAGCTTCGTCTAGAGAGGAGTGTGTGGAAAGCATCTATGGAGGGTCATTGGAAACTCAATGTGGATGCGGCTTGGTCAGAGTTTCATCAAAAGGGGAAGTCTTGGATGAATTCTTCTTGATCATCTTGGGAAGCCAATTATGGGAGGTTGCAAGTTTTTGAACCACAATTGGGGAGTTAAAGTTTTAGAAGCTAAAGCTGTGATGCTTGGTCTGGCTGAGTTAGAAAGGTTTTGACATAGGCTGAACCCTCATGTGGAAATCGAGTCTAATTCTTTGGAGGTGGTTAGATTGTTAAGCCACATGGATTCTGATTCATCTGAAGTTGATTTATTTTATTTTATTTTATTGTGAAGGAAGCTTTTAGCCTCACTGCTTTTGTTATCTATCATTTTTTGTAAGATCCTTAAAGAGGAGAACAAAGTTTCCCACTGCTTAACTTCTTTGGCTTCCTCTTCTAGATATAGAAAGATGTCTTTCCAGCTTTTGTTCTTCCCTTTATCCTTGAAGGGGGTTTTGTTTGTTGGCAATAATTGTTTCGCTAAAGCATTTATGTTTAGAAAAAGGTTGATGATGATACACTAGAACATTAATACTCTAAAACAAATTAATAAAAATTTAAATTAAGTTCATGAATAATAACAAGTGTAAGAACACTTATTTACATATAATAAATAGTAAATTTGGTATATCAATTTTATAACTCACCAATCTACTAGATATAAAGTATATTTGTTGACTAATATACTAAATAAAGTATACAGGTAACTGACGCACCAAACATAAAGTATATCAAATATACAAAAAGGGTAAAATTGAAATAATAAAAAAAAAAAAACAAAAACTAGACCTGAATTTTTGGCTATGTTTGTAAATTTCATAAAAGCATTGCTAAATTTACAATTTTTATAATATTTCTTTACTATTTTTGTAACTACCCCTTTTGAAAAACTATAATAATAAATATATAAGTTTTTTTTGTTAAAATATCATTTTAGTCCCATACTTTGAAATTTGTTCAATTTTAGCCCCTATATTTTCCATGGTCTAATTTCAGTGCTTGTGTGCTCAATAAATCTTAAATTTAGTCCCTCAAAGTTAATTTTTGTTGAAATTGATTAAATAATAATACTAATTTTCATGCAATAAAATAAATATATGTTTTCAAAATTTATAGTAAAAATACTATAAATAACAAAAAGTTCTTTAAAGAACCAAGAATAAACTAGTATTGGGGACCGTATTTAAGATTTATTGAAAGTAGAGAAAGTAAAATTGAATAAACTTCAAAGTATATGGACTAAAATGATATTTTAACATAAGTTTTTTTAGGGCAAATATCAATTTATACCCTTGAACTGAGGGTTGTATCAATTTTAAACACTAAACAAATAATTGTATCAATTTAAACACTGGATTTTTGGGTTGTATCAATTTAAACCCTAAACTGATAATTGTATCAATTTAGACCATGAACTTTCATAAATGTATCCATTTAAACCCTACATTATATTTTATTTGGATAAACATCATGTAAGACTTGTAATTTTATCAATTAAACCTCTAAACTTACATAAGTGAATCAATTTAGACTCTCATTGAAGATTTATTTGAAAATTGTCCATTAAAATGATAATCGTCATTTTTGTTAAATCAACATTTGTAGAAATCTACACACATATAAAGAAATATGCATTGACATTTTTCAAATATAATCCTAACAAAGGCTATAAATTGATAATCTCTTATGACAATTTATAAGTTTAATTGAAAAGATTAAATGTTGTGTAAAATTTTTCAAACGCGTATAAATTGATAAACTTATGAAAGTTCAAGATTTAAATTGATATACTCATAAAAGTTTAGAGTTTAAAGATGTTCTTGGATTGTCTATGAAAAAAAGTGTTTTTTAAAAATACATTTTTTAAAACTGTAAAATGAGTTTAATTTAAACATGTTTGGTTAGGTCTTTTTACA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mRNA sequence

ATGGCAAAATTTGATATCCTCTCCAAGCTAGTGGCTAGATCAATTATAACCAAAATTAGGTTGGTGCCGCAGTGCTCCAAGCGATGGGCACCTCAGGACCCGTCAAACTTCGTAATGCCACAACGAAGTAAGGTTCCCTTTGGATCGTTGTGGGTGAAAGATGCCATTGAGGATGAGGATAAGGCAGGGGCTCTTGGTCTTCAAGAAGTTTCCCCACTCCCTCCCCTTTTTTCTTTCGAGCTTCGTCTAGAGAGGAGTGTGTGGAAAGCATCTATGGAGGGTCATTGGAAACTCAATGTGGATGCGGCTTGTGGTTCGTCGCCGCTGCTGCACGTTTCACCGCCGGTAGTTACTTTCCCTCGCAGTTTTTTTCTTCTCTCTCTGTTTCGACCAGCAGCTTCCTCCCGCCGTAGCGATGCCTTGACTCGCCGCTCATCGTCGCCGGAAGTCGCGCCCAACCTCCTCACTCTTTCTTATTTGCATCGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCAAAATTTGATATCCTCTCCAAGCTAGTGGCTAGATCAATTATAACCAAAATTAGGTTGGTGCCGCAGTGCTCCAAGCGATGGGCACCTCAGGACCCGTCAAACTTCGTAATGCCACAACGAAGTAAGGTTCCCTTTGGATCGTTGTGGGTGAAAGATGCCATTGAGGATGAGGATAAGGCAGGGGCTCTTGGTCTTCAAGAAGTTTCCCCACTCCCTCCCCTTTTTTCTTTCGAGCTTCGTCTAGAGAGGAGTGTGTGGAAAGCATCTATGGAGGGTCATTGGAAACTCAATGTGGATGCGGCTTGTGGTTCGTCGCCGCTGCTGCACGTTTCACCGCCGGTAGTTACTTTCCCTCGCAGTTTTTTTCTTCTCTCTCTGTTTCGACCAGCAGCTTCCTCCCGCCGTAGCGATGCCTTGACTCGCCGCTCATCGTCGCCGGAAGTCGCGCCCAACCTCCTCACTCTTTCTTATTTGCATCGTTAG

Protein sequence

MAKFDILSKLVARSIITKIRLVPQCSKRWAPQDPSNFVMPQRSKVPFGSLWVKDAIEDEDKAGALGLQEVSPLPPLFSFELRLERSVWKASMEGHWKLNVDAACGSSPLLHVSPPVVTFPRSFFLLSLFRPAASSRRSDALTRRSSSPEVAPNLLTLSYLHR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc07G07520.2Clc07G07520.2mRNA