Clc07G05620 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGAAAAGAAGTCTTTGCATAAAATAAGTCACGCCCCTTGAACCCAGAAAAAAAGGGGCAAAAAGTAAAGAAAACTCCTCTCGACGAATTGATTTTTATTCATTTTCTTTTTCTTCTCTTTTCAATTTGGTTCTTTATCGGAGGATTAGATTTGGGTCACGATTTTTCCTGTTATTTCGTTGGAATTTTGTCCGAATTCCAATCCCGATTGCCATCCTCTTCCATTGTCGGGGTTGTGTTTAATTTCAACAGTTCTTTTTTCATTCTGTCGATTTCATTATTTGGAAGACTGCCACGCAGCGATGTTCCGATTTGAGCAGGAGAAGATCCGAAAACGAATTTGATATTTCCCAATTGGTTTCTTTGATCAGTTGAATTCGTTTCAGTGCTCTTAGGGTCTGATATGGCTGATGCTCTCTCTGTTATTCCTGCATTTGTGCTCCGAAACCTCTCTGATAAACTCTATGAGAAGCGGAAGAACGCTGCTCTTGAGGTCTACTTCACTAACCATTTCATCGCTTTTCATTTCTAGGGTTTGATTGTACGTAATCTTCTAAGTTGCATTGTGCTTTTAGGTTGAGGGAATTGTGAAGCAACTTGCGTCGGCTGGAGATCATGAGAAGATTACAGCTGTTATCAATCTGCTGACCAACGATTTCACTATGTCGCCTCAAGCGAATCATAGAAAGGTATGAGATGAATGCGAAAACGAATGCTTGTGATAGTTCAGGTTTTTCTTTTAGAGTTTGGGTTTTGGGTTAAATCGTAATTTGCTGTTCATTATTATTATTATTATTTGTTTGTTTGTTTGGAATTTGCTTGATTTTTAACTTTCCATTTCATTTTTAGGGAGGATTGATAGGGCTTGCTGCTGCAACTGTTGGCTTGTCTTCTGATGCGTCTCAACATCTTGAGGTTAGTATATTCTTAGGCGGTTTCCTATTTAGTTTTATAGTTTACTTCATCATGATTTCAAATGGACTATAGCCGTTATATCCTACAACTAAGTAAGTAATCTACTTAAAATGTACCTGAAGCGTTTACTGGTTATTAGATGGGTATGGTATCCTAAGTCTGCAGCTTGTTGCTTAAAACTGTTGAACTATAGAGATTCTTGCTGCACCGTGTATAACATTTTGGGAGAAGGGCATATGAAACTTGATTTGTTTCTCCTCTCTCTTTAAATTGTCTAACTTTAAGGGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTCCTTGTTGTTGATGTTTAAATTGTTTCGGTGCTATATAAATCAGAAAGTAGCCATTTTCTGGGATTAAATTTGTTCTGCTTCCTTCCATTATGGTGTTGTTAATATCTTATAGATGTTTCTTCTAACATTATAAGTGAACTTTCCAGCAAATTGTACCTCCTGTGCTCAATTCTTTTTCTGATCAAGATAGCAGAGTACGTTATTATGCATGTGAAGCTCTATACAACATTGCAAAGGTGAGAAAACTTGTTAGAGTTGTTAATGCATTTCTATTGCTAGAGCTGAATATGTACTTCTATTGCTGCAGGTTGTCAGAGGAGATTTTATAGTTTTTTTTAACCAGATATTTGATGCCTTATGTAAGCTTTCAGCTGATTCAGATGCCAATGTACAAAGTGCTGCACATCTATTGGATCGGCTTGTGAAGGTACTCACTTACTCACCCCCTCCTGCCACAAGTTTAACGAGATAAAAAGGAAGTAATTCCATGTTTCAAACATTCTCTGATTCACCATGGATTGAGAGGATCACCAGAATGGAAAATAGCAGATGCATATATCTTTAGATAACATATGGCCTCTTATTCAAATGCTTTACATTTAAAGATTTACTCTGCCTACCTCATTGATGTAAATTGGTGCAGCTTCTTCAAAGTTAGAAGTTGAGGGAGATGTCTTGTTCTCTTGCTCTCTGTTTTGAATTCCTCCTCCTTTTTCCTCTTTTTCCCTTGAATAGTAACAAACAACTCTTTGTTTTGATGAACAATTTCTCTTGTTTTTAACTAATTTTATGAATTAAATGGAACAGGATATTGTTACTGAAAGTGATCAGTTCAGGTATGCCATCATTTCTTAAACTGCTTGGTTTGGCTATTTTATTGAATGTTACTTTTAAGAAGCATTGTTTTGAAATTCTATTGCAAGATGTATTTGTTTATATTTCTTTTGGTGATCTTCTTTCTTCAGCATCGAAGAGTTTATTCCATTGCTGAGGGAGCGTATGAATGTCCTGAATCCCTATGTCCGTCAGTTTTTGGTTGGATGGATCACTGTACTTGATAGCGTGCCAGATATTGATATGTTGGGCTTTCTTCCTGATTTTCTTGATGGTGAATGTGTTAACTGACATTTCTTTTAATATATAATCTCTTCTCTTTTCTTTATTGAATGTGGAGTCAAAGGTGTGAAGAGCACTCTATTTCTGTAATTTTTACAGCTAAACTTACAGATCCGTGATGAATTTCAGGTTTGTTTAATATGTTGAGTGATTCAAGTCATGAAATCCGGCAACAAGCTGATTCTGCTCTTTCGGAGTTTCTCCAAGAGATAAAAAATTCTCCAGTAAGATTTGCTTAGCTAACATCGACTTGTTGAGTGCCCATAACTAGATTGATAGCCTTCAATTGTTGCACTCCATTTATTTATTCTTTTAATAATTACTTTGTAACCAAAACCATTTTTATCATTAAAGCTAATTGTAGTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCAAGCTCTTTGGCTCTAGGTGTTGTGTCTCTGCTTTTGTATTTTTCTGATTTTGAATGAAGAGTTTTGGTTTCTTATATGAAAAGAAAATTAATTTCCCGTTTCTACTGATTATAACTTGTTTGGACAACAAACAAAATAAGAAAAATAGCACGAGGACATACATGCAACCACGCAAATGCAAAAATAGATTTAATAAATATCATCTATCTTTTCTACATTTTCTTCGTTGCATGTGCAAAATTTATTTGTTCATTTAATAATTTTCTGACTCGAGCAGTGCTACTCTTGAAGTCTGTAGATTATGGCCGAATGGCTGAGATTCTGGTCCAGAGGGCTTCTTCCCCAGATGAATTTACTCGCTTAACGGCTATTACATGGGTACTTTGGACTTGAGCATCCATCATTTGTCATTATAACTTCTCTAAGATTAAAAAAAAAAAAAATTGACTCAGTCTCACTTTTTTGTGAGGTCCTTCCTAGATCTATCGATAACCGATAGACATTTCTTACTGTTGTGCATTATCTTTATAAATTTATATTTTCTTATATTTACAGATTAACGAGTTTGTAAAACTTGGTGGAGATCAACTAGTACCTTATTATGCTGACATTCTAGGAGCAATTCTGCCTTCCATAGCTGATAAAGAAGAGAAGATTAGAGTGGTAGGATTTTTCTTCCCCCTTTCTTTTGCCCCTTGTGCCATGAACACCATGCACGTAATTTGATCCTATAATTTAAGTTTTTATTTCTTTTTCAACCACTAGTTATGTTTTCCATATTATGATTGTTTTTCATTATCCTTAATATAAGATTATGGTTGAGAAATATGAGAGATATGTTATATAGGACTCATCACCAACATTATATAGAAACAACTACTTTCATTGAAAGAAATGAAAGATTACAAGGGCATACAAAAAACCAAGCCCACAAAAACTCGACTAAAGTGAAAACCATAATTGAAAAATTGAGAGGAAATAAGCATAAATTTTAAAAACAGAAAACTAAAAATGAAATCGTTATTAAACGGGGCCTGAACCATCATATCTTTTATCTTTAAACTTTAGTGTTGTTTCTGTTTCAAAGAAAAAAAAGGAGAAGAAAATATTAAAGGAAAACTGCACAATAATACTCTTTGTTACTTGAAGTTAACATATAAAATACCTATAACGTTTCTTCTCTTAAATGTACATCTTTCTTTAATTCATACTCTTTCTTCTCTTTTGACCAATTGGAGACATCTTGTGTAACTCCTTTGGCTTGGGCTTTTGGCCCCTTTTTGTAAACTTCATACATCAATACAATTTGTTTCTTATCTAAAAAAAGAACTTAGAGATAAAAATGTAGGACCAATTATAAATTCTCAGTGAGTGAATTAAAATGGCTATAACGTTTAGTATCTGGCTAGTTTTAGCTGCTATATAATAATTGGGAGTGTTAGTTGTTTGACTTAATACGATCAGAGAGAATGTAAAGGGATTTAATAGTTTCTCTCTTCAACCTCATGGTTTGTTATAAAGTAGAGTTTTCCCTTGAGGGGACTTAATTCGCTTTTATGAGAATTTAGTGCAACTGATTTGTTTACATTATATTTGAAGGTTGCGCGGGAAACTAATGAAGAGCTTCGTAATATCAAGGCATTTCCATCCGAAGGATTTGATGTTGGTGCTATCCTTTCTATTGCTAGGAGGTATAGCCCCCGTCCACCGATCTTTGCTGGTCCCCTACTTCCACTGAAAGTTGGTTTTTAAATTAAAAAGAATTATTTGGCAATGGGAACACAATGTTGGAGTTATGTGGAGTAGTTATATTGATTTCATTTGATGTAAGCTTTTTGCTTTGATGACCGATAGGATGTTTTCATGATTGTTGCTTCTGTTGATTGATCAGACAACTATCTAGCGAACATGAGGCTACCAGGATTGAAGCCTTGCATTGGATATCAACACTTTTAAACAGACATCGAACTGAGGTGCCTATGATATTGTCAATTTTTTGTTTTTTTGTATCACAGATGACTTGTCTTTAACATATGGATTGACCTATTACTTATCCTAGGGTTATCCTTTTTGATCTCTGCATTATTAAACCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAAGTAAAAGAAAGGAAGGAATTTGACCTGGAATTCTGATGTATGCACTACCAACAACCTTCATTTTGCCATTGGGGTTATCTAGAATTAAGAGTGGCAATTGATAACCTCCAGG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MADALSVIPAFVLRNLSDKLYEKRKNAALEVEGIVKQLASAGDHEKITAVINLLTNDFTMSPQANHRKGGLIGLAAATVGLSSDASQHLEQIVPPVLNSFSDQDSRVRYYACEALYNIAKVVRGDFIVFFNQIFDALCKLSADSDANVQSAAHLLDRLVKDIVTESDQFSIEEFIPLLRERMNVLNPYVRQFLVGWITVLDSVPDIDMLGFLPDFLDGLFNMLSDSSHEIRQQADSALSEFLQEIKNSPSVDYGRMAEILVQRASSPDEFTRLTAITWINEFVKLGGDQLVPYYADILGAILPSIADKEEKIRVVARETNEELRNIKAFPSEGFDVGAILSIARRLAGENGVVLIRMKWKLGISPAHLSLLCRKVKLHNKIMDTPTGVGHMSEVCQGMSASDMCWTPMVLIYLDDILDSLLQALSDPSDEIKVDEEYDIPIKLSSITWFVFDRLKLAVKVVLLVLDVHACIAKDQQHFRQLVVFLVHNFRINNSLLEKRGALIIRRLCVLLEAERVYRELSTILEGESDLDFASIMVQALNLILLTSSELSDLRDLLKKSLVHAAGKDLFVSLYASWCHSPMAIISLCLLAQSYQHASVVIQSLVEEDINVKFLVQLDKLIRLLETPVFAYLRLQQSAAFKILRTRLKTVPPYSFSGEHFKQLSSSGNSYSAMHHLSGLNNEDGDVSQDAGNSRSGINFAARLQQFEHMQHEHRLHAKEQTLSRTSTPPPQATMGVEIPEETKRAASAPASAHTPAPAPAPAPVPASAAEINRPPSRSRRGPGQLQL Homology
BLAST of Clc07G05620 vs. NCBI nr
Match: XP_004142375.1 (protein VAC14 homolog [Cucumis sativus] >KAE8648877.1 hypothetical protein Csa_008989 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1186.8 bits (3069), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/812 (82.64%), Postives = 682/812 (83.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. NCBI nr
Match: XP_038892202.1 (protein VAC14 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1182.9 bits (3059), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/812 (82.64%), Postives = 680/812 (83.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. NCBI nr
Match: XP_008464719.1 (PREDICTED: protein VAC14 homolog [Cucumis melo] >KAA0040982.1 protein VAC14-like protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20332.1 protein VAC14-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1181.8 bits (3056), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/812 (82.14%), Postives = 679/812 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. NCBI nr
Match: XP_022157785.1 (protein VAC14 homolog [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1160.2 bits (3000), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/814 (80.34%), Postives = 674/814 (82.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. NCBI nr
Match: XP_023531445.1 (protein VAC14 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/813 (79.83%), Postives = 666/813 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZU97 (Protein VAC14 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAC14 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 946.4 bits (2445), Expect = 2.0e-274 Identity = 547/814 (67.20%), Postives = 610/814 (74.94%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68F38 (Protein VAC14 homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=vac14 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 443.4 bits (1139), Expect = 5.5e-123 Identity = 297/788 (37.69%), Postives = 426/788 (54.06%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZIW5 (Protein VAC14 homolog OS=Gallus gallus OX=9031 GN=VAC14 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 8.3e-119 Identity = 289/794 (36.40%), Postives = 427/794 (53.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80WQ2 (Protein VAC14 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vac14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 426.8 bits (1096), Expect = 5.4e-118 Identity = 271/713 (38.01%), Postives = 392/713 (54.98%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q66L58 (Protein VAC14 homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=vac14 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 426.4 bits (1095), Expect = 7.0e-118 Identity = 286/781 (36.62%), Postives = 432/781 (55.31%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TBZ1 (Protein VAC14-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold228G00200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1181.8 bits (3056), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/812 (82.14%), Postives = 679/812 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CM92 (protein VAC14 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502538 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1181.8 bits (3056), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/812 (82.14%), Postives = 679/812 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DU23 (protein VAC14 homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024406 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1160.2 bits (3000), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/814 (80.34%), Postives = 674/814 (82.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSR4 (protein VAC14 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489436 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1141.7 bits (2952), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/813 (79.70%), Postives = 666/813 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUJ1 (protein VAC14 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447407 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1138.3 bits (2943), Expect = 0.0e+00 Identity = 647/813 (79.58%), Postives = 664/813 (81.67%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. TAIR 10
Match: AT2G01690.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 946.4 bits (2445), Expect = 1.4e-275 Identity = 547/814 (67.20%), Postives = 610/814 (74.94%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. TAIR 10
Match: AT2G01690.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 941.8 bits (2433), Expect = 3.5e-274 Identity = 547/815 (67.12%), Postives = 610/815 (74.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. TAIR 10
Match: AT3G25800.1 (protein phosphatase 2A subunit A2 ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 3.3e-06 Identity = 68/273 (24.91%), Postives = 118/273 (43.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05620 vs. TAIR 10
Match: AT3G25800.2 (protein phosphatase 2A subunit A2 ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 3.3e-06 Identity = 68/273 (24.91%), Postives = 118/273 (43.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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